CM2 - microbiologie médicale et infectiologie partie 1 Flashcards
3 GRANDES ÉTAPES DANS LE TRAITEMENT DES ÉCHANTILLONS:
qu’est-ce qui se passe dans la pré-analyse?
- Test demandé par le professionnel de la santé.
- Échantillon prélevé et acheminé au laboratoire.
- Réception de l’échantillon au laboratoire de microbiologie.
qu’est-ce qui se passe dans l’analyse?
- Étalement de l’échantillon sur une lame microscopique : coloration de Gram
- Étalement de l’échantillon sur des «géloses» (milieux nutritifs pour les bactéries)
- Géloses sont mises dans des incubateurs à 37oC
les 3 types de géloses et comment se fait le choix de la gélose?
qu’est-ce qu’on fait au gélose une fois qu’on y a installé le prévlèvement?
on les mets dans des incubateurs à différentes conditions:
Pour satisfaire les exigences des bactéries, certaines géloses sont incubées
* Dans une étuve à l’air ambiant (21% d’O2)
* Dans une étuve à CO2
* Dans une tente anaérobie
vrai ou faux
Tente anaérobie permet la survie et la croissance des bactéries anaérobies strictes
vrai
qu’est-ce qu’on fait au banc de travail?
quels genres de tests sont utilisés?
Les géloses sont incubées à 37oC et examinées le lendemain.
examination des colonies et les sélection pour identifier les types de bactéries
—> on test la bactérie isolée selon différents tests:
Hémolyse
Coagulase
Catalase
Tests biochimiques automatisés
quelles sont les grandes étapes de la pré-analyse, analyse et post-analyse (en résumé)?
Quand le médecin doit-il prescrire des hémocultures?
Combien d’hémocultures faut-il prescrire?
En général :
* le médecin prescrit 2 hémocultures
* L’infirmière prélève 4 bouteilles
10 ml de sang/bouteille
2 hémocultures => 4 bouteilles (40 mL en tout)
où est-ce qu’on fait le prélèvement?
particularité du cathéter
en général, au niveau périphérique
cathéter —> possibilité de contamination —> peut aussi être milieux de bactéries
donc on peut y faire le prélèvement pour comparer la croissance et déterminer si le cathéter est la cause de l’infection
Comment procéder au prélèvement? (les étapes)
observes
si on fait deux hémocultures, se font-elles au même sites?
non, 2 hémocultures 2 sites
Pourquoi une bouteille aérobie et une anaérobie?
Pourquoi prélever 2 hémocultures (40 ml de sang)?
Quand prescrire plus que 2 hémocultures?
type d’infections
Endocardite aiguë :
* Obtenir 3 hémocultures1 < 2h, avant de débuter le traitement.
Endocardite subaiguë (germe en général peu virulent, patient non instable):
* Obtenir 3 hémocultures1 < 24h, avant de débuter le traitement.
* Prélever 2 autres hémocultures si la première série est négative après 24 heures.
1 hémoculture = prélèvement 1 bouteille aérobie + 1 bouteille anaérobie
Pourquoi prélever en « 2 temps »?
Évaluer la contamination cutanée
Évaluer le caractère continu de la bactériémie (ce pourquoi on le fait sur deux sites différents)
traitment des hémocultures au laboratoire (en 3 étapes):
à la réception
détection dans l’appareil
rôle du technicien/ne
- Dès la réception au laboratoire, les bouteilles d’hémoculture sont déposées dans un appareil qui maintient la température à 37°C et qui** brasse les bouteilles de façon continue.**
- L’appareil détecte la présence de croissance bactérienne grâce aux métabolites générés par les bactéries dans la bouteille.
- La technicienne effectue une coloration de Gram sur le liquide de la bouteille d’hémoculture «positive» et** ensemence des milieux de culture (géloses)** ce qui permettra d’identifier la bactérie impliquée et de procéder à un antibiogramme. (plusieurs sous-étapes)
Est-ce important de savoir quelle(s) bouteille(s) est (sont) +?
+ exemples
Pas vraiment
* Un S. epidermidis dans les 2 bouteilles d’une hémoculture n’est pas plus significatif que s’il était retrouvé dans une seule bouteille (contaminant probable).
- Même si on trouve des bacilles Gram négatif (BGN) seulement dans la bouteille anaérobie, il peut s’agir d’une bactérie aérobie (anaérobie facultative).
Interprétation des résultats d’hémoculture (bactériémie ou contaminant)
quelles indices le/la médecin analyse/interprète?
Est-ce un contaminant?
selon les Gram +/Gram -
jamais, peut-être, probablement
Retrouver plusieurs germes dans une culture de sang indique quoi?
culture de sang —> souvent monomicrobié —> 1 germe fait l’infection
=> quand y’a plusieurs germes —> grande possibilité de contamination
Interprétation des résultats des Gram d’hémoculture
quels agents possibles?
Le médecin doit analyser les indices
Après combien d’heures d’incubation, l’appareil a-t-il détecté la croissance bactérienne?
- En présence d’une bactériémie, la majorité des hémocultures seront positives en moins de 24 heures.
- Les bouteilles d’hémoculture sont incubées un maximum de 5 jours avant de conclure qu’elles sont négatives.
Le médecin doit analyser les indices
Le lien entre le site de l’infection et le germe identifié est-il plausible?
juste observe
- Exemple de lien plausible : présence de Neisseria meningitidis dans l’hémoculture d’un patient hospitalisé pour une méningite.
- Exemple de lien peu plausible : présence de Streptococcus viridans dans l’hémoculture d’un enfant hospitalisé pour une méningite. Les Streptococcus viridans ne cause pas de méningite.
Hémocultures et infection de cathéter
les bactéries des cathéters viennent de où?
quels résultats nous font penser à une infection de cathéter vasculaire?
- Les infections de cathéter (veineux ou artériel) peuvent être attribuables à des bactéries de la flore normale de la peau.
- La présence de 2/2 hémocultures positives à un germe de la flore normale de la peau (staphylocoque à coagulase négative, Corynebacterium sp.,Bacillus sp.) devrait évoquer une infection de cathéter vasculaire.
Bactériémie: communautaire ou nosocomiale
Une bactériémie communautaire est attribuable à une infection acquise dans la communauté si:
Une bactériémie est qualifiée de nosocomiale si:
Bactériémie: communautaire ou nosocomiale
Une bactériémie communautaire est attribuable à une infection acquise dans la communauté si:
- Elle survient < 48 heures après l’arrivée à l’hôpital
- Ex.: Patient admis il y a 48 heures pour une pneumonie. Les hémocultures prélevées à
l’arrivée à l’hôpital montrent la présence de Streptococcus pneumoniae.
Une bactériémie est qualifiée de nosocomiale si:
* Elle survient > 48 heures après l’arrivée à l’hôpital
ET
* Elle est attribuable à une condition infectieuse qui n’était pas présente à l’arrivée à l’hôpital.
- Ex.: Accidenté de la route intubé aux soins intensifs depuis 5 jours qui développe une pneumonie. Les hémocultures et les sécrétions trachéales prélevées il y a 48 heures montrent du Staphylococcus aureus.
quels sont les deux types d’examen de laboratoire sur un échantillon urinaire?
Deux types d’examen de laboratoire peuvent être réalisés
* Analyse d’urine (laboratoire de biochimie)
* Culture d’urine (laboratoire de microbiologie)
La culture d’urine - 2 grands principes
Comment faire la différence entre la croissance de bactéries qui proviennent de l’urètre et celles qui proviennent de la vessie?
2 grands principes:
L’urètre distale n’est pas stérile
L’urine est normalement stérile
Comment faire la différence entre la croissance de bactéries qui proviennent de l’urètre et celles qui proviennent de la vessie?
* Technique de prélèvement par mi-jet.
* Culture quantitative de bactéries (>108 UFC/L).
Pré-analyse pour culture d’urine:
quelles sont les 3 étapes importantes?
- L’indication de la culture d’urine est une étape cruciale.
- Le clinicien doit questionner le patient pour savoir s’il a des symptômes ou non.
- La présence de bactérie dans les urines sans symptômes associés nécessite très rarement un traitement.
comment se fait la technique de prélèvement d’urine par mi-jet chez la femme et l’homme?
quelle est différence entre ITSS ET UTI? en termes de jet
ITSS = début du jet
UTI = mi-jet
Quelle quantité de bactériurie est significative?
combien de temps pour obtenir les résulats de l’antiobiogramme?
Comment expliquer l’inflammation avec culture d’urine négative?
Culture faite après le début des antibiotiques
L’inflammation vient d’ailleurs que l’urine (urètre?, la prostate?)
L’inflammation est causée par un MO non cultivable.
Quels sont les principaux agents des infections urinaires?
* E. coli
* Proteus mirabilis
* Klebsiella pneumoniae
* Enterocococcus spp.
* Staphylococcus saprophyticus
différencier les infections urinaire haute vs. basse selon leurs symptômes?
Culture de gorge –
quelle bactérie on recherche?
qu’est-ce qu’on recherche à l’examen?
on utilise quoi ?
pourquoi faut-il spécifier le type de germe qu’on veut identifier dans une culture de gorge?
dans culture d gorge —> faut spécifier quel germe on cherche puisque la bouche n’est pas un milieu stérile
Culture de gorge: quel est le rôle du laboratoire?
Lorsqu’un médecin prescrit une culture de gorge sans autre précision, les agents infectieux recherchés sont :
- Streptococcus β hémolytique du groupe A
- Streptococcus β hémolytique du groupe C
- Streptococcus β hémolytique du groupe G
Pourquoi indiquer si le patient est allergique à la pénicilline sur la requête?
Dépistage de SGA par test rapide
regarde
comparer les culture de gorge vs. test rapide vs. TAAN
sensibiblité
qu’est-ce que ça détecte?
durée d’attente des résultats
nécessité de l’antibiogramme?
expliquer la sérologie ASO?
les 3 étapes à faire avant le prélèvement d’une culture de plaie de surface
Culture de plaie de surface
1) Nettoyer la plaie
2) Peser sur les tissus au pourtour
3) Prélever des sécrétions purulentes
quelles conditions on met sur les cultures de plaie de surface?
- Coloration de Gram
- Culture aérobie seulement
La qualité d’une prélèvement de plaie se mesure par ?
- La présence de polynucléaires
- L’absence de cellules squameuses
Culture de pus profond
où se fait le prélèvement (2 options)?
idéalement, le prélèvement c’est quoi?
a) Prélèvement fait en salle d’opération ou par un chirurgien.
b) Prélèvement fait en radiologie d’intervention.
2) Idéalement, une seringue contenant du pus ou un morceau de tissue prélevé en profondeur.
condition des culture de pus profond?
qualifier le risque de contamination de pus profond
- Coloration de Gram
- Culture aérobie et anaérobie
Risque de contamination théoriquement moindre que pour une plaie superficielle.
Liquides biologiques normalement stériles - Que sont-ils? (5 principaux)
Les principaux:
* Liquide articulaire
* Liquide péricardique
* Liquipe péritonéal
* Liquide pleural
* Liquide céphalo-rachidien
Puisqu’ils sont normalement stériles – sur quoi on porte attention dans le Gram et quelles sont les conditions de la culture?
sur quoi se fait le diagnostic de Clostridioides difficile et on recherche quoi6
Technique EIA
GDH et Toxine (+/-)
qu’est-ce que les différentes combinaisons indiquent quant à la présence du C. difficile?
Recherche du gène des toxines de C.diff (TAAN)
TAAN vs. EIA
ça recherche quoi?
limites en termes de sensibilité, utlisateur?
GDH vs EIA vs TAAN
compare selon sensibilité, spécificité et substance détectée:
La recherche de pseudomembranes
quelles sont les trois critères de cet examen?
Prévention des infections – quelles sont les pratiques de base
Hygiène des mains (4 moments où le fait):
* Avant de toucher au patient
* Avant une intervention aseptique
* Après un risque de contact avec un liquide biologique
* Après tout contact avec un patient ou son environnement
Hygiène respiratoire
* Tousser dans son coude
* Porter un masque si Sx respiratoires
Équipement de protection individuel (EPI) lors de situations particulières
* Gants/blouses/protection du visage
Utilisation et disposition adéquate des objets tranchants
Lequel choisir?
Solution hydroalcoolique vs. Eau et savon
qu’est-ce qui différencient les ß-lactamines entre eux?
quel est le mécanisme d’action des ß-lactamines?
ß-LACTAMINE INHIBE PBP
—> ce qui empêche la synthèse de peptidoglycan => pep ne peuvent se relier ensemble —> ça produit une structure instable
Pénicilline
quelle est sa classe
sa catégorie
et ses voies d’administration?
Pénicilline - quel est son spectre?
quel est le spectre de l’ampicilline?
quelles sont les Bactéries productrices de ß-lactamases?
+ quel est le mécanisme d’Action de cette bactérie?
- Staphylococcus aureus (non SARM)
- Environ 35% des Haemophilus influenzae
- La plupart des Moraxella catarrhalis
- Tous les Klebsiella pneumoniae
- Environ 30% des E. coli
mécanisme: bactéries viennent détruire la ß-lactamine avant qu’elle puisse se lier sur le PBP
Deux solutions contre les bactéries productrices de ß-lactamases?
+ exemples
Pipéracilline/tazobactam - spectre d’action
quels sont les effets secondaires des ß-lactamines?
