Chap 7 - Staph Flashcards

1
Q

Quelles sont les caractéristiques des Staph? (ceux croisés en hopitaux)

A
  • MRSA et MSSA (sensible à la méthiciline) sont dans les plus présents dans les hôpitaux.
  • Gram +, catalase et coagulase +
  • SARM-AH (acquis en milieu hospitalier) ou SARM-AC (acquis en communauté)
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2
Q

Quelles types d’infection cause S. aureus?

A
  • Cause : abcès, furoncles à la base des poils, impétigo qui est une infection de la peau très contagieuse causer par S. aureus + S pyogenes, infections post-opératoires et nosocomiales, colonisation des poumons chez les patients atteints de fibrose kystique, syndrome du choc toxique (souches produisant TSST-1), empoisonnement alimentaire par l’ingestion d’exotérotoxines qui agissent comme superantigènes, mammite bovine.
  • Cause plusieurs facteurs de virulence = multiples types d’infections.
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3
Q

Quel sont les tests d’identification possible pour S. aureus?

A

Tolère le sel (7.5%) et fermente le mannitol (gélose MSA, mannitol salt agar),
coagulase + (en tube, coagulase + fibrinogène = fibrine) et nucléase / thermonucléase + (sur gélose à ADN au bleu de toluidine, tourne rose en présence d’acide nucléique)

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4
Q

Quels sont les caractéristiques de SARM?

A

plus correctement résistant à l’oxacilline :
o Possède une transpeptidase supplémentaire (PBP : peniciline-binding protein) codée par le gène mecA (acquis par transfert horizontal)
o SARM-AC : plus dangereux mais moins résistant aux antibiotiques,
Cause fasciite nécrosante, principalement une infection de la peau pas multirésistant (car arrivé plus tard que le SARM AH), contagieux par simple contact et peut devenir une septicémie. Exacerbé par PVL.

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5
Q

quels sont les stages de virulence de S. aureus?

A

o Stage 1 : colonisation – protéine A et FnBP qui sont des adhésines
o Stage 2 : très virulent, endommage les tissus et dissémination – autres facteurs de virulence.

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6
Q

quelles sont les caractéristiques de la mammite bovine?

A
  • Première cause de mammites cliniques au Canada.
  • Souvent difficile à détecter, détecté par compte des globules blancs dans le lait et souvent sous-cliniques.
  • Réfractaire aux traitements avec antibiotiques Pir, Cep et Cef (mammites chroniques et persistantes)
  • Réservoir d’infection pour le troupeau
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7
Q

Comment a été développé le vaccin contre la mammite bovine?

A

• Collecte du lait et bactéries pour l’analyse du profil transcriptionnel, comparaison des expression in vivo et in vitro. On identifie les outils les plus importants pour l’infection.
• Validation qPCR : on compare ou s’est exprimé, dans la vache VS dans bouillon + Fe / dans bouillon – Fe / dans le lait.
o Scénario 1 : gène exprimé lors d’une infection chez la vache à cause de la restriction en Fe
o Scénario 2 : gène exprimé lors de l’infection chez la vache à cause du lait
o Scénario 3 : gène exprimé lors de l’infection chez la vache à cause de l’hôte
• On teste les gènes en faisant des mutants qui ne produisent plus l’outil et on compare si les mutants ont moins de virulence.

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8
Q

Quelles sont les trois structures lié aux facteurs de virulence de S. aureus?

A

Adhésines, modullines, aggressines

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9
Q

Qu’est-ce qui est exprimé en premier, adhésines ou peptides autoinductibles ou exoproduits?

A
  • Première chose exprimée est les adhésines (transcription d’adhésines), qui va décline tôt, après les peptides autoinductibles.
  • Après, c’est les toxines et les molécules qui permettent la sortie (exoproduits) qui sont exprimés, après le post-exponential timing signal.
  • Peptides autoinductibles servent à identifier la densité de la population et vont être exprimé quand après le début de la croissance.
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10
Q

Décrire comment est réguler la virulence de aureus

A
  • Première chose exprimée est les adhésines (transcription d’adhésines), qui va décline tôt, après les peptides autoinductibles.
  • Après, c’est les toxines et les molécules qui permettent la sortie (exoproduits) qui sont exprimés, après le post-exponential timing signal.
  • Peptides autoinductibles servent à identifier la densité de la population et vont être exprimé quand après le début de la croissance.
  • Avec les peptides autoinductibles, RNAIII sont up-réguler et après une heure il y a translation de sigma-hémolysine
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11
Q

Quelles sont les caractéristiques de small-colony variants (SCVs)?

A
  • Due à des mutations ponctuelles dans les infections chroniques persistantes
  • Souche dont la respiration est déficiente, va majoritairement fermenter et produit donc moins d’ATP (fait que la croissance est lente d’où les petites colonies), réduit sa susceptibilité aux aminoglycosides, produit beaucoup de biofilm et grande persistance intra¢ (car ne tue pas les ¢, la croissance est lente au point de ne pas pouvoir former les molécules endommageant les tissus = ¢ vit = persistent) et hémolyse réduite.
  • Pas réguler par arg car la croissance est trop lente, mais par sigB qui est lié aux adhésines.
  • SCVs font plus d’adhésines (normale, ne se rendent pas à la deuxième étape) en comparaison avec le type sauvage
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12
Q

Quelles sont les facteurs de virulence de S. aureus?

A

o Protection initiale contre la R.I. : capsule, mobilité, sIgA protéase, C5a peptidase
o Permet adhérence aux tissus de l’hôte : fimbriae, adhésines non-fimbriae (glycoprot)
o Causant dommages à l’hôte : toxine, hémolysine, phospholipases
o Modulant la R.I. : endotoxine et suerantigène
o Donnant une capacité métabolique : tryptophanase, guaA chez aureus
o Ceux nécessaires à l’expression et à la sécrétion des facteurs de virulence (chez aureus)
 S. aureus agr
 Moniteur de population (quorum sensing)
 Facteurs σ alternatifs (ex. sigB chez SCVs)
 Sortae
 Appareils de sécrétion (général, type I, II, III), ici général est celui utilisé

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13
Q

Décrire le quorum sensing de P. aeruginosa

A
PQS (P. quinoline signal), les molécules signal sont reconnues par 3 structures différentes (LasR, RhiR, PqsR) ceci permet de former une balance entre les opérons qui sont activés ou inhibés).
o	HSL (homosérine lactone): signal est diffuser et n’a ainsi pas de senseur associé, et affecte les mêmes choses que Agr.
L'activation de LasR controlent l'expression d'une trentaine de protéines
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14
Q

Décrire le système de quorum sensing de S. aureus

A

o Agr : peptide signal qui utilise un transporteur qui est sorti de la bactérie et a un senseur qui va capter le signal et influencer la sporulation, la motilité, le biofilm, conjugaison et la virulence.

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15
Q

Quels sont les liens entre les systèmes de quorum sensing de S. aureus et P. aeruginosa?

A

o HQNO, qui utilise la même voie de synthèse que PQS, a un impact proportionnel sur le biofilm de aureus. HQNO limite la chaine respiratoire ce qui favorise les SCVs.
o Donc pour les patients atteints de fibrose cystique, lors d’une infection de aureus, si aeruginosa arrive, comme il y a HQNO de formé va favoriser infection extra et intracellulaire et persistante, tout comme l’utilisation de tobramycine.

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16
Q

Quelles sont les caractéristiques de S. epidermidis?

A
  • Commensal de la peau chez presque 100% des humains. Ils se rencontre parfois dans les septicémies nosocomiales
  • Les prothèses cardiaques, cathéters et implants facilitent la colonisation de ce pathogène.
  • Grand producteur de biofilms
  • Peuvent être aussi MR-CNS (mecA+)
  • Plusieurs CNS chez la vache : S. chromogenes, S. xylosus
17
Q

Décrire les système d’exportation et de sorting des gram + (Staph).

A
  • Utilise GSP, motif LPXTG, signal en c terminal reconnu par la sortase.
  • Les peptidoglycanes lient les acides téichoique qui sortent de se rendent à l’extérieur (polymère de glycérol phosphate.
  • Les protéines M (S. pyogenes) et FnBP (S. aureus) lient les peptidoglycanes dans la membrane et sortent de la membrane.
18
Q

Décrire l’expérience sur les FnBPs

A
  • Le gène de FnBP comprend une partie N-peptide signal pour GSP, les domaines de liaison à la fibronectine (D1 à D11) et la partie C-sortase signal (LPXTG) pour l’attachement au PG.
  • La fibronectine (Fn) s’attache à l’extrémité N-terminale du FnBP (ben FnBP s’attache au Fn).
  • À l’aide de spectroscopie de force (AFM-FS) pour étudier l’interaction entre la fibronectine et S. aureus.
  • 4 tests : fibronectine libre ajoutée (crée de la compétition donc pas d’interaction) – juste CMA sans fibronectine – mutant S. aureus FnBP nég. – juste les sites de liaison (crée compétition aussi donc moins d’intéraction).
  • Les interactions par addition de feuillets béta nuit aux interactions (béta-Zipper en tandem du N-terminal de Fn). Cette interaction n’aide pas
  • L’autre expérience : pour la mammite bovine, quand le lait sort, la bactérie a besoin d’adhérer pour ne pas sortir
19
Q

Comment malouin a trouvé un new antibiotique?

A
  • À la base on cherchait les antibiotiques dans le sol, mais on a commencé à en chercher dans les plantes.
  • En cherchant une molécule qui réduit la virulence et non pas la croissance, en ciblant l’hémolysine. On trouver la tomatidine qui cible ATPsynthétase. Pour les souches SCVs, comme la chaine est déjà ralenti, la tomatidine nuit aux SCVs ce qui en fait un antibiotique ciblant les SCVs
20
Q

Qu’est-ce que PBP2a et qu’est-ce que cela fait?

A

transpeptidase supplémentaire chez SARM (PBP : peniciline-binding protein) codée par le gène mecA (acquis par transfert horizontal)
Cette PBP2a a peu d’affinité pour les antibiotiques de la classe des béta-lactamines et peut fonctionner en présence de ces antibiotiques.
PBP2a assure donc l’étape finale de la synthèse du peptidoglycane (les 4 autres PBP sont normalement inhibé par l’antibiotique). Permet de lier les peptidoglycanes, c’est la deuxième étape et la première étape est la transglycosylation.

21
Q

Pourquoi le SARM-AC est plus dangereux mais moins résistant?

A

car possède le gène de la toxine Panton-Valentine (PVL), une leucocidine qui forme des pores dans les leucocytes ET/OU possède la cassette chromosomique SCC-IV ou SCC-V. La cassette n’est pas mobile une fois dans le chromosome de S. aureus et peut être diclonal.

22
Q

Comment confirme-t-on un SARM?

A

présomptif (sur géloses commerciales), détection PCR gène mecA, détection de la protéine PBP2a (sur lame)

23
Q

Est-ce que la mammite bovine peut devenir Chronique / persistante?

A

oui

24
Q

expliquer comment a été trouvé une cible pour un antibiotique contre la mammite bovine.

A
  • Après la découverte d’une cible pour un vaccin, recherche d’une cible / gène pour antibiotique = gène guaA est fortement exprimé lors de l’infection, code pour GMPsynthetase donc intra¢ ce qui limite la formation de vaccin, mais son expression est régulée par riborégulateur. Quand le switch est on, pas de guanine et AUG est disponible, mais en présence de guanine le switch est off et guaA ne peut être transcrit = pas de production de GMP nécessaire à la bactérie.
  • But : trouvé un analogue a guanine qui peut bloquer le switch, appeler antibioswitch. Analogue trouvé est le 2,5,6,-triaminopyrinidin-4-one- (PC1)
25
Q

expliquer l’avantage de l’antibiotique contre la mammite bovine

A

Est spécifique et ciblé, car demande que le switch soit devant guaA, ce qui est présent chez aureus, epidermidis, haemolyticus et C. difficile. Donc ne touche pas E. coli, enterococci et streptococci

26
Q

décrire le système AIP

A

AIP (autoinducing peptide) s’accumule = AgrC qui est le senseur donne un P au régulateur AgrA = exprime P2 et P3, P2 comprend agrB, D, C et A et P3 comprend RNAIII (un ARN régulateur) = AgrD une prot et pore AgrB , la région B, D et C est variable.

27
Q

est-ce que le système AIP peut être utilisé pour limiter l’action de d’autres souches?

A

oui, AIP comprend formation d’un cycle thiolactone pas une cystéine centrale et l’extrémité C-terminale . Il y a divers groupes de AIP, et par conséquent des AIP hétérologue peuvent venir bloquer le système (au niveau du senseur) = but utiliser une autre souche pour annuler la virulence, fonctionne sur modèle animal mais pas sur l’homme, mais susceptible a peptidase.

28
Q

Pourquoi les SCVs sont résistants à certains antibiotiques comme la tobramycine?

A

Le gradient de proton de la membrane peut être utilisé par des antibiotiques comme la tobramycine. Donc les SCVs sont protégé contre ce type d’antibiotique car n’ont pas les cofacteurs des cytochromes, comme il y a des mutations dans la biosynthèse de la menadione ou de hemin.

29
Q

Comment peut-on prouver que les SCVs font bel et bien plus de biofilm comparer à aureus typique?

A

pour un mutant dont la voie de biosynthèse de la menadione est altéré, en ajoutant de la menadione dans le milieu, la souche l’utilise et réduit sa formation de biofilm.

30
Q

Quels facteurs contribuent à la persistance des SCVs?

A

L’augmentation des adhésines fait aussi en sorte que la bactérie se fait plus facilement internaliser
La souche sauvage fait une hémolysine qui tue la cellule
le biofilm aide aussi la persistance

31
Q

Comment a-t-il été démontrer que SCVs a plus d’adhésines?

A

(quand on compare l’expression de fnbA avec spectroscopie de force AFM-FS). Même force est utiliser pour séparer les deux mais phénomène beaucoup plus fréquent.

32
Q

quelles structures de S. aureus et de S. pneumoniae se lie au TA?

A

Chez S. aureus : D-Alamine ou GlcNAc lient les TA.

Chez S. pneumoniae : ChoP lient les TA