chapitre 7

Question 1

Un arbre a un seul locus represente -il la vrai histoire des véritable histoire évolutive ?

Answer 1

Non, il faut un grand nombre de locus

Question 2

diversité vs differencation

Answer 2

1 popu change–> la composition change mais la diversité reste stable.
Cela ne change pas INTRA
Mais inter oui

Question 3

la pente represente la diversité ou la composition

Answer 3

composition qui change

Question 4

que se passe il si sur une branche presente + de subtitution qu’une autre branche

Answer 4

selection positive qui rajoute mutation

Question 5

quell est toujours l’hypothese nulle ?

Answer 5

derive + mutation

evolution neutre

Question 6

que ce passe il au niveau des mutations sur la selection est positive.
Selection purificatrice ?

Answer 6

accumulation de mutation non synonyme

deletion de mutations non synonymes

Question 7

que cela indique si il y a un excés ou un manque de mutations non synonyme

Answer 7

indique une selection

Question 8

quelle est la différence ente un arbre de gène et d’espèces

Answer 8

kjhgv

Question 9

Comment construit on un arbre évolutif ?

Comment nomme t on ça ?

Answer 9

A un gène, un locus on peut detecter une différence dans la séquence des nucléotides chez deux taxons

Phylogénie moléculaire

Question 10

Que signifie des variations génétiques récentes qui sont partagés entre des taxons ?

Commeent appel on ça

Answer 10

Cela indique qu’ils sont phylogénétiquement apparentés et on reçu cet allèle d’un ancêtre commun.

Synapomorphie moléculaire

Question 11

pourquoi on dit que l’arbre phylogenetique n’est pas équivalent à l’arbre des espèces.

Answer 11

Quand on construit une phylogénie moléculaire avec un seul gène (un seul locus), l’arbre résultat relate l’histoire généalogique de CE gène. Cette histoire peut être la même que l’histoire des lignées d’organismes qu’elle veut représenter, mais ce n’est pas toujours le cas.

Question 12

que sont les deux raisons qui expliquent la discordance entre l’arbre d’un gène vs des espèces

Answer 12

la reproduction sexuée et le temps écoulé parfois trop court pour que le tri du polymorphisme ancestral soit complété. ( alors il y a un polymorphisme

Question 13

quelle est la différence au niveau de la transmission entre les taxons sexués ou asexués

Answer 13

• Asexué: transmission des gènes d’une génération à l’autre reflète la généalogie des organismes. VRAI POUR TOUTE LES GÈNES DU GENOME
• Sexué: les individus transmettent seulement la moitié de leur matériel génétique, générations après générations. Cela fait en sorte que les généalogies d’allèles sont entremêlées

Question 14

qu’est ce qu’une coalescence ?

Answer 14

remontant dans te temps au fil d’une généalogique de gènes à partir de deux (ou plusieurs) allèles actuels, on peut identifier le point où on trouve la copie de l’allèle qui est l’ancêtre commun des allèles considérés. Cette fusion des lignées d’allèles en un allèle ancestral est nommée coalescence

Question 15

la coalescence peut elle survenir après la divergence ?

Answer 15

NON

Question 16

lorsqu’on regarde la phylogénie de plusieurs populations qui divergent et deviennent des lignées indépendantes, que sont les scénarios possibles Pour des allèles partagés par deux lignées?

Answer 16

Soit;
La coalescence survient dans le même ordre que l’ordre de divergence entre les populations d’organismes
don arbre de gène = arbre espèces

Ou la coalescence des allèles pré date la divergence des populations.
Alors différence entre les arbres établis et la vrai histoire des population

Question 17

Que faut il pour qu’un allèle remplace l’ancestrale ?

Que se passe il pour la grande majorité des cas pour un allèle neutre ?

Answer 17

Il doit augmenter en fréquence dans les populations

• Arrive par dérive

Question 18

comment appele on le fait qu’un nouvel allèle remplace l’ancestrale ?

Answer 18

Subtitution d’allèle

Question 19

que se passe il avant la subtitution du gène ?

Answer 19

Polymorphisme génétqiue, on a les deux gènes et d’autres peuvent arriver pendant ce temps

Question 20

Comment fait on les arbres pour éviter des problèmes ?

a quel moment on estime que c’est .la plus vraisemblable

Answer 20

On établis les relations phylogénétique avec plusieurs locus ( souvent neutre) voir même le génome entier

Quand une forte majorité de locus révèlent la même histoire,

Question 21

L’évolution moléculaire d’une population réfère à quoi ?

Answer 21

l’évolution de sa composition génétique au fil des générations.

Question 22

Expliquer la différence entre l’évolution moléculaire neutre et adaptative

Answer 22

Évolution neutre: évolution résultant des mutations et de la dérive.

• Les mutations surviennent au hasard.
• La majorité des mutations n’ont pas d’effets sur le phénotype et le fitness.
• La dérive peut éliminer ou fixer des mutations (allèles) dans les populations.
• La dérive est omniprésente.

o Évolution adaptative: évolution résultant de l’action de la sélection. En lien avec les phénotypes et leur fitness.

• Survient EN PLUS de l’évolution neutre.
• La sélection positive peut faire monter en fréquence, voire fixer un allèle
• La sélection négative peut faire baisser en fréquence, voire éliminer un allèle
• Certains régimes de sélection maintiennent la variation

Question 23

dans un contexte phylogénétiques que sont les différences entre les évolutions neutres et adaptatives ?

Answer 23

Évolution neutre:
 Sert de ‘référence’ (car elle est toujours en action)
 Reflète l’histoire et les divergences des populations
 Sert à construire une horloge moléculaire pour dater des événements
o Évolution adaptative:
 Survient EN PLUS de l’évolution neutre
 Affectera différemment les locus neutres vs. ceux déterminant un trait phénotypique sous sélection
 Affectera différemment les mutations synonymes (ne causent pas de changement du phénotype, donc pas affectées par la sélection) ou non-synonymes (peuvent causer un changement de phénotype, donc peut être affecté par la sélection).

Question 24

quelle est l’hypothèse de base de l’évolution ?

Answer 24

L’évolution est neutre

L’évolution neutre sert de ‘’référence’’, car elle est toujours en action. Elle reflète l’histoire et les divergences des populations et sert à construire une horloge moléculaire pour dater les événements.

Question 25

qu,est ce que l’Horloge moléculaire

Quelle force evolutive y participe

Answer 25

L’évolution neutre dans une population (sur une branche) prédit l’accumulation à un rythme régulier de substitutions neutres au fil des générations (comme le tic-tac régulier d’une horloge).
Des allèles sont remplacés par d’autres et la composition de la population change

Question 26

qu’est ce que la signature moléculaire

Answer 26

La sélection naturelle laisse une signature moléculaire (des traces) dans les séquences d’ADN de gènes codants lorsque les phénotypes associés sont sous sélection positive ou négative.

Question 27

l’évolution adaptative survient elle seule ?

Answer 27

Non elle vient en plus de l’évolution neutre