Coronavirus Flashcards
Quels sont les 3 coronavirus pathogéniques pour l’humain et ayant causé des épidémies majeures dans les dernières 20 années?
- SARS
- COVID-19
- MERS
- Quel est l’hôte intermédiaire pour SARS-CoV-1 et MERS-CoV?
Dromadaires (MERS)
Civettes (SARS)
Le virus causant la COVID-19 est très proche de quel autre coronavirus, du point de vue de la séquence? (phylogénétique)
SARS
- Génome : ARN ou ADN?
ARN
- Virus enveloppé ou non?
Enveloppé
- Rôle de la protéine S?
La protéine S est posée sur la surface du virus comme une couronne. Elle est essentielle pour
la pénétration du virus dans l’hôte (INTERNET mais logique)
- RdRp : enzyme ou protéine structurale?
C’est une polymérase qui copie l’ARN viral pour sa réplication (enzyme)
- Quelles sont les 4 principales protéines de structure?
1) M (protéines de membrane)
2) S (protéine spike)
3) E (protéine d’enveloppe)
4) N (protéine nucléocapside enveloppant ARN)
- Quelle espèce animale constitue le principal réservoir pour les coronavirus pathogéniques pour l’humain?
La chauve-souris
- Quel fluide corporel permet aux coronavirus d’être transmis d’une personne à une autre ou d’une espèce animale à une autre?
La salive et les écoulements nasaux (gouttelettes/aérosols)
- En date de février 2023, combien y a-t-il eu de cas confirmés de la COVID-19 dans le monde?
Plus de 600 millions
- En date de février 2023, combien de personnes sont décédées de la COVID-19 dans le monde, officiellement (cas confirmés)?
6 millions
- Pourquoi le compte officiel de décès associés à COVID-19 est-il sous-estimé?
Parce que les cas ne sont pas tous rapportés (auto-dépistage et auto-diagnostic)
Dans certains pays, les données ne sont pas disponibles
- Comment peut-on avoir un estimé plus exact du nombre de décès causés par COVID-19?
Regarder l’excès de mortalité
- Quand COVID-19 a-t-elle été déclarée une pandémie?
Mars 2020
Quel est le taux de reproduction R0 estimé pour les variants récents de la COVID-19, BA4 et BA5 ?
Entre 15 et 20
Quel était le taux approximatif de mortalité causée par COVID-19 estimé initialement (printemps 2020), et quelle est l’estimation actuelle?
Était : 3 à 6%
Maintenant : 0,5 à 2%
- Principaux facteurs de risque pour le décès causé par COVID-19?
- L’âge
- Obésité
- Maladies cardiovasculaires
- MPOC
- Diabète
- Cancers
- Certaines formes d’immunodéficience
Pourquoi la vague Omicron à l’hiver 2021-2022 a-t-elle été moins létale que les vagues précédentes?
Puisque le variant Omicron est moins pathogénique et a un taux plus faible d’infection des
poumons
La Chine a abandonné sa politique de confinement drastique des personnes infectées. La vague d’infection qui a suivi a atteint son pic à quel moment environ?
décembre 2022
pic le 20 janvier 2023
Quels sont les 3 symptômes les plus fréquents (NB la perte d’odorat n’était pas connue au moment de la préparation de ce PowerPoint, donc ne pas en tenir compte)
- Fièvre (83%)
- Toux (82%)
- Difficultés respiratoires (32%)
- Que signifie « hypoxémie »?
Diminution de la concentration d’O2 sanguin
- Quelle est la complication la plus sérieuse et menant au décès?
Syndrome de détresse respiratoire aigue (SDRA)
- Quel est le temps moyen écoulé entre les premiers symptômes et le décès?
14 jours …
- Comment s’appelle le récepteur du virus?
ACE2
- L’inflammation est une composante importante de la maladie? Oui/non
Oui, puisque dans la plupart des cas, la progression vers le stade de SDRA est associé à de
fortes concentrations de cytokines et de chimiokines pro-inflammatoires
- Il y a présence anormale de fluides dans les poumons? Oui/non
Oui
* Les alvéoles pulmonaires sont envahis de cellules immunitaires et ils sont fréquemment encombrés de débris cellulaires.
* Il y a des œdèmes autour des vaisseaux sanguins du parenchyme pulmonaire.
- Quel mécanisme moléculaire est à la base de l’évolution?
Mutation
- La mutation D614G est maintenant présente dans quel % des souches du virus, approximativement?
90% presque toutes
- La mutation D614G concerne quelle protéine du virus?
La protéine S
- La mutation D614G est apparue de multiples fois de façon indépendante, alors que d’autres
variants sont semble-t-il apparus une seule fois avant de se propager. Quelle pourrait être la raison pour laquelle la mutation D614G apparaissait avec plus de facilité?
C’est une simple mutation d’un acide aminés. Donc se fait très facilement
À quel moment le variant Delta est-il devenu très majoritaire au Canada, parmi les nouveaux cas?
À l’été 2021
Vague Omicron de décembre 2021-janvier 2022 au Canada : comment se compare-t-elle à la première vague du printemps 2020?
Elle se propage plus rapidement
Combien de mutations ce variant porte-t-il dans la protéine S, comparé aux souches « ancestrales » de 2020?
32
- Depuis la vague Omicron, devrait-on continuer d’administrer aux patients les anticorps monoclonaux de la compagnie Regeneron?
Non, c’est inefficace
- Pourquoi Omicron est-il moins pathogénique que les variants précédents?
Puisqu’il infecte moins les voies respiratoires inférieures, donc les poumons sont moins
touchés et moins inflammés.
- Par quel mécanisme le variant XBB est-il apparu?
Par recombinaison
Traitements
- Que signifie « repositionnement » de molécules pharmacologiques?
Utilisation de molécules développées, et parfois approuvées, pour d’autres indications.
- Quels sont les avantages du repositionnement?
Les propriétés pharmacocinétiques et pharmacodynamiques sont connues. Les effets indésirables sont connus.
Les dosages vs effets indésirables sont optimisés.
Les études de Phase I peuvent être évitées complètement.
L’approbation sera obtenue beaucoup plus rapidement.
- Remdesivir et molnupiravir inhibent quelle protéine virale?
La polymérase
- Les cocktails d’anticorps monoclonaux de Regeneron sont-ils purifiés à partir du sang des patients et injectés tels quels?
Anticorps monoclonaux recombinants produits dans cellules humaines, purifiés et testés in vitro chez l’animal puis chez l’humain
- Pouvez-vous expliquer en une phrase ce qu’est le mécanisme de neutralisation d’un virus par des anticorps?
Les sites variables des anticorps se fixent sur les protéines S, ce qui empêche les virus se rentrer.
Les cocktails d’anticorps monoclonaux sont-ils administrés oralement, par injection, ou par inhalation?
Par injection
- Les cocktails d’anticorps monoclonaux ciblent quelle protéine virale?
La protéine S
- À quels patients COVID est-il préférable d’administrer la dexaméthasone?
Les patients qui présentent des complications plus sévères.
- Quelle est la différence essentielle entre molnupiravir et remdesivir?
Leur mode d’administration Remsedivir = injectable Molnupiravir = oral
Pourquoi les molécules ciblant le virus n’offrent-elles généralement pas de bénéfices chez les patients déjà hospitalisés?
Puisqu’ils sont utilisés en stade précoce, pour inhiber le virus. Les patients étant à l’hôpital ont déjà développé les complications. L’antiviral n’est donc pas utile puisqu’il est utile en prévention de ces complications et non pour les soigner.
- Quelles sont les deux molécules qui constituent le Paxlovid?
Nirmatrelvir et Ritonavir
- Quel est le rôle du ritonavir dans ce médicament?
Il sert d’inhibiteur à la dégradation du Nirmatrelvir afin de maintenir sa concentration
- Comment est administré le Paxlovid?
Oralement
- Quel est le rôle de l’enzyme virale ciblée par le Paxlovid?
La protéine non structurale 5 (Nsp5) du coronavirus est une protéase à cystéine nécessaire à la transformation de la polyprotéine virale et donc cruciale pour la réplication virale. (INTERNET)
- La dexaméthasone appartient à quelle famille de molécules?
Corticostéroïde
Pourquoi les vaccins constitués d’une protéine virale purifiée sont-ils appelés « sous- unité »?
Les vaccins à sous-unités protéiques contiennent des fragments (protéines) inoffensifs et purifiés du virus qui ont été choisis précisément pour leur capacité de déclencher une réponse immunitaire. (INTERNET, gouvernement du Canada)
- Comment les vaccins à ARNm sont-ils délivrés?
Par injection intramusculaire
l’ARNm est transporté dans particules de liposomes
- Comment inactive-t-on le virus SARS-CoV-2 pour produire du vaccin inactivé?
1) amplification
2) inactivation par beta-propiolactone
Pour les différents vaccins, on cherche à provoquer la production d’anticorps dirigés contre quelle protéine virale?
La protéine S
- Quels sont les principaux problèmes des vaccins existants contre COVID-19?
Les doses de rappel sont moins efficaces parce que notre système immunitaire se souvient de la première souche (1er vaccin) qui n’est plus pareille. Il favorise donc la production d’anticorps qui sont moins effi
- Les vaccins ont-ils sauvé un nombre appréciable de vies humaines pendant la pandémie?
Oui, ils ont significativement diminué le risque d’hospitalisation et de décès
- Quels sont les arguments en faveur de l’annualisation des campagnes vaccinales pour COVID?
1) Le virus évolue rapidement, permettrait d’avoir une souche adaptée à chaque année 2) plus facile à planifier
3) Meilleure acceptance du public
- Quels sont les bénéfices espérés des vaccins intranasaux?
1) Déclenche une réponse immunitaire localisée plus rapide 2) protège contre les complications et contre les symptômes 3) Neutralisation rapide, donc diminution de la transmission 4) inclus IgA
Prévention, mesures en santé publique
- Quel type de masque est le plus efficace?
N95
Quel type de produit peut-on utiliser pour désinfecter des surfaces potentiellement contaminées par du SARS-CoV-2?
Tous savon ou produit de nettoyage est suffisant
- Par quel mécanisme la ventilation diminue-t-elle les risques d’être infecté?
Diminue la concentration gouttelettes du virus dans l’air et permet la dispersion plus rapide.
Dans une étude concernant des écoles, quelles mesures diminuaient le risque que les écoliers soient infectés?
1) port du masque par les professeurs
2) Interdiction de se présenter en cas de symptômes
3) annulation des activités extrascolaires
- Quelles mesures aboutissaient au contraire à une augmentation du risque?
1) barrière de plexiglas entre les bureaux 2) fermeture de la cour de récré
