clase 14 Flashcards

1
Q

en que esta basada la hibridacion

A

está basada en el proceso de renaturalización de dos cadenas sencillas de DNA.

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2
Q

Que desnaturaliza a los acidos nucleicos

A

se desnaturalizan por efecto de agentes químicos o físicos, perdiendo su conformación tridimensional.

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3
Q

QUIMICAMENTE a que se debe la desnaturalizacion

A

se debe tanto a la rotura de los puentes de hidrógeno entre pares de bases como de las interacciones hidrofóbicas entre bases apiladas.

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4
Q

analizar el siguiente diagrama

A
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5
Q

Nombra algunos elementos empleados para desnaturalizar el ADN

A

moléculas
sencillas, altamente polares, con grupos amino y
carbonilo, estos les permiten competir en la
formación de enlaces de hidrógeno.

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6
Q

que proceso recibe el nombre de hibridacion

A

Formación de moléculas dúplex de DNA cuyas
hebras tienen distinto origen (distinto origen o ácido
nucleico) recibe el nombre de hibridación.

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7
Q

que aumenta la estabilidad de un hibrido

A

La estabilidad del híbrido es tanto mayor cuanto más
elevada sea la proporción de bases complementarias
y mayor la longitud de las secuencias apareadas.

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8
Q

en que se basa el principio basico del ensayo de hibridacion

A

Todos se basan en la gran especificidad de la
interacción entre bases complementarias.

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9
Q

que se requiere para que la hibridacion permita identificar en un genoma o en una muestra cualquier de acido nucleico, una secuencia particular

A

se requiere de dos elementos básicos:

1. Secuencia diana: Gralmente obtenido con enzimas de restricción.
2. Sonda: fragmento corto de AN, secuencia conocida
y complementaria a la secuencia diana (marcado
radiación, coloreado, fluorescente)

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10
Q

cuales son los factores que influyen sobre la hibridacion

A
  • Concentración DNA o RNA diana.
  • Concentración y tamaño de la sonda.
  • Temperatura y tiempo de hibridación.
  • Características del medio de reacción (pH, fuerza
  • iónica, concentración de agentes desnaturalizantes,
  • adición de ciertos polímeros, etc.)
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11
Q
A
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12
Q

como se clasifican los metodos de ensayo de hibridacion

A

en tres grupos

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13
Q

caracteristica de la hibridacion en fase liquida

A
  • Inicialmente empleado.
  • Utiliza muestra RNA o DNA en disolución.
  • Cinética es más rápida.
  • Todas las moléculas diana son igualmente accesibles.
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14
Q

caracteristicas de hibridacion de soporte solido

A
  • Pueden procesar varias muestras simultáneamente
  • facilitando el control de la hibridación.
  • Cinética es más lenta.
  • Proceso menos eficiente.
  • Sencillo de realizar y más versátil.
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15
Q

caracteristicas de la hibridacion dot-blot y slot-blot

A
  • Método más simple y común, gracias a su posibilidad
  • de emplear muestras de AN sin purificar (sangre,
  • heces, esputo).
  • Muestra aplica gota a gota (dot-blot)
  • Muestra aplica en manchas alargadas (slot-blot)
  • Ambas sobre un filtro de nitrocelulsa o nylon, cuyas
  • propiedades de absorción fijan las moléculas de
  • ácido nucleico y proteína.
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16
Q

cuales son las 5 etaps de la hibridacion de Southern

A
  1. Separación electroforética.
  2. Desnaturalización.
  3. Transferencia.
  4. Hibridación.
  5. Detección.
17
Q

cuales son las caracteristicas de la hibridacion de nothern

A
  • Proceso idéntico al Southern, pero el ácido nucleico analizado es RNA.
  • Por su menor tamaño no es necesaria su fragmentación.
  • Emplea principalmente para obtener informaciónsobre el tamaño de RNAs y sobre el modelo de expresión de genes específicos.
18
Q

Que es la hibridacion In Situ

A

Hibridación en soporte sólido, en la que la sonda se
aplica sobre muestras en la ubicación natural,
generalmente aquellas preparadas para microscopia.

19
Q

para que se emplea la transferencia de Western

A

Para detectar las proteínas presentes en la
muestra.

20
Q

el papel de la sonda equivale a la del anticuerpo en un….

A

inmunoensayo

21
Q

com es la clasificacion de las sondas en funcion del metodo de preparacion

A
  • Longitud o tamaño de la secuencia diana.
  • Método de marcaje y detección.
  • Tamaño de la sonda.
  • Método de preparación (clonación celular o acelular, síntesis química).
22
Q

son sondas llamadas sondas genómicas, clonadas o biológicas.

A

Sonda ADN (clonación celular)

  • Las primeras en utilizarse
  • Longitud variable, entre 100 bases y cientos de Kb.
23
Q

Caracteristicas de las sondas obtenidas por clonacion acelular

A
  • Sondas de menor tamaño (método PCR).
  • Consta de un menor número de fases, por lo que las sondas se obtienen de forma más rápida y sencilla.
24
Q

de que forma se diseñan las sondas sinteticas

A

se diseñan de forma que contengan la secuencia
complementaria a una zona del DNA diana (parte del
gen que se desea analizar).

25
Q

que es necesario para diseñar una sonda

A
  1. Conocer la secuencia completa de la proteína, o al menos un fragmento de ella, al que corresponderá la secuencia diana de DNA.
  2. A partir de esa secuencia aminoacídica, se establece (base código genético) la secuencia nucleotídica que habrá de tener el DNA.
  3. Para reducir su número, se selecciona el segmento
    de secuencia que posea la menor degeneración
    posible.
  4. Una vez sintetizadas todas las sondas, se ensaya su
    hibridación con el DNA de partida, una de ellas
    será la correcta.
26
Q

cual es el principio basico del marcaje de sonda

A

es la unión química o conjugación del marcador a la sonda.

27
Q

cuales son los metodos directos e indirectos de marcaje de sonda

A
  • La sonda lleva unido un marcador detectable (método directo de marcaje).
  • Otra molécula no detectable o grupo indicador, con la capacidad de ser reconocido posteriormente por una proteína detectora, que es la que va marcada (método indirecto)