Chp 1: Analyses et modèles génétiques

Question 1

Quels sont des exemples des outils que les chercheurs en bio mol utilisent pour étudier une nouvelle protéine?

Answer 1

1) le gène ou l’ADN recombinant codant pour la protéine (ADN recombinant = DNA artificially created by combining genetic material)

2) un modèle d’étude représenté par une cellule ou un organisme mutant chez lequel la fonction de cette protéine est atténuée (reduced), absente ou suractive

3) une source de protéine recombinants purifiées pour des études cellulaires et biochimiques

Question 2

Quelles sont les 2 stratégies utilisées pour étudier une protéine?

Answer 2

1) Génétique classique
2) Génétique inverse

Question 3

Qu’est-ce que la différence entre la génétique classique et inverse?

Answer 3

Génétique classique: Commence avec l’isolement d’un organisme mutant qui semble présenter une déficience pour un processus biochimique spécifique/une faute phénotypique. L’isolement est fait par une banque d’ADN.

Génétique inverse: quasiment les mêmes étapes que la génétique classique mais on commence avec l’isolation d’une protéine intéressante ou par l’identifier d’après une analyse transcriptomique/génomique d’une cellule.

Question 4

Différence entre une analyse transcriptomique/génomique

Answer 4

Analyse transcriptomique: Studies all the RNA molecules produced by genes

Analyse génomique: Studies an organism’s entire set of genes and DNA sequences

Question 5

Quels sont les techniques de détection qu’on peut utiliser pour valider l’exactitude de notre modèle d’étude ou de nos manipulations génétiques?

Answer 5

1) FISH (Fluorescence in situ hybridation): utilise des sondes nucléique pour observer les endroits où les acides nucléiques sont exprimés dans une cellule ou un organisme

2) IFA (Immunofluorescence assay): utilise des anticorps pour observer les endroits où les protéines sont exprimées dans une cellule ou un organisme

Question 6

Quels sont des informations qu’un analyse génétiques des mutants (OGM) peuvent nous révéler?

Answer 6

1) Des nouveau gènes nécessaires au déroulement du processus

2) L’ordre dans lequel les produits des gènes agissent dans un processus

3) L’intéraction ou non de produits codés par des gènes différents

Question 7

Définir le terme “allèles”

Answer 7

Allèles: les différentes formes ou variations d’un gène

(les généticiens utilisent le mot “allèle” en référence aux différents variations génétiques qui existent naturellement dans les populations)

Question 8

Définir le terme “mutation”

Answer 8

Mutation: cas dans lesquels on sait qu’un nouvel allèle vient d’apparaître

Question 9

Définir le terme “mutagène”

Answer 9

Mutagène: un agent qui provoque un changement dans la séquence d’ADN

Question 10

Définir le terme “organisme de type sauvage”

Answer 10

Organisme de WT: un organisme qui a un génotype standard que sert de référence pour les expériences de croisement

Question 11

La différence entre des organismes haploïdes, diploïdes, pluriploïdes

Answer 11

Haploïdes: un seul jeu de chromosomes (la majorité d’organismes unicellulaires simples comme des bactéries)

Diploïdes: deux jeux de chromosomes (ex, organismes pluricellulaires comme des souris)

Pluriploïdes: 6-10 jeux de chromosomes (cellules cancéreuses)

Certains organismes (ex, levures) peuvent exister dans l’état haploïdes ou diploïdes

Question 12

La différence entre un homozygote et un hétérozygote (adjectives, ex, un organisme homozygote)

Answer 12

Homozygote: lorsqu’ils ont deux allèles identiques pour un gène spécifique (un de chaque parent)

Hétérozygote: lorsqu’ils ont des allèles différents pour un gène spécifique, un dominante et l’autre récessif (l’allèle dominante determine le phénotype observable)

Question 13

La différence entre un allèle mutant récessif ou dominant

Answer 13

Allèle mutant récessif: si qu’il en faut deux copies mutantes pour observer le phénotype mutant

Allèle mutant dominant: si qu’il en faut seulement un allèle mutant (et un allèle de type sauvage) pour observer le phénotype mutant

Question 14

Définir le terme “gènes haploïdes-insuffisants”

Answer 14

Gènes haploïdes-insuffisants: des gènes qui nécessitent les deux allèles pour le fonctionnement normal de la cellule. Le retrait ou l’inactivation d’un seul allèle dans un gène de ce type conduit à un phénotype mutant.

Question 15

Dominante négative?

Answer 15

Une mutation dans un allèle qui peut causer un changement de structure dans une protéine, qui interfère avec la fonction de la protéine sauvage codée par un autre allèle.

Question 16

Expliquer la cascade d’activation du FT NFkB

Answer 16

• Exemple d’une mutation dominante négative
  -mutation sur les séries 32 et 36 du inhibiteur kappa B (IkB), inhibe sa phosphorylation (therefore stays in cytoplasm)
• NFkb est un facteur de transcription qui se trouve toujours dans le cytoplasme lorsqu’il est liée à IKB (le IKB masque son localisation)
• IKK est un kinase de IKB
• avec un certain signal qui se lie à son récepteur, le IKK phosphoryle le IKB et provoque le détachement d’IKB du NFKB.
• NFkB entre dans le noyau et régule un certain processus de transcription
  -si l’organisme est un hétérozygote

Question 17

Mutation ponctuelle? Mutation ponctuelle silencieuse?

Answer 17

Une mutation où il y a juste un changement d’une seule paire de bases (nucleotide)

Ponctuelle silencieuse: provoque aucun changement dans la séquence d’AA ou l’activité d’une protéine codée par ce gène

Question 18

Ségrégation des mutations?

Answer 18

Passage des mutations par méiose ou mitose

Mitose=cellules somatiques
Méiose=cellules germinales

Question 19

Méiose vs mitose pour la ségrégation des mutations

Answer 19

Mitose: les mutations sont passés aux 2 cellules filles car les cellules filles sont génétiquement identiques de l’un à l’autre

Méiose: En raison d’un recombination génétique pendant le crossing over, chaque gamète peut avoir un combination unique des allèles et des mutations de chaque parent

Question 20

Mutagenèse dans un organisme diploïde modifie ____?

Answer 20

modifie seulement un allèle d’un gène, produisant des mutant hétérozygotes

which makes sense cause it would be super rare for a mutagènese to cause a mutation in the exact same spots of the two allèles

Question 21

Mutant hétérozygote vs mutant homozygote?

Answer 21

Mutant hétérozygote: possède un allèle muté et un allèle WT

Mutant homozygote: possède 2 allèles mutés

Question 22

Criblages génétiques?

Answer 22

Genetic screening in English

Les procédures utilisées pour identifier et isoler les mutants

Question 23

Mutations létales récessives?

Answer 23

–

Question 24

Complémentation génétique?

Answer 24

• lorsqu’un organisme a deux copies d’un mutation recessive, il démontre un phénotype mutant car deux copies du gène peuvent pas produire la protéine fonctionnelle
• complementation génétique = une technique utilisé pour voir si les mutations sont dans le meme gene ou deux genes différents
  -dans cette technique, deux mutants sont croisées
  -si la cellule fille démontre un phénotype WT, il veut dire que les mutation responsable pour le mutant sont dans des genes différents (les allèles se complémentent)
• si la cellule fille démontre un phénotype mutant, il veut dire que la mutation sont dans le meme gene (les allèles ne se complémentent pas)

Question 25

double mutants?

Answer 25

• on utilise les phénotypes doubles mutant si qu’on veut étudier un processus cellulaire où on a besoin de déduire l’ordre du fonctionnement d’un groupe de gènes et leurs produits protéiques
• comme des voies de biosynthèse, voies de signalisation