Conformazioni multiple del DNA

Question 1

In base agli studi diffrattometrici, quali sono le possibili forme del DNA?

Answer 1

DNA A, B, Z

Question 2

Da cosa differiscono le tre forme del DNA?

Answer 2

Dipende da condizioni ambientali, legame con proteine e tipo di sequenza che modificano morfologia, avvolgimento e solco.

Question 3

Quali sono le caratteristiche d’elica del DNA B?

Answer 3

Più lungo e sottile, dx, 10 bp per giro, basi perpendicolari all’asse centrale, solco maggiore: ampio e profondo, solco minore: stretto e medio, conformazione legame glicosidico: anti

Question 4

Quali sono le caratteristiche generali del DNA B?

Answer 4

Rappresenta il modello di Watson e Crick. Umidità : 92%. Angolo Tilt, l’inclinazione tra le basi

Question 5

Quali altri angoli, oltre Tilt, descrivono le alterazioni al parallelismo fra le coppie di basi?

Answer 5

Twist: Scivolamento basi una sulle altre
Roll: Rotazione bp attorno all’asse

Question 6

Quali sono le caratteristiche d’elica del DNA A?

Answer 6

Corto e spesso, dx, 11 bp per giro, asse nel solco maggiore, solco maggiore stretto ma molto profondo, solco minore largo ma poco profondo, conformazione legame glicosidico anti

Question 7

Quali sono le caratteristiche generali del DNA A?

Answer 7

Umidità: 75%
- Ibridi DNA-RNA (Primer o inizio trascrizione)
- Complessi pt-DNA
- Presenza OH in C2 dello zucchero

Question 8

Quali sono le caratteristiche d’elica del DNA Z?

Answer 8

Allungato e sottile, sx, 12 bp per giro, asse nel solco minore, solco maggiore appiattito e posto sulla superficie d’elica, solco minore stretto e profondo, conformazione legame glicosidico: anti per Citosina e sin per Guanina (interferenze steriche zucchero e gruppo carbonilico C2)

Question 9

Quali sono le caratteristiche generali del DNA Z?

Answer 9

• Umidità: dipende quantità purine e pirimidine
• Andamento zig-zag per il solco singolo dato dagli scheletri zucchero fosfato
• Condizioni di alta salinità o alcol
• Metilazione cisteine, stabilizzazione Dna (B e Z), estrusioni basi azotate
• Regioni di regolazione DNA

Question 10

A cosa sono dovute le strutture secondarie insolite?

Answer 10

• Basi che non si appaiono per brevi tratti
• Appaiamento basi diverso da Watson e Crick

Question 11

Quali sono le strutture secondarie insolite?

Answer 11

Triplex, Cruciforme, G-Quadruplex

Question 12

Quali sono le caratteristiche della struttura triplex?

Answer 12

Sono punti deboli del genoma. Costituito da tre filamenti intrecciati, ricche di G e C interagendo con 2 legami H

Question 13

Quali sono le caratteristiche delle strutture cruciforme?

Answer 13

Sono sequenze palindromiche, ricche di A e T, legami H tra basi complementari dello stesso filamento

Question 14

Quali sono le caratteristiche delle G-Quadruplex?

Answer 14

• 4 filamenti ricchi di guanine
• Presenti in Telomeri e protooncogeni
• Presenza favorita da cationi monovalenti

Question 15

Qual è il significato biologico delle G-Quadruplex?

Answer 15

• Funzione protettiva
• ON/OFF espressione genica
• Blocco replicazione DNA
• Controllo lunghezza telomeri