CLASE 4 Flashcards

1
Q

De acuerdo a la tecnica, como clasificamos las pruebas geneticas

A
  1. Citologeneticas: Cariotipo, Hibdiración in situ, MLPA. hibridación genomica comparativa
  2. Secuenciación: Secuenciación de nueva generación y de sanger
  3. Otras: PCR
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2
Q

De acuerdo al uso, cuales son las clasificaciones de las pruebas geneticas

A
  • Diagnosticas
  • Presintomaticas (antes del inicio de sintomas como en huntingon)
  • Portadores
  • Forenses (identificación con fines legales)
  • Predictivas (identifica variantes que pueden tener riesgo de desarrollar X condición)
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3
Q

Que y CUALES son las pruebas de tamizaje prenatal y para que sirven.

A

La prueba de tamizaje prenatal es el test prenatal no invasivo (NIPT), el cual consiste en recolectar ADN fetal circulante a partir de una muestra de la madre. Sirven para tamizar aneuploidias o variantes principales.

OJO, solo se hace despues de la semana 10 del embarazo

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4
Q

Las pruebas de tamizaje prenatal se incluyen en el POS?

A

NO se incluyen

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5
Q

Cuales son las 3 muestras que se pueden tomar para hacer diagnosticos confirmatorios de manera prenatal

A

Vellosidades corionicas
Liquido amniotico
Sangre del Cordón umbilical

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6
Q

En que consisten las pruebas preimplantacionales

A

Si se presenta una enfermedad de origen genetico heredable y la persona desea tener descendencia, se puede hacer fecundación in vitro, de esta manera, se retiran ovulos de la mujer afectada por la patología y se hacen pruebas geneticas en cada uno de estos detectando cual esta libre de la enfermedad para posteriormente implantarlo y desarrollar el embarazo

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7
Q

De acuerdo al cromsoma en el que ocurren, las variantes monogenicas pueden clasificarse en

A

Autosomicas y ligadas a X

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8
Q

Que es un cariotipo, que anomalias detecta

A

Paraclinico genetico que permite detectar cromosomopatias numericas (euploidias y aneuploidias) y estructurales grandes. Por lo general detecta anomalias mayores a 5-10 Mb

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9
Q

Cuales son los requisitos de la muestra para poder realizar un cariotipo y como se hace este

A

OJO, las celulas deben ser:
- Nucleadas
- Capaces de realizar mitosis
Esto sin importar de donde sea tomada la muestra. Lo que se hace, es cultivar 2-3 dias estas celulas en un portaobjetos y estimulando quimicamente la mitosis. Posteriormente se les coloca colchicina para detenerlas en metafase, donde estan mas condensados los cromosomas y con esto, se centrifugan y separan las celulas para posteriormente teñirla o hacerle bandeo con tinción de Giemsa (bandas G). La persona encargada debe buscar el sitio de la celula donde ocurrio la mitosis para tomar la captura. Debe tomar cerca de 25-30 fotos de las mitosis

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10
Q

Mencionar 5 consecuencias clinicas a las cuales se asocia el Sindrome de Down

A
  • Cardiopatia congenita
  • Respuesta a anticuerpos suboptima
  • Discapacidad intelectual
  • Alta predisposición a infecciones, principalmente respiratorias
  • Envejecimiento precoz
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11
Q

Mencionar que sindrome se asocia a microcefalia y esternon corto

A

Sindrome de Edwards (trisomia 18)

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12
Q

Mencione el paso a paso de como reportar el resultado de un cariotipo

A
  1. Poner un igual antes del numero de cromosomas
  2. Poner el numero de cromosomas encontrados
  3. Colocar una coma
  4. Colocar cromosomas sexuales (XX o XY)
  5. Colocar en corchetes la cantidad de metafases interpretadas
  6. Adicionar slash (/) en el caso de mosaicismos y adicionar el otro cariotipo completo

Ejemplo: 46,XX [25]

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13
Q

Mencione la anomalia congenita y su mayor caracteristica asociada de los siguientes sindromes:
- Sindrome de Down
- Sindrome de Patau
- Sindrome de Edwards
- Sindrome de Klinefelter
- Sindrome de turner

A
  • Down: Trisomia 21. Se asocia a baja implantación de orejas, pliegue palmar unico, cuello corto, macroglosia y microstomia, puente nasal ancho, obesidad centripeta, cardiopatias congenitas, nariz en silla de montar
  • Patau: Trisomia 13. Microftalmia, microcefalia, labio y paladar hendido, polidactilia, anomalias renales y cardiacas
  • Edwards: Trisomia 18. Se asocia a microcefalia y esternon corto
  • Klinefelter: Cariotipo XXY. Se asocia a hipogonadismo, infertilidad, ginecomastia, eventos tromboticos, trastornos del neurodesarrollo
  • Turner: Monosomia X. Se asocia a cuello corto y grueso, linfedema, torax ancho, pezones invertidos y teletelia, talla baja
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14
Q

Defina:
- Cromosoma en anillo
- Isocromosoma
- Translocación balanceada

Porque es importante reconocer estas 3 condiciones en el cariotipo?

A
  • El cromosoma adquiere una forma anillada tras la unión de sus dos telomeros
  • Los dos cromosomas pares se separan y unen sus brazos Q y sus brazos P, quedando un cromosoma con dos brazos P y otro con dos brazos Q
  • Paso una porción de un cromosoma a otro. Son balanceadas si no se pierde o gana información genética

OJO, estas anomalias son importantes porque SOLO se detectan en cariotipo

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15
Q

En que sindrome son frecuentes los isocromosomas

A

Turner

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16
Q

Como se subclasifican las variantes del numero de copias

A

Deleciones o duplicaciones de material genetico

17
Q

Que permite identificar la hibridación genomica comparativa o Array CGH

A

Detecta anomalias estructurales y numericas pequeñas, medianas o grandes no balanceadas. Mayores a 750 Kb

18
Q

Resuma como funciona el Array CGH

A

Tenemos una secuencia control y la muestra de ADN del paciente, debemos fragmentar la muestra y la comparamos con la secuencia control. Si hay mas fluorescencia que en el control (mas copias), estamos frente a una duplicación mientras que si hay menos fluorescencia (menos copias), estamos frente a una deleción (CNV)

19
Q

En general, para que sirve el Array CGH

A

OJO:
1. Para detectar variantes en el numero de copias PUNTUALES
2. Para detectar variantes cromosomicas numericas o estructurales no detectables con el cariotipo en el paciente con malformaciones mayores multiples
3. Puede pedirse de primera intención si hay malformaciones mayores y menores

20
Q

El array CGH es una prueba genetica o genomica, por que

A

Genetica, no permite detectar alteraciones detalladas de todo el genoma

21
Q

3 ejemplos para usar Array CGH

A
  • Discapacidad intelectual
  • Retraso en el neurodesarrollo global
  • Autismo
22
Q

Que significa MLPA

A

Multiplex Ligand-dependent Probe Amplification

23
Q

Que variantes detecta el MLPA

A

Variantes estructurales PUNTUALES. Se pide especificamente para una condición que busco. Es mas microscopica que el Array CGH. Detecta CNV pequeños, tanto deleciones como duplicaciones

24
Q

Como se lee el Locus 22q11.2

A

Cromosoma 22
Brazo Q
Región 1
Banda 1
Subbanda 2

25
Mencione dos condiciones donde podria pedir un MLPA
Sindrome de DiGeorge, deleción 22q11.2, esta gemera cardiopatias e inmunodeficiencias Sindrome de Williams (Del 7q11.23) → afecta gen de la elastina
26
El MLPA es una prueba genetica o genomica
Genetica puntual
27
Para que sirve la secuenciación de nueva generación
OJO, NO detecta variantes en el numero de copias, sino variantes puntuales (sustitución, inserción, deleción de bases). Detecta MUY pocas CNV. OJO, es puntual, debemos buscar algo especifico
28
La secuenciación de nueva generación es genetica o genomica
Genetica y PUNTUAL
29
Si en una secuenciación de nueva generación nos arrojan un resultado de sustitución de base con: + 50% de copias con C y 50% con T, probablemente estemos ante
Un paciente heterocigoto para ese gen
30
Que puedo pedir si necesito ver varios genes PUNTUALES al tiempo comunes para una enfermedad sin necesidad de evaluar todo el genoma
Un panel de genes (de SNG)
31
Para que sirve el exoma completo
Permite detectar un 85% de todas las variantes que existen debido a que analiza todas las regiones codificantes o exones. Con esta detecto variantes puntuales o de secuencia pero NO CNV
32
Siempre que tengamos un canal AV, siempre sospechar
Down
33
Para que uso la secuenciación de sanger
ver variantes puntuales o que ya conocemos (se que voy a ir a buscar) MUY DIRIGIDO
34
Para que uso el FISH
identifica solo VARIANTES DE NUMERO DE COPIA dirigidas o arreglos cromosomicos