chapitre 3 - caryotype Flashcards
Quels sont les deux types de chromatine? Sont-ils codants?
euchromatine (code pour des gènes)
hétérochromatine (non codant)
Nommer les 2 bandes d’euchromatine ainsi que ce qu’elles contiennent
bande R: euchromatine active contient gène actifs
bande G: euchromatine inactive contient gènes inactifs à cause du moment du dév., du type de cellule ou du moment du cycle cellulaire
Nommer 3 raisons expliquant l’inactivation de l’euchromatine
- moment du développement
- type de tissu
- moment du cycle cellulaire
Quelle bande retrouve-t-on dans l’hétérochromatine
bande c (ADN non codant)
V ou F: L’euchromatine active est plus condensée que l’euchromatine inactive
faux
Quel est l’ordre de transcription des bandes de chromatine?
R, G et ensuite C
Comment appelle-t-on l’hétérochromatine pouvant devenir de l’euchromatine?
hétérochromatine facultative
Où retrouve-t-on l’hétérochromatine constitutive? Quelle paire de base y retrouve-t-on en plus grande quantité?
centromères, où il y a plus de C-G comme leur liaison est plus solide
Qu’est-ce que la coloration de Giemsa révèle-t-elle?
une différence de composition en protéines chromatiniennes
Comment appelle-t-on les extrémités d’un chromosome?
télomère
Quels sont les symboles des bras courts et bras longs des chromosomes?
bras court : p
bras long : q
Comment appelle-t-on un chromosome ayant les deux bras de la même longueur?
métacentrique
Comment appelle-t-on un chromosomes ayant le bras court franchement plus court que le bras long?
submétacentrique
Comment appelle-t-on un chromosome ayant le bras court peu ou pas visible?
acrocentrique
Les télomères contiennent-ils de l’information génétique?
Non
Quelle courte séquence est répétée en tandem au niveau des télomères?
TTAGGG
Quels sont les 3 rôles des télomères?
- préserver l’intégrité; des chromo
- protéger de la dégradation par des nucléases
- empêcher les recombinaisons aberrantes
Les régions subtélomériques sont-elles codantes?
Oui, elles sont riches en gènes
p+q=
1
identifier les éléments de nomenclature chromosomique suivants:
17p13.1
17 : # chromoso me
p: bras court
13.1: localisation internationale
Qu’est-ce qu’un caryotype?
classification des chromo
Le caryotype humain est dit …
a. diploide
b. autosomal
c. euploide
d. haploide
euploide
Quelles caractéristiques sont utilisées pour classer les chromo?
Taille et forme (bande R?)
Dans quelle phase les chromo doivent-ils être polur faire un caryotype?
métaphase (+condensé)
Nommer les 3 types de cellules pouvant être utilisées pour faire un caryotype
- cellule en division spontanées et fréquentes dans l’organisme
- cellules en division spontanées mais lentes dans l’organisme
- cellules ne se divisant pas dans l’organisme
Donner des exemples de cellules en division spontanées et fréquentes dans l’organisme pouvant servir à un caryotype
- cellules hématopoïétiques de la ME
- cellules germinales du testicule
- cellules embryonnaires par biopsie choriale
- certaines cellules tumorales
Donner des exemples de cellules en division spontanées mais lentes dans l’organisme pouvant servir à un caryotype
- cellules du tissu conjonctif (fibroblastes)
- cellules embryonnaires lors d’amniocentèse
- certaines cellules tumorales
Donner un exemple de cellule ne se divisant pas dans l’organisme pouvant servir à un caryotype
lymphocytes circulants
Quels sont les 3 marquages chromosomiques les plus courants? Nommer leur traitement et coloration
- Marquage par bande G: GTG, trypsine, coloration Giemsa
- Marquage bande R: RHG, heat, coloration Giemsa
- Marquage bande C: CBG, sulfate de Baryum, coloration Giemsa
Que permet de trouver la coloration de Giemsa seule?
Les cassures chromosomiques
Quel marquage chromosomique est le plus utilisé en Amérique pour les analyses et diagnostiques d’anomalie de nombre et de structure?
marquage GTG (bandes G)
Quel marquage chromosomique est le plus utilisé en Europe pour les analyses et diagnostiques d’anomalie de nombre et de structure?
marquage RHG (bandes R)
Que met en évidence la coloration par sulfate de Baryum?
hétérochromatine constitutive
Pour quelles études les bandes C sont-elles utiles?
études des chromosomes dicentriques (2 centrosomes)
des Y courts
asymétries des p des chromo acrocentriques
Quelles sont les 4 étapes de l’établissment d’un caryotype chez un patient?
- comptage des chromo
- découpage des chromo (ordinateur)
- classement : taille, forme et bandes
- appariement des chromo homologues
Quelle est la résolution d’un caryotype standard? et celle d’un caryotype haute résolution?
standard : 300-550
haute résolution: 800-1000
caryotype féminin et masculin normal
féminin: 46,XX
masculin: 46, XY
caryotype trisomie 21 masculin
47, XY, +21
caryotype syndrome de turner
45,X
caryotype féminin translocation d’un bout du chromo 1 sur le 18
46, XX, t(1;18)
Qu’est-ce qu’un idéogramme
un caryotype avec la locations des bandes d’identifiée
Je permet d’étudier le génome humain d’une façon plus fine :
a. caryotype standard
b. cytogénétique moléculaire
cytogénétique moléculaire
Nommer 2 techniques de cytogénétique moléculaire
- FISH (fluorescent in situ hybridation)
- hybridation génomique comparative sur micropuce
Nommer les 3 colorants fluorescents utilisés en cytogénétique moléculaire
- moutard de quinacrine (vert)
- DAPI (bleu)
- iodure de Propidium (rouge)
expliquer qu’est-ce que l’hybridation
alternance des processus de dénaturation et de renaturation de l’ADN
Qu’est-ce que la dénaturation de l’ADN?
séparation des bases complémentaires divisant l’hélices d’ADN en deux simples brins
Expliquer le principe de la technique FISH (3 étapes)
- Faire une sonde moléculaire en marquant chimiquement une petite séquence d’ADN simple brin dont l’emplacement est connu dans le génome
- Mettre la sonde en contacte avec les chromosomes dénaturés pour que la sonde puisse s’hybrider spécifiquement a/n de sa séquence complémentaire
- Visualiser la sonde au microscope
Quel est l’avantage du FISH comparativement à un caryotype haute résolution?
le FISH permet la détection d’anomalie inframicroscopique
Nommer les 4 types de sondes FISH et ce qu’elles permettent de détecter
- sonde de peinture chromosomique (paire spécifique de chromo, translocation)
- sonde télomérique (intégrité des bras chromosomiques)
- sondes centromériques (anomalies de structures)
- sonde à séquence unique (syndrome de microdéletions et microduplications)
Nommer 3 types d’application du FISH
- cartographie génique pour identifier un gène sans connaitre sa fonction
- diagnostic cytogénétique (anomalie de petite taille ou noyau en interphase)
- études des mécanismes de transformation maligne
Qu’est-ce qu’une aneuploïdie?
pas avoir le bon nombre de chromosomes
Donner 4 exemples de diagnostics cytogénétiques possibles grâce au FISH interphasique
- anomalies de nombre de chromosomes homogène ou en mosaïque
- diagnostic rapide des aneuploïdies fréquentes (X, Y, 13, 18 et 21)
- identification de l’origine d’un fragment chromosomique
- mise en évidence d’une microdéletion
Quel important facteur dans les leucémie myéloïdes chroniques et leucémie aigues lymphoblastique le FISH peut-il mettre en évidence?
translocation 9;22 impliquant la fusion des gènes BCR et ABL
Qu’est-ce que la technique CGH de cytogénétique moléculaire?
Comparative Genomic Hybridization
- Analyse fine de perte (délétion) ou de gain (duplication) de matériel génétique en comparant des séquences d’ADN fractionnée (micropuces) d’un patient et d’ADN contrôle
Quels sont les deux micropuces pouvant être utilisées pour la technique CGH
- BACs
- Oligonucléotides
Quelle micropuce a la meilleure résolution?
oligonucléotides (BACs a la meme résolution que FISH)
Quel marqueur peut inclure les micropuces oligonucléotides? Que permet ce marqueur (2)?
SNP (Single Nucléotide Polymorphism)
- Permet la détection de disomie uniparentales
- Permet de repérer un segment d’ADN ou les 2 chromo ne diffèrent que par 1 nucléotide
Nommer les 4 avantages des micropuces dans la technique CGH
- Meilleur résolution
- meilleure sensibilité pour la détection des duplications
- Pas besoin de savoir où cibler dans le génome au préalable
- pas besoin que la cellule soit en division
Nommer 3 situations où l’analyse cytogénétique par micropuce est recommandée en première ligne sans le caryotype
- retard intellectuel
- désordre du spectre de l’autisme
- Malformations congénitales
Quels sont les symptomes du syndrome de microdélétion 1p36?
retard mental modéré à sévère
Dysmorphie
cardiopathie / cardiomyopathie
difficultés alimentaires
convulsions
La délétion réccurente 16p11.2 est en lien avec quelle condistion
autisme
Quels sont les deux types d’anomalies chromosomiques?
- anomalies du nombre
- anomalie de structure
Qu’est-ce qu’une anomalie chromosomique homogène? Quand la non-disjonction a-t-elle lieu?
anomalie présente dans toutes les cellules d’un individu
non-disjonction lors de la méiose d’un des parents
Qu’est-ce qu’une anomalie chromosomique mosaïque? Quand la non-disjonction a-t-elle lieu?
une anomalie présente dans une sous-population cellulaire
non-disjonction lors du développement du zygote
Quelle est la différence l’aneuploïdie et la polyploïdie?
aneuploïdie = ajout ou perte d’un ou pls chromo d’une même paire homologue
polyploïdie = addition d’un ou pls compléments haploïdes
Les monosomies des autosomes sont-elles viables?
Non, elles provoquent des fausses-couches
Nommer une monosomie viable et son «code»
syndrome de Turner : 45,X
Nommer 3 cas de trisomies autosomales
Syndrome de Patau (trisomie 13)
Syndrome d’Edwards (trisomie 18)
Syndrome de Down (trisomie 21)
Nommer 3 cas de trisomies liées aux gonosomes
Syndrome du triple X
Syndrome de Klinefelter
Syndrome de Jacobs / du double Y
Nommer 4 symptômes du syndrome du triple X
- taille légèrement supérieure à la normale
- quotient intellectuelle légèrement abaissé dans certains cas
- aucune anomalie morphologique évidente 4. léger hypogonadisme
Nommer 4 symptômes du syndrome de Jacobs
- très grande taille
- atrophie des testicules et stérilité
- calvitie précoce
- agressivité
Nommer 6 symptômes du syndrome de Patau
Anomalies du …
- SN
- visage
- coeur
- membres
- abdominale
- reins
La trisomie 13 et 18 sont-elles viables? % de mort in utero? % de décès après un an?
oui MAIS
95% de décès in utero
90% de décès après un an de vie
Nommer 5 symptômes du syndrome d’Edwards
Anomalies du coeur
Anomalies du squelette (dev. muscles)
déformation de la main
profond retard mental
malformation viscérales
Nommer symptômes du syndrome de Down
déficience intellectuelle variable
petite taille
hypotonie musculaire
laxité articulaire quasi-constante
malformation cardiaques et intestinales
cataracte congénitale
maladie de Hirschsprung
Leucémie
Vieillissement + Alzheimer précoce
Nommer 6 symptômes de la tétrasomie
- Retard du langage, d’apprentissage et de développement
- grande taille
- dysmorphie faciale
- anomalie cardiaque
- hypotonie avec laxité articulaire
- léger hypogonadisme
Dans quel cas les cas polyploïdie sont-ils viables?
sur les chromosomes sexuels
Quelle est la polyploïdie la plus fréquente?
triploïdie (69XXX, 69XXY, 69XYY)
Quels sont les deux mécanisme auxquels sont dues les triploïdies? Lequel est le plus fréquent? Expliquer ces mécanismes
diandrie: dispermie= le + fréquent (ovule fécondée par 2 spz) ou diplospermie ( ovule fécondée un spz diploide)
digynie: ovule diploïde fécondée par spz
Nommer symptômes de la triploidie 69XXX, XXY ou XYY
Important retard de croissance
Malformation sévère
À quoi les anomalies de structure sont-elles presque toujours dues?
cassures chromosomiques
Comment-appelle-t-on un fragment chromosomique non recollé contenant un centormère?
délétion terminale
les délétions terminales persiste-t-elle dans les cellules filles au cours des divisons cellulaires?
oui
comment appelle-t-on un fragment chromosomique non recollé qui me contient pas de centromère?
fragment acentrique
les fragments acentriques persiste-t-ils dans les cellules filles au cours des divisons cellulaires?
non, ils seront perdus
Nommer 3 avenues possible pour un fragment à la suite de sa cassure
- se perdre
- se recoller exactement comme il était avant
- se recoller différemment
QU’est-ce qu’une anomalie chromosomique équilibrée? A-t-elle un effet phénotypique?
Une anomale n’entrainant pas de déséquilibre du matériel génétique n’ayant pas d’effet phénotypique
Quel problème peut survenir lors d’une anomalie équilibrée?
la formation de gamètes déséquilibrées donnant des zygotes anormaux
Nommer 2 façons dont une anomalie non équilibrée peut survenir
- de novo
- remaniement parental équilibré
Comment appelle-t-on une anomalie portant sur 1 chromo avec une seule cassure?
délétion terminale
Que devient le télomère du chromosome a la suite d’une délétion terminale?
Comme le télomère est parti avec la délétion, le chromo s’en reconstitue un pour se stabiliser
Nommer 3 symptômes de del(4) (p.15.3)
- dysmorphie faciale
- syndrome polymalformatif
- retard mental
Nommer 5 symptômes de del(18)
- retard de dév.
- retard mental
- oreilles larges et décollées
- bouche large
- anomalies dentaires
Le syndrome du cri du chat est une anomalie chromosomique de quel type?
de structure, délétion terminale
Comment appelle-t-on une anomalie portant sur 1 chromo avec une seule cassure touchant le centromère?
isochromosome
de quoi sont constitués les deux chromosomes issu d’une cassure de type isochromsome? Quelle est la position de leur centromère?
1 constitué des 2 chromatides du bras court
1 constitué des 2 chromatides du bras long
Les deux sont métacentriques
Nommer l’anomalie suivante:
46, X, i (Xq)
À quoi L’associe-t-on parfois?
isochromosome du bras long du chromosome X
Parfois associé au syndrome de Turner
Comment appelle-t-on une anomalie avec perte de matériel génétique portant sur 1 chromo avec 2 cassures ne touchant pas le centromère?
délétion intercalaire ou intertitielle
Expliquer ce qui se passe lors d’une délétion intercalaire
perte du segment entre les deux cassures et recollement des 2 portions restantes
Le syndrome de Prader-Willi est une anomalie de quel type?
délétion intercalaire
Comment appelle-t-on une anomalie sans perte de matériel génétique portant sur 1 chromo avec 2 cassures ne touchant pas le centromère
inversion paracentrique
Comment appelle-t-on une anomalie sans perte de matériel génétique portant sur 1 chromo avec 2 cassures touchant le centromère?
inversion péricentrique
Les inversions entrainent ils des conséquences phénotypiques?
Quelles sont les conséquences des inversion?
Aucune conséquences phénotypique
Conséquence est sur les gamètes puisque le problème survient a/n du crossing over
Quand peut-on voir une boucle d’appariement?
Lorsqu’un chromo contenant une inversion tente de faire l’enjambement
À quoi sont prédisposés les gens ayant inv(9) (p11q13)?
cancers
inv(9) (p11q13) est elle fréquente?
Oui (1-3% de la population)
Nommer 5 syndrome dus à une micro délétion ainsi que le chromosome sur lequel se situe la micro délétion
- syndrome Prader-Willi et Angelman (chromo 15)
- syndrome de DiGeorge (chromo 22)
- syndrome de Smith Magenis (chromo 17)
- syndrome de Rubinstein Taybi (16)
- Syndrome de Wolf Hirschorn (4)
Une duplication est-elle une anomalie équilibrée?
non
Qu’arrive-t-il lorsqu’un chromo a 2 cassures impliquant les extrémités
chromosome en anneau
Nommer 3 symptômes de r(1)
- très petit poids à la naissance
- retard de croissance
- retard mental modéré
Comment appelle-t-on une anomalie portant sur 2 chromo avec 2 cassures?
translocation
Quelles sont les deux sortes de translocation?
- translocation réciproque
- translocation Robertsonienne
Explique la translocation réciproque
échange de segments entre 2 chromo et formation de deux nouveaux chromo recombinés
Les trnasloications se font-elles entre les bras des chromo homologues?
non
translocation réciproque équilibrée:
- variation nb chromo?
- perte de matériel génétique?
- effet phénotypique?
- risque d’une descendance anormale?
- non
- non
- non
- oui
Quels sont les 3 génotypes possibles pour les gamètes d’un porteur d’une translocation réciproque équilibrée?
- 2 chromo normaux
- 2 chromo transloqués mais équilibrés
- 1 chromo normal et 1 chromo transloqué (déséquilibre)
les translocations réciproques non équilibrées sont elles viables
cela dépend de l’importance du déséquilibre
- S’il est important: avortement spontané
- S’il est moins important: retard mental et malformations
Expliquer la translocation Robertsonienne
les bras p de 2 chromo acrocentriques se décollent de leur centromère et les deux bras q fusionnent
Translocation Robertsonienne:
- variation du nb de chromo?
- perte de matériel génétique?
- effet phénotypique?
- risque d’une descendance anormale?
- oui, 45 chromo
- oui, les bras acrocentriques
- non
- Oui, risque accru
Pourquoi les porteur d’une translocation Robertsonienne n’ont-ils pas d’effet phénotypique?
Puisque les bras acrocentriques perdus sont constitués d’hétérochromatine
Qu’est-ce que l’insertion?
translocation particulière où un fragement de chromo est inséré au sein d’un autre
dans quels cas (3) l’utilisation en première ligne de la CGH sur micropuce est-elle recommandée?
- retard mental
- autisme
- polymalformation
Est-il nécessaire d’effectuer un CGH sur micropuce pour :
- rechercher un remaniement équilibré
- rechercher des anomalies de ploïdies
- risque d’aneuploïdie (prénatal)
- phénotype clair d’anomalie chromosomique précise
non
