Chapitre 4 : Noyau (complet) Flashcards
Nommer et expliquer les deux fonctions principales du noyau chez les eucaryotes
1) Protéger l’ADN de collisions potentielles avec des moteurs protéiques en séquestrant les molécules d’ADN
2) Empêcher la traduction précoce d’ARNm immatures (avant excision d’introns) en contrôlant leur sortie
Pourquoi les procaryotes n’ont pas besoin de noyau? Expliquer selon les fonctions du noyau eucaryote
1) N’ont pas de moteurs protéiques dans le cytoplasme, donc pas besoin de protéger l’ADN
2) ARNm bactériens n’ont pas d’introns, la transcription et la traduction se font en simultané dans le cytoplasme
Qu’est ce qui caractérise une séquence 1) conservée? et 2) non-conservée?
1) Qui est commune aux espèces ayant un ancêtre commun.
2) Inversement
Qu’est ce qui caractérise une séquence 1) codante? et 2) non-codante?
1) Qui contient l’information nécessaire à la synthèse d’une protéine
2) Inversement
Qu’est ce qui caractérise une séquence 1) exprimée? et 2) non-exprimée?
1) Qui est active, autrement dit, qui, selon la cellule est utilisée.
2) Inversement
Qu’est ce qui caractérise une séquence 1) unique? et 2) répétée?
1) Qui n’apparaît qu’une fois dans un génome haploide, donc deux fois chez l’humain (pcq paires de chromosomes identiques)
2) Qui apparaît plusieurs fois sur un même gène ou dans un même génome
Qu’est ce qui caractérise une séquence régulatrice?
Qui est généralement non-codante, mais est exprimée pour réguler le nombre de protéines traduite depuis un gène.
Qu’est ce qui caractérise une séquence consensus?
Qui est composée du nucléotides présent le plus souvent à chaque position du gène entre les espèces.
Attention : n’existe chez aucune des espèces
Quel genre de séquences retrouverons-nous dans la séquence unique de l’ADN? Donner des exemples si possible
Exprimées, codantes/non-codantes, régulatrices, conservées
Ex : Introns, exons (forment gène), autres séquences uniques
Quel genre de séquences retrouverons-nous dans la séquence répétée de l’ADN? Donner des exemples si possible
Non-exprimées, non-codantes, non-conservées
Ex : transposons, télomères/centromères, duplications de segments chromosomiques durant le chevauchement de la méiose
Qu’est-ce qu’un BLAST? et son équivalent pour les acides aminés?
Un BLAST est un alignement d’ADN pour comparer les bases entre différents organismes, afin d’établir une séquence consensus ayant la base majoritaires à chaque position du brin.
L’équivalent pour les a.a est un BLAST avec des protéines, afin d’établir une séquence consensus, qui est ayant l’a.a majoritaire à chaque position du peptide
Quelle est la solution à l’instabilité du compactage causé par les groupements P chargés (-)?
Les enrouler autours de protéines chargées (+) : les histones assemblées en nucléosomes.
De quoi sont composés les nucléosomes? et combien de pb peut on enrouler autours?
Des bobines composées de 8 histones (4 paires de 2 identiques) autours desquelles s’enroulent 150pb
Nommer les deux segments des histones, à quoi servent-ils?
1) Queues N-terminales : permettent la régulation du passage d’euchromatine à hétérochromatine selon les modifications, parce qu’elles sortent du nucléosome
2) Parties C-terminales : permettent l’assemblement des histones en nucléosomes, parce qu’elles sont autocomplémentaires.
Laquelle des condensations de l’ADN peut être transcrite en ARNm?
L’euchromatine (11nm)
Quelle protéine facilite le passage de l’euchromatine à l’hétérochromatine? Se baser sur la structure de l’hétérochromatine
L’histone H1, qui permet de rapprocher l’ADN entrant et sortant du nucléosome, ce qui favorise leur empilement en fibre de 30nm (hétérochromatine)
À quoi servent les protéines SIR?
Lorsque les queues d’histones des nucléosomes de l’hétérochromatine sont compatibles, faire des boucles avec celle-ci pour la condenser davantage
Ou se trouve le nucléole et quel est le rôle respectif de chacun de ses deux composants
Dans le noyau, il s’agit du regroupement des zones plus sombres au microscope MET
1) Fibrillaire (plus sombre au MET) : au centre, site de production de l’ARNr (ribosomal)
2) Granuleux (plus clair au MET) : en périphérie, site d’assemblage des sous-unités ribosomales (ARNr et protéines)
Schématiser et expliquer les étapes de la synthèse de ribosomes ; doit contenir les milieux cellulaires
Correction diapo 21 PDF chapitre 4
Pourquoi les ARNm doivent-ils être épissés?
Parce qu’ils ont des séquences exprimés non-codantes non-régulatrices, donc inutiles, ayant été transcrites sur l’ARNm. Par exemple des introns.
Que font les snRNPs, ou les retrouve-t-on?
Ils participent à l’épissage des ARNm en liant les séquences spécifiques au extrémités des introns, ce qui permet de les enlever.
Vu qu’ils travaillent avec les transcrits d’ADN, ils sont un peu partout dans le noyau.
Que font les snoRNPs, ou les retrouve-t-on?
Ils participent à l’épissage des ARNr précurseurs en les modifiant et en les coupant.
Vu qu’ils travaillent avec les ARNr, ils sont confinés aux nucléoles du noyau.
Que sont les sn/snoRNPs? et ou sont-ils synthétisés?
Ce sont des complexes ARNsno/sn-protéines qui sont synthétisés dans les corps de Cajal.
Quelles sont les trois parties du chromosomes essentielles à la division cellulaire et leur rôle?
1) Origine de réplication : permet la duplication de l’ADN durant la phase S du cycle.
2) Télomères : protègent les extrémités des chromosomes et s’assurent qu’ils sont répliqués au complet
3) Centromères : permettent la liaison des microtubules aux chromosomes grâce aux kinétochores lors de la séparation des chromosomes dupliqués
Qu’est-ce qui différencie l’ORI de la levure de celui de l’Homme?
L’ORI de la levure a toujours la même séquence spécifique riche en A-T, alors que chaque ORI humain a une séquence différente
Qu’est-ce qui tiens ensemble les chromatides sœurs suite à la phase S
Les cohésines, qui les tiens jusqu’à l’anaphase
Donner deux différences entre les cohésines et les condesines.
Cohésine : - gardent les chromatides sœurs attachées
- liées de la fin de la phase S à l’anaphase
Condensines : - aident à condenser la chromatide en chromosomes
- liées de la prophase à la télophase
Comment les microtubules s’attachent-ils au chromosomes lors de la mitose?
Grâce aux kinétochores, qui lient spécifiquement le centromère du chromosome et attachent les microtubules au chromosome.
Qu’est-ce que CENP? à quoi ça sert?
CENP est une variation de l’histone 3 qui définissent les centromères et aident les kinétochores à s’attacher.
Quelles sont, en ordre, les 4 phases de la division cellulaire?
1) Gap 1 (G1)
2) Phase S (réplication)
3) Gap 2 (G2)
4) Phase M (mitose et cytokinèse)
Quel rôle joue les MTOCs dans la division cellulaire et à quel moment est-il répliqué?
Les MTOCs, ou centrosomes, servent à déplacer les chromatides pendant la mitose et à éloigner les pôles gauche et droit.
Le MTOC est répliqué pendant les phases S et G2.
Quels sont les 3 types de microtubules des MTOCs et leurs rôles ? Schématiser et expliquer
1) Chevauchants : de chaque pôle lié par kinésine, action de laquelle éloigne les pôles
2) Kinétochoriens : lient le kinétochore du chromosome pour le déplacer
3) ? Astériens : servent de structure aux pôles
Correction schéma diapo 31 PDF chapitre 4
Quelles sont les 5 étapes de la mitose en ordre
1) Prophase
2) Prométaphase
3) Métaphase
4) Anaphase
5) Télophase
En considérant les MTOCs, microtubules et moteurs protéiques, décrire la prophase. Schématiser le mécanisme
Kinésines sont groupées par deux, une qui marche, du (-) vers le (+), sur un microtubule chevauchant du pôle droit, une qui marche sur un microtubule chevauchant du pôle gauche. Au final, leur mouvement s’annule, mais les microtubules bougent, donc les MTOCs des deux pôles s’éloignent du fuseau mitotique
Correction schéma diapo 32 PDF chapitre 4
En considérant les MTOCs, microtubules et moteurs protéiques, décrire la prométaphase. Schématiser
La dynéine dans les kinétochores du chromosome lie latéralement microtubule astral et marche vers le (-), soit vers le MTOC. Une fois rendu, l’attachement est converti de latéral à direct grâce à la croissance et l’attachement d’un nouveau microtubule dit kinétochorien. Finalement, un autre microtubule kinétochorien du pôle opposé lie le chromosome.
Correction schéma diapo 33 PDF chapitre 4
En considérant les MTOCs, microtubules et moteurs protéiques, décrire la métaphase
Dure très peu longtemps, tous les chromosomes sont au centre
En considérant les MTOCs, microtubules et moteurs protéiques, décrire l’anaphase
Anaphase A : Microtubules kinétochoriens se raccourcissent, car son dépolymérisés lors de leur détachement du kinétochore à mesure que la dynéine kinétochorienne avance dessus.
Anaphase B : Microtubules chevauchants continuent d’éloigner les pôle du fuseau mitotique grâce à l’action de la kinésine
Cela et la dégradation des cohésines permet la séparation des chromatides sœurs
Correction schéma diapo 34 PDF chapitre 4
Quel est l’équivalent du MTOC chez les plantes? Schématiser
Des complexes yTuRC libres dans cytoplasme qui s’attachent au microtubules existants ou au RE et définissent le site de naissance d’un nouveau microtubule. Durant mitose, fuseau mitotique construit par ces yTuRC qui se placent à des endroits stratégiques. Moteurs protéiques fonctionnent comme animaux.
Correction schéma diapo 35 PDF chapitre 4
Qu’est-ce que la cytokinèse?
La division du cytosol
Qu’est-ce qui différencie la cytokinèse animale, végétale et bactérienne?
Animale : Anneau contractile d’actine-F se serre grâce à myosine
Végétale : Appareil de Golgi libères vésicules remplies de matériaux de construction (précurseurs cellulose) qui sont acheminées jusqu’au centre de la cellule grâce à kinésine d’un réseau de microtubules nommé phragmoplaste. Une fois au centre, membrane vésicules fusionnent pour former paroi, et matériaux sont libérés.
Bactérienne : Ceinture de FtsZ (filament intermédiaire) se serre grâce à dépolymérisation du filament.
Qu’est-ce qui différencie la mitose de la méiose?
La ploidie des cellules produites : mitose produit deux cellules diploides fonctionnelles, alors que méiose produit quatre cellules haploides (gamètes)
Nommer les 2 grandes étapes de la méiose et leurs sous-étapes en ordre
Méiose I (séparation des chromosomes homologues) : Prophase I, Prométaphase I, Métaphase I, Anaphase I Télophase I
Méiose II (séparation des chromatides sœurs) : Prophase II, Prométaphase II, Métaphase II, Anaphase II Télophase II
Quels sont les deux processus responsables de l’unicité génétique de chaque gamète et quand se produisent-ils?
L’enjambement des bivalents (prophase I) et le brassage interchromosomique (anaphase I)
Qu’est-ce qu’un bivalent? Qu’est-ce qui permet sa formation?
L’assemblement des chromosomes homologues.
Le complexe synaptonémal (SCP) composé surtout de cohésines qui forme et stabilise le bivalent
Quelle est la différence entre le bivalent et le chiasma
Bivalent est l’assemblement des chromosomes en structure droite.
Chiasma est une structure en X caractéristique à l’enjambement sur un chromosome, il peut y avoir plusieurs chiamsas sur un bivalent.
Schématiser et expliquer la recombinaison du bivalent
Correction diapo 42 PDF chapitre 4
Vrai ou faux : si un brin de chaque chromosome est coupé deux fois, la recombinaison a lieu
Faux, c’est lorsque tous les brins de chaque chromosome sont coupés une fois
Quelle est la particularité de RecA, et ou la retrouve-t-on?
Elle peut simultanément lier un simple brin et un double brin d’ADN. Elle est retrouvée à proximité des SCP et des chiasmas.
Schématiser et expliquer les différences entre la méiose et la mitose ; doit contenir protéines importante et nom des étapes
Correction diapo 46 PDF chapitre 4
Quelle est la similarité entre l’enveloppe nucléaire et la membrane mitochondriale?
Les deux ont deux membranes et un espace intermembranaire
Qu’est-ce qui permet la continuité entre le cytoplasme et le nucléoplasme?
La présence de pores nucléaires permettant la diffusion directe, mais conditionnelle, de certaines substances
Quelles molécules peuvent diffuser librement à travers le pore nucléaire (CPN)? et qu’en est-il des autres?
Les molécules de moins de 9nm, les autres doivent activement ouvrir le pore davantage pour passer.
Quelles sont les signaux pour le transport actif et leur récepteur respectif?
Importation : Signal de Localisation Nucléaire (NLS) et récepteur de karyophérine importine, permet entrée dans le noyau à travers le pore.
Exportation : Signal d’Exportation Nucléaire (NES) et récepteur karyophérine exportine, permet sortie du noyau à travers le pore.
Qu’est-ce qui différentie NES de NLS?
NLS est un peptide caractérisé par une forte charge (+), alors que NES est un peptide caractérisé par une hélice-a amphiphile dont la partie hydrophobe est surtout faite de Leucine (L)
Quels sont les deux sites de liaison sur les karyophérines?
Site signal-spécifique et site Ran-GTP
Schématiser et expliquer le fonctionnement de Ran-GTP avec karyophérine ; doit contenir toutes les protéines et structure pertinentes
Correction diapo 51 PDF chapitre 4
Schématiser CPN et décrire le rôle des différentes nucléoporines
Correction diapo 52 PDF chapitre 4
Expliquer les 4 transports nucléaires alternatifs de protéines membranaires
1) Rétention de diffusion : protéine membranaire rencontre CPN et diffuse à travers SANS TOUCHER au FG-Nups. Pour empêcher protéine de retourner du côté cytoplasme, elle lie chromatine grâce à domaine de liaison spécifique
2) Par facteur de transport : vu précédemment, par le biais de karyophérines
3) Par motifs de tri : comme facteur de transport, mais protéines reconnue par karyophérine dès début de sa traduction
4) Par vésicules : protéine diffuse à travers membrane par vésicules sans karyophérines! On peut mettre grosses protéines, ou plusieurs protéines dans vésicule
Schématiser et expliquer les facteurs d’attachement et de détachement des protéines au karyophérines (importines et exportines) ; doit contenir Ran-GTP et GDP, GEF et GAP et milieux cellulaires
Correction diapo 55 PDF chapitre 4
