Chp 1: Analyses et modèles génétiques Flashcards
Quels sont des exemples des outils que les chercheurs en bio mol utilisent pour étudier une nouvelle protéine?
1) le gène ou l’ADN recombinant codant pour la protéine (ADN recombinant = DNA artificially created by combining genetic material)
2) un modèle d’étude représenté par une cellule ou un organisme mutant chez lequel la fonction de cette protéine est atténuée (reduced), absente ou suractive
3) une source de protéine recombinants purifiées pour des études cellulaires et biochimiques
Quelles sont les 2 stratégies utilisées pour étudier une protéine?
1) Génétique classique
2) Génétique inverse
Qu’est-ce que la différence entre la génétique classique et inverse?
Génétique classique: Commence avec l’isolement d’un organisme mutant qui semble présenter une déficience pour un processus biochimique spécifique/une faute phénotypique. L’isolement est fait par une banque d’ADN.
Génétique inverse: quasiment les mêmes étapes que la génétique classique mais on commence avec l’isolation d’une protéine intéressante ou par l’identifier d’après une analyse transcriptomique/génomique d’une cellule.
Différence entre une analyse transcriptomique/génomique
Analyse transcriptomique: Studies all the RNA molecules produced by genes
Analyse génomique: Studies an organism’s entire set of genes and DNA sequences
Quels sont les techniques de détection qu’on peut utiliser pour valider l’exactitude de notre modèle d’étude ou de nos manipulations génétiques?
1) FISH (Fluorescence in situ hybridation): utilise des sondes nucléique pour observer les endroits où les acides nucléiques sont exprimés dans une cellule ou un organisme
2) IFA (Immunofluorescence assay): utilise des anticorps pour observer les endroits où les protéines sont exprimées dans une cellule ou un organisme
Quels sont des informations qu’un analyse génétiques des mutants (OGM) peuvent nous révéler?
1) Des nouveau gènes nécessaires au déroulement du processus
2) L’ordre dans lequel les produits des gènes agissent dans un processus
3) L’intéraction ou non de produits codés par des gènes différents
Définir le terme “allèles”
Allèles: les différentes formes ou variations d’un gène
(les généticiens utilisent le mot “allèle” en référence aux différents variations génétiques qui existent naturellement dans les populations)
Définir le terme “mutation”
Mutation: cas dans lesquels on sait qu’un nouvel allèle vient d’apparaître
Définir le terme “mutagène”
Mutagène: un agent qui provoque un changement dans la séquence d’ADN
Définir le terme “organisme de type sauvage”
Organisme de WT: un organisme qui a un génotype standard que sert de référence pour les expériences de croisement
La différence entre des organismes haploïdes, diploïdes, pluriploïdes
Haploïdes: un seul jeu de chromosomes (la majorité d’organismes unicellulaires simples comme des bactéries)
Diploïdes: deux jeux de chromosomes (ex, organismes pluricellulaires comme des souris)
Pluriploïdes: 6-10 jeux de chromosomes (cellules cancéreuses)
Certains organismes (ex, levures) peuvent exister dans l’état haploïdes ou diploïdes
La différence entre un homozygote et un hétérozygote (adjectives, ex, un organisme homozygote)
Homozygote: lorsqu’ils ont deux allèles identiques pour un gène spécifique (un de chaque parent)
Hétérozygote: lorsqu’ils ont des allèles différents pour un gène spécifique, un dominante et l’autre récessif (l’allèle dominante determine le phénotype observable)
La différence entre un allèle mutant récessif ou dominant
Allèle mutant récessif: si qu’il en faut deux copies mutantes pour observer le phénotype mutant
Allèle mutant dominant: si qu’il en faut seulement un allèle mutant (et un allèle de type sauvage) pour observer le phénotype mutant
Définir le terme “gènes haploïdes-insuffisants”
Gènes haploïdes-insuffisants: des gènes qui nécessitent les deux allèles pour le fonctionnement normal de la cellule. Le retrait ou l’inactivation d’un seul allèle dans un gène de ce type conduit à un phénotype mutant.
Dominante négative?
Une mutation dans un allèle qui peut causer un changement de structure dans une protéine, qui interfère avec la fonction de la protéine sauvage codée par un autre allèle.
Expliquer la cascade d’activation du FT NFkB
- Exemple d’une mutation dominante négative
-mutation sur les séries 32 et 36 du inhibiteur kappa B (IkB), inhibe sa phosphorylation (therefore stays in cytoplasm) - NFkb est un facteur de transcription qui se trouve toujours dans le cytoplasme lorsqu’il est liée à IKB (le IKB masque son localisation)
- IKK est un kinase de IKB
- avec un certain signal qui se lie à son récepteur, le IKK phosphoryle le IKB et provoque le détachement d’IKB du NFKB.
- NFkB entre dans le noyau et régule un certain processus de transcription
-si l’organisme est un hétérozygote
Mutation ponctuelle? Mutation ponctuelle silencieuse?
Une mutation où il y a juste un changement d’une seule paire de bases (nucleotide)
Ponctuelle silencieuse: provoque aucun changement dans la séquence d’AA ou l’activité d’une protéine codée par ce gène
Ségrégation des mutations?
Passage des mutations par méiose ou mitose
Mitose=cellules somatiques
Méiose=cellules germinales
Méiose vs mitose pour la ségrégation des mutations
Mitose: les mutations sont passés aux 2 cellules filles car les cellules filles sont génétiquement identiques de l’un à l’autre
Méiose: En raison d’un recombination génétique pendant le crossing over, chaque gamète peut avoir un combination unique des allèles et des mutations de chaque parent
Mutagenèse dans un organisme diploïde modifie ____?
modifie seulement un allèle d’un gène, produisant des mutant hétérozygotes
which makes sense cause it would be super rare for a mutagènese to cause a mutation in the exact same spots of the two allèles
Mutant hétérozygote vs mutant homozygote?
Mutant hétérozygote: possède un allèle muté et un allèle WT
Mutant homozygote: possède 2 allèles mutés
Criblages génétiques?
Genetic screening in English
Les procédures utilisées pour identifier et isoler les mutants
Mutations létales récessives?
–
Complémentation génétique?
- lorsqu’un organisme a deux copies d’un mutation recessive, il démontre un phénotype mutant car deux copies du gène peuvent pas produire la protéine fonctionnelle
- complementation génétique = une technique utilisé pour voir si les mutations sont dans le meme gene ou deux genes différents
-dans cette technique, deux mutants sont croisées
-si la cellule fille démontre un phénotype WT, il veut dire que les mutation responsable pour le mutant sont dans des genes différents (les allèles se complémentent) - si la cellule fille démontre un phénotype mutant, il veut dire que la mutation sont dans le meme gene (les allèles ne se complémentent pas)
double mutants?
- on utilise les phénotypes doubles mutant si qu’on veut étudier un processus cellulaire où on a besoin de déduire l’ordre du fonctionnement d’un groupe de gènes et leurs produits protéiques
- comme des voies de biosynthèse, voies de signalisation
