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Control transcripcional: factores de transcripción Flashcards

1
Q

¿Qué son los factores de transcripción?

A

Proteínas reguladoras de la expresión de genes

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Q

¿Cómo afectan los factores de transcripción a la transcripción?

A

Estimulan o inhiben la transcripción

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3
Q

¿Qué es la amplificación de la señal en el contexto de los factores de transcripción?

A

Cuando un FT se une a la región reguladora al mismo tiempo puede activar otros sitios

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4
Q

¿Cuáles son las características estructurales comunes de las proteínas activadoras y represoras?

A

Dominios o aminoácidos que configuran estructuras específicas

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Q

¿Qué tipo de aminoácidos poseen las proteínas que interactúan con el ADN?

A

Aminoácidos básicos (positivo)

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6
Q

¿Qué motivos estructurales tienen las proteínas reguladoras de la expresión de genes?

A
  • Hélice-vuelta-hélice (homeodominio)
  • Hélice-bucle-hélice
  • Motivo de cierres de leucina
  • Motivo de dedos de zinc
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7
Q

¿Qué es un coactivador en el contexto de la transcripción?

A

Se une a la caja de regulación positiva y recluta TF-Il

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8
Q

¿Qué papel juega la concentración de factores de transcripción?

A

Depende del estado de la célula y señales del exterior

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9
Q

¿Cómo pueden actuar las proteínas represoras?

A
  • Compitiendo por el sitio de enlace
  • Enmascarando el sitio de activación
  • Interactuando con el factor general de transcripción (TBP)
  • Reclutando CRC para condensar la cromatina
  • Reclutando desacetilasas específicas de histonas
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10
Q

¿Qué es la caja TATA?

A

Promotor donde se unen los FT generales

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11
Q

¿Qué es un amplificador en el contexto de la transcripción?

A

Puede estar en diversas regiones del nucleosoma o alejado de este

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12
Q

¿Qué permite que la transcripción se lleve a cabo en ADN compacto?

A

Las proteínas activadoras permiten descompactar y volver a compactar el ADN

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13
Q

¿Qué influye en la transcripción de un gen?

A

La afinidad de los factores de transcripción a una secuencia específica del ADN

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14
Q

¿Qué son los factores de transcripción (FT)?

A

Son proteínas que aumentan la tasa de transcripción de genes virales y promueven la replicación viral rápida.

Los FT, promotores y OR de los virus pueden incrementar significativamente la cantidad de copias de ARN mensajero.

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15
Q

¿Qué es un elemento de respuesta?

A

Es una secuencia específica de desoxirribonucleótidos organizada por estructuras palíndromes que activa y controla la transcripción en respuesta a ligandos.

Se ubica en la región promotora y se activa al unirse un receptor a un ligando.

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16
Q

¿Dónde se localizan los elementos de respuesta en el ADN?

A

En la región promotora del ADN.

Se activan cuando hay un receptor que reconoce ADN y una zona reconocida por un ligando.

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17
Q

¿Qué tipos de factores pueden activar los elementos de respuesta?

A

Hormonas, proteínas especializadas, metabolitos, etc.

También pueden ser activados por secuencias potenciadoras como amplificadores y silenciadores.

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18
Q

¿Qué es un potenciador en el contexto de la transcripción?

A

Una secuencia que puede amplificar o silenciar la expresión de un gen.

Los potenciadores pueden llevar la transcripción por encima del nivel basal.

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19
Q

¿Cómo funcionan los silenciadores en la transcripción?

A

Pueden retrasar el nivel de transcripción 100 veces o más.

Actúan disminuyendo la cantidad de ARN mensajero producido.

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20
Q

¿Qué sucede cuando un receptor de hormona se une a un elemento de respuesta sin ligando?

A

Recluta a un correpresor que bloquea la ARN pol II y no hay transcripción.

Esto impide la activación del gen hasta que el ligando esté presente.

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21
Q

¿Qué ocurre cuando la hormona tiroidea está presente?

A

Se une a su receptor y recluta a un mediador que activa los factores transcripcionales necesarios para la transcripción.

Esto permite la producción de ARN mensajero.

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22
Q

¿Cómo interactúan los factores de transcripción con el ADN?

A

Reconocen patrones de donadores y aceptores de puentes de hidrógeno en el surco mayor del ADN.

La interacción se facilita por grupos aceptores de hidrógeno en el surco mayor.

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23
Q

¿Cuál es el dominio de unión del ADN en los factores de transcripción?

A

Es una región que interactúa específicamente con el ADN, principalmente en el surco mayor.

Incluye estructuras como hélice-vuelta-hélice (HTH) que proporcionan flexibilidad.

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24
Q

¿Qué son los heterodímeros en el contexto de los factores de transcripción?

A

Son complejos formados por dos hélices simétricas que regulan la producción de ARNm a partir de un mismo gen.

Pueden generar activación en diferentes zonas, amplificando la respuesta.

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25
¿Qué es un operón?
Es un segmento de ADN que pasa por un proceso de transcripción y agrupa genes regulados por los mismos mecanismos de control. ## Footnote Un operón genera un solo ARN mensajero que codifica múltiples proteínas.
26
¿Qué ejemplos se mencionan de represores en la transcripción?
Represor Lac, represor P434, cro P434, y represor trp. ## Footnote Estos son ejemplos de proteínas que regulan la expresión génica.
27
¿Qué son los factores de transcripción (FT)?
Son proteínas que aumentan la tasa de transcripción de genes virales y promueven la replicación viral rápida. ## Footnote Los FT, promotores y OR de los virus pueden incrementar significativamente la cantidad de copias de ARN mensajero.
28
¿Qué es un elemento de respuesta?
Es una secuencia específica de desoxirribonucleótidos organizada por estructuras palíndromes que activa y controla la transcripción en respuesta a ligandos. ## Footnote Se ubica en la región promotora y se activa al unirse un receptor a un ligando.
29
¿Dónde se localizan los elementos de respuesta en el ADN?
En la región promotora del ADN. ## Footnote Se activan cuando hay un receptor que reconoce ADN y una zona reconocida por un ligando.
30
¿Qué tipos de factores pueden activar los elementos de respuesta?
Hormonas, proteínas especializadas, metabolitos, etc. ## Footnote También pueden ser activados por secuencias potenciadoras como amplificadores y silenciadores.
31
¿Qué es un potenciador en el contexto de la transcripción?
Una secuencia que puede amplificar o silenciar la expresión de un gen. ## Footnote Los potenciadores pueden llevar la transcripción por encima del nivel basal.
32
¿Cómo funcionan los silenciadores en la transcripción?
Pueden retrasar el nivel de transcripción 100 veces o más. ## Footnote Actúan disminuyendo la cantidad de ARN mensajero producido.
33
¿Qué sucede cuando un receptor de hormona se une a un elemento de respuesta sin ligando?
Recluta a un correpresor que bloquea la ARN pol II y no hay transcripción. ## Footnote Esto impide la activación del gen hasta que el ligando esté presente.
34
¿Qué ocurre cuando la hormona tiroidea está presente?
Se une a su receptor y recluta a un mediador que activa los factores transcripcionales necesarios para la transcripción. ## Footnote Esto permite la producción de ARN mensajero.
35
¿Cómo interactúan los factores de transcripción con el ADN?
Reconocen patrones de donadores y aceptores de puentes de hidrógeno en el surco mayor del ADN. ## Footnote La interacción se facilita por grupos aceptores de hidrógeno en el surco mayor.
36
¿Cuál es el dominio de unión del ADN en los factores de transcripción?
Es una región que interactúa específicamente con el ADN, principalmente en el surco mayor. ## Footnote Incluye estructuras como hélice-vuelta-hélice (HTH) que proporcionan flexibilidad.
37
¿Qué son los heterodímeros en el contexto de los factores de transcripción?
Son complejos formados por dos hélices simétricas que regulan la producción de ARNm a partir de un mismo gen. ## Footnote Pueden generar activación en diferentes zonas, amplificando la respuesta.
38
¿Qué es un operón?
Es un segmento de ADN que pasa por un proceso de transcripción y agrupa genes regulados por los mismos mecanismos de control. ## Footnote Un operón genera un solo ARN mensajero que codifica múltiples proteínas.
39
¿Qué ejemplos se mencionan de represores en la transcripción?
Represor Lac, represor P434, cro P434, y represor trp. ## Footnote Estos son ejemplos de proteínas que regulan la expresión génica.
40
¿Qué se activa para poder usar lactosa en ausencia de glucosa?
Se activa el proceso que permite el uso de lactosa.
41
¿Qué sucede cuando la lactosa se une a la proteína represora?
La proteína represora se desacopla, dejando libre el operador.
42
¿Qué se activa tras desacoplarse la proteína represora?
Se activa el proceso de transcripción.
43
¿Cuántas proteínas codifica el ARNm inducido por lactosa?
Tres proteínas: B-galactosidasa, permeasa, transacetilasa.
44
¿Cómo es la secuencia del operador en el contexto de la lactosa?
Es un palíndromo que permite la interacción con la proteína represora.
45
¿Qué son los dominios de unión al ADN HTH?
Son factores transcripcionales o represores.
46
¿Qué caracteriza al operón Trp?
Es constantemente activo y permite la síntesis de triptófano.
47
¿Qué papel juega el triptófano en el operón Trp?
Actúa como correpresor y se une a la proteína represora en altas concentraciones.
48
¿Qué ocurre cuando la proteína represora se une al ADN en el operón Trp?
Bloquea el sitio del operador, resultando en un operón de expresión reprensible.
49
¿Qué es la hélice-asa/búcle-hélice (H-B-H, H-L-H)?
Es una sección que conecta dos hélices en la estructura de proteínas.
50
¿Cuál es la secuencia consenso de ADN a la que se une el dominio básico?
CANNTG.
51
¿Cómo se clasifican las proteínas reguladoras en tres clases?
Clase A, Clase B, Clase C.
52
¿Qué caracteriza a las proteínas de Clase A?
Se expresan en la mayoría de los tejidos y promueven la transcripción de genes reguladores.
53
¿Qué hace el factor E12?
Promueve la diferenciación de linfocitos T y B en etapas tempranas.
54
¿Qué función tiene el dominio C-terminal de VPH?
Discrimina entre sitios de ADN para influir en la replicación y transcripción.
55
¿Qué son las proteínas de Clase B?
Son proteínas tejido-específicas.
56
¿Qué familia de proteínas actúa en la diferenciación miogénica?
Familia MRFs (MyoD, Myogenin, MRF4).
57
¿Qué caracteriza a las proteínas de Clase C?
Tienen un arreglo en tándem de motivos bHBH y regulan funciones vitales.
58
¿Qué es c-Myc?
Un protooncogen que actúa en la proliferación celular.
59
¿Qué regula TFE3?
La síntesis de la inmunoglobulina de cadena pesada.
60
¿Qué papel tienen los cierres de leucina?
Regulan funciones celulares vitales en momentos determinados.
61
¿Cuáles son las partes de la región de cierre de leucina?
Tallo y región básica.
62
¿Qué forman c-fos y c-jun?
El complejo factor de transcripción AP1.
63
¿Por qué son importantes c-fos y c-jun?
En la regulación del desarrollo.
64
¿Qué es el Tallo en el contexto de la biología molecular?
Región de cierre de leucina 460 - 80 residuos aminoácidos ricos en leucina que forman un núcleo hidrofóbico de una superhélice con 2 distintos subdominios.
65
¿Cuáles son los ejemplos de genes que forman el complejo factor de transcripción AP1?
c-fos, c-jun.
66
¿Qué papel tienen los factores de transcripción como c-fos y c-jun en el organismo?
Importantes en la regulación del desarrollo.
67
¿Qué consecuencias pueden tener los excesos o mutaciones de c-fos y c-jun?
Generan cáncer.
68
¿Qué requieren los dedos de zinc para su actividad de unión?
Zinc.
69
Describe la estructura de los dedos de zinc.
Átomo de zinc unido a residuos de cisteínas e histidinas distantes con una secuencia intermedia descrita como una asa (loop).
70
¿Cuántas asas helicoidales tiene cada dominio de los dedos de zinc?
2 asas helicoidales perpendiculares entre sí.
71
¿Cómo están organizados los dedos de zinc?
En series de 9 dominios repetidos que contienen 30 aminoácidos plegados en una unidad estructural simple alrededor de un átomo de Zn.
72
¿Qué hace un dominio transactivador?
Facilita que se recluten más factores para que se lleve a cabo la transcripción.
73
¿Qué función cumple un dominio regulable?
Une al ligando.
74
¿Qué tipo de secuencias son reconocidas por los motivos de unión al ADN en los dedos de zinc?
Secuencias palíndromes.
75
¿Cuáles son algunos ejemplos de receptores que contienen dedos de zinc?
* Receptores a estrógenos, progesterona, testosterona * Receptores a glucocorticoides (cortisona, hidrocortisona, dexametasona) * Receptores a ácido retinoico, tiroxina y Vitamina D.
76
Las zonas en contacto con dedos de zinc requieren _______.
[la unión de un ligando].
77
¿Qué porcentaje de casos de elementos de respuesta se activan por proteínas de unión al ADN con dedos de zinc?
90%.
78
Proporciona un ejemplo de secuencia reconocida por dedos de zinc.
ERE: AGGTCAhnn'TCACCT.
79
¿Cuál es la secuencia GRE reconocida por los dedos de zinc?
GRE: AGAACAnnnTGTTCT.
80
¿Qué significa TRE en el contexto de los dedos de zinc?
TRE: AGGTCATGACCT.
81
¿Qué es RARE en el contexto de los dedos de zinc?
RARE: AGGTCANNnnAGACCA.

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