Chapitre 5 (Transcription & Maturation de l'ARNm) Flashcards
Quand est-ce que débute l’épissage?
Quand le premier intron a complètement émergé de la polymérase
Comment les jonctions intron-exon peuvent-elles être déterminées?
En comparant la séquence génomique à celle des ARNm matures.
Quelles sont les régions permettant la reconnaissance des introns et des exons?
1- Le point de branchement: Adénine à environ 20 à 50 pb de l’extrémité 3’
2- Il y a toujours un CG à l’extérminté5’
3- Il y a toujours un AG à l’extrémité 3’
L’épissage de l’ARNm se fait en 2 réactions de transestérification. Expliquez les deux réactions.
La première: Le groupement -OH de l’adénine situé au site de branchement attaque le groupement phosphoryle de la guanine de l’extrémité 5’. Cela fait apparaître la jonction triple.
La seconde: 3’-OH de l’exon devient nucléophile et attaque le groupement phosphoryle au site d’épissage 3’ de l’intron. Les exons épissés permettent la libération de l’intron.
Donnez les caractéristiques des snARN
1- riches en uracile
2- ne sont pas des ARNm
3- vie sous forme d’ARN -> ne sont jamais traduits
4- participent directement à l’épissage des pré-ARNm (U1, U2, U4, U5, U6)
Une fois associé à des protéines, les snARN forment des particules nommées ribonucléoprotéiques (snARP). Quelle sont les rôles de ces particules?
Reconnaître les sites d’épissages
Rapprocher les sites
Réaction de clivage et de ligation
Comment le complexe s’associe-t-il?
par appariement des bases, les ARN des snARP dictent son assemblage
Quelles sont les 6 grandes étapes de l’assemblage du complexe d’épissage?
1- U1 reconnaît le site d’épissage, la protéine U2AF lie la zone polypyrimidine près du site d’épissage 3’. Cela permet au BBP de se lier au site de branchement
2- U2 déplace la BBP et lie le site de branchement, l’adénine ressort du brin
3- U4 et U6 se lient à U5 et créent un complexe avec U1 et U2. Ceci forme le complexe d’épissage.
4- Une fois le complexe formé, une reconfiguration extensive des appariements des bases libère les snARN U1 et U4
5- le complexe devient catalytiquement actif et induit la première réaction de transestérification qui forme le lien 2’-5’ entre le sucre de l’adénine et le phosphate du guanine en 5’
6- U5 termine le rapprochement des extrémités des exons et induit la 2e réaction de transestérification.
Quelles sont les fonctions des protéines SR?
elles peuvent faire des liaisons protéines-protéines. leur présence sur les introns favorise la formation du spliceosome.
Quelles sont les fonctions des ribonucléoprotéines hétérogènes nucléaires (hnRNP)?
Réguler l’association du complexe d’épissage au pré-ARNm sans interagir directement avec ce dernier.
Comment l’alternative d’épissage est-elle régulée?
Selon le type cellulaire et en fonction du développement
Comment l’épissage alternatif est-il régulé?
Par des protéines liant l’ARN sur des séquences spécifiques près des sites d’épissage
L’ARNm mature contient-il toujours des régions non-codantes?
oui! elles sont situées à ses deux extrémités et sont appelées région 5’UTR et 3’ UTR
Qu’est-ce qui délimite la région codante?
le codon initiateur et le codon d’arrêt
Quels sont les deux mécanismes d’éditions?
La désamination (A ou C)
Insertion/délétion d’uridine
La concentration d’un ARNm dépend de..?
son taux de transcription et de sa stabilité (taux de dégradation)
Quelles sont les 3 enzymes permettant le mécanisme de dégradation?
1- Exonucléase à partir de 5’
2- Exonucléase à partir de 3’
3- Endonucléase
Par où commence la dégradation des ARNm?
par le bout le moins bien protégé!
Par quoi sont transportés les ARNm entre le noyau et le cytoplasme?
Par des karyophérines qui reconnaissent et lient une séquence spécifique d’acides aminés sur les protéines à transporter.
Le complément de protéine nécessaire au transport des ARNm vers le cytoplasme incluent quelles protéines?
- protéines qui reconnaissent les exons
- protéines qui s’associent à la coiffe en 5’
- protéines qui s’associent à la queue poly-A
Quelles sont les 5 ARN impliqués dans la traduction et quels sont leurs rôles?
ARNt: adaptateurs entre l’ARNm et les acides aminés. Reconnaissance des exons
miARN: appariement à une séquence complémentaire de l’ARNm
snARN: participent à l’épissage des ARNm
ARNM: intermédiaire entre le gène et la protéine
ARNr: rôle structural et enzymatique dans les ribosomes, assure la traduction
Qu’est-ce que le ribosome?
Organite composé de 2 sous-unités (petites et grandes). Il est composé de protéines ribosomales et d’ARNr
Où sont produits les ARNr?
Dans le nucléole
Quelles sont les modifications chimiques qui se produisent sur le long précurseur d’ARNr?
- méthylation en 2’-OH des sucres des nucléotides
- isomérisations des uridines en pseudouridines (la pseudouridine permet de rigidifier la structure secondaire-tertiaire des ARN)
À quoi servent les snARN? (small nuclear RNA)
Ils servent de guide pour les modifications chimiques et le clivage des précurseurs des ARNr.
La structure secondaire des ARNt est subdivisée en 4 régions. Quelles sont-elles?
Boucle D et boucle T(psi)CG
Boucle anticodon et bras accepteurs de l’acide aminé
Qu’implique la maturation des ARNt?
- clivage au 5’ par la RNase P
- modification de plusieurs bases (environ 10% des nucléotides)
- Épissage (seulement certains)
Il existe 3 types de modifications, quelles sont-elles?
1- Les U en 3’ sont remplacées par CCA (un acide aminé est attaché à cette extrémité plus tard)
2- Méthylation sur 2’ des ribososes (méthylguanine)
3- Conversion de U spécifiques en pseudouridine, ribothymidine (T) ou dihydrouridine (D)
