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Génétique II > Chapitre 2.3 - Le Mécanisme De La Réplication Procaryote > Flashcards

Chapitre 2.3 - Le Mécanisme De La Réplication Procaryote Flashcards

1
Q

La réplication de l’ADN d’E.Coli est prise en charge par quelle molécule/ ensemble de protéine?

A

Le réplisome

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Q

Qu’est-ce que le réplisome?

A

Un complexe protéique associé à la fourche de réplication

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3
Q

Le réplisome regroupe 5 enzymes essentiels dans la réplication de l’ADN, lesquels?

A
  • Pol I
  • Pol III
  • Primase
  • DnaB (Hélicase)
  • Gyrase
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4
Q

Comment ce nomme le sous-complexe protéique impliqué dans l’initiation de la synthèse de chaque fragment d’Okazaki?

A

Le primosome

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5
Q

Que regroupe de primosome?

A

L’hélicase DnaB et la primase (DnaG)

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6
Q

Est-ce que la primase est une composante permanente du primosome?

A

Non, elle s’associe à chaque évènements d’amorçage

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7
Q

Dans quels sens les brins matrices doivent traversés la sous-unité alpha de Pol III?

A

Brin avancé = 3’->5’ OK

Brin retardé = 5’-> 3’ IMPOSSIBLE

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8
Q

Quand et où une boucle d’ADN simple brin est crée?

A

Sur le brin retardé lors de la synthèse du brin avancé.

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9
Q

Un fois la boucle formé, que ce passe t’il?

A
  • Le primosome synthétise une amorce d’ARN
  • La sous-unité alpha de Pol III se lie a l’amorce d’ARN
  • La matrice du brin retardé est tirée de manière à ce que la Pol III synthétise le fragment d’Okazaki dans la bonne direction
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10
Q

Est-ce que les deux sites catalytiques alpha de Pol III sont dans la même orientation?

A

NON, il sont dans des directions opposées.

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11
Q

À quoi sont liées les deux sous-unités phi?

A

À l’hélicase

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12
Q

Où et dans quel sens se déplace l’hélicase?

A

Sur la matrice du brin retardé dans le sens 5’->3’

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13
Q

Par quel intermédiaire les deux centre catalytiques Alpha communique avec l’hélicase?

A

Par les sous-unité phi.

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14
Q

Quel protéine recouvre l’ADN simple-brin?

A

SSB

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15
Q

À quel moment/ quelles enzymes doivent s’associer pour qu’il y ai création d’une nouvelle amorce d’ARN sur le brin retardé?

A

La primase et l’hélicase (les deux composante du primosome)

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16
Q

Qu’arrive t’il lorsque l’ADN polymérase qui termine la synthèse du fragment d’Okazaki complète le brin?

A

L’ADN polymérase se détache de l’attache Bêta et de l’ADN.

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17
Q

Suite au détachement de l’ADN polymérase, quel est la nouvelle cible du chargeur d’attache?

A

Le brin retardé portant une nouvelle amorce d’ARN.

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18
Q

Que fait le chargeur d’attache au brin retardé?

A

Il assemble une attache bêta à la jonction matrice:amorce

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19
Q

Une fois l’attache bêta lié à la jonction matrice:amorce qu’arrive-t’il?

A

L’ADN polymérase réplicant le brin se lie à l’attache Bêta et initie la synthèse du fragment d’Okazaki.

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20
Q

Qu’est-ce qui permet d’augmenter de 10X la vitesse de séparation des biens parentaux?

A

La liaison de l’hélice se à l’holoenzyme Pol III

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21
Q

Quel complexe charge et décharge les attache Bêta?

A

Le complexe gamma

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22
Q

Vrai ou faux, lorsque la sous-unité alpha est lié a l’attache bêta, le complexe gamma peut aussi se lier a l’attache bêta?

A

FAUX, car alpha et gamma se lie au même endroit.

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23
Q

Combien d’origine de réplication possède les chromosomes de bactéries?

A

UNE seule

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24
Q

Quelle est la fonction de cette origine de réplication?

A

Fournir la première amorce requise pour que Pol II débute la synthèse d’ADN

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25
Q

Comment nomme t’on l’origine de réplication pour E.coli et les autres Enterobacteriaceae?

A

oriC

26
Q

Combien de séquences sont conservées chez oriC?

A

2 type de séquence de 9 paires de bases

1 type de séquence de 13 paires de bases

27
Q

Comment ce produit l’initiation de la réplication au site oriC?

A

Environ 30 copies de la protéine DnaA se lient avec les 4 segments de 9 pb.

28
Q

Quel est l’effet de l’appariment des DnaA avec les segments à 9 pb?

A

La fusion de la région contenant les 3 segments de 13 pb

29
Q

Quel est le complexe qui se lient a la région désapparier pour libéré DnaC (sert seulement a lier un DnaX)?

A

Le complexe DnaB6 DnaC6

30
Q

En plus de libéré DnaC, que fait DnaB?

A

Elle agrandie la région désaparié

31
Q

Quel est l’enzyme qui reconnaît DnaB et se lie à elle ainsi qu’à l’ADN?

A

La primase

32
Q

Le complexe DnaB-Primase permet deux choses, lequels?

A

La fabrication d’amorce d’ARN et l’assemblage de l’holoenzyme Pol lll

33
Q

Quel est l’hypothèse favorisé dans la conception du mouvement de l’ADN par rapport à la machinerie de réplication?

A

Celle selon laquelle la machinerie de réplication est statique dans la cellule.

34
Q

Deux promoteurs sont situés près de l’origine de réplication, quel est leur rôle?

A

Ils amènent la formation d’une boucle R et donc, stimulent la formation d’un complexe ouvert à l’origine

35
Q

Quel est la protéine qui se lie à la boucle R et quel est son rôle?

A

La protéine HU facilite la fusion de l’ADN et promouvoir la formation d’un ADN superenroulé négativement.

36
Q

Qu’est-ce qui est requis pour la liaison de DnaA à l’origine?

A

Des super-enroulements négatifs.

37
Q

Combien de fois par division cellulaire la réplication du chromosome est initiée?

A

UNE seule fois

38
Q

Est-ce que le chromosome peut présenter plusieurs fourches de réplication et dans quel circonstance y en a t’il plus que deux?

A

Oui selon le temps de division. Lorsque le temps de dédoublement est < 60.

39
Q

Quel est la durée de la réplication ?

A

Environ 40 mins

40
Q

Que fait la méthylation dans la réplication de l’ADN?

A

Elle la régule

41
Q

Qui ajoute un groupement méthyle à l’ADN et où l’ajoute t’il?

A

La méthylase Dam méthyle à la position N9 de l’Adénine

42
Q

Comment le degré de méthylation du palindrome permet à la machine d’initiation de distingué une origine répliqué, d’une origine non répliqué?

A

Une fois la réplication faite, il a deux molécules d’ADN hemi-méthylés

43
Q

Une fois l’ADN répliqué, elle est hemi-méthylé (la méthylation est présente que sur un brin d’ADN). Est-ce que oriC peut être activé et induire une autre réplication dans ces conditions?

A

Non, car pour qu’oriC soit activé, l’ADN doit être complètement méthylé.

44
Q

Quel est la protéine associé a l’état hemi-méthylé?

A

LA protéine SeqA

45
Q

Qu’arrive t’il lorsque SeqA est relâché?

A

Dam peut méthylé l’autre brin d’ADN.

46
Q

Comment se termine la réplication de l’ADN?

A

PAr une longue région contenant 6 sites de 23 pb quasi-identiques, appelé site ter.

47
Q

Quels sites ter sont traversé la la fourche de réplication 1?

A

TerF, TerB et TerC

48
Q

Quels sites ter sont traversé la la fourche de réplication 1?

A

TerF, TerB et TerC

49
Q

Quels sites ter sont traversé la la fourche de réplication 2?

A

Ter E,D et A

50
Q

Quel est l’enzyme qui inhibe l’hélicase DnaB?

A

Tus

51
Q

Quel est l’étape finale de la réplication ?

A

La séparation des deux cellules filles

52
Q

Quelle enzyme catalyse la séparation des deux cellules filles?

A

La topoisomérase de type ll

53
Q

Comment est convertir l’ADN circulaire simple brin de M13?

A

En une forme duplex circulaire appelée RF

54
Q

Comment peut-être RF?

A

Superenroulé RFl

Porteuse d’une cassure simple-brin RFll

55
Q

À quel mécanisme s’apparente la synthèse du nouveau brin a partir de l’ancien brin de M13?

A

La synthèse du brin avancé dans l’ADN d’E.coli

56
Q

Chez quel type de microorganisme la réplication d’un ADN duplex circulaire par le mode en cercle tournant?

A

Bactériophage

57
Q

Que produit le mode cercle tournant?

A

Une molécule simple-brin multimérique dans laquelle plusieurs unités de génomes sont liées en tandem.

58
Q

Le brin (+) de phiX174 est synthétisé sur une matrice RFI selon quel mode?

A

Cercle tournant avec boucle

59
Q

À quoi correspond le taux de réversion d’une mutation de E.coli?

A

1 erreur sur 1000 bactéries par génération

60
Q

Quels sont les 4 propriétés qui explique le faible taux d’erreur?

A
  1. Maintient de niveaux équilibré de dNTP
  2. Mécanisme en 2 étapes, un changement de conformation induit est nécessaire pour que la réaction se produise
  3. Les fonction exonucléase 3’->5’ de Pol I et Pol ll
  4. D’autres systèmes enzymatique corrigeant les erreurs.
61
Q

Quels sont les deux autres propriétés qui augmente la fidélité des ADN polymérase?

A
  1. L’incapacité des ADN polymérase d’initier l’élongation des brin d’ADN sans amorce
  2. L’incapacité des polymérase à synthétiser dans le sens 3’-5’.

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