Chapitre 5 (Transcription & Maturation de l'ARNm) Flashcards
Quand est-ce que débute l’épissage?
Quand le premier intron a complètement émergé de la polymérase
Comment les jonctions intron-exon peuvent-elles être déterminées?
En comparant la séquence génomique à celle des ARNm matures.
Quelles sont les régions permettant la reconnaissance des introns et des exons?
1- Le point de branchement: Adénine à environ 20 à 50 pb de l’extrémité 3’
2- Il y a toujours un CG à l’extérminté5’
3- Il y a toujours un AG à l’extrémité 3’
L’épissage de l’ARNm se fait en 2 réactions de transestérification. Expliquez les deux réactions.
La première: Le groupement -OH de l’adénine situé au site de branchement attaque le groupement phosphoryle de la guanine de l’extrémité 5’. Cela fait apparaître la jonction triple.
La seconde: 3’-OH de l’exon devient nucléophile et attaque le groupement phosphoryle au site d’épissage 3’ de l’intron. Les exons épissés permettent la libération de l’intron.
Donnez les caractéristiques des snARN
1- riches en uracile
2- ne sont pas des ARNm
3- vie sous forme d’ARN -> ne sont jamais traduits
4- participent directement à l’épissage des pré-ARNm (U1, U2, U4, U5, U6)
Une fois associé à des protéines, les snARN forment des particules nommées ribonucléoprotéiques (snARP). Quelle sont les rôles de ces particules?
Reconnaître les sites d’épissages
Rapprocher les sites
Réaction de clivage et de ligation
Comment le complexe s’associe-t-il?
par appariement des bases, les ARN des snARP dictent son assemblage
Quelles sont les 6 grandes étapes de l’assemblage du complexe d’épissage?
1- U1 reconnaît le site d’épissage, la protéine U2AF lie la zone polypyrimidine près du site d’épissage 3’. Cela permet au BBP de se lier au site de branchement
2- U2 déplace la BBP et lie le site de branchement, l’adénine ressort du brin
3- U4 et U6 se lient à U5 et créent un complexe avec U1 et U2. Ceci forme le complexe d’épissage.
4- Une fois le complexe formé, une reconfiguration extensive des appariements des bases libère les snARN U1 et U4
5- le complexe devient catalytiquement actif et induit la première réaction de transestérification qui forme le lien 2’-5’ entre le sucre de l’adénine et le phosphate du guanine en 5’
6- U5 termine le rapprochement des extrémités des exons et induit la 2e réaction de transestérification.
Quelles sont les fonctions des protéines SR?
elles peuvent faire des liaisons protéines-protéines. leur présence sur les introns favorise la formation du spliceosome.
Quelles sont les fonctions des ribonucléoprotéines hétérogènes nucléaires (hnRNP)?
Réguler l’association du complexe d’épissage au pré-ARNm sans interagir directement avec ce dernier.
Comment l’alternative d’épissage est-elle régulée?
Selon le type cellulaire et en fonction du développement
Comment l’épissage alternatif est-il régulé?
Par des protéines liant l’ARN sur des séquences spécifiques près des sites d’épissage
L’ARNm mature contient-il toujours des régions non-codantes?
oui! elles sont situées à ses deux extrémités et sont appelées région 5’UTR et 3’ UTR
Qu’est-ce qui délimite la région codante?
le codon initiateur et le codon d’arrêt
Quels sont les deux mécanismes d’éditions?
La désamination (A ou C)
Insertion/délétion d’uridine
