Chapitre 2 - Actinomycètes Flashcards
Quels sont les deux principaux genre de morphologie chez les actinomycetes?
Nocardioformes et sporoactinomycetes
Combien de groupes différencier par les paroi cellulaires sont présents chez les actinomycetes? Et quel caractéristiques permet de sous-divisé un de ces groupes?
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Quels sont les rôles des actinomycètes dans le sol?
- structure
- cycle du carbone et de l’azote (décompositionet minéralisation)
Est-ce que les actinomycètes peuvent dégrader la chitine?
Ja
Quel est le nom du composé qui donne l’odeur à la terre?
Géosmine (terpènes)
Est-ce que les actinomycètes peuvent former des mycéliums aériens?
Ja
Comment le mycélium des actinomycètes les avantagent dans le sol, lorsque comparé aux bactéries?
Colonisent plus aisément les sols secs
Vrai ou Faux : les actinomycètes ne sont jamais des thermophiles.
Faux
Les spores des actinomycètes peuvent causer des allergies et quels maladies?
Poumon de fermier, lèpres
Quel organisme peut dégrader les hydrocarbures?
Actinomycètes
Nommer deux niches des actinomycètes
- sol
- bouche et dents
- intestins d’insectes
- nourriture
- compost et fumier
- l’eau (douce et salée)
Quel genre, chez les actinomycètes, possède un chromosome linéaire?
Streptomyces
Pourquoi les actinomycètes ont besoin de facteurs de transcription différents des bactéries?
Car ils ont un usage enzymatique de codons différents
Nommer les deux gènes de développement d’actinomycètes.
bld : formation et fonctionnement du mycélium aérien
whi : développement de spores matures
Quels sont les deux plasmides de Streptomyces?
SCP1 et SCP2, s’intègrent au chromosome
Quelles caractéristiques confèrent les plasmides?
Caractéristiques quant à la fertilité et à la mobilité
Comment se fait la conjugaison chez les actinomycètes?
Par fusion des hyphes, et non par des pili deconjugaison.
Les actinomycètes sont des Gram- ou +?
Gram+
Quand les actinomycètes sont mobiles, sous quelle forme se présentent-elles?
Sous forme de spores flagellés
Quels sont des genres d’actinomycètes qui ne forment pas ou peu de mycélium?
Propionibacterium, Cornybacterium et Mycobacterium
Quel genre d’actinomycètes a un mycélium instable, qui peut se fragmenter en coques et bacilles?
Nocardia
Quels sont les deux formes que le mycélium peut prendre chez les actinomycètes?
- Coenocytique (pas septes)
- Septé (simple paroi internes ou double paroi internes)
Différencier le mycélium du subtrat du mycélium aérien.
Primaire : tube de germination issu de la spore, ancré dans le support solide des nutriments, croissance apicale
Aérien : hyphe sur le mycélium primaire, plus épais et moins ramifiés, généralement pigmenté, plus riche en ADN, contient des structure aux fonctions inconnues
Quel est un synonyme de spore?
Conidies
Comment se passe la reproduction sexuée chez les actinomycètes?
Par croisement des filaments
Pourquoi les agrégats sont problématiques dans un fermenteur?
Forment un gradient de nutriment, le milieu est ainsi plus uniforme
Quels sont les deux groupes de spores?
Exospore et endospore
Quelles sont les fonctions des spores
Reproduction et résistance à des conditions environnementales difficiles
Qu’est-ce qui est nécessaire à la germination des spores?
Nutriments exogènes, eau et CALCIUM
Comment le spore germent? (il fait quoi après)
un tube émerge du germe et les hyphes du subtrat primaire va coloniser le tout, après mycélium aérien, et structure de spores
Quels sont les deux types de sporulation exogène?
Par fragmentation d’hyphes avec enveloppe ou sans enveloppe
Quelles sont les caractéristiques des exospores?
- présence de pigments
- tréhalose a un rôle dans la resistance et la dormance des spores
- lorsqu’en dormance est sensible à l’environnement
À quoi sert le traitement 5 min à 50 pour les spore d’actinomycètes?
Permet d’avoir une germniation uniforme
Quelles sont les caractéristiques des endospores?
- formées dans le cytoplasme de l’hyphe, paroi externe épaisse, multicouche très résistante
- thermophile
- dormance constitutive. Activation de manière plus spécifique (choc chimique de 55, puis 48h à 20)
Quelles sont les facteurs controlant la sporulation?
- La grandeur du mycélium est proportionnel à la quantité de nutriemnts disponibles
- Facteurs externes : carence, O2, eau, Température
- Facteurs intrinsèques : gène chromosomiques ou plasmidiques, facteurs de régulation de la sporulation souvent associé à la production d’antibiotique
Est-ce qu’il est facile d’avoir formation de spore dans une culture submergé?
Na
Qu’est-ce qui est plus d’intérêt pour actinomycètes, le métabolime primaire ou secondaire?
SECONDAIRE
Quelles métabolites secondaires est métabolisés par actinomycètes?
- Antibiotiques
- Insecticides
- Herbicides
- Antiparasitaires
- Fongicides
- Substances antitumorales
- Hypocholestérolémiants
À quelle moment de la croissance est lié la formation de métabolites secondaires?
Associé à la différenciation aérienne
Les métabolites secondaires sont codés par des groupes de gènes
Les métabolites secondaires sont codés par des groupes de gènes
Quels sont les mécanismes qui permettent à la souche (actinomycète) de survivre à la présence de métabolites?
- Altération de la perméabilité de l’antibiotique et modification de la cible cellulaire de l’antibiotique
- Rétroinhibition ou la dégradation d’enzymes des voies de biosynthèse pour stopper la production des métabolites secondaires
Nommer les facteurs de régulation des métabolites secondaires.
- gène bld
- ppGpp synthase associé au ribosome
- présence trop élevée de phosphate inorganique dans le milieu empêche la synthèse structurelle de plusieurs métabolites secondaires
- Facteur A
- Facteur PI : déclenche la production d’antifongique
- famille de protéines SARP : régulent les voies biosynthétiques des métabolites secondaires
Décrire le fonctionnement du facteur A
Facteur A libère le promoteur de adpA lorsqu’ilse lie à une autre protéine cytoplasmique nommé ArpA. Transcription du gène codant pour adpA peut alors se faire et adpA active le régulateur strR qui permet la production de streptomycine
Il y a beaucoup de voies principales pour le métabolisme des subtrats carbonés
Il y a beaucoup de voies principales pour le métabolisme des subtrats carbonés
Quelles est la première souche utilisé pour produire tétracycline?
Streptomyces aureofaciens
La céphalosporine et la tétracycline sont des bactéricides en grande concentration, mais le sont-il en faible concentration?
Non, sont bactériostatiques
Quel est le problème généré par la tétracycline?
Peut développer des résistances croisées chez microorganismes
Comment se fait la biosynthèse de la tétracycline? (général)
Du glucose, transformé en acétyl-CoA, en mélanyl-CoA puis en un intermédiaire tricyclique, qui est transformé en une variété de tétracyclines connue. Plus la glycolyse est basse plus la production de tétracycline et le taux de la voie des pentoses phosphates augmentent.
Quel type de mutant permet de produire des analogues de tétracycline plus stables chimiquement?
S. aureofaciens avec un système de méthylation compromis
Quels sont les deux facteurs (tests) affectant le choix des souches utilisées pour la production de tétracycline?
- Épreuve de diffusion en gélose (Ensemence S. sur tapis bactérien de bactérie que l’on cible, regarde inhibition)
- Sélection de souches pour contrer la résistance aux antibiotiques (trouve les inhibiteurs de béta-lactamase, utile à utilisé en combiné)
Comment on prépare l’inoculum d’un fermenteur produisant de la tétracycline?
Utilise les spores dans un bouillon avec liqueur de mais et CaCo3, pendant 24h. On préfermente avec 5% (v/v) dans un petit biofermenteur.
Décrire le procédé de fermentation de la tétracycline.
En culture immergée, utilise 2-10% de l’inoculum dans un milieu de Duggar. 1. avoir biomasse, donc bcp d’O2 est requis = contient bcp de métabolites primaires (6h-12h). 2. 60h- 65h à 2 pH 5.8 - 6 Croissance mycéliale diminue alors que les métabolites secondaires sont produits jusqu’à des taux maximaux (hyphes minces) 3. Production d’antibiotiques diminue, mycélium se fragmente et autolyse (phase finale)
Pourquoi on doit limité la présence de phosphate lors de la production de tétracycline?
Réprime la production
Quel est l’impact d’une forte quantité de chlore présent lors de la production de tétracycline?
Produit d’autres antibiotiques également comme la chlorotétraclycine.
Quelles sont les alternatives permettant de réduire le chlore présent lors de la production de tétracycline?
- Résine d’échange d’ions
- Argent
- Substance qui inhibent l’incorporation du chlore dans l’antibiotique
- Mutant qui ne peuvent pas faire chlorotétracycline (best)
