Constituants chimiques Flashcards
Eau
- H,O
- Solvant, hydrolyse
Molécules organiques
- C, H, O, N, P, S
- Protéines, ADN, ARN, lipides, glucides
Ions
- Na, K, Mg, Ca, Cl
- Potentiel membranaire, régulation, activation
Éléments traces 1
- Mn, Fe, Co, Cu, Zn
- Cofacteurs enzymatiques
Éléments traces 2
- Se
- Composante de la sélénocystéine
Éléments restreints
- B, Al, V, Mo, I
- Chez certains organismes seulement
% d’eau ?
→ 75% du poids
La teneur en eau et l’activité
métabolique
L’activité métabolique des cellules est
presque toujours proportionnelle à
leur contenu en eau
L’eau est impliquée dans des
réactions chimiques…
- Hydrolyse
* Condensation
– La
cryptobiose
• État complètement arrêté du
métabolisme
Cas des formes de résistances de cryptobiose
Spores et kystes
Formes résistantes aux
mauvaises conditions
ds cryptobiose
• Cas des organismes primitifs = Tardigrades - Organismes capables de survivre à la dessiccation sans produire de structures résistantes
États de l’eau
Libre & lié
Eau libre
– Libres de ses mouvements
– Disponible comme solvant
Eau liée
– N’a plus sa liberté
– Peu ou pas disponible comme
solvant
(-> impliqué ds dissolution)
Structure tertiaire de l’ADN
- Molécule circulaire
* Molécule linéaire
Molécule circulaire de l’ADN
– Molécule dont les 2 extrémités sont jointes pour former une boucle continue. • ADN des Bactéries (procaryotes) • ADN plasmidique : se réplique indépendamment du génome. • ADN mitochondrial • ADN chloroplastique
Molécule linéaire
de l’ADN
– Double hélice s’enroule autour de
protéines basiques nommées histones
chez les eucaryotes.
Particularités de l’ARN
– Le ribose est le sucre de l’ARN
– L’uracile (U) remplace la thymine (T)
– Possibilité de former des structures en épingle
Structures secondaires de l’ARN
: formation
d’épingles et de boucles
Structure tertiaire de l’ARN
forme
finale de la molécule
(ressemble à la lettre L
inversée).
Classification de l’ARN
– ARN messager (ARNm)
– ARN de transfert (ARNt)
– ARN ribosomal (ARNr)
– ARN nucléaire hétérogène (ARNhn, ARN prémessager)
ARN messager (ARNm)
Molécule transcrit à partir d’un gène codant pour une protéine
ARN de transfert (ARNt)
Molécule servant d’adaptateur pour la traduction
ARN ribosomal (ARNr)
Molécule faisant partie de la structure d’un ribosome
ARN nucléaire hétérogène (ARNhn, ARN prémessager)
Transcrit primaire qui deviendra un ARNm après remodelage
maturation de l’ARNhn en ARNm
1. Modification des extrémités de l’ARN prémessager • Extrémité 5’ : addition d’une coiffe 7- méthylguanosine triphosphate • Extrémité 3’ : Addition d’une queue poly A 2. Épissage de l’ARN prémessager • Introns et exons de l’ARNm
Déf protéines
– Un polymère constitué d’un grand nombre
d’acides aminés unis par des liaison peptidiques
et replié dans un configuration 3D.
Acide aminé (a.a.) déf
Unité de base des protéines – Présente un groupement aminé (NH
2
) ou iminé
(NH) et un groupement carboxyle (COOH)
– Il existe 21 a.a. protéiques chez l’humain
Liaison peptidique déf
– Formée par les groupement COOH d’un a.a. et le groupement NH 2 (ou NH) d’un autre a.a .
Chaines latérales
- Le carbone α, qui lie le groupement COOH et
NH2, porte également un atome d’hydrogène et
un groupement variable (R) nommé chaîne
latérale
– Chaque a.a. possède une chaîne latérale qui lui
est spécifique
– Types : Polaires chargées, polaires non chargées,
non polaire
Forces stabilisant protéines tertaires
- Pont S-S
- Liaison ionique
- Liaison H
- Effet hydrophobe (molécules nn-polaires, forces de London)
Caractéristiques
lipides
– Famille très hétérogène
– Définis par leurs propriétés physiques
• Solubles dans les solvants des lipides
• Aspect et consistance (corps gras, visqueux)
Classification lipides
– Les triacylglycérols
– Les phosphoglycérolipides (phospholipides)
– Les glycolipides
– Les stéroïdes
Les glycolipides
• Structure qui ressemble à celles des phospholipides : 2 chaînes d’acides gras + une tête hydrophile
constituée d’un ou plusieurs sucres
• Molécules amphipathiques
• Constituants des membranes biologiques
Le cholestérol
• Comprend une structure plane (stéroïde) avec une queue d’hydrocarbure non polaire et une région
hydrophile constituée par un groupement OH.
• Constituant des membranes biologiques
Les triacylglycérols
Esters de 3 acides gras avec le glycérol.
=> par condensation
Les phosphoglycérolipides
phospholipides
• Esters de 2 acides gras avec le glycérol \+ un groupement phosphate portant un ammonium quaternaire (selon les phospholipides) • Molécules amphipathiques • Constituants des membranes biologiques
Les glycolipides
• Structure qui ressemble à celles des phospholipides : 2 chaînes d’acides gras + une tête hydrophile constituée d’un ou plusieurs sucres • Molécules amphipathiques • Ne dérivent pas du glycérol, mais plutôt de la sphingosine. • Ne possèdent pas de groupement phosphate. • Constituants des membranes biologiques
Les stéroïdes: fonction
• Signaux chimiques (hormones stéroïdes) • Constituant des membranes biologiques des cellules Eucaryotes animales. (cholestérol)
Le cholestérol
• Comprend une structure plane (stéroïde) avec une queue d’hydrocarbure non polaire et une région hydrophile constituée par un groupement OH. • Sert à la synthèse d’hormones • Sert à la synthèse de l’acide biliaire • Constituant des membranes biologiques
cortisol
Hormone des glandes surrénales
sécrétée lors d’un stress afin de
préparer le corps à affronter l’événement
oestradiol
Hormone sexuelle femelle
Définition glucides
– Polyalcools qui portent soit une fonction carbonyle
aldéhyde ou cétone
Monosaccharides
Type de glucides le plus simple
Oligosaccharides
Chaîne plus ou moins longue de monosaccharides liés
les uns aux autres
Polysaccharides
• Longue chaîne et complexe constitués de centaines de
monosaccharides
• Source d’énergie ou de réserve (ex.: glycogène, amidon)
Glycosaminoglycanes
• Longues chaînes polysaccharidiques non ramifiées
• Composées d’unités disaccharidiques répétées, l’un des
glucides est aminé
• Constituants de la matrice extracellulaire
Formation d’un disaccharide
Établissement d’une liaison glycosidique
entre deux monosaccharides
α glucides
- Amidon (amylose&amylopectine)
- Glycogène
β glucides
- Cellulose
- chitine
Les glycosaminoglycanes de la
matrice extracellulaire
• Longues chaînes polysaccharidiques non ramifiées • Composées d’unités disaccharidiques répétées, l’un des glucides est aminé (sucre – sucre aminé)n (constitué d’α et β -glucose) • Constituants de la matrice extracellulaire => 1 sucre= 1 a.a