Chapitre 7 : Traduction (complet) Flashcards
Schématiser un ribosome ; doit contenir l’ARNm (avec codon identifié), l’ADN matrice (avec codon identifié), les ARNt (avec anticodon identifié ou applicable), les sous-unités et les sites catalytiques
Correction diapo 2 PDF chapitre 7
Dans quel sens le ribosome traduit-il l’ARNm?
De 5’ vers 3’
Quelle est la séquence du codon DÉPART, et à quel a.a correspond-il?
AUG, méthionine
Comment est reconnu le bon AUG initiateur chez les procaryotes?
Une séquence conservée appelée RBS (ribosome binding site) est présente en 5’ du codon AUG.RBS-AUG détermine le point d’attachement de la sous-unité ribosomale, l’ARNr 16S de laquelle est complémentaire à RBS. Un AUG seul signifie une Met au milieu de la protéine.
Qu’est-ce que la séquence Kozak?
La séquence que doit avoir un codon initiateur pour être reconnu 100% du temps. Il s’agit de CRCCAUGG, ou R est une purine (A ou G)
Comment est reconnu le bon AUG initiateur chez les procaryotes?
Petite sous-unité ribosomale liée à un ARNt-Met (transportant l’a.a Met, donc ayant l’anticodon correspondant) se déplace sur l’ARNm de 5’ vers 3’ jusqu’au premier AUG. Suite à l’appariement anticodon-codon, la petite sous-unité s’arrête et la grande vient la rejoindre.
Nommer les 4 sites du ribosome en ordre de 5’ vers 3’ de l’ARNm et leur fonction
Site de liaison de l’ARNm (pas dans l’ordre)
1) Site E (exit) : pas spacieux, n’a même pas de place pour les ARNt, donc les éjecte
2) Site P (peptidyle) : très spacieux, donc retient l’ARNt qui porte la chaîne peptidique (en élongation)
3) Site A (accepteur) : peu spacieux, n’a de place que pour un ARNt et son a.a, il retient celui-si en attendant la formation du lien peptidique
Nommer les trois étapes de la traduction
1) Initiation
2) Élongation
3) Terminaison
TRUC : même nom que pour la transcription
Donner la différence principale entre la traduction procaryote et eucaryote, à quoi est-elle due?
La traduction procaryote est co-transcriptionnelle, pcq procaryotes n’ont pas de noyau, donc ADN, ARNm transcrits et ribosomes sont dans même compartiment cellulaire (cytoplasme)
Nommer les 3 facteurs d’initiation liant l’ARNm au tout début de l’initiation
1) eIF4E (eucaryote initiation facteur) : reconnaît et lie coiffe 7-méthylglutarate 5’
2) PABPI (Poly-A binding protéine) : reconnaît et lie queue poly-A 3’
3) eIF4G : reconnaît et lie eIF4E et PABPI
Quels sont les deux avantage de la formation du complexe de facteur protéiques durant l’initiation?
1) Stabilise ARNm et favorise recrutement du complexe de préinitiation du ribosome
2) Confère à l’ARNm une conformation circulaire qui favorise la circulation des ribosomes
Schématiser et expliquer la formation du complexe de préinitiation ; doit contenir les facteurs d’initiation pertinents et le nom des complexes intermédiaires
Correction diapo 13 PDF chapitre 7
Qu’est-ce qui permet la transition de l’initiation à l’élongation?
L’hydrolyse du GTP associé à eIF2, qui immobilise complexe de préinitiation au site d’initiation;
L’hydrolyse d’un deuxième GTP, celui-ci associé à eIF5 , qui permet la complétion du ribosome par l’attachement de la grosse sous-unité.
Qu’arrive-t-il aux facteurs d’initiation lorsque la grosse sous-unité ribosomale s’attache?
Ils sont relâchés
Vrai/Faux : l’élongation implique la formation de plusieurs liens peptidiques simultanément
Faux, cela se fait un codon à la fois (donc un a.a et un lien peptidique à la fois)
Quelles sont les trois étapes clefs de l’élongation d’un a.a?
1) L’entrée des ARNt-a.a successifs
2) La formation du lien peptidique
3) La translocation du ribosome
Ou et comment s’attache un ARNt-a.a au ribosome?
Au site A, l’ARNt-a.a arrive lié à un EF1a-GTP (élongation facteur), si l’anticodon s’apparie au codon de l’ARNm, GTP de EF1a est hydrolysé, ce qui entraîne un changement de conformation du ribosome, ce qui rapproche l’a.a de l’ARNt du site A de la chaîne peptidique du site P pour faciliter liaison.
Que se passe-t-il s’il n’y a pas d’appariement anticodon-codon entre l’ARNt-a.a et l’ARNm?
Pas d’hydrolyse et ARNt-a.a lié à EF1-GTP diffuse et laisse le site libre.
Par quel ARNr est catalysé la formation du lien peptidique?
ARNr 28S
Qu’est-ce que la translocation, pourquoi a-t-elle lieu?
Mouvement complexe du ribosome qui permet le décalage des ARNt d’un site vers la gauche, libérant ainsi le site A pour un nouvel ARNt-a.a.
Elle a lieu pcq, suite à la formation du lien peptidique, l’ARNt du site A reçoit la chaîne peptidique, mais le site A n’a pas la place nécessaire pour l’accueillir, donc il doit se déplacer vers le site P.
D’où vient l’énergie nécessaire à la translocation?
1) De la formation du lien peptidique
2) De l’hydrolyse du GTP de EF2
Schématiser grossièrement et expliquer en détails la translocation du ribosome
Correction schéma diapo 21, explications diapos 18 à 22 PDF chapitre 7
Comment le ribosome peut-il être assez flexible pour faire la translocation?
Grâce aux sites de liaison dynamiques entre l’ARNm et les ARNr. Ces derniers changent de conformation continuellement pour lier, accompagner et relâcher les ARNt. Ces changements sont les plus prononcés lors du mouvement de la tête de la petite sous-unité et du bras L1 de la grosse.
De quels deux facteurs dépend la terminaison, et comment agissent-ils?
1) eRF1 (eucaryote release facteur) : ressemble à un ARNt normal et s’adapte à position A ribosome lorsqu’il est positionné sur le codon STOP de l’ARNm pour empêcher d’autres ARNt de lier
2) eRF3 : agit de concert avec eRF1. Hydrolyse son GTP rompre le lien ester entre ARNt du site P et la chaîne peptidique qu’il porte, ce qui la libère.
