Chapitre 5 : Compartiments (complet) Flashcards
Que peuvent devoir traverser les protéines pour atteindre leur localisation cible?
1) Une membrane
2) Deux membranes
3) Pore
Qu’est-ce que le principe de continuité?
Deux compartiments connectés directement, donc permettant la diffusion directe de protéines.
Que sont les trois ingrédients nécessaires pour placer une protéine dans son compartiment correspondant?
1) Énergie (transport actif)
2) Étiquette (signal peptidique, et parfois sucre)
3) Destination (récepteur)
Comment fonctionne le transport des protéines avec les deux membranes de la mitochondrie
Correction diapo 9 PDF chapitre 5
Pourquoi a-t-on besoin de peptidases suite à l’incorporation mitochondriale de protéines?
1) Pour couper les signaux d’adresse afin d’éviter que la protéine revienne en arrière
2) Pour permettre à la protéine rendue linéaire par le signal peptidique, ou une autre séquence d’a.a, de se replier et de devenir fonctionnelle
Décrire la différence entre l’incorporation de protéines chaperonnées vs non chaperonnées au niveau du TOM
Les sous-unités 20 et 22 de TOM (TOM20-22) recevront les peptides non chaperonnés, alors que TOM70 recevra ceux chaperonnés par Hsp70.
Quelles sont les deux différences entre l’incorporation à travers les deux membranes mitochondriales et celle à travers les deux membranes du cholorplaste?
1) Protéines analogues à TOM et TIM, s’appellent respectivement TOC et TIC (transport outer/inner chloroplaste).
2) Nécessite signaux supplémentaires pour avoir accès au 3e compartiment (thylakoïde) et à sa membrane
Quelles sont les deux types de réticulum, en quoi diffèrent-ils?
Rugueux (RER) : plus dense
Lisse (REL) : moins dense
Quelles sont les fonctions du REL, et du RER?
REL : synthèse de lipides (production de membranes)
RER : synthèse de protéines destinées à la sécrétion
Schématiser et expliquer l’ajout de lipides à la membrane
Correction diapo 15 PDF chapitre 5
Vrai/Faux : les nouveaux phospholipides peuvent s’ajouter sur les deux feuillets de la membrane
Faux, les nouveaux phospholipides peuvent slm s’ajouter au feuillet externe de la membrane, il faut des flippases (dont des scramblases) pour les distribuer par la suite.
Ou se regroupent les lipides destinés à un organite particulier? Schématiser grossièrement si nécessaire
Site de bourgeonnement
Quelles sont les fonctions des peroxysomes, et les enzymes correspondantes?
1) Oxydation des molécules organiques par oxydase
2) Neutralisation du H2O2 par peroxydase et catalase
Quelle séquence portent les protéines pérox et permet leur incorporation post-traductionnelle aux vésicules précurseurs?
La séquences SKL
Schématiser et expliquer la synthèse de peroxysomes ; doit contenir RER, REL, peroxines, pexs (1,5, etc.), de nuovo et croissance-fission
Correction diapo 20 PDF chapitre 5
Vrai/Faux : fonction et forme du peroxysome peuvent changer selon l’environnement et les besoins cellulaires
Vrai
À quel niveau se fait le contrôle du taux de multiplication des peroxysomes? Pourquoi?
Au niveau transcriptionnel, pcq dépend de protéines peroxines pour sa croissance, donc si on en a moins, moins de peroxysomes peuvent maturer.
Vrai/Faux : un même peroxysome garde toujours la même fonction
Faux, un peroxysome peut se séparer en deux ayant des activités métaboliques différentes
Quel est l’équivalent du peroxysome chez les champignon? À quoi sert-il?
Le corps de Woronin, sert à guérir les hyphes qui ont des trous en les bouchant, réduisant ainsi la perte de cytosol
Quel est l’équivalent du peroxysome chez les graines? À quoi sert-il?
Glyoxysome, sert à transformer les lipides de la plante mère en sucres pour faire la néoglucogenèse, pcq graines ne peuvent pas faire photosynthèse au début de sa croissance.
Quel différence y a-t-il entre la réception de lipides chez les mitochondries/chloroplastes et les membranes plasmiques normales?
Ils ne reçoivent pas le traffic vésiculaire du RE, les lipides de celui-ci leur sont transférés par des protéines d’échange de phospholipides (PEP)
Comment s’appelle le RE du muscle squelettique? Schématiser grossièrement et expliquer son rôle
Correction diapo 28 PDF chapitre 5
Vrai/Faux : entrée des protéines dans le RE est co-traductionnelle, et l’énergie provient de l’hydrolyse d’ATP
Faux, l’énergie provient de la synthèse du peptide par le ribosome
Qu’est-ce qu’un signal peptidique? Schématiser le sur son peptide, et identifier les séquences utiles
Une hélice-a hydrophobe transmembranaire et N-terminale de 20 a.a appelée PSIT (peptide signal d’initiation de transfert).
Correction diapo 29 PDF chapitre 5
De quoi peut être suivi le PSIT? À quoi sert-il?
Un site de clivage AXA, qui est une cible pour des peptidases membranaires à la fin de la traduction
Décrire l’attachement du signal peptidique à la membrane avant son incorporation
1) SRP (signal reconnaissance particule) est une GTPase soluble formée de 6 protéines et d’un ARN, qui contient poche hydrophobe qui reconnaît PSIT fraîchement traduit (donc le reste du peptide est encore en synthèse dans le ribosome)
2) Liaison SRP-PSIT bloque le site A du ribosome, ce qui interrompt la synthèse.
3) SRP-PSIT-Ribosome lie récepteur SRP sur la membrane du RER.
4) Une fois attachée, SRP hydrolyse son GTP, ce qui relâche PSIT toujours attaché au ribosome et l’insère dans un translocateur adjacent.
Schématiser grossièrement et expliquer le passage de PSIT dans translocateur concerné ; doit contenir les conformations ouverte, fermée, le bouchon, la couture, le PSIT et le reste du peptide
Correction diapo 33 PDF chapitre 5
Vrai/Faux : un peptide du côté C-terminal d’AXA sera membranaire
Faux, toute la partie du peptide située du côté C-terminal d’AXA sera relâché dans le RE, donc soluble
Quelle caractéristique du signal peptidique détermine quelle extrémité du peptide sera cytosolique lors de la translocation dans le RER? Schématiser grossièrement
L’orientation du PSIT, déterminé selon la position en C-terminal ou N-terminal des charges (+) du signal peptidique. Les charges (+) sont toujours du côté cytosolique.
Quel est le deuxième signal qui peut produire une protéine membranaire lors de la translocation? Comment?
Le SAT (séquence d’arrêt de translocation), il s’agit d’une hélice-a hydrophobe, comme PSIT, qui ne peut pas traverser le translocateur.
Vrai/Faux : les protéines comportant des hélices-a hydrophobes sont synthétisées dans le RER
Vrai, sauf les protéines mitochondriales et chloroplastiques
Schématiser grossièrement la disposition membranaire des protéines avec les séquences suivantes ; identifier les milieux cellulaires et les extrémités peptidiques :
1) NH2–++–PSIT–SAT–++–PSIT–SAT–C
2) NH2–SAT–++–PSIT–AXA–++–PSIT–C
3) NH2–PSIT–++–SAT–PSIT–++–AXA–SAT–C
Les charges (+) doivent toujours être du côté cytosolique, et les PSIT et SAT doivent être transmembranaires