Brainscape's Knowledge GenomeTM

Browse over 1 million classes created by top students, professors, publishers, and experts.


See full index

biomol > cour 2 > Flashcards

cour 2 Flashcards

1
Q

ckoi u genome

A

C’est l’ensemble des
informations contenues
dans l’ADN d’une cellule
d’un organisme.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q

genome a des… necessaire pr

A

Séquences nécessaires
pour coder tous les ARN et
toutes les protéines de
l’organisme

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q

ou le genome es contenu chez les humain vs les bacterie

A

Contenu dans le noyau
chez les eucaryotes
(ADN génomique)

 Contenu en un seul
chromosome circulaire
chez les bactéries

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

corelation et genome

A

Il existe généralement une corrélation positive entre la taille d’un génome (le nombre de pb), le nombre de gènes et la complexité de l’organisme.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q

à l’intérieur d’un
même groupe d’organismes
similaires on retrouve

A

grande variation

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q

donne l information genetic presente ds le genome

A
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
7
Q

ckoi encode

A

permettent de
répertorier le type d’information
retrouver dans le génome apre avoir sequencer le genome humain

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
8
Q

ou est reparti l adn genomic

A

L’ensemble de l’ADN génomique d’un
organisme est réparti sur un ou plusieurs
chromosomes

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
9
Q

Les bactéries portent habituellement leurs
gènes ou

A

sur un seul chromosome
circulaire

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
10
Q

Les eucaryotes divisent leur ADN

A

en
plusieurs chromosomes. Souvent un
ensemble de chromosomes différents est
présent 2 fois (les organismes diploïdes

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
11
Q

ckoio les plasmide chez les procaryote

A

nous retrouvons les plasmides qui sont de petites molécules d’ADN circulaires généralement indépendantes du chromosome et susceptibles d’êtres transmises d’un individu à un autre.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
12
Q

cmt l info genetic est transmise ds une bacterie

A

Transmission verticale et horizontale de l’information génétiqu

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q

Le chromosome bactérien est
concentré ou

A

dans la région du nucléoïde
où des protéines s’associent à l’ADN
pour aider la compaction.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
14
Q

bcp de plasmide? chez pro

A

Les bactéries sont souvent
porteuses de plasmides : un ou
plusieurs, identiques ou différents

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q

cmt se fait la replication des plas,ide

A

Ils se répliquent
indépendamment du
chromosome.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
16
Q

caract plasmide

A

Les plasmides ne contiennent pas
de gènes importants pour la
croissance (dans les conditions
normales), mais ils confèrent
souvent un caractère avantageux
comme la résistance à un
antibiotique

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
17
Q

les cellule eucaryote son koi

A

diploide
* Présence de chromosomes homologues
* Génère une plus grande quantité d’ARN

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
18
Q

ckoi les niveau de ploidie ossible

A

D’autres niveaux de ploïdie sont possibles :
* Cellules germinales (haploïdes)
* Mégacaryocytes (polyploïdes) (humain)
* Certaines variétés végétales (polyploïdes)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
19
Q

ckoi ploidi

A

est le nombre de copies,
dans une cellule donnée, de jeux
complets des chromosomes du
génome de ce type d’organisme

On désigne par x le nombre de
chromosomes d’un seul jeu
complet

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
20
Q

ploidi et x

A

La majorité des organismes est diploïde (2x) au niveau de ses cellules somatiques (2n) et haploïde (x) pour les gamètes (n).
Certaines cellules sont polyploïdes. Il s’agit
d’une amplification complète du génome (3x, 4x,
6x, etc.)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
21
Q

agriculture a souven selectioné… et prk

A

L’agriculture a souvent sélectionné des espèces végétales polyploïdes.
 Permet de surmonter le problème de stérilité des hybrides.
 Ou au contraire, crée des espèces sans graines (pastèque, citron,
banane…)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
22
Q

kel organites eucaryotes ont leur propre génome

A

: les mitochondries et
les chloroplastes.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
23
Q

ckoi les pt commun entre mito et chloro

A

Points communs (ADN mito et chloro) :
 Existent en plusieurs copies par organite.
 Réplication indépendante du reste de la
cellule
 Transmission non mendélienne
 Génomes circulaires
 Séquences ressemblant aux génomes
bactériens.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
24
Q

def gene

A

Un caractère transmissible (héréditaire) et porté par l’ADN.
Un ensemble de segments d’acides nucléiques contenant l’information
nécessaire pour produire un ARN fonctionnel de façon contrôlée

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
25
Q

organisation gene pro

A

Généralement
organisés en opérons

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
26
Q

transcriotion gene pro

A

transcrits
polycistroniques

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
27
Q

decrit gene eucaryote

A

Généralement
plus longs,monocistroniques,
avec des nuances (épissage alternatif),
discontinus

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
28
Q

ckoi la densité genique

A

le nombre de gènes par mégabase (Mb) d’ADN

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
29
Q

correlation chez les eucaryote vis a vis de la densité genique

A

Chez les eucaryotes, il y a une
corrélation négative entre la
densité génique et la complexité de
l’organisme (plus complexe = moins
de gènes par Mb).
La densité génique chez l’humain est
de 10 gènes/Mb.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
30
Q

bacteri et densité genique

A

Les bactéries ont une haute densité
génique (1000 gènes/Mb).

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
31
Q

genome des bacteri est constitué de koi

A

Leur génome est constitué
majoritairement des séquences
codantes.

Le reste constitue les séquences non-codantes régulatrices de l’expression génique(promoteur, etc…)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
32
Q

la densité genetic est cmt o fil de l evolution

A

densité génique de plus en plus faible au fil de l’évolution
Les organismes plus complexes ont des génomes plus grands. Cependant,
l’augmentation du nombre de gènes est moins rapide

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
33
Q

La diminution de la densité génique s’explique par

A

r l’ajout de séquences
non codantes :
 À l’intérieur des gènes : introns
 ADN intergénique : séquences uniques et les séquences répétée

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
34
Q

ckoi intron

A

c’est la portion non-codante d’ADN située dans un gène,
qui est transcrite puis éliminée par épissage, pendant la maturation des ARN.

La présence d’introns dans un
gène peut augmenter sa taille
d’une façon significative

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
35
Q

role adn intergenic

A

: principal responsable de la diminution de la densité génique chez les espèces plus complexes
—-inclut parfois une partie
des séquences associées
aux gènes

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
36
Q

cki les seq unic de l adn intergenic

A

1- Les SÉQUENCES RÉGULATRICES de
l’expression génique (promoteurs,
enhancers).
2- ARN RÉGULATEURS : Long ARN
(lncRNA) et petit ARN (microARN ou
snARN) non traduits impliqués dans la
régulation.
3- Les ORIGINES DE RÉPLICATION
4- PSEUDOGÈNES et fragments de gènes.
Entre 12 600 et 19 700 pseudogènes
dans le génome humain! Produits par
duplication, incorporation de gènes
viraux, mutations, etc

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
37
Q

les seq repeter de adn intergenic

A

1- TRANSPOSONS (chapitre 4) :
séquences d’ADN capables de
se déplacer de manière
autonome dans le génome.

2- Régions hautement répétitives :
incluent les TÉLOMÈRES, les
CENTROMÈRES et les
MICROSATELLITES==vari et peuve coser prob lor de la replication

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
38
Q

cmt adn es compacter chez les procaryote

A

Empaqueté dans une structure appelée nucléoïde située directement
dans le cytoplasme. Pas de membrane.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
39
Q

adn enroulé?

A

Surenroulement de l’ADN à l’aide de
protéines structurelles.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
40
Q

nucleoide est..

A

dynamique

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
41
Q

c leskel les deu forma de condensation de l adn chez les eucaryotes ?

A

Chromosome mitotique :
très condensé (maximal)
Chromatine non mitotique :
moins condensé

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
42
Q

L’état de l’ADN dépend

A

de la phase du cycle cellulaire où se
trouve la cellule.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
43
Q

Pendant l’interphase : l’ADN

A

loge dans le noyau, sous forme de longs
chromosomes filamenteux. L’ADN est sous forme de chromatine plus ou moins
condensée

44
Q

Pendant la mitose

A

le noyau disparait et l’ADN est compacté en
chromosomes mitotiques qui se trouvent dans le cytoplasme.

45
Q

les protéines représente

A

la moitié de la masse moléculaire d’un
chromosome

46
Q

LES CHROMOSOMES MITOTIQUES role

A

Assurent la transmission
efficace des gènes aux cellules
filles lors de la division
 Structure stable
 Taille compacte
 Protection de l’information
plus importante

47
Q

La CHROMATINE c

A

est un ensemble d’ADN et de protéines associées.

48
Q

cki les proteine de la chromatine

A

-La majorité des protéines sont des histones (protéines de condensation).
 Les protéines non-histones incluent les protéines s’occupant de la
transcription, réplication, réparation et recombinaison de l’ADN

49
Q

chromatine fai koi de negative

A

elle diminue substantiellement l’accessibilité de
l’ADN pour les protéines. Heureusement, il est possible de moduler sa
structure au besoin.

50
Q

deu forme de chromatine

A

 Hétérochromatine : fibres condensées 30 nm
 Euchromatine : fibres étendues 10 nm
(régions actives)

51
Q

les histones contrôlen

A

le passage d’une forme à
l’autre, via des
complexes remodelants

52
Q

ckoi le premier niveau de la condensation de l adn

A

n est l’organisation de l’ADN en
NUCLÉOSOME

53
Q

Le noyau du nucléosome H1 (core)
est constitué

A

de 8 histones.

54
Q

adn s enroule cmb de fois autour de chake noyau

A

L’ADN s’enroule 1,65 fois autour
de chaque noyau et cela
représente ~147 pb

55
Q

L’ADN reliant 2 noyaux mesure et nom

A

L’ADN reliant 2 noyaux mesure
entre 20 et 60 pb et est appelé
intercalaire (linker).

56
Q

cmt est l iNTÉRIEUR DU NOYAU DU NUCLÉOSOME :

A

 H2A (2/nucléosome)
 H2B (2/nucléosome)
 H3 (2/nucléosome)
 H4 (2/nucléosome)
===octamere

57
Q

cmt es l’EXTÉRIEUR DU NOYAU DU NUCLÉOSOME :

A

H1 (1/nucléosome)
e

58
Q

L’affinité des histones pour l’ADN es

A

très grande et non spécifique à la
séquence de bases

59
Q

Les histones contiennent cmb d acide aminer et leskel

A

un haut pourcentage (20%) d’acides aminés
lysines et arginines (chargées +)

60
Q

avec ki les histone interagisse

A

Elles interagissent avec la charpente
d’ADN (chargée -)

61
Q

les histone interagisse avec l adn a kel nivo et prk

A

au niveau du sillon mineur
car :
1-indep de la seq
2-+facile a courber au niveau du sillon mineur
3-aime region riche en A-T et

62
Q

La liaison des histones à l’ADN fai koi

A

déforme la double hélice et la replie
autour du noyau d’histones.

63
Q

de kel histone le noyau du nucleosome est formé

A

Le noyau est formé de
2 dimères H2A-H2B et d’un
tétramère H3-H4 pour un
total de 8 histones (2 de
chaque type).

64
Q

Les dimères et les tétramères
s’assemblent uniquemen kan

A

en presence d adn
donc Le noyau du nucléosome peut s’agencer seulement en présence d’ADN.

65
Q

Les queues N-terminales
des histones se retrouvent ou

A

vers l’extérieur du
nucléosome

66
Q

cmt se fait l assemblage du nucleosome

A

1-Le tétramère H3-H4 se lie à l’ADN en premier. Il induit une courbure dans l’ADN et l’enroule.
2-Les deux dimères H2A-H2B se joignent
ensuite au complexe et le stabilisent.

67
Q

cmb ya de pt de contact adn-histone a l int du nucleosome

A

13

68
Q

pt de contact adn histone represente koi

A

un pour chaque
fois que le sillon mineur fait face au noyau

69
Q

cmb ya de lien d hydrogene ds l assemblage du nucleosome

A

~40 liens hydrogènes
sont formés, la plupart
impliquant les «O» de la
charpente de l’ADN

70
Q

queu N term role

A

-Les queues N-terminales
maintiennent l’ADN enroulé.
-Elles émergent à des
positions spécifiques et
permettent des
interactions entre les
nucléosomes

71
Q

avec kel type de region d adn les histone interagisse

A

Interaction des histones avec des
régions spécifiques de l’ADN
(mais indépendant de la séquence!)

72
Q

c leskel les Sites importants de
modifications posttraductionnelle

A
  • Phosphorylation (P)
  • Acétylation (Ac)
  • Méthylation (Me)
73
Q

kel est la position des queu d histone

A

 Les queues des H2B et H3 émergent entre les 2 brins d’ADN, où 2 sillons
mineurs se font face, créant une brèche juste assez grande pour la chaîne
peptidique.

 Les queues des H4 et H2A émergent en haut et en bas de deux hélices.

Les queues forment plusieurs des liaisons H entre l’ADN et les histones.

74
Q

position des nucleosome et prk

A

la plupart des nucléosomes ne sont pas fixés à leur emplacement

a cause
Du fait de leurs interactions dynamiques et non spécifiques d’une
séquence particulière

75
Q

LIAISON DE L’ADN À DES PROTÉINES NON-HISTONE negative effects

A

 Inhibition de positionnement : compétition entre les protéines non-histones et le nucléosome (histones). Inhibe la formation d’un futur nucléosome.

76
Q

LIAISON DE L’ADN À DES PROTÉINES NON-HISTON effet positive

A

Assemblage préférentiel : interaction entre les protéines non-histones et les
nucléosomes existants (histones).
Stabilise les nucléosomes et/ou permet
l’assemblage d’un nouveau nucléosome

77
Q

sequence riche en A-T a koi

A

plus d affinité

78
Q

tendance des seq riche en A-T

A

ont tendance à se courber naturellement au niveau du sillon mineur.
Chaque nucléosome essaie donc de maximiser sa localisation sur des
séquences riches en A:T au niveau du sillon mineu

79
Q

seq A-T sont eessentiel au nuclosome

A

Mais, ces séquences ne
sont pas essentielles au
nucléosome

80
Q

de cmb compactation de celluule eucaryote

A

L’assemblage de l’ADN en nucléosomes permet une certaine compaction.
Cependant, la cellule eucaryote nécessite une compaction encore plus
grande, d’un facteur de 1 000 à 10 000 !

81
Q

euchromatine structure (histone-effet-pb)

A

1-L’histone H1 interagit avec l’ADN intercalaire entre les nucléosomes et avec une partie de l’ADN autour du
nucléosome

2-Cela a pour effet de resserrer les nucléosomes
entre eux et d’enrouler 20 pb de plu

82
Q

fixation H1 role

A

La fixation de H1 donne un
angle mieux défini pour l’entrée
et la sortie de l’ADN du
nucléosome.

83
Q

heterochromatine- queu histone forme koi et prk

A

les queues-N des histones des
nucléosomes adjacents forment de nombreuses interactions.

Cela permet aux nucléosomes de se rapprocher ensemble davantage, puis former une structure en hélice.

84
Q

cite les deu modele heterochromatine possible

A

Modèle solénoïde (a-b) : caractérisé par l’interaction entre le nucléosome et son
voisin immédiat.

Modèle en zigzag (c-d) : hélice « à deux débuts » qui oblige l’interaction entre un
nucléosome et le 2e suivan

85
Q

organisation heterochromatine

A

, l’hétérochromatine peut s’organiser en boucles (DNA loops) de
40-90 kb. La structure exacte demeure inconnue,

86
Q

base des boucle de heterochromatine

A

a base de chaque
boucle est retenue par des agrégats protéiques appelés “nuclear scaffold”
(échafaudage nucléaire).

87
Q

cki les proteine d echauffage nucleaire

A

les topoisomérases II : maintien de la
structure et s’assurent que les boucles
demeurent séparées l’une de l’autre.
* les protéines SMC :
participent au maintien

88
Q

commen on pe trouver les proteine d adn

A

Les protéines liant une séquence spécifique de l’ADN ne peuvent la trouver que si cette section est déroulée/décondensé

89
Q

pr avoir acces a l adn La chromatine doit

A

constamment remodelée pour
permettre la réplication, la réparation, la
transcription, etc

90
Q

le remodlage de la chromatine est controler par koi

A

-Les complexes remodelants de la chromatine (ATP-dépendants)
* Le complexe de modifications post-traductionnelles des queues
d’histones

91
Q

par ki son recruté les complexe remodelant de la chromatine

A

les facteurs de transcription
les queues N-terminales des histones

92
Q

Les complexe remodelant de la chromatine on besoin de koi

A

Ils ont besoin de l’ATP pour fonctionner.
L’énergie est utilisée pour permettre une
redistribution des liens entre l’ADN et les histones

93
Q

Les nucléosomes sont tenus par des
liens

A

non-covalents (surtout liens H)

94
Q

les type de lieb des nucleosome permette koi

A

 Ils peuvent être “transférés” vers
un autre brin
 L’ADN peut déroulé légèrement
par “glissement”

95
Q

plus le site rechercher est ver le centre du nucleosome

A

En règle générale, plus le site recherché se trouve vers le centre du
nucleosome, moins il sera accessible fréquemment

96
Q

Il existe quatre grandes sousfamilles de complexes remodelants leskel

A

SW1/SNF : switch/sucrose
non- fermentable
* ISW1 : imitation switch (ISWI)
* CHD : chromodomain helicase
DNA-binding.
* INO80 : inositol requiring 80

97
Q

les complexe remodelan de l adn permette koi

A

Tous permettent le
glissement,

98
Q

SW1/SNF permet koi

A

est connu pour permettre le transfert et
l’éjection des nucléosomes

99
Q

Les complexes INO80

A

permettent l’échange
d’histone

100
Q

ckoi COMPLEXES DE MODIFICATIONS POST-TRADUCTIONNELLES DES QUEUES
D’HISTONE

A

La portion N-terminale de chacune des histones sort du nucléosome et
est accessible pour être modifiée

101
Q

cmt on modifi la queu des histone

A

par trois enzyme:
 Ajout d’un groupement acétyl (COCH3)(acetyltransferases)
 Ajout d’un gr. méthyle (CH3) sur une arginine ou une lysine
(méthyltransferases)
 Ajout d’un phosphate sur une serine (kinases

102
Q

L’ajout du CH3 provoque une

A

répression de la transcription. La queue méthylée recrute des protéines responsables de la formation d’hétérochromatine

103
Q

L’ajout d’acetyl ou du P

A

neutralise la charge (+) de l’histone et elle interagit moins bien avec l’ADN → l’ADN peut être déroulé plus facilement

104
Q

epigenetic

A
105
Q

ckoi les variante d histone

A

Séquence protéique diffère de celle des histones conventionnelles sur
quelques résidus, mais cela modifie grandement leurs propriétés !

Les variants sont spécifiques à certaines espèces, types cellulaires ou
phases cellulaires

106
Q

position des variante dhistone

A

Ils sont positionnés de manière spécifique à la séquence et régulent ainsi la
transcription.

biomol (3 decks)

Brainscape helps you reach your goals faster, through stronger study habits.
© 2024 Bold Learning Solutions. Terms and Conditions