Chapitre 4 : Réparation de l'ADN et transposition COPY Flashcards
Quels sont les 3 manières de classer de mutations?c’est-À-dire qu’elles peuvent avoir un effet sur quel élément?
- structure: simple(ponctuelle) et profonde
- fonction: perte de fonciton, gain
- valeur adaptative: néfaste ou bénéfique
Comment varie l’impact de la mutation?
Selon le type cellulaire (somatique ou germinale) et le moment du développement
Est-ce que les mutations dans les cellules germinales seront transmises à la descendance?
oui, mutations héréditaire
Quels sont les effets de la mutation? p.3
- Change séquence codant prot (la protéine produite sera différente
- change région régulatrice de l’expression génique / structure globale de l’ADN : protéine n’est pas modifiée mais plutot n’Est plus produite
Quelles sont les mutations ponctuelles?
Substitutions des nucléotides
indels : isertion et délétion des paires nucléotides
Quelles sont les modifications profondes?
-Large insertion ou délétion
- Réarrangement chromosomique (changer l’ordre des gènes=Translocation, recombinaison aberrante, transposon, inversion)
- Amplification génétique
Qu’est-ce que la substitution?mutation ______
mutation simple (ponctuelle)
remplacement d’un nucléotide, (erreur pendant la rép qui n’est pas réparée) et éventuellement
d’une paire de nucléotides, par un autre (nucléotide sur brin matrice mauvais fait associer un mauvais nucléotide).
OFFF Qu’implique les subsitutions?qui y partcipie
mécanismes de réplication de l’ADN
Quelles sont les 2 classes de substitution?p.7
- La transition d’une pyrimidine à
une autre (C à T) ou d’une purine
pour une autre (A à G)
• La transversion d’une pyrimidine
pour une purine (T pour A ou G) ou
le contraire
Que se passe-t-il si une base erronée n’est pas réparée? et la cellule deviendra ___morphique
la mutation sera incorporée au
génome dès la réplication suivante et sera polymorphique
Comment on sait quel brin est modifié chez les procaryotes afin de savoir quel brin réparé?
- méthyltransférase Dam reconnaît la séquence
«GATC» sur l’ADN et y ajoute un groupe méthyle
(CH3) sur l’adénine.
- Avant la réplication : ADN parental = méthylé
- Pendant la réplication : la nouvelle molécule d’ADNdb
est hémiméthylée.
Brin matrice → méthylé
o Brin néoformé → ne l’est pas encore. s’il est alors il n’est pas muté, mais s’il ne l’est pas sur le GTAC le plus proche, il est méthylée
Que fait la protéine MutS?
La protéine MutS parcourt l’ADN et détecte les distorsions de la charpente de l’ADN et s’y lie en libérant ATP
Que se passe-t-il lorsque distorsion trouvée?
MutS s’attache en changeant de conformation, ADP–> ATP et recrute prot MutL
Qu’active l’association de MutS et MutL?
L’association de MutS et MutL active la
protéine MutH
Que fait MutH?
clive le brin d’ADN non
méthylé au site –GATC –
Que se passe-t-il après que MutH?
L’hélicase spécialisée UvrD s’attache au point de césure
Après l’hélicase spécialisée recrutée suite à MutH, que se passe-t-il?
Une exonucléase élimine les nucléotides
à partir de la césure et jusqu’au-delà du
mésappariement
Comment se fait la réparation après les étapes de prot Mut, l’hélicase UvrD et l’exonucléase?
Réparation par l’ADN pol III et la ligase.
Que déclenche MutH?
MutH coupe sélectivement
le brin non méthylé (séquence hémiméthylées), ce qui
déclenche la réparation
spécifique du brin neuf
Est-ce la même exonucléase qui intervient dans l’élimination de l’ADNsb?
Non, Différentes exonucléases
Comment les cellules eucaryotes font-elles la MMR?
Avec des homologues de
MutS et MutL (MSH et MLH)
Pourquoi la machinerie de réplication copie difficilement les séquences de microsatellite?
Séquence répétées se ressemblent beaucoup. Ex: AAAAAAAAAAAAA
Qu’est-ce que le mécanisme de glissement réplicatif? Comment se produit-il?
Dérapage par appariement décalé de séquences réoétés en cours d réplication. Augmente ou diminue le nombre de répétition présentes.
Les boucles se formeront sur quel brin dépendemment si c’est une augmentation ou diminution?
Augmentation : nouveau brin
Diminution : adn matrice
Donner un exemple de maladie avec mécanisme de glissement
Maladie Huntington, répétition CAG.
Quelles sont les altérations chimiques spontannées?
- action de l’eau
- facteur environnementaux
- Altération chimiques provoquées par radiation
Quelles sont les altérations hydrolytiques?
1) Désamination (perte NH3)
2) dépurination
Quels sont les mécanismes de mutagènes (agents chimiques) facteurs environnementaux!
- alkylation : ajout gr. chimique sur bases
- Oxydation : ajout d’un O ou perte d’un H –> mutation plus commune du cancer
- analogue de base : autre molécule remplace une base
- agent intercalant : molécule s’inserre entre les bases (intervient dans répli/transcri)
Quelles sont les altérations chimiques causées par les radiation?
- rayon Uv : fusion photochimique
-Rayon ionisante : cassure bicatenaire de l’ADN (direct) et apparition radicaux libres (indirectement)
Quels sont les enzymes du mécanisme d’inverstion directe d’altération
- La photolyase (proca + euca)
- La méthyltransférase (humain + souris)
Que fait la photolyase?
Reconnaît les dimères de
pyrimidines (causés par UV)
et se lie à lui. Lors de la
prochaine exposition à la
lumière, elle clive l’anneau
de cyclobutane. (plante et proca)
Que fait la méthyltransférase (humain + souris)?Réaction réversible ?
Reconnaît G-CH3 (causé par une
alkylation d’un mutagène)
Catalyse transfert du CH3 de la
méthylguanine vers une de ses
cystéines. Réaction irréversible,
l’enzyme ne peut pas être réutilisée.
Qu’est-ce que la réparation par excision de base (voie BER)?
ADN glycosyles parcourent l’ADN et analysent le sillon mineur. détecte une base altérée et/ou une base qui a été insérée par mésappariement avec une base altérée
Après avoir détecter une lésion particulier, que fait l’ADN glycosylase
a base altérée pivote
vers l’extérieur (flip out)
de la double hélice et elle
est alors placée dans le site
actif de l’ADN glycosylase
Qu’est-ce que la réparation par excision de nucléotides(NER)?
Les protéines Uvr (e.coli) vont détacher le nucléotide mésapparier en segment.
Est-ce que la réparation translésionnelle est mutagène?
Processus forcément mutagène, mais
mieux que d’avoir une réplication
incomplète du chromosome.
Quelles sont les 4 méthodes pour réparer les cassures bicaténaire de l’ADN?
- Recombinaison homologue (HR)
- Ligature directe des extrémités non homologues (NHEJ)
La Recombinaison homologue (HR) se fait de quelle manière et par quoi?
L’enzymes recombinases
information perdue lors de la mitose est récupérée sur le chromatide soeur
Quelles sont les étapes de NHEJ?
-Ku70/Ku80
-Kinase DNA-PKcs
-Endonucléase Artemis
-Ligase IV
a. Reconnaissance des l’extrémités libres de l’ADN et
assemblage/stabilisation du complexe NHEJ au DSB; Ku70-Ku80 se lie à l’ADN cassée, il attire par échafaudage la formation du complexe
b. Formation d’un lien entre les extrémités et protection: la formation du complexe d’activation de la kinase DNA-PKcs afin d’empêcher l’action de la nucléase non-spécifique
c. Altération des extrémités de l’ADN pour les rendre
compatibles (franches) par endonucléase Artemis;
d. Ligation des extrémités par la ligase IV et dissolution du complexe NHEJ
