CNV classification criteria

Question 1

CNV che si sovrappongono a regioni associate a sindromi da microdelezioni/ microduplicazioni

Answer 1

PATOGENETICA

Question 2

CNV che si sovrappongono completamente ad una regione nota sensibile al dosaggio;

Answer 2

PATOGENETICA

Question 3

CNV con penetranza ed espressione ben documentate riportate in più pubblicazioni che descrivono pazienti con fenotipo sovrapponibile;

Answer 3

PATOGENETICA

Question 4

CNV multigeniche che includono almeno un gene sensibile al dosaggio, anche se gli altri geni hanno un significato incerto.

Answer 4

PATOGENETICA

Question 5

delezioni che coinvolgono l’estremità 5’ e i primi esoni di geni aploinsufficienti (HI);

Answer 5

PROBABILMENTE PATOGENETICA

Question 6

delezioni che coinvolgono più esoni all’interno di un gene HI;

Answer 6

PROBABILMENTE PATOGENETICA

Question 7

delezioni che coinvolgono gli esoni terminali e l’estremità 3’ di geni HI;

Answer 7

PROBABILMENTE PATOGENETICA

Question 8

delezioni o duplicazioni che coinvolgono geni con più casi riportati in letteratura che correlano con il fenotipo dei soggetti analizzati;

Answer 8

PROBABILMENTE PATOGENETICA

Question 9

CNV contenenti elementi regolatori noti e validati di geni malattia.

Answer 9

PROBABILMENTE PATOGENETICA

Question 10

CNV senza geni nell’intervallo genomico rilevato, di dimensione maggiore rispetto alla soglia stabilita dal laboratorio da indicare nell’informativa/referto;

Answer 10

VUS

Question 11

CNV descritta in un piccolo numero di casi nella popolazione generale, ma non ad una frequenza sufficientemente elevata da essere considerato un polimorfismo (>1%);

Answer 11

VUS

Question 12

CNV che contiene un piccolo numero di geni, ma non è noto se i geni nell’intervallo siano sensibili al dosaggio;

Answer 12

VUS

Question 13

CNV descritta in più pubblicazioni e/o database in modo contraddittorio, senza conclusioni definitive riguardo al significato clinico;

Answer 13

VUS

Question 14

CNV interna ad un singolo gene con un effetto poco chiaro sul frame di lettura della trascrizione.

Answer 14

VUS

Question 15

CNV comuni nella popolazione generale ma con una frequenza inferiore all’ 1%;

Answer 15

PROBABILMENTE BENIGNA

Question 16

CNV con una forte evidenza che ne esclude il coinvolgimento in malattie mendeliane, ma senza prove sufficienti per affermarlo definitivamente;

Answer 16

PROBABILMENTE BENIGNA

Question 17

CNV senza geni nell’intervallo genomico rilevato, di dimensione minore rispetto alla soglia stabilita dal laboratorio.

Answer 17

PROBABILMENTE BENIGNA

Question 18

CNV riscontrate nella popolazione generale con una frequenza pari o superiore all’ 1%;

Answer 18

BENIGNA