Chapitre 2 - Notions de base en métabolisme énergétique Flashcards

1
Q

Quelle est la définition du métabolisme ?

A

Définition: « Ensemble de réactions biochimiques que subissent les nutriments une fois à l’intérieur des cellules de l’organisme ».

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2
Q

Pourquoi dit-on que le métabolisme est un cycle continuel d’élaboration et de dégradation des substances?

A

Car les cellules CONSOMMENT de l’énergie pour pouvoir EXTRAIRE des nutriments, une plus grande quantité d’énergie. Et utilisent cette énergie pour subvenir à leurs besoins!

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3
Q

Vrai ou Faux:

Au repos, un organisme dépense peu d’énergie.

A

FAUX:

Même au repos, un organisme dépense beaucoup d’énergie.

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4
Q

Donnez les définitions d’anabolisme et de catabolisme :

Ainsi qu’un exemple pour chacun.

A

L’anabolisme = « Ensemble des réactions de synthèse de grosses molécules ou structures à partir de molécules plus petites ».
Ex: - La synthèse du glycogène, du triacylglycérol (TAG), des protéines ou de l’ADN

Le catabolisme = « Ensemble des processus de dégradation de structures complexes en substances plus simples ».
Ex : – L’hydrolyse des aliments dans le tube digestif.
Ex: – Les réactions de transformation de glycogène en glucose, du TAG en acide gras et glycérol ou des protéines en acides aminés.

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5
Q

Dans des conditions physiologiques standard, aucune des réactions biochimiques vitales ne se produirait sans un mécanisme accélérant leur vitesse de réactions. D’autre part, de nombreuses réactions cellulaires sont défavorables énergétiquement (ΔG > 0) et ne se dérouleront pas spontanément.
Donc, comment obtenons-nous ces réactions ?
Quelle est la molécule universelle possédant une forte énergie libre?

A
  • Ces réactions peuvent avoir lieu car les enzymes catalysent les réactions endergoniques en les couplant à des réactions exergoniques. (accélère vitesse de réaction)
  • La somme des deux réactions ayant alors un ΔG < 0 (négatif). = réaction favorable

• La molécule universelle qui possède cette forte énergie libre est l’ATP.

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6
Q

Qu’est ce qu’une réaction endergonique?

Comment est appelée la réaction inverse?

A

Endergonique: Réaction dont le ΔG est > 0 (positif). = non favorable.
La réaction inverse est une réaction exergonique dont le ΔG est < 0 (négatif)

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7
Q

_____ constitue la monnaie d’échange majeure de l’énergie cellulaire.

A

L’ATP

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8
Q

L’ATP est composée d’une base azotée, d’un pentose, et de trois molécules hautement énergétiques.
Nommez la base azotée, le pentose et le nom des 3 molécules dont l’on parle :

A

L’ATP est composée d’une base azotée, l’ADÉNINE, d’un pentose, le RIBOSE, et de trois molécules de PHOSPHATE hautement énergétiques.

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9
Q

L’ATP est le carburant utilisé par toutes les cellules et pour tous les processus vitaux.
Ces processus vitaux incluent :
* 6 réponses (2 plus importantes)

A

Ces processus vitaux incluent:
– Le maintien des pompes membranaires (24-30%),
– la synthèse des des protéines/enzymes (12-25%),
– les cycles de substrats du métabolisme intermédiaire (~7-8%),
– la gluconéogenèse (~5-8%),
– la contraction musculaire (~5-6%) et
– la synthèse des acides nucléiques (~5%).

acronyme mémorisation: MepINCA

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10
Q

Vrai ou Faux:

En absence d’ATP, la mort survient immédiatement.

A

VRAI

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11
Q

Nommez un mode fondamental de transfert immédiat d’énergie libre des systèmes biologiques.

A

Cycle ATP ADP

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12
Q

L’énergie utile dans une molécule d’ATP = liaisons _______, dont l’hydrolyse de chaque a un ΔG relativement très ______.

A

L’énergie utile dans une molécule d’ATP = liaisons PHOSPHODIESTERS
dont l’hydrolyse de chaque a un ΔG relativement très NÉGATIF.

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13
Q

L’ATP a ΔG ______parmi les molécules phosphorylées, ce qui lui permet d’agir efficacement comme ______d’énergie.

A

L’ATP a ΔG INTERMÉDIAIRE parmi les molécules phosphorylées, ce qui lui permet d’agir efficacement comme TRANSPORTEUR d’énergie.

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14
Q

L’ATP peut phosphoryler les composés de plus ____ ΔG° (hydrolyse de l’ATP) alors que l’ADP peut spontanément être phosphorylée en ATP par les composés dont le ΔG°’ est _____.

Ce dernier processus, appelé phosphorylation au niveau du ______, constitue l’une des voies de ______ d’ATP.

A

L’ATP peut phosphoryler les composés de plus FAIBLES ΔG° (faible énergétiquement donc positif) (hydrolyse de l’ATP) alors que l’ADP peut spontanément être phosphorylée en ATP par les composés dont le ΔG°’ est SUPÉRIEUR. (supérieur énergétiquement donc très négatif)

Ce dernier processus, appelé phosphorylation au niveau du SUBSTRAT, constitue l’une des voies de SYNTHÈSE d’ATP.

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15
Q

Grâce à son potentiel énergétique intermédiaire, l’_____ est essentiel pour le couplage des réactions ________qui sont dépendantes des réactions d’oxydation des substrats énergétiques apportés par l’_________.

A

Grâce à son potentiel énergétique intermédiaire, l’ATP est essentiel pour le couplage des réactions ANABOLIQUES qui sont dépendantes des réactions d’oxydation des substrats énergétiques apportés par l’ALIMENTATION.

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16
Q

Quelle est la définition du métabolisme énergétique ?

A

Processus de transformation des substrats énergétiques alimentaires et de réserves corporels qui permet d’obtenir l’énergie nécessaire à l’accomplissement des fonctions de toutes les cellules vivantes de notre organisme

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17
Q

L’optimisation d’énergie produite par le _________ énergétique dépends de la présence (_______________) ou l’absence (_______________) d’oxygène

A

L’optimisation d’énergie produite par le SUBSTRAT énergétique dépends de la présence ( MÉTABOLISME AÉROBIE ) ou l’absence ( MÉTABOLISME ANAÉROBIE ) d’oxygène

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18
Q

Nos cellules utilisent la molécule d’oxygène durant les réactions d’oxydation comme accepteur final d’électrons, afin de produire quoi ?

A

Elle permet (la molécule d’oxygène) de produire le plus d’ATP possible au sein de la mitochondrie ( = respiration cellulaire)

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19
Q

Combien d’ATP fourni la dégradation complète du glucose en aérobie ?

A

Il fournit 30 à 32 molécules ATP

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20
Q

On distingue 3 étapes dans le transfert d’énergie des substrats énergétiques à l’ADP pour former l’ATP, lesquels ?

A
  1. Oxydation des acides aminés, des acides gras et du glucose en acétyl CoA
  2. Oxydation de l’acétal CoA via le cycle de Krebs avec transfert d’énergie au NAD+ et FAD pour former le NADH+H+ et le FADH2
  3. Oxydation du NADH+ H+ et FADH2 pour former de l’ATP
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21
Q

1) Que doivent subir les nutriments, lors de l’étape de l’oxydation en acétyl-CoA ?
2) Que forme cette oxydation?

A
  • Les nutriments (Glucose, AG, et AA) doivent tout d’abord subir des transformations pour fournir de l’acétyl-CoA
  • Permet la formation de CO2, de NADH+H+ et d’acétyl-CoA
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22
Q

L’étape de l’oxydation de l’acétyl-CoA via le cycle de Krebs provoque 2 choses, lesquels?

A
  • Permet l’élimination de l’acétyl-CoA sous forme de 2x CO2

- S’accompagne du transfert de protons H+ au NAD+ et FAD pour former le NADH+ H+ et le FADH2

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23
Q

L’étape de l’oxydation de NADH + H+ et de FADH2 pour former l’ATP nécessite quoi ?

A

Cette étape nécessite un ensemble de protéines

Et de l’oxygène (formation d’H2O)

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24
Q

Dans l’étape de l’oxydation de NADH + H+ et de FADH2 pour former l’ATP, à quel niveau ces coenzymes sont-ils réduits?

A

Au niveau de la chaîne respiratoire (système OXPHOS)

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25
Q

Qu’est-ce que la phosphorylation oxydative ?

A

En bref : “Processus par lequel l’énergie du NADH+ H+ et du FADH2 est transférée à l’ADP pour former l’ATP.”

Définition longue: La «phosphorylation oxydative» = «voie métabolique mitochondriale qui utilise l’énergie libérée par le catabolisme des nutriments dans un ensemble des réactions d’oxydoréduction qui aboutissent à une consommation d’oxygène et à une réaction de phosphorylation de l’ADP pour former de l’ATP».

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26
Q

Contrairement à la B-oxydation (acides gras) et la cétolyse (corps cétoniques), quelle voie métabolique peut se produire en absence d’oxygène?
Quel est le ratio/bilan d’ATP de cette voie par molécule utilisée?

A

La voie de la GLYCOLYSE peut se produire en absence d’oxygène. Elle fournira 2 molécules d’ATP par molécule de glucose.

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27
Q

Vrai ou Faux:
La production d’énergie (ATP) par la voie de la glycolyse dans le cytosol, est suffisant pour entretenir les besoins énergétiques de la cellule?

A

Faux: Bien que la production d’énergie par la voie de la glycolyse dans le cytosol (anaérobie) ne soit pas négligeable (2 ATP/glucose), elle est insuffisante pour entretenir les besoins énergétiques de la cellule.

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28
Q

La ß-oxydation (acides gras) et la cétolyse (corps cétoniques) ont lieu où?
La présence de quoi est obligatoire pour produire de l’ATP dans leur cas?

A

La ß-oxydation (acides gras) et la cétolyse (corps cétoniques) ont lieu dans la MITOCHONDRIE et la présence d’OXYGÈNE est obligatoire pour produire de l’ATP dans leur cas.

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29
Q

Qu’est-ce qui a pour fonction de produire l’essentiel de l’énergie cellulaire?

A

La phosphorylation oxydative a pour fonction de produire l’essentiel de l’énergie cellulaire

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30
Q

Quel système assure la phosphorylation oxydative ?

A

Le système OXPHOS

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31
Q

recommandé

Donnez la définition du système OXPHOS

A

Ensemble des cinq complexes multi-enzymatique encrés dans la membrane interne des mitochondries

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32
Q

Recommandé

Nommez les 2 types de réaction enzymatique et leur nombre retrouvées dans le système OXPHOS:

A

4 oxydoréductases

1 ATP synthétase

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33
Q

Qui suis-je

Nous jouons le rôle de pompe à protons?

A

Les complexes I, II, III, IV
Lol même si on sait que le complexe II n’est pas une pompe à proton et qu’en plus on le voit sur le schéma des notes… (thanks biocell)

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34
Q

Par quoi est alimenté la pompe à proton du système OXPHOS ?

A

L’énergie qui alimente cette pompe est celle qui est libérée par l’oxydation des molécules des nutriments.

35
Q

recommandé
Dans le système OXPHOS:
Qu’est -ce qui sert à lier les groupements phosphate à l’ADP ?

A

Le passage des ions H+ vers la matrice par l’ATP synthétase sert à lier les groupements phosphate à l’ADP.

36
Q

recommandé
Qui suis-je?
Principaux organites producteurs d’énergie chez les organismes pluricellulaires ?

A

Les mitochondries

37
Q

La __________ des nutriments lors de la respiration cellulaire se fait grâce à des réactions _______________.

A

La DÉGRADATION des nutriments lors de la respiration cellulaire se fait grâce à des réactions D’OXYDORÉDUCTION.

38
Q

Déterminez les termes “oxydation” et “réduction”

A

Oxydation : perte d’électron

Réduction : gain d’électron

39
Q

La substance oxydée _____ des électrons, alors que la substances qui les attire _____des électrons

A

La substance oxydée PERD des électrons, alors que la substances qui les attire GAGNE des électrons

40
Q

Vrai ou Faux

Les électrons sont libres en solution ?

A

Faux, les électrons n’existent pas à l’état libre en solution
** Les protons non plus!

41
Q

Les protons H+ n’existent pas à l’état libre en solution. À quoi sont-ils toujours liés ?

A

Ils sont toujours liés au nuage électronique d’une autre molécule!
** les électrons aussi n’existent pas à l’état libre en solution

42
Q

Pourquoi lors des réactions d’oxydoréduction, les électrons (e-) qui sont gagnés ou perdus sont toujours associés à des protons H+ ?

A

Car les électrons (e-) et les protons (H+) n’existent pas à l’état libre en solution.
Les protons H+ sont toujours liés au nuage électronique d’une autre molécule.

43
Q

Au cours du métabolisme énergétique en aérobie, l’oxydation des nutriments se fait par la perte successive de paires de H+ (et aussi de paires d’e-) en provenance des molécules de substrat jusqu’à ce qu’il ne reste que… ?

A

Jusqu’à ce qu’il ne reste que du CO2.

44
Q

Qui est l’accepteur final d’électrons; à la toute fin du processus d’oxydoréduction, qui se combine avec les atomes H+ pour former du H2O?

A

L’O2

45
Q

Lorsque les nutriments sont oxydés, leur énergie est transmise successivement à une «chaîne» d’autres molécules et finit par aboutir à quoi?

A

Cela aboutit à de l’ADP, permettant la formation de molécules d’ATP riches en énergie.

46
Q

Les réactions d’oxydoréduction sont catalysée par quoi?

A

Les enzymes, plus précisément les déshydrogénases.

47
Q

Qui suis-je ?

Je permet le transfert d’hydrogène d’une molécule à une autre.

A

Les déshydrogénases

48
Q

Les déshydrogénases nécessitent la présence d’un ________ pour fonctionner, habituellement dérivée d’une ___________ du groupe ____.

A

Les déshydrogénases nécessitent la présence d’une COENZYME pour fonctionner, habituellement dérivée d’une VITAMINE du groupe B.

49
Q

Quels sont les dérivés des coenzymes NAD+ et FAD ?

A

NAD+ est dérivé de la vitamine B3

FAD est dérivé de la vitamine B2

50
Q

Nommez 2 coenzymes de plusieurs déshydrogénases très importantes de voies oxydatives:

A

NAD+ (dérivé de la vitamine B3)

FAD (dérivé de la vitamine B2)

51
Q

On dit que le NAD+ est un “agent oxydant” (accepteur d’électron). Il est la forme oxydé de quelle substance?

A

Il est la forme oxydée du NADH+ H+

*Donc le NADH+ H+ est la forme réduite du NAD+

52
Q

Dans la synthèse des acides gras, on dit que le NADPH+ H+ est essentiel et agit comme un … ?

A

Un “agent réducteur”

53
Q

Le NADH+H+ et le FADH2, au niveau du système OXPHOS, sont des molécules de transport d’électrons nécessaires à quoi ?

A

Molécules de transport d’électron nécessaires à la phosphorylation oxydative de l’ADP

54
Q

Si NADH+H+ est la forme réduite du NAD+, déterminez celle du FAD

A

La forme réduite du FAD est le FADH2

55
Q

Quelle est la source primaire du FADH2 ?

A
  • Le cycle de Krebs

- La ß- oxydation (des acides gras)

56
Q

Qui suis-je

Je suis une coenzyme, dans le cycle de Krebs, de la succinate déshydrogénase qui oxyde la succinate en fumarate ?

A

FAD

57
Q

Le FAD est une coenzyme de la réaction de l’acyl-CoA déshydrogénase qui se déroule dans quel processus catabolique?

A

Lors de la ß-oxydation des acides gras.

58
Q

Le FAD est une coenzyme de la réaction de l’acétyl-CoA déshydrogénase qui se déroule à quelle étape de la synthèse du métabolisme énergétique ?

A

Lors de la ß-oxydation des acides gras.

59
Q

Vrai ou Faux

Les coenzymes agissent comme des accepteurs de P+ ?

A

Faux, les coenzymes sont des accepteurs de H+ (ou d’électrons)

60
Q

Dans le cycle de Krebs, le FAD est un coenzyme de la succinate déshydrogénase qui oxyde le succinate en quoi?

A

oxyde le succinate en fumarate.

61
Q

Dans la ß-oxydation, le FAD est une coenzyme de la réaction de quel enzyme?

A

Dans la ß-oxydation le FAD est une coenzyme de la réaction de l’acyl-CoA déshydrogénase.

62
Q

Dans les réactions rédox, les coenzymes agissent comme des accepteurs de H+ (ou d’électrons), c’est-à-dire qu’elles sont ______ chaque fois qu’un substrat est ______.

A

Dans les réactions rédox, les coenzymes agissent comme des accepteurs de H+ (ou d’électrons), c’est-à-dire qu’elles sont RÉDUITES chaque fois qu’un substrat est OXYDÉ.

63
Q

Vrai ou Faux:

Dans les réactions rédox, les enzymes agissent comme des accepteurs de H+ (ou d’électrons).

A

FAUX:
Les COENZYMES agissent comme des accepteurs de H+ (ou d’électrons), pas les enzymes!!!

** C’est pour ca que les déshydrogénases (enzymes) nécessitent des coenzymes!
Explication: Les déshydrogénases (enzymes) catalysent l’oxydation d’une substance par ÉLIMINATION d’atomes d’hydrogène, ce ne sont PAS des accepteurs d’hydrogène (elles ne retiennent pas ces atomes et ne forment pas de liaisons avec eux). Elles ont donc besoin des coenzymes!

64
Q

Quel est le rôle de la Coenzyme A (CoA) ?

A

Elle est nécessaire au transfert du groupement acyle intervenant dans de très nombreuses voies du métabolisme (cycle de Krebs, bêta-oxydation).

65
Q

Vrai ou Faux:

La partie réactive du coenzyme A (CoA) est son groupement carbone?

A

FAUX:
La partie réactive du CoA = fonction thiol (-SH) libre; c’est pourquoi il est très souvent symbolisée par HS-CoA (ou CoA-SH).

66
Q

Coenzyme A et acylation (estérification) :

La réaction d’oxydation du pyruvate par la PDH forme l’acétyl-CoA avec une liaison ______riche en énergie.

A

La réaction d’oxydation du pyruvate par la PDH forme l’acétyl-CoA avec une liaison ACYLTHIOESTER riche en énergie.

67
Q

L’activité catalytique des enzymes peut être directement modifiée par deux types d’altérations lesquels ?

A
  • Altération structurales

- Altération conformationnelles

68
Q

Dans les voies métaboliques, le taux de catalyse des enzymes peut être diminué ou augmenté par..? (2)

A
  • Une régulation allostérique ET/OU

- Une modification covalente

69
Q
La phosphorylation (ou déphosphorylation) est considérée comme étant une modification covalente. 
Par quoi peut-elle être induite?
A

Phosphorylation (ou déphosphorylation) induite par:

Une molécule de signalisation externe : hormone, facteur de croissance, cytokine

70
Q

Régulation allostérique, Vrai ou Faux:

Les enzymes des voies métaboliques ne possède qu’un seul site de fixation ?

A

Faux: Elles possèdent, en plus de leur site actif, un site allostérique (lié par un effecteur)

71
Q

La plupart des enzymes des voies métaboliques ont une régulation allostériques ou covalentes?

A

Allostériques

72
Q

Comment réagit l’enzyme lorsqu’un effecteur activateur se fixe au site allostérique ?

A

Elle prend sa forme active

73
Q

En régulation allostérique:

Un effecteur inhibiteur à pour effet d’ ________ l’enzyme.

A

Un effecteur inhibiteur à pour effet d’INACTIVER l’enzyme.

*prend sa forme inactive, le substrat ne peut pas de lier.

74
Q

En régulation allostérique, quand est-ce que l’enzyme devient active ?

A

Lorsqu’un effecteur activateur se fixe au site allostérique

75
Q

Dans la régulation allostérique des voies métaboliques, un métabolite de la voie réactionnelle peut agir comme _______et se fixer de façon ________ à l’enzyme afin de moduler son activité catalytique.

Ainsi, dans les systèmes multienzymatiques des voies métaboliques, un des produits de la chaîne de réactions (du début, intermédiaire ou de la fin) peut servir soit comme un _______, soit comme un __________spécifique à une des enzymes de la chaîne.

A

Dans la régulation allostérique des voies métaboliques, un métabolite de la voie réactionnelle peut agir comme EFFECTEUR et se fixer de façon NON-COVALENTE à l’enzyme afin de moduler son activité catalytique.

Ainsi, dans les systèmes multienzymatiques des voies métaboliques, un des produits de la chaîne de réactions (du début, intermédiaire ou de la fin) peut servir soit comme un ACTIVATEUR, soit comme un INHIBITEUR spécifique à une des enzymes de la chaîne.

76
Q

Vrai ou Faux:
Dans les voies métaboliques, la phosphorylation est un mécanisme de régulation par modification covalente des enzymes important et très fréquent

A

VRAI

77
Q

Régulation par modification covalente:
De nombreuses enzymes métaboliques sont mises en position «active» ou «non-active» par une phosphorylation ou une déphosphorylation. Qu’est-ce qui catalyse chacune de ces réactions?

A

La phosphorylation est catalysée par diverses protéines KINASES spécifiques
La déphosphorylation est catalysée par des protéines PHOSPHATASES.

78
Q

Phosphorylation/Déphosphorylation (covalent) :

Les kinases et phosphatases sont en général régulées par des signaux extérieurs, comme: (4)

A

les hormones, les cytokines et autres facteurs de croissance ainsi que par les variations de calcium intracellulaire
(acronyme: HCCC)

79
Q

Nommez deux hormones antagonistes libérées dans le sang par les cellules endocrines du pancréas qui assurent un rôle de régulation au niveau de la glycémie:

A
  • L’insuline

- Le glucagon

80
Q

Quel est la valeur moyenne visée pour la glycémie ?

A

La glycémie doit être près de 1 g/L (5,6 mmol)

81
Q

Vrai ou Faux:

L’insuline et le glucagon sont reconnus par des récepteurs membranaires spécifiques?

A

VRAI

82
Q

Dans les cellules cibles, le récepteur du glucagon active quelle protéine?

A

Une protéine kinase dépendance de l’AMP cyclique; la protéine kinase A (PKA)

83
Q

Dans les cellules cibles, le récepteur de l’insuline active quelle protéine?

A

La protéine phosphatase 1 = (PP1)

84
Q

Dans un exemple de régulation covalente de l’activité enzymatique via phosphorylation/déphosphorylation par les hormones tel que l’insuline et le glucagon, quel hormone subira une phosphorylation et laquelle subira une déphosphorylation?
Expliquez!

A

Insuline: déphosphorylation, car les récepteurs de l’insuline active la protéine phosphatase 1 (PP1)
Glucagon: phosphorylation, car les récepteurs du glucagon active une kinase dépendante de l’AMP cyclique, une protéine kinase A (PKA)