Brainscape's Knowledge GenomeTM

Browse over 1 million classes created by top students, professors, publishers, and experts.


See full index

Biomol final > Chapitre 6 > Flashcards

Chapitre 6 Flashcards

1
Q

Les gènes eucaryotes sont mono ou polycistronique et pourquoi

A

monocystronique (un gène a son propre promoteur et fait son propre arnm, code pour 1 seule prot) parce qu’il faut une régulation fine de la transcription gène par gène

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q

Les 3 ARN pol eucaryotes font quoi et leur variété/nombre de transcrit

A

ARN pol 1 et 3 :
Peu de variété mais très nombreux dans les cellules
ARN pol1 : arn 28s, arn 5,8s et arn 18s
ARN pol 3 : ARN 5s, ARN 7S et ARN de transfert

ARN pol 2 :
+++ variété mais très peu nombreux dans cellule

traduction des protéines

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q

quoi de spéciale en périphérie de lARN pol 2 des eucaryotes

A

plus de sous-unité en périphérie (RPB1,2,3…) pour se lier a plus de facteurs de transcritpion

La sous-unité RPB1 de l’aRN pol 2 des eucaryotes a une queue C terminale avec plusieurs répétions de 7 a.a

celle-ci a deux fonctions
1.La queue c temrinale phosphorylée permet de passer de l’étape d’initiation à l’étape d’élongation en recrutant les facteurs d’élongation

  1. recrutement des facteurs de maturation des pré arnm (coiffe, queue…)
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

les 4 séquences conservées du promoteur eucaryote

A

Bre, TATA (-25 et -35), inr (initiator), DPE (downstream promoter element)

habituellement on retrouve 2 ou 3 de ceux-ci

Inr est le plus souvent présent

complexe de préinitiation survient a la boite tata lorsquelle est la (site d’initiation), souvent présent chez les promoteurs des gènes activement transcrits

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q

une seule mutation a l’intérieur de …. diminue drastiquement la transcription mais une mutation entre celle-ci et le site d’initiation change rien

A

la boite tata

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q

Les facteurs de transcription généraux chez les eucaryotes permettent quoi et à quoi ils ressemblent chez les procaryotes

A

permettent la liaison de l’ARN pol au promoteur et l’initiation de la transcription (ouverture de lADN et libération de la pol)

ce sont des facteurs protéiques multimériques
ex: TF2D= TBP (reconnait TATA très fortement) + TAF (reconnais d’autres éléments du promoteur moins fortement)

fonction ressemble a celle de sigma 70 chez les procaryotes

les plus importants sont TF2B, TF2D

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
7
Q

Les TAF dans TF2D ont une fonction autre que lier le promoteur, c’est quoi

A

peuvent réguler l’association TBP-TATA en cachant TBP

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
8
Q

Assemblage du complexe d’initiation de la transcription

A
  1. TF2D contient TBP qui se lie a la boite TATA avec son C terminale courbé qui induit une courbure dans l’ADN

*TBP-TATA sert de plateforme d’échaffaudage pour les autres facteurs de transcriptions qui arrivent apres

  1. TF2B lie l’ADN et la TBP
    son C-terminal lie: TBP, Bre et ADN apres TATA
    son N-terminal lie: pol 2 lorsquelle arrive

3.TF2F arrive avec la pol 2 et la positionne au site d’initiation en se liant au promoteur
*ca stabilise les facteurs déjà placés avec l’ADN (TBP, ADN, TF2B)

  1. TF2E se lie et active TF2H lorsqu’il arrive

TF2H fait
-hydrolyse de l’ATP
-Hélicase
-Phosphorylation de queue ARN pol 2 en C terminal

Permet l’ouverture des brins et phosphoryle la queue pour recruter les facteurs d’élongation (aident à rapidement synthtiser l’ARNm et certains aident à la correction) et certains facteurs de maturation de l’ARN m

La TBP reste collé sur la boite TATA mais tout le reste s’en va et l’ARN pol 2 peut commencer la traduction (elle est libérée)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
9
Q

Qu’est ce qui permet l’accès à l’ADN pour l’ARN pol 2 et pour les facteurs de transcription généraux lors de l’initiation

A

Complexe médiateur contenant des modificateurs de la chromatine et des modificateurs de nucléosomes. Il s’associe avec l’aRN pol 2 et différents facteurs (généraux, activateurs ou inhibiteurs) afin de changer l’ACcès à l’ADN

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
10
Q

La phosphorylation par la,,, des a.a particulier est nécessaire pour le recrutement de chaque…

A

TF2H

facteur différent

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
11
Q

Qu’est ce qui permet l’accès à l’ADN pour l’ARN pol 2 et pour les facteurs de transcription généraux lors de l’élongation

A

Le complexe FACTs vient enlever H2a-H2b des nucléosomes avant le passage de l’ARN pol 2 pour donner accès a l’ADN et le remet tout de suite apres son passage

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
12
Q

Explique comment se passe le clivage et la poly adénylation de l’ARNm

A

Les protéines de clivage et de polyadénylation (CPSF et CsTF ) sont déjà placées sur la queue c terminale de l’ARN pol 2 avant la transcription du signal.

Lorsque le signal est transcrit, CSPF lie la séquence AAAUAAA en amont du site de clivage et le CsTF lie la séquence riche en G/U ou en U en aval du clivage. Les deux prot se lient se qui induit une corubure dans le transcrit et les prot CF1 et CF2 viennent stabiliser le complexe. PAP doit arriver avant que Cf1 et Cf2 coupent l’aRNm puisque celle-ci viendra ajouter 12 adénines à la fois à la fin (ext 3’). PABP2 à chaque tranche de 12 adénines stimule la PAP jusqua temps qu’on atteigne 200-250 A, PABP2 arrête la rx.

La polymérase continue de transcrire malgré ca et c’est Rtt103 qui lie la queue C temrinale et recrute Rat 1 ayant une activité exonucléase. Il va dégrader le nouvel ARN de trop et atteindre la pol qu’il frappe et la pol se dissocie , la transcription se termine.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q

Comment on appelle le modèle de terminaison avec Rat1

A

modèle torpille

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
14
Q

L’épissage peut débuter dès que… et se poursuit souvent …

Il commence souvent

A

le premier intron est transcrit par l’ARN pol et sorti

apres la fin de la transcription

il commence souvent apres l’ajout de la poly-A

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q

Les facteurs de maturation de l’ARNm durant la transcription sont ou et ca fait quoi

A

sont au niveau de la queue c terminale de l’ADN pol et ca rend plus rapide la transcription

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
16
Q

La coiffe en 5’
Ajoutée quand
par qui
c’est quoi qu’on ajoute exactement
Les fonctions de la coiffe

A

Ajoutée quand on a transcrit entre 25-30 nucléo

rx catalysée par une enzyme collée sur la queue C terminale de l’ARN pol

On ajoute une 7-méthylguanosine triphosphate à l’ext 5’

La 7-méthylguanosine possède un méthyl sur l’azote #7 de la guanine et on relie le tout avec le CH3 du nucléotide avant avec un pont triphosphate 5’-5’

fonctions:
protection contre les enzymes hydrolytiques
Site d’attache pour la petite sous-unité des ribosome lors de la traduction
Distingue les ARN m des autres ARN
Permet de se lier à CAP qui permet passage par les pores nucléaire et facilite la maturation de l’ARNm

17
Q

Étapes chimiques de la modulation de la coiffe

A
  1. phosphatase retire le phosphate y
  2. guanosine transférase ajoute une guanine mono-phosphate en liaison inverse (5’-5’)
  3. methyl transférase ajoute un methyl sur la guanine et parfois quelques sucres adjacents
18
Q

Épissage des introns, comment ca se passe

A

séquences conservées de chaque côté des introns d’environ 30-40 nucléotides

il y a aussi une adénine à la position 100 dans l’intron qui est le point de branchement

2 rx de transesterification
1. Le groupement 2’OH de l’adénine (point de branchement) attaque le groupement phosphoryle du G en 5’ de l’intron

il y a alors une liaison triple sur l’adénine

2.Le groupement 3’oH libéré de l’exon 1 vient attaque le groupement phosphoryle en 5’ de l’exon 2, ce qui donne la fusion des deux exons

Ces rx ne sont pas spontanées, on a besoin du spliceosome pour les faires. Il comprend envrion 150 prot dont 5 snArn (U1, U2, U4, U5,U6) et qui peuvent se lier a des protéines nucléaires pour former des particules ribonucléoprotéiques.

19
Q

Explique le role du spliceosome

A

Les rx de l’épissage ne sont pas spontanées, on a besoin du spliceosome pour les faires. Il comprend envrion 150 prot dont 5 snArn (U1, U2, U4, U5,U6) et qui peuvent se lier a des protéines nucléaires pour former des particules ribonucléoprotéiques.

snARN U1 se lie en 5’ de l’intron

U2AF se lie à l’extrémité 3’ de l’intron

Permet à BBP de se lier à l’adénine (pt de branchement)

snRNP U2 enlève BBP et se place a sa place, ce qui fait ressortir l’adénine

snRNP U4 et U6 sont déjà assemblés et snRNp U5 vient s’y lier

Les 3 prot créent un complexe avec U1 et U2 pour les rapprocher (on approche le A du G en 5’ de l’intron)

Reconfiguration
U1 part
U4 part
U6 prend la place de U1 en s’associant avec U2 et U5
Catalytiquement actif forme premiere rx de transesterification

U5 induit la deuxieme rx de transesterification

intron est dégradé par enzyme de débranchement et Rnase qui forme l’exosome

20
Q

qui aide a la reconnaissance intron-exon?

A

Protéines SR se lient sur des séquences d’amplification d’épissage (ESE) et peuvent faire des interaction prot-prot qui aide a la liaison avec le spliceosome

Protéine U2Af est particulièrement importante pour aider a la liaison du U2 au pt de branchement

21
Q

comment on explique que différents arnm peuvent etre produit dans différents tissus ou différents stades de développement avec le meme gene

A

épissage alternatif (possibilité d’assembler les exons selon différents patrons d’assemblage )

22
Q

comment l’épissage est régulé

A

protéines liant l’aDn sur des sites près de l’épissage

represseur peut empecher un exon de se mettre

activateur peut promouvoir de mettre un exon la

ils interagissent aussi avec les facteurs d’épissage

23
Q

Est ce que les ARNm contiennent juste des séquences codantes?

A

non, avant le AUG on voit le 5’UTR et apres le codon stop on voit le 3’UTR.
C’est des zones non-codantes mais régulatrices

24
Q

L’édition des bases des ARNm mature se voit chez quels organisme en général et consiste en quoi

A

désamination de A ou de C (A donne I, C donne U)
insertion ou délétion d’uridine

on voit souvent ca chez mitochondries des protozoaires des plantes mais rarement chez l’humain

25
Q

La stabilité de l’ARNm détermine…

A

un controle de l’arrêt de la traduction (ex: une prot qui doit etre peut produite, son arnm sera instable)

26
Q

Les mécanismes de dégradation de l’ARNm

A

La plupart du temps, on commence par dégrader la queue poly A

Déadénylase dégrade la queue et exonucléases 3’ continuent le travaille (il s’agit d’un exosome)

Si on commence par la coiffe, il faut une enzyme décoiffante pour enlever le 7-méthylguanoside et ensuite exonucléases 5’

on peut aussi couper au milieu avec une endonucléase et dégrader ensuite avec exonucléases 5’ et 3’

27
Q

Chaque ARNm est prédestiné à un type de dégradation spécifique, comment?

A

Dépend des prot liées à l’ARN m qui peuvent protéger certains bouts ou recruter les enzymes de dégradation et a la séquence d’ARNm

28
Q

Arnm à dégradation ultra rapide

A

séquence AUUUA ++ à l’ext 3’ non traduite est détectée rapidement par la déadénylase et l’exosome

29
Q

Explique les rôle des Karyophérines et les séquences qu’elles lient

A

Protéine de transport qui permettent entre autre de sortir l’ARNm du noyau

Importine (amene au noyau): se lie à séquence spécifique d’acide aminé NLS

Exportine(sort du noyau): se lie a séquence spécifique d’acide aminé NES

Les karyophérines se lient aux séquence d’acide aminé des protéines sur l’ARNm (ex: prot de l’épissage, prot pour la coiffe ou pour la queue)

Biomol final (4 decks)

Brainscape helps you reach your goals faster, through stronger study habits.
© 2024 Bold Learning Solutions. Terms and Conditions