Compartiment cellulaire 1 - cours 7 Flashcards

1
Q

La cellule eucaryote possède plusieurs compartiments délimités par quoi?

A

Par des membranes

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2
Q

La synthèse protéique (traduction) commence où?

A

Toujours dans le cytoplasme

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3
Q

Après la traduction dans le cytoplasme, que doivent faire les protéines?

A

Elles doivent trouver leur chemin vers leur «lieu de travail».

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4
Q

Que peuvent franchir les protéines pour aller vers leur «lieu de travail» (3)?

A

-Un pore formé d’un gros complexe protéique (CPN)
-Une membrane (RER, peroxysome)
-Deux membranes (mitochondries et chloroplastes)

*Certaines protéines doivent sortir de la cellule (voie de sécrétion)

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5
Q

Qu’est-ce qu’il faut pour organiser les protéines dans la cellule (3)?

A

-L’énergie (transport actif)
-L’étiquette (peptide signal et parfois sucre)
-Destination (récepteur)

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6
Q

Comment les organites diffèrent? Sur quoi ça impact?

A

Ils diffèrent dans le nombre de membranes qui les entourent et cela impacte sur le type de mécanisme de passage des protéines vers ces organites.

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7
Q

Vers quel organite (à partir du cytosol), les protéines doivent-elles passer par un pore? Le passage est-il réversible (se fait dans les deux sens)?

A

Du cytosol <—> noyau

*Passage réversible

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8
Q

Vers quels organites (à partir du cytosol), les protéines doivent-elles passer par deux membranes? Le passage est-il réversible (se fait dans les deux sens)?

A

Cytosol —> mitochondrie
Cytosol —> chloroplaste

*Passage irréversible

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9
Q

Vers quels organites (à partir du cytosol), les protéines doivent-elles passer par une membrane? Le passage est-il réversible (se fait dans les deux sens)?

A

Cytosol —> réticulum endoplasmique
Cytosol —> peroxysomes

*Passage irréversible

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10
Q

Entre quels organites, les protéines effectuent-elles du trafic vésiculaire (voie de sécrétion et endocytose)? Le passage est-il réversible (se fait dans les deux sens)?

A

Réticulum endoplasmique <—> appareil de golgi
Appareil de golgi —> surface de la cellule
—> vésicules de sécrétion
<—> endosome tardif
Endosome tardif —> lysosomes
Endosome précoce —> endosome tardif
Endosome précoce <—> surface de la cellule

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11
Q

De quoi est compose l’enveloppe nucléaire?

A

L’enveloppe nucléaire possède deux membranes et un espace intermembranaire (en continuité avec la lumière du RER).

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12
Q

Que permettent les pores nucléaires?

A

Les pores nucléaires permettent une continuité entre le nucléoplasme (intérieur du noyau) et le cytoplasme : les protéines autorisées peuvent passer de part et d’autre ( sous certaines conditions).

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13
Q

Comment s’est forme le noyau?

A

Une hypothèse sur la formation du noyau propose
l’invagination de la membrane plasmique
(cours 1). Cette même invagination aurait aussi donné naissance au réticulum endoplasmique.

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14
Q

Vrai ou faux : Le transport nucléaire est unidirectionnel à travers les pores nucléaires.

A

Faux : Le transport nucléaire est bidirectionnel à travers les pores nucléaires.

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15
Q

Que permet le centre protéique des pores nucléaires?

A

Cela permet de faire varier la taille de l’ouverture de la pore.

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16
Q

Comment fonctionne le transport nucléaire chez les petites vs grosses proteines?

A

-Les petites protéines de 9 nm de diamètre et moins (petites protéines) peuvent facilement passer (diffuser) à travers le pore, par diffusion simple (transport passif).

-Les plus grosses molécules de 9-40 nm de diamètre ( grosses protéines et sous-unités ribosomales) peuvent aussi passer par le pore, mais nécessitent de l’énergie (transport actif) pour agrandir davantage l’ouverture du pore

17
Q

Qu’est-ce qu’un signal d’importation? Que permet-il?

A

Un Signal de Localisation Nucléaire (SLN) est nécessaire pour entrer dans le noyau par le transport actif. Ce signal est un petit peptide caractérisé par une forte charge positive située quelque part dans la protéine (ex. KKKRK).
=signal d’importation

18
Q

Qu’est-ce qu’un signal d’exportation? Que permet-il?

A

Un Signal d’Exportation Nucléaire (SEN) est nécessaire pour sortir du noyau. Il s’agit d’une hélice αamphiphile comportant plusieurs résidus Leucine (la partie hydrophobe) (ex. LXLXXLXL).

19
Q

Qu’arrive-t-il lorsqu’un signal d’importation est muté?

A

La proteine reste dans le cytoplasme puisque le signal ne permet pas l’importation de cette dernière dans le noyau.

20
Q

Qu’y a-t-il pour chaque signal (SLN ou SEN)?

A

Pour chaque signal (SLN ou SEN), il y a un récepteur.

21
Q

Que sont les karyophérines?

A

Les karyophérines (karyion= noyau et pherein=porter) sont des récepteurs de signaux nucléaires

22
Q

Quels sont les rôles des karyophérines (3)?

A

Elles lient le SLN (karyophérines importines) ou le SEN (karyophérines exportines) et transportent les protéines à travers le pore nucléaire

23
Q

Une karyophérine possède deux sites de liaisons. Quels sont-ils?

A

Un pour le signal (SLN ou SEN), situé sur la protéine à importer ou exporter

Un pour la Ran-GTP (GTPase monomérique de la
famille Ras).

24
Q

Le complexe du pore nucléaire (CPN) est une _______ ________ construite à partir des __________.

A

Le complexe du pore nucléaire (CPN) est une structure modulaire construite à partir des nucléoporines (Nups).

25
Q

Quels sont les éléments qui font partis de la structure du pore (4)? Quels sont leur rôle?

A

Poms (Pore Membrane proteins, en bleu) : ancrent le CPN dans l’enveloppe nucléaire

Nups de liaison (Linker Nups, en vert) : relient les deux anneaux (rose et jaune)

Nups asymétriques : attachées aux deux anneaux (les filaments et le panier)

FG Nups (Phenylalanine-Glycine Rich repeat containing nups , en violet) : forment le canal central et interagissent avec les karyophérines.

26
Q

De quoi sont composées les FG Nups (nucléoporines)?

A

Phenylalanine-Glycine Rich repeat containing nups

27
Q

Qu’est-ce que la molécule RAN?

A

RAN est une protéine de type Ras.

Ran = Transport dans le noyau

28
Q

Combien de conformations les protéines RAS ont? Quelles sont-elles?

A

Toute protéine RAS a 2 conformations possibles, RAS-GTP et RAS-GDP.

29
Q

Que permet la structure RAS-GTP (2)?

A

La structure RAS-GTP interagit avec d’autres protéines (ici, avec les karyophérines) et a une activité de GTPase en présence de la protéine GAP.

30
Q

Qu’arrive-t-il avec le GDP qui résulte de l’hydrolyse de la RAS-GTP?

A

Le GDP qui résulte de l’hydrolyse est libérée à l’aide d’une autre protéine, une GEF (qui change le GDP pour un GTP).

31
Q

Quels sont les membres de la famille RAS (6)? Quels sont leur rôle à chacun?

A

EF-Tu, EF-G = Traduction
Ran = Transport dans le noyau
Rab, Arf, Sar = Transport vésiculaire

32
Q

Les importines (karyophérines d’importation) peuvent lier _______ et _______.

A

Les importines (karyophérines d’importation) peuvent lier Ran-GTP et SLN :

33
Q

Les deux liaisons que peuvent faire les importines (lier ran-GTP et SLN) sont mutuellement ________.

A

exclusives

34
Q

La cellule exploite la propriété des importines (liaisons exclusives) en favorisant la ________ dans le cytoplasme et ________ dans le noyau.

A

la Ran-GDP dans le cytoplasme et Ran-GTP dans le noyau.

35
Q

La proportion de Ran-GTP et Ran-GDP dépend de quoi?

A

a proportion de Ran-GTP et Ran-GDP dépend des activités de GAP (hydrolyse de GTP) et GEF (facteur d’échange).

36
Q

Vrai ou faux : Les exportines lient le signal SEN et Ran-GTP de façon exclusive (un ou l’autre).

A

FAUX, Les exportines lient le signal SEN et Ran-GTP en même temps

37
Q

Expliquer le fonctionnement des importines (5 étapes)

A

1-Une protéine ayant un signal de localisation nucléaire (SLN) se lie à l’importine

2-Le complexe importine-SLN passe du cytosol vers le noyau

3-L’importine relâche la protéine SLN dans le noyau et lie une molécule de Ran-GTP

4-Le complexe importine-Ran-GTP passe du noyau vers le cytosol

5-L’importine relâche la molécule de Ran-GTP (qui devient du Ran-GDP) et est disponible pour lier une nouvelle protéine SLN

38
Q

Expliquer le fonctionnement des exportines (5 étapes)

A

1-L’exportine passe du cytosol vers le noyau en ayant rien de lier à elle

2-L’exportine lie en même temps une protéine ayant un signal d’exportation nucléaire (SEN) et une molécule de Ran-GTP

3-Le complexe exportine-SEN-Ran-GTP passe du noyau vers le cytosol

4-L’exportine relâche la protéine SEN et la molécule de Ran-GTP (qui devient Ran-GDP)

5-L’exportine est disponible pour retraverser le cytosol pour aller dans le noyau et lier de nouvelles molécules

39
Q

Quelles sont les voies alternatives de transport (4)?

A

A ≡ Modèle de diffusion-rétention= voie passive, juste protéine qui passe
B ≡ Modèle du facteur de transport= Karyo et RAN-GTP
C ≡ Modèle de séquence signal = importine 16 & pas de RAN-GTP
D ≡ Modèle médié par la vésicule = indépendant du pore nucléaire