CM5 - Microbiologie médicale et infectiologie partie 2 Flashcards
ATB: Céfazoline
Nomme le spectre habituel et des exemples de bactéries non couvertes
Spectre habituel:
- S. aureus
- Streptococcus ß-hémolytiques
- qques entérobactéries dont (E. coli, Klebsiella, Proteus)
Exemple de bactéries non couvertes:
- Plupart des bactéries gram -
- SARM
- Pseudomonas aeruginosa
ATB: Céfazoline
- Catégorie?
- Per os OU IV?
- Usage fréquent?
- Céphalosporine de 1ère génération
- Seulement en IV
- Prophylaxie chirurgicale pour des cellulites de la peau (spectre: germe svt présent a/n de la peau)
ATB: Ceftriaxone
Donne le spectre habituel et des exemples de bactéries non couvertes
Spectre habituel:
1) Gram +:
- streptocoques
- Streptococcus ß hémolytiques
- Streptococcus viridans (majorité)
- Staphylococcus aureus (SASO)
2) Gram -:
- Entérobactéries
- N. gonorrhoeae
- N. meningitidis
- H. influenzae
Exemple de bactéries non couvertes:
- SARM
- Entérocoques
- Pseudomonas aeruginosa
Dis pour quels ATB le SARM est sensible/résistant (4)
Quel est le mécanisme de résistance de SARM?
Modification de la cible PBP: PBP est modifiée de manière à ce qu’elle ait une affinité réduite pour ces antibiotiques, ce qui les rend moins efficaces.
Nomme 2 ATB avec résistance aux ß-lactamase. Seront-ils effectives contre le SARM?
- cloxacilline/céfazoline
- Non, Puisque le mécanisme de résistance de SARM n’est pas une ß-lactamase
Nomme 2 ATB inhibiteurs de ß-lactamase. Seront-ils effectives contre le SARM?
- clavulanate/tazobactam
- Non, Puisque le mécanisme de résistance de SARM n’est pas une ß-lactamase
Quel ATB est le + svt utilisé pour SARM? Décris
- sa classe
- son mécanisme d’action
- ses voies d’administration
- Vancomycine
- Classe: Glycopeptide
- Mécanisme d’action Cell wall: Inhibition de la synthèse des peptidoglycanes (endroit différent des β -lactamines)
- Voies d’administration: IV et Orale (pas d’absorption systémique)
Si j’ai un SARM dans le sang, esq je donne de la Vancomycine en IV ou Orale?
IV pcq le orale n’a pas d’absorption systémique et ne va pas se rendre au sang
V ou F: La vancomycine agit au même endroit que la pénicilline
FAUX
ATB: Vancomycine
Décris le spectre habituel & des exemple de bactéries non couvertes
Spectre habituel:
- Cocci gram + dont le SARM
- Streptocoques
- Entérocoques (sauf ERV)
- bâtonnets Gram + (incluant C.diff)
Exemple de bactéries non couvertes:
- Bactéries gram –
- ERV
V ou F: Le spectre des vancomycine INCLUT activité contre Gram -
FAUX, Pas d’activité contre les Gram négatif
Nomme les effets secondaires de la vancomycine IV (3)
- Réaction liée à la perfusion
- Néphrotoxicité
- Leucopénie
Les effets sont relié à la vitesse d’infusion de ABT
ATB: Ciprofloxacine
- Classe
- Mécanisme d’action
- Administraiton
- Classe : Fluoroquinolones
- Mécanisme d’action: Inhibe la synthèse de
l’ADN (↓ DNA gyrase) - Administration : IV ou Oral (excellente
biodisponibilité)
on favorise tjr la voie oral si biodispo bonne
ATB: Ciprofloxacine
- spectre habituel
- exemple de bactéries non couvertes
Spectre habituel: Gram (-)
- Entérobactéries (E. coli, E. coli, Klebsiella, Proteus, Salmonella, Shigella, Yersinia)
- Campylobacter
- Pseudomonas aeruginosa**
Exemple de bactéries non couvertes: Anaérobes
Nomme le seul antibiotique oral qui peut traiter une infection à Pseudomonas aeruginosa
Ciprofloxacine
Une combinaison Vancomycine/Ciprofloxacine va avoir une bonne couverture de quelles bactéries?
Gram + et Gram -
Nomme les effets toxiques possible par le ciprofloxacine (5)
- Nausée, diarrhée, colite à Clostridioides difficile
- Surinfection à Candida spp.
- Tendinite
- Anévrisme de l’aorte abdominale
- Neurotoxicité
Précautions: À qui NE PAS administrer de ciprofloxacine?
- aux enfants
- femme enceinte
- femme qui allaite
ATB: Gentamicine
- Classe
- Mécanisme d’action
- Administration
- Classe: Aminoglycoside
- Mécanisme d’action: Inhibiteur sous-unité 30S ribosomale ET↓ Synthèse des protéines
- Administration: IV
ATB: Gentamicine
- spectre habituel
- exemple de bactéries non couvertes
Spectre habituel:
- Entérobactéries
- Pseudomonas aeruginosa
- synergie avec pénicilline pour entérocoques et certains streptocoques
Exemple de bactéries non couvertes:
- Anaérobes
- Gram (+) (Sauf en cas de combinaison antibiotique pour synergie)
- H.influenzae
Pourquoi on utilise des combinaison ATB et synergie?
On vient éviter les effets secondaire de l’autre ATB + c’est efficace
Nomme 2 exemples de combinaison ATB + synergie pour certains endocardite à Enterococcus sp.
- Aminoglycoside + β-lactam: Ampicilline + Gentamicine
- Combinaison de 2 β-lactam: Ampicilline + Ceftriaxone
Nomme les effets secondaires de la Gentamicine (2)
1) Néphrotoxicité
- Ajustement en insuffisance rénale
- Suivre les dosages
2) Ototoxicité vestibulaire et auditive
- Vertiges et surdité
ATB: Métronidazole
- Classe
- Mécanisme d’action
- Administration
- Classe : Nitroimidazole
- Mécanisme d’action: Inhibe la synthèse d’ADN (↓ DNA synthesis)
- Administration : IV ou Oral (excellente
biodisponibilité)
ATB: Métronidazole
- spectre habituel
- exemple de bactéries non couvertes
Spectre habituel:
- Anaérobes incluant le Clostridioides
difficile - Certains parasites (Giardia, Trichomonas vaginalis, amibes)
Exemple de bactéries non couvertes: Bactéries aérobies Gram + et Gram -
Nomme les effets toxique possible de la métronidazole? (3)
- Inappétence
- Arrière-gout métallique
- Effet antabuse (donne des nausées et des crampes abdominales si associé à l’alcool)
Précaution: À qui NE PAS administrer la métronidazole?
- femme qui allaite
- dans premier trimestre de grossesse
Quelle est la forme oral VS IV:
Acycolvir VS Valacyclovir ?
Lequel est mieux absorbé?
- Acyclovir: IV
- Valacyclovir: oral
- Valacylovir = mieux absorbé, puis convertit en acyclovir
C’est quoi l’acyclovir/valacyclovir%?
Nomme leur 2 mécanismes d’actions.
- Prodrogues qui ont besoin d’une enzyme virale (thymidine kinase), puis d’enzymes de la cellule pour que le médicament devienne actif.
- Principal: agit comme « terminateur de chaîne »
- Aussi: Inhibe la polymérase bactérienne
Décris l’activation de l’acyclovir
ATB: Acyclovir/Valacyclovir
- spectre habituel
- exemple de virus non couverts
Spectre habituel:
- HSV-1
- HSV-2
- VZV
Exemple de bactéries non couvertes: CMV
Nomme les effets toxiques de Acyclovir/Valacyclovir (2)
1) Néphrotoxicité (lithiases) - (Acyclovir)
- Importance de l’hydratation
2) Neurotoxicité
Nomme 3 méthodes standardisées disponibles pour les tests de sensibilité aux ATB
- Disque antibiotique
- Gradiant antibiotique
- Automatisé (Vitek)
Nomme les critères d’interprétations de la sensibilité aux ATB selon l’ATB et la bactérie
Cocentration minimal inhibitrice (CMI) vs zone d’inhibition des antibiotiques
V ou F: Les antibiotiques testés au laboratoire n’apparaissent pas toujours au rapport
VRAI, “Cascade antibiotique” pour favoriser l’utilisation de molécule à spectre moins large
Quel est la nomenclature en latin pour les virus herpes?
Que veut dire viridae en latin?
Nomme 5 espèces de ces virus.
- Herpesviridae
- Viridae fait référence à une famille de virus
- HSV-1, HSV-2, VZV, CMV, EBV sont des espèces de la familles Herpesviridae
Donne la nomeclature commune des virus herpes.
- Virus herpès simplex 1 (HSV1) = HHV-1
- Virus herpès simplex 2 (HSV2) = HHV-2
- Virus varicella-zoster (VZV) = Human alphaherpesvirus 3 ou HHV-3
- Cytomegalovirus (CMV) = HHV-4
V ou F: le nom commun des virus s’écrit en italique
FAUX, le nom commun des virus qui ne s’écrit pas en italique.
ex.:
- Virus herpès simplex (HSV)
- Virus varicelle-zona (VZV)
V ou F: dans la famille des Herpesviridae, les virus ont la capacité d’être sous forme latente.
VRAI
V ou F: TOUS les virus de la famille des Herpesviridae peuvent se transmettre alors que la personne est asymptomatique
FAUX,
à l’exception de VZV, les virus de la famille des
Herpesviridae peuvent se transmettre alors que la personne est asymptomatique.
- Définition: Phase de latence
- Définition: Infection chronique
Phase de latence:
- Forme inactive
- Le virus ne se réplique pas ou très peu
- Échappe à la réponse immunitaire.
Infection chronique:
- Forme active
- Le virus se réplique
- Réponse immunitaire de l’hôte sans être capable d’éliminer le virus.
Nomme 3 méthodes diagnostiques pour les infections virales
- Détection d’un antigène viral
- Sérologie: Détection d’une réponse immunitaire 2nd à l’infection virale
- TAAN: Détection de l’acide nucléique spécifique au virus
Le type de spécimen à prélevé pour le
diagnostic d’une infeciton virale dépend de ? (4)
- du pathogène
- du site d’infection
- du temps depuis le début des symptômes
- du type de test demandé
Donne des exemples de méthodes diagnostiques disponibles pour ces virus:
- HSV
- VZV
- VIH
- HBV
Méthode Dx: Test Antigénique
A. Se fait comment?
B. Vitesse des résultats?
C. Spécificité et sensibilité?
A. Plusieurs méthodes disponibles
- Automatisées vs manuelles
- Test peut parfois être fait à l’extérieur du labo de microbiologie
B. Résultats peuvent être disponibles rapidement (Exemples: COVID-19, VIH, AgHBs, Influenza)
C. Spécificité et sensibilité varie selon le test mais en règle général:
- Sensibilité inférieure au TAAN
- Spécificité bonne
On utilise le test antigénique pour quoi ? (2)
On ne l’utilise pas pourquoi?
- Hépatite B (AgHBs, Anti-HBs (immunité))
- VIH (Anti-VIH - Ag p24)
PAS POUR ROTAVIRUS/ADÉNOVIRUS (Ag) (selles)
Méthode Dx: TAAN
A. Se fait comment?
B. Vitesse des résultats?
C. Spécificité et sensibilité?
A. Plusieurs méthodes disponibles
- Test maison ($) vs commercial ($$-$$$)
- Automatisé vs semi-automatisé
- Monoplex vs multiplex
- Qualitatif vs quantitatif
B. Rapidité d’obtention des résultats dépends du test utilisé: Varie entre < 1h à > 2 semaines
C. Sensibilité et spécificité: Excellente
PCR est un type de TAAN
Dans le TAAN, C’est quoi une valeur Ct (cycle treshold) et à quoi ça sert?
- Valeur Ct (correspond au cycle auquel la fluorescence générée dépasse un seuil défini) est obtenue lors de la réalisation d’une amplification génique par PCR = utilisée pour quantifier la quantité d’ADN ou d’ARN présente dans un échantillon
- Si Ct est élevé = ça m’a pris bcp de cycles pour détecter le virus (Plus le Ct est élevé = moins il y a de virus)
V ou F: Règle générale, le TAAN (méthode moléculaires) permet de trouver SEULEMENT ce que je cherche
VRAI
Tu peux seulement amplifier un virus (ex.: COVID) et pas les autres. Parfois, on fait des multi-test qui s’appliquent à plusieurs pathogènes ($$$$)
V ou F: On peut faire des tests de sensibilité pour les bactéries et les virus
FAUX, Pour les virus, il n’y a pas de test de sensibilité comme les bactéries.
Mais avec TAAN, on cherche des mutations de résistance des virus
Donne des exemples d’organismes pour lesquels on utilise TAAN
- VHB: TAAN VHB (VHB-DNA) (quantitatif)
- VHC: TAAN VHC qualitatif et quantitatif (charge virale)
- VIH - charge virale
- CMB - charge virale (TAAN)
- EBV - charge virale (TAAN)
and many more
- Def: sérologie
- Def: séroconversion
- Sérologie: composition des anticorps présents dans le sérum sanguin d’un individu à un moment donné (ex.: IgG, IgM, …)
- Séroconversion: anticorps spécifiques deviennent détectables dans le sérum sanguin d’un individu pour la première fois (signifie qu’une personne a récemment été exposée à l’agent pathogène)
Méthode Dx: Sérologie
On cherche quel anticorps en début de la maladie? Esq c spécifique?
Anticorps IgM
- Obtenue durant la phase aigue
- Peu spécifique
V ou F: Les sérums sont testés en pairs à différents moments
VRAI
- Modification du profile sérologique et séroconversion
- Par exemple; IgM -> IgG ou (-) -> (+)
- Dx rétrospectif (Ex.: patient à des lésions à la bouche (Herpes), mais la sérologie est négatif. Si on répète le test dans un moins, la sérologie va être +.)
Donne des exemples de pathogènes pour lesquels on utilise la sérologie
1) Statut immunitaire et/ou séroprotection (immunity)
- VHB
- VZV
2) Diagnostic d’infection chronique ou latente
- VIH, VHC, VHB
- CMV, VZV, HSV
V ou F: En sérologie, les Anticorps ne servent qu’à savoir si exposition antérieure au virus
Ne dit pas si les symptômes présentés par le patients sont secondaires au virus
VRAI
Nomme les 3 types d’infections virales
Quels sont les niveaux IgM vs. IgG durant la réponse primaire vs. secondaire à une infection?
Pourquoi la période fenêtre est importante?
- Le moment de l’acquisition de l’infection joue un rôle important
- Importance de connaître l’évolution normale de la maladie
Est-ce que la sérologie pour VZV est efficace?
- Sérologie Positif si on a fait la maladie durant notre vie (mais ne dit pas si aigue ou non)
- Peut être faussement négatif même si vacciné (si niveaux Ac trop bas)
- Si on suspecte une maladie active (p.ex zona), un test moléculaire (TAAN) serait le test à privilégié.
MAIS Sérologie pour VZV utile: Post-exposition de cas symptomatiques pour des personnes dont l’immunité est inconnue (pour savoir si on donne Ig, vaccin,..)
Nomme les 2 méthodes sérologiques
- Automatisé
- Semi-automatisé
Une femme de 42 ans se présente pour des lésions vésiculaires sur les mains et les pieds ainsi que des aphtes dans la bouche. Elle a fait de la fièvre. Elle n’a jamais eu de feux sauvages à sa connaissance, ni d’herpès génital.
La sérologie type spécifique montre des IgG contre HSV-1
Est-ce que ses vésicules sont dues à HSV?
Non…
- Pied-main-bouche causé par un entérovirus
- Patiente porteuse asymptomatique de HSV
VIH:
- ADN ou ARN + quelle famille?
- Caractéristique spéciale?
- Responsable de quelle maladie?
- Endémique où?
- Virus ARN de la famille des Retroviridae
- Possède enzymes (transcriptase inverse) capable de produire de l’ADN à partir d’ARN.
- Responsable du syndrome d’immunodéficience humaine (SIDA)
- Afrique (distribution non égale dans le monde, et mode de transmission différente selon endroit)
VHB:
- ARN ou ADN?
- Quel est l’obstacle à l’éradication du VHB?
- Distribution géographique?
- Virus double brin d’ADN hépatotrope
- Peut établir une infection persistante avec un réservoir stable de matériel génétique sous forme d’ADN (reste en faible qté dans hôte même si elle guérit, chance de réactivation)
- Élevé en Amérique du Nord, certains pays Afrique, Amérique du Sud, Asie,…
VHC:
- ARN ou ADN?
- Prévalence?
- Virus ARN simple brin hépatotrope
- Prévalence > 10% dans certaines régions du globe
Nomme les liquides potentiellement infectieux pour le VIH, VHB, VHC (14)
- les spécimens de laboratoire contenant des concentrés de VIH, de VHB et de VHC
- le sang
- tous les liquides biologiques visiblement teintés de sang
- le sperme (sauf pour le VHC)
- les sécrétions vaginales (sauf pour le VHC)
- le liquide pleural
- le liquide amniotique
- le liquide péricardique
- le liquide péritonéal ou ascitique
- le liquide synovial
- le liquide céphalorachidien
- la salive (pour le VHB seulement)
- le lait maternel (pour le VIH)
- lors de la transmission verticale.
V ou F: Si je reçois une piqûre de VIH, c’est à 100% sûr que je vais l’avoir
FAUX
Par ordre de grandeur décroissante, décris le risque de développer le VHB, VHC et VIH si on se fait exposer au virus par: une piqûre, muqueuse et sang, peau non saine et sang, morsure
VHB: Piqûre > Morsure (rare) > Muqueuse et sang & Peau non saine et sang (non quantifié)
VHC: Piqûre > Morsure (si sand dans bouche agresseur, rare) = Muqueuse et sang (rare) > Peau non saine et sang (non démontré)
VIH: Piqûre > Muqueuse et sang > Peau non saine et sang (rare) = Morsure (si sang dans bouche agresseur, rare)
Par ordre de grandeur décroissante, décris les sources qui causent un risque de transmission associé à une exposition sexuelle pour le VIH-1
- Relation anale réceptive
- Relation vaginale réceptive
- Relation anale insertive
- Relation vaginale insertive
- Relation orale réceptive
- Relation orale insertive
Si charge virale indétectable = risque de transmission négligeable ou très faible
Il y a plus de risque de transmettre le VIH ou le VHC quand on partage du matériel d’Injection?
VHC > VIH
Pour le VIH, décris combien de temps ça prend pour détecter les anticorps et les antigènes (+ ordre d’apparition). Aussi, c’est perçu avec quels tests?
Sérologie VIH: Test rapide
A. Permet la recherche de quoi + dans quel contexte?
B. Que signifie un résultat négatif?
A. Permet la recherche d’Ac VIH dans une situation d’urgence (soir ou nuit, jours fériés)
- Exposition accidentelle
- Femme enceinte en travail et n’ayant pas eu de dépistage pendant la grossesse.
B. Un résultat négatif n’exclut pas une infection aiguë PCQ Test de 3e génération qui ne détecte pas l’Ag p24
Sérologie VIH: Test de 4e génération
- Détecte quoi?
- Compare période fenêtre avec test de 3e génération
- Souvent effectué par quelle méthode?
- Détecte les d’Ac VIH-1/VIH-2 et l’Ag p24.
- Période fenêtre plus courte qu’avec un test de 3e génération.
- Souvent effectué par méthode automatisé lors des heures ouvrables du laboratoire.
Décris l’algorithme de confirmation du VIH au LSPQ (fais le gros schéma)
Pourquoi répéter test pour VIH sur un 2e échantillon?
Surtout pour éviter les erreurs « administratives »
Nomme 4 autres tests demandé dans le contexte de VIH + leur rôle
Dessine un graph de l’évolution de la charge virale et les CD4 dans le contexte de VIH
Décris l’évolution de la maladie du VIH s’il est non traité
Explique ces termes pour VHB:
- AgHBs
- Anti-HBs
- Anti-HBc
- Ag HBe
- Anti-HBe
1) AgHBs
- Antigène de surface qui indique que le patient est contagieux (maladie active)
2) Anti-HBs
- Anticorps contre l’antigène de surface de l’hépatite B
- Présent après une infection ou la vaccination contre l’hépatite B
3) Anti-HBc (core)
- Anticorps contre l’antigène de la nucléocapside du virus de l’hépatite B
- Possible de demander les Anti-HBc IgM si suspicion de maladie aigue.
- PAS présent après la vaccination contre l’hépatite B pcq c’est pas dans le vaccin (si le patient n’a jamais contracté la maladie)
- Seulement présent si tu as contracté la maladie
4) Ag HBe
- Antigène du protéine de fusion issue de la région préC/C du génome.
- Signe d’une réplication virale active.
- Peut être négatif dans le contexte de réplication active si mutation préC.
5) Anti-HBe
- Anticorps contre l’antigène Hbe.
- Suggère la fin de la réplication active.
Comment détecter le VHB?
TAAN VHB
- Mesure la charge virale du virus de l’hépatite B
- Présent lors d’infection aigue ou chronique
L’AgHBs peut être détecté de _______ suivant l’exposition au VHB.
1 à 12 semaines
Fais un schéma qui démontre les niveaux de
- AgHBs
- Anti-HBs
- Anti-HBc
- Ag HBe
- Anti-HBe
durant l’évolution de la VIH
Qu’est-ce qui arrive aux niveau de AgHBs, Anti-HBc (et IgM), AgHBe, ANti-HBe si je développe un hépatite B chronique?
Décris l’évolution de l’hépatite B (résumé)
On ne peut pas savoir, besoin des Anti-HBc
Résultats:
- Ag HBs : négatif
- Anti-HBs : 280 UI/L
- Anti-HBc totaux : positif
Immunité à cause du vaccin OU il a déjà fait l’infection avant?
Déjà fait l’infection avant
Résultats:
- Ag HBs : négatif
- Anti-HBs : 280 UI/L
- Anti-HBc totaux : négatif
Immunité à cause du vaccin OU il a déjà fait l’infection avant?
À cause du vaccin
Quel sont les critères pour être considéré comme:
- protégé contre infection de VHB
- protégé contre réinfection par VHB
- Si anti-HBs >10 UI/L 1 fois dans sa vie = protégé contre l’infection.
- Si infection ancienne et guérie, protégé contre la réinfection
La recherche de l’AgHBs ne devrait pas être faite en-deçà de 30 jours après une dose de vaccin. Pourquoi?
car on pourrait détecter l’AgHBs vaccinal et croire, à tort, que la personne est infectée
Interpréte ces résultats de sérologie hépatite B:
- AgHBs: +
- Anti-HBs: 0 UI/L
- Anti-HBc totaux: +
- Anti-HBc igM: -
Infection chronique
Interpréte ces résultats de sérologie hépatite B:
- AgHBs: -
- Anti-HBs: 45 UI/L
- Anti-HBc totaux: -
- Anti-HBc igM: -
Vacciné
Interpréte ces résultats de sérologie hépatite B:
- AgHBs: -
- Anti-HBs: 40 UI/L
- Anti-HBc totaux: +
- Anti-HBc igM: -
Infection ancienne et “guérie”
Interpréte ces résultats de sérologie hépatite B:
- AgHBs: +
- Anti-HBs: 1 UI/L
- Anti-HBc totaux: +
- Anti-HBc igM: +
Infection récente
Les Ac anti-VHC peuvent être détectés environ de _______ suivant l’exposition au VHC.
L’ARN du VHC peut être détecté ______ les Ac anti-VHC
2 à 12 semaines
avant
Comment se fait la détection de VHC?
- Ac Anti-VHC (sérologie)
- TAAN VHC qualitatif
- TAAN VHC quantitatif
Décris l’histoire naturelle de l’infection par le virus de VHC
Nomme 2 conséquences des changements climatiques sur les maladies infectieuses
1) Maladie endemique qui se propage plus facilement
- Période de reproduction augmentée
2) Émergence de nouvelles maladies de nature infectieuse
- Vecteurs (tiques)
- Mouvement de population
L’augmentation de la température au Canada crée un environnement plus favorable pour les tiques en ? (3)
- Prolongeant leur période d’activité
- Augmentant l’étendue géographique des réservoirs et des hôtes pour les tiques (p. ex. les souris et les
chevreuils) - Allongeant la durée de la saison d’exposition des
humains aux tiques
En plus de la maladie de Lyme, d’autres maladies transmises par les tiques, par exemple ______ et la __________, ont commencé à se propager, et leur incidence est susceptible d’augmenter.
- Anaplasmose
- Babésiose
Pourquoi dois-je me préocuper des changements
climatiques dans ma pratique? (5)
- Vigilance
- Syndrome infectieux inhabituel
- Notification à la santé publique
- Enseignement aux patients sur la prévention de
certaines maladies et des nouvelles zones à risques. - Rester à l’affut des communications de la santé
publique
