Chapitre 7 Flashcards
Déf génomique
branche de la génétique qui étudie les génomes entiers
Génétique structurale vs fonctionnelle
struc: nature physique des génomes entier
fonc: mode d’expression des gènes et ensemble des prot codé par ces gènes
Qu’est-ce que l’approche shotgun?
c’est une méthode de séquençage (date de 2003) encore utilisée aujourd’hui, l’assemblage virtuelle a permis de consolider l’approche
Quelles sont les étapes du séquençage shotgun?
prend de l’ADN génomique
1. fragmentation aléatoire en millions de fragments
2. création d’une banque ADN
3. séquençage + grand nb de fragments possibles, choisis au hasard
4. overlap les séqu lues
5. overlap des contig pour compléter
Déf d’une banque d’ADN
collection de fragment ADN provenant d’un individu, chaque fragment est inséré dans un vecteur
Déf d’un contig
c’est une séquence non-déterminées lors du 1er assemblage
quelle méthode permet de déterminer la séquence des trous lors d’un shotgun?
long-insertion vector
Comment procède-t-on pour identifier un gène lors du séquençage?
grâce à la bio informatique, possible identifier les portions codantes
Que permet d’analyser la technologie des puces à ADN?
permet de quantifier l’expression des gènes pour une espèce ou un tissus donné
Quel serait un intérêt de la biologie structurale?
permet de mieux tracer les arbres phylogéniques et comprendre l’origine des espèces
Quel serait un intérêt de la biologie fonctionnelle?
bâtir des profils d’expression des gènes dans divers conditions physiologique
identifier les motifs régulateur