Chapitre 1.4- Régulation De La Traduction Flashcards
La régulation de l’expression des gènes peut se faire à deux niveaux, lequels?
Au niveau de la synthèse protéique et au niveau de la transcription.
À quel niveau s’exerce le contrôle de la traduction?
Au niveau de l’initiation.
Quels sont les deux mécanismes généraux de la régulation de la transcription?
A. La fixation de protéine près du RBS
B. L’appariment de bases dans l’ARNm qui masque des RBS
Qu’arrive t’il lorsque des protéine se lie près du RBS d’un ARNm?
L’ARN 16S ne peut se lier à l’ARNm, le ribosome ne peut être assemblé et il n’y a pas de traduction.
Vrai ou faux, c’est la/les protéines codées par l’ARNm qui bloque l’accès au RBS?
Vrai, lorsqu’ils sont en nombre trop important les protéines permettent un autorégulation
Quel est la conséquence de l’appartement de base dans un ARNm?
Les RBS sont bloqué ce qui interfère avec la liaison de l’ARN 16S et donc inhibe la traduction.
Dans quel circonstance l’ARNm fait des appariements de bases pour inhiber sa traduction?
Lorsqu’il y a plusieurs opérons sur le même segment et qu’un est en cour de traduction.
Avec quoi la synthèse des protéine ribozomique doit être coordonnée et pourquoi?
Avec la quantité d’ARNr disponible, car sans l’ARNr les protéines r n’ont aucun rôle.
Pourquoi la vitesse de synthèse protéique et le nombre de ribosome requis sont liés à la vitesse de croissance de la cellule?
Car plus la cellule grandit, plus elle doit synthétiser des protéines. Pour synthétiser les protéines a besoin de ribosomes.
Comment se coordonne le nombre de protéines r produites, la quantité d’ARNr libre et la vitesse de synthèse?
Les protéines r agissent comme leur propre répresseur.
Comment les protéine r peuvent être leur propre répresseur?
Les gènes codants pour les protéines r sont regroupé sous forme d’opéron.
Pour chaque opérons, une protéine r se lie au site où l’ARNm débute la traduction.
Cette liaison de la protéine r empêche le ribosome de se lier et d’initier la traduction.
Qu’arrive t’il lorsqu’il n’y a pas assez d’ARNr pour fixé les protéines r?
Une protéine r va se fixer sur l’ ARNm ce qui va empêcher la traduction d’une autre protéine r.
Comment une protéine r peut se lier à la fois sur un ARNr (composante du ribosome) et comme régulateur de sa traduction (en se liant à son ARNm)
Les sites de liaison sur les deux ARN sont très similaire. De plus le site de liaison sur ARNm inclus le codon d’initiation, donc inhibe la traduction. Mais la protéine r se lie plus fortement à l’ARNr lorsqu’elle est disponible.
Quelles autres molécules peuvent réguler leur propre traduction?
Les aminoacyl-ARNt synthéase.
Il existe une autre méthode de régulation de la traduction selon la température et le concentration de certains métabolites, laquelle?
La formation de différente structures par l’ARNm
Quel est l’exemple de la formation de différente structures par l’ARNm pou réguler sa traduction?
Les ribocommutateurs SAM
Pourquoi la vitesse de traduction des ARNm n’est pas la même pour tous les ARNm?
Cela dépend de la séquence de Shine-Dalgarno, de la fréquence des codons préféré et donc de la fréquence des ARNt correspondants.
Comment se fait la régulation de la traduction chez les eucaryotes?
Elle peut se faire au niveau global (carence en aa, infection virale, température élevé) ou au niveau d’ARNm spécifique.
Quelles sont les étapes ciblées par la régulation de la traduction au niveau globale chez les eucaryotes?
- Reconnaissance de l’ARNm
2. Liaison de l’ARNt initiateur à la sous-unité 40S
De quelle façon est controlé le mécanisme d’inhibition chez les eucaryotes?
Par phosphorylation
Que se passe-t’il lorsque la sous-unité alpha de eIF2 est phosphorilé?
Cela inhibe l’activité de eIF2B qui agit sur eIF2, ce qui diminu le niveau de eIF2 lié au GTP.
Pourquoi la baisse des niveau de eIF2 lié au GTP induit une faible initiation de la traduction?
Car, eIF2-GTP est nécessaire pour amener l’ARNt initiateur vers la SU 40S. Sans ce mécanisme la traduction ne peut avoir lieu.
Quels sont les 4 kinases responsables de la phosphorilation de eIF2 et comment sont-elles activées?
- HRI activé dans les réticulocytes lorsque l’hème est en qté insuffisante et suite a un stress oxydatif ou de haute température.
- PKR activé lors d’infection virales
- GCN2 actié lors de carence en aa
- PEK activé lors de stress divers.
Comment agit le mécanisme inhibant globalement la traduction qui cible l protéine eIF4E?
Les protéines 4E-BP non-phosphorylé entre en compétition avec eIF4G.
Si 4E-BP se lie à eIF4E = pas de traduction
Si eIF4G se lie à eIF4E = traduction
Les protéines 4E-BP inhibe la traduction seulement sous leur forme non-phosphorylé, quel protéine kinase est responsable de phosphorylation?
MTor
Quels sont les facteurs qui active mTor et donc qui phosphoryle 4E-BP?
- Facteur de croissance
- Hormones
- Facteurs simulant les divisions cellulaires
Quel agents sont inhibiteur de mTor?
Agent de chimiothérapie
Pourquoi la liaison a eIF4E est utilisé pour inhibé la traduction de certains ARNm dans des endroits précis?
Car cette liaison est impliqué dans la localisation précise de plusieurs protéine
Quelles sont les deux protéines qui permettent d’inhiber l’ARNm Oskar durant leur transport du pôle antérieur vers la région postérieur?
- Bruno
- Cup
Que fait la protéine Bruno?
Elle se lie dans la région 3’ non traduite de l’ARNm Oskar
Que fait la protéine Cup?
Elle se lie a la protéine Bruno et inhibe la traduction de l’ARNm Oskar
Quel est l’action de la protéine Maskin liant eIF4E?
Elle inhibe la traduction de plusieurs ARNm.
Quelle protéine recrute Maskin pour inhiber la traduction des ARnm?
La protéine CPEB
Quel domaine possède la protéine Maskin qui lui procure son pouvoir inhibiteur?
Un domaine 4E-BP
Quel est le principal régulateur des niveaux de fer chez l’Homme?
La protéine ferritine
La synthèse de ferritine est régulé par quelle protéine?
IRP
Qu’arrive t’il lorsque les niveaux de fer sont bas?
IRP reconnaît une structure tige boucle sur l’ARNm (IRE) et il y a inhibition de la traduction de ferritine.
Quelle est l’ARNm qui est traduit lorsque la concentration en aa est faible et n’est pas traduit lorsque les niveaux en aa sont élevés?
L’ARNm de Gcn4
Quels types d’effets peuvent avoir les protéines résultants de la traduction d’ARNm mutés ou endommagés?
Effets négatifs sur la cellule
Qu’arrive t’il lorsqu’il n’y a pas de codon stop suite a une erreu dans le cadre de lecture?
Le ribosome est bloqué à l’extrémité 3’ de l’ARNm
Chez les procaryotes, quelle molécule permet de sauver les ribosome bloqués?
Les ARNtm, comme SsrA
Quel est le résultat de l’intervention de SsaR sur un ribosome bloqué?
Le ribosome est recyclé et l’ARNm défectueux est libéré. De plus, le polypeptidique libéré est marqué avec une étiquette de 10 aa.
Que permet l’étiquette de 10 aa su le polypeptide?
Elle est reconnu par les protégés qui dégrade alors le peptide.
Quels sont les deux mécanismes qui permette aux eucaryotes de vérifier l’intégrité de leur ARNm?
Processus de dégradation de l’ARNm induite par un codon non-sens
Processus de dégradation de l’ARNm induite par l’absence d’un codon stop
Chez les mammifères, si la traduction d’un ARNm normal déplace tous les complexes des jonction des exons, que fait la traduction d’un ARNm anormal?
Il ne déplace pas tous les complexe des jonctions des exons et c’est comme ça qu’un ARNm anormal peu être détecté.
Le non déplacecement de tous les complexe des jonctions des exons induit quoi?
Le recrutements des protéine Upf1,2,3 su le ribosome
Que font les protéine Upf1, Upf2 et Upf3?
Ils activent une enzyme hydrolysant la coiffe de l’ARNm ce qui permet la dégradation de l’ARNm.
Lorsqu’il n’y a pas de codons stop, la queue de poly A est traduite, qu’est-ce que cela induit?
Cela induit l’introduction d’une suite de lysine à la fin de la protéine et le blocage du ribosome.
Quel complexe se lie à tout ribosome bloqué?
Exosome qui inclut une exonucléase 3’-5’
Que fait le complexe exosome?
Il stimule la dissociation du ribosome et l’activité exonucléase dégrade l’ARNm. Finalement la protéine contenant la suite de lysine est, elle aussi, dégradée.
