Chapitre 2.3 - Le Mécanisme De La Réplication Procaryote Flashcards
La réplication de l’ADN d’E.Coli est prise en charge par quelle molécule/ ensemble de protéine?
Le réplisome
Qu’est-ce que le réplisome?
Un complexe protéique associé à la fourche de réplication
Le réplisome regroupe 5 enzymes essentiels dans la réplication de l’ADN, lesquels?
- Pol I
- Pol III
- Primase
- DnaB (Hélicase)
- Gyrase
Comment ce nomme le sous-complexe protéique impliqué dans l’initiation de la synthèse de chaque fragment d’Okazaki?
Le primosome
Que regroupe de primosome?
L’hélicase DnaB et la primase (DnaG)
Est-ce que la primase est une composante permanente du primosome?
Non, elle s’associe à chaque évènements d’amorçage
Dans quels sens les brins matrices doivent traversés la sous-unité alpha de Pol III?
Brin avancé = 3’->5’ OK
Brin retardé = 5’-> 3’ IMPOSSIBLE
Quand et où une boucle d’ADN simple brin est crée?
Sur le brin retardé lors de la synthèse du brin avancé.
Un fois la boucle formé, que ce passe t’il?
- Le primosome synthétise une amorce d’ARN
- La sous-unité alpha de Pol III se lie a l’amorce d’ARN
- La matrice du brin retardé est tirée de manière à ce que la Pol III synthétise le fragment d’Okazaki dans la bonne direction
Est-ce que les deux sites catalytiques alpha de Pol III sont dans la même orientation?
NON, il sont dans des directions opposées.
À quoi sont liées les deux sous-unités phi?
À l’hélicase
Où et dans quel sens se déplace l’hélicase?
Sur la matrice du brin retardé dans le sens 5’->3’
Par quel intermédiaire les deux centre catalytiques Alpha communique avec l’hélicase?
Par les sous-unité phi.
Quel protéine recouvre l’ADN simple-brin?
SSB
À quel moment/ quelles enzymes doivent s’associer pour qu’il y ai création d’une nouvelle amorce d’ARN sur le brin retardé?
La primase et l’hélicase (les deux composante du primosome)
Qu’arrive t’il lorsque l’ADN polymérase qui termine la synthèse du fragment d’Okazaki complète le brin?
L’ADN polymérase se détache de l’attache Bêta et de l’ADN.
Suite au détachement de l’ADN polymérase, quel est la nouvelle cible du chargeur d’attache?
Le brin retardé portant une nouvelle amorce d’ARN.
Que fait le chargeur d’attache au brin retardé?
Il assemble une attache bêta à la jonction matrice:amorce
Une fois l’attache bêta lié à la jonction matrice:amorce qu’arrive-t’il?
L’ADN polymérase réplicant le brin se lie à l’attache Bêta et initie la synthèse du fragment d’Okazaki.
Qu’est-ce qui permet d’augmenter de 10X la vitesse de séparation des biens parentaux?
La liaison de l’hélice se à l’holoenzyme Pol III
Quel complexe charge et décharge les attache Bêta?
Le complexe gamma
Vrai ou faux, lorsque la sous-unité alpha est lié a l’attache bêta, le complexe gamma peut aussi se lier a l’attache bêta?
FAUX, car alpha et gamma se lie au même endroit.
Combien d’origine de réplication possède les chromosomes de bactéries?
UNE seule
Quelle est la fonction de cette origine de réplication?
Fournir la première amorce requise pour que Pol II débute la synthèse d’ADN
Comment nomme t’on l’origine de réplication pour E.coli et les autres Enterobacteriaceae?
oriC
Combien de séquences sont conservées chez oriC?
2 type de séquence de 9 paires de bases
1 type de séquence de 13 paires de bases
Comment ce produit l’initiation de la réplication au site oriC?
Environ 30 copies de la protéine DnaA se lient avec les 4 segments de 9 pb.
Quel est l’effet de l’appariment des DnaA avec les segments à 9 pb?
La fusion de la région contenant les 3 segments de 13 pb
Quel est le complexe qui se lient a la région désapparier pour libéré DnaC (sert seulement a lier un DnaX)?
Le complexe DnaB6 DnaC6
En plus de libéré DnaC, que fait DnaB?
Elle agrandie la région désaparié
Quel est l’enzyme qui reconnaît DnaB et se lie à elle ainsi qu’à l’ADN?
La primase
Le complexe DnaB-Primase permet deux choses, lequels?
La fabrication d’amorce d’ARN et l’assemblage de l’holoenzyme Pol lll
Quel est l’hypothèse favorisé dans la conception du mouvement de l’ADN par rapport à la machinerie de réplication?
Celle selon laquelle la machinerie de réplication est statique dans la cellule.
Deux promoteurs sont situés près de l’origine de réplication, quel est leur rôle?
Ils amènent la formation d’une boucle R et donc, stimulent la formation d’un complexe ouvert à l’origine
Quel est la protéine qui se lie à la boucle R et quel est son rôle?
La protéine HU facilite la fusion de l’ADN et promouvoir la formation d’un ADN superenroulé négativement.
Qu’est-ce qui est requis pour la liaison de DnaA à l’origine?
Des super-enroulements négatifs.
Combien de fois par division cellulaire la réplication du chromosome est initiée?
UNE seule fois
Est-ce que le chromosome peut présenter plusieurs fourches de réplication et dans quel circonstance y en a t’il plus que deux?
Oui selon le temps de division. Lorsque le temps de dédoublement est < 60.
Quel est la durée de la réplication ?
Environ 40 mins
Que fait la méthylation dans la réplication de l’ADN?
Elle la régule
Qui ajoute un groupement méthyle à l’ADN et où l’ajoute t’il?
La méthylase Dam méthyle à la position N9 de l’Adénine
Comment le degré de méthylation du palindrome permet à la machine d’initiation de distingué une origine répliqué, d’une origine non répliqué?
Une fois la réplication faite, il a deux molécules d’ADN hemi-méthylés
Une fois l’ADN répliqué, elle est hemi-méthylé (la méthylation est présente que sur un brin d’ADN). Est-ce que oriC peut être activé et induire une autre réplication dans ces conditions?
Non, car pour qu’oriC soit activé, l’ADN doit être complètement méthylé.
Quel est la protéine associé a l’état hemi-méthylé?
LA protéine SeqA
Qu’arrive t’il lorsque SeqA est relâché?
Dam peut méthylé l’autre brin d’ADN.
Comment se termine la réplication de l’ADN?
PAr une longue région contenant 6 sites de 23 pb quasi-identiques, appelé site ter.
Quels sites ter sont traversé la la fourche de réplication 1?
TerF, TerB et TerC
Quels sites ter sont traversé la la fourche de réplication 1?
TerF, TerB et TerC
Quels sites ter sont traversé la la fourche de réplication 2?
Ter E,D et A
Quel est l’enzyme qui inhibe l’hélicase DnaB?
Tus
Quel est l’étape finale de la réplication ?
La séparation des deux cellules filles
Quelle enzyme catalyse la séparation des deux cellules filles?
La topoisomérase de type ll
Comment est convertir l’ADN circulaire simple brin de M13?
En une forme duplex circulaire appelée RF
Comment peut-être RF?
Superenroulé RFl
Porteuse d’une cassure simple-brin RFll
À quel mécanisme s’apparente la synthèse du nouveau brin a partir de l’ancien brin de M13?
La synthèse du brin avancé dans l’ADN d’E.coli
Chez quel type de microorganisme la réplication d’un ADN duplex circulaire par le mode en cercle tournant?
Bactériophage
Que produit le mode cercle tournant?
Une molécule simple-brin multimérique dans laquelle plusieurs unités de génomes sont liées en tandem.
Le brin (+) de phiX174 est synthétisé sur une matrice RFI selon quel mode?
Cercle tournant avec boucle
À quoi correspond le taux de réversion d’une mutation de E.coli?
1 erreur sur 1000 bactéries par génération
Quels sont les 4 propriétés qui explique le faible taux d’erreur?
- Maintient de niveaux équilibré de dNTP
- Mécanisme en 2 étapes, un changement de conformation induit est nécessaire pour que la réaction se produise
- Les fonction exonucléase 3’->5’ de Pol I et Pol ll
- D’autres systèmes enzymatique corrigeant les erreurs.
Quels sont les deux autres propriétés qui augmente la fidélité des ADN polymérase?
- L’incapacité des ADN polymérase d’initier l’élongation des brin d’ADN sans amorce
- L’incapacité des polymérase à synthétiser dans le sens 3’-5’.
