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BCM-2000 > Chap 1.4 > Flashcards

Chap 1.4 Flashcards

1
Q

Quels sont les deux moyens de régulation de la traduction

A

Majoritairement au niveau de la transcription et parfois au niveau de la synthèse protéique

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Q

Quel est l’avantage de réguler la traduction plutôt que la transcription?

A

Le contrôle de la traduction se fait au niveau de l’initiation

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3
Q

Combien de mécanismes y a-t-il pour la régulation de la traduction chez les bactéries?

A

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4
Q

Nommez les mécanismes de la régulation chez les bactéries

A
  1. Fixation de protéines près du site de fixation du ribosome
  2. Formation d’appariement au sein de l’ARNm
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Q

Quelle est la conséquence commune aux deux mécanismes de la régulation de la traduction chez les bactéries

A

Il est impossible pour le ribosome de se lier à son site de liaison puisqu’il est soit :

a) occupé par une/des protéines
b) masqué par les appariment ARNm-ARNm

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6
Q

Avec quoi la synthèse des protéines r est-elle coordonnée?

A

Avec la quantité ARNr libre

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7
Q

Vrai ou Faux?

Les protéines r agissent comme répresseurs de leur propre synthèse?

A

Vrai

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8
Q

Comment les protéines r font pour réprimer leur propre synthèse ?

A

Il y a liaison d’une protéine r sur le site de l’ARNm où la traduction débute sur chaque opéron

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9
Q

Qu’est ce qui permet aux protéines r d’agir comme composante du ribosome et comme régulateur de leur propre traduction?

A

C’est par les structures primaires et secondaires similaires du site de liaison de S8 sur l’ARN 16S et de l’ARNm.

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10
Q

Existe-t-il d’autre(s) molécules qui peuvent réguler leur propre traduction?

A

Oui, il y en a 2:

Les aaRS (aminoacyl-ARNt-synthéthase) se fixent sur leurs propres ARNm

Dans certains cas, l’ARNm lui même va changer sa structure pour favoriser ou inhiber la traduction

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11
Q

Qu’est ce qu’un ribocommutateur?

A

C’est une molécule qui régule l’initiation de la traduction.

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12
Q

Quelles sont les deux positions du ribocommutateur et quels sont les effets de chacune d’elles?

A 
Position ouverte (ON): le site de fixation du ribosome est accessible. La traduction peut donc avoir lieu.
Position fermée (OFF): le site de fixation du ribosome n'est pas accessible. La traduction ne peut donc pas avoir lieu
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13
Q

Quels sont les paramètres qui explique la position d’un ribocommutateur?

A

La concentration de ……..?

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14
Q

Est-ce que tous les ARNm bactériens sont traduits à la même vitesse?

A

non

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15
Q

Qu’Est ce qui fait varier la vitesse de l’initiation de la traduction, et par quel facteur?

A

La vitesse d’initiation varie en fonction de la séquence Shine-Dalgarno et la vitesse peut être augmentée jusqu,à un facteur X100

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16
Q

Qu’Est ce qui fait varier la vitesse de l’élongation de la chaîne lors de la traduction?

A

C’est la fréquence des codons préférés et de leur ARNt correspondants

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17
Q

Comment le ribosome reconnaît-il le codon start et se lie à l’ARNt?

A

Il y a appariemnts entre le séquence Shine-Dalgarno (de l’ARNm) et l’extrêmité 3’ de l’ARN 16S

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18
Q

Que veut-on dire par un régulation globale?

A

C’est la régulation simultanée de toute la population des ARNm

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19
Q

Chez quelle classe du vivant y a-t-il une régulation globale au niveau de la traduction?

A

C’est chez les eucaryotes

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20
Q

Vrai ou faux?
En plus de la régulation globale au niveau de la traduction chez les eucaryotes, il y a aussi de la régulation spécifique?

A

Vrai

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21
Q

Quels sont les facteurs physiologiques qui mènent à l’inhibition de la traduction d’ARNm?

A
  • Carence en aa
  • Infection virale
  • Haute température
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22
Q

Quel niveau de la traduction est régulé par la régulation globale?

A

C’est au niveau de l’initiation, lors de:

  • la reconnaissance de l’ARNm
  • la liaison de l’ARNt initiateur (ARNti) à la SU 40S
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23
Q

Comment se nomme le mécanisme de régulation de la traduction qui inhibe la traduction d’ARNm?

A

C’est la phosphorylation de protéines

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24
Q

Quelle est la sous-unité de quel facteur de traduction qui est phosphorylée afin d’inhiber la traduction des ARNm?

A

C’est la sous-unité alpha d’eIF2

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25
Q

Comment la phospholyration d’eIF2 permet l’inhibation de la traduction des ARNm?

A

L’activité d’un facteur d’échange du GTP qui agit sur eIF2 est inhibée. Cela diminue le ratio d’eIF2 liée au GTP par rapport à la quantité d’eIF2 qui est liée à un GDP.
Puisqu’il faut absolument eIF2 lié à du GTP pour lier l’ARNt initiateur à la SU40S, la faible quantité d’eIF2 lié à du GTP explique la faible initiation de la traduction

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26
Q

Quel est le rôle d’eIF2

A

Acheminer l’ARNt initiateur vers la SU 40S

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27
Q

Quel est la classe d’enzyme qui phosphoryle la SU alpha d’eIF2?

A

Ce sont des kinases

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28
Q

Combien de kinases différentes l’humain possède-t-il pour phosphoryler eIF2. Sont-elles tous régulées de la même manière?

A

Il y a 4 kinases et elles ne sont pas régulées de la même manière, mais par des stress cellulaires distincts.

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29
Q

Quel est le résidu précis qui est phosphorylé sur eIF2

A

C’est la Ser-51

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30
Q

Nommer les 4 kinases qui phosphoryle eIF2

A
  • HRI
  • PKR
  • GCN2
  • PEK
31
Q

Décrire le mécanisme d’HRI

A

Il y a une diminution de la vitesse de traduction :

  • Dans les réticulocytes: lorsqu’il y a une quantité insuffisante d’hème
  • Dans les autres celluless: Suite à un stress oxydatif ou de hautes températures
32
Q

Décrire le mécanisme de PKR

A

Il y a une diminution de la vitesse de traduction lors d’une infection virale (puisque cela produit souvent des ARN doubles-brin de longueur supérieure à 30pb)

33
Q

Décrire le mécanisme de GCN2

A

Il y a une diminution de la vitesse de traduction lors d’une carence en aa. Cest la liaison d’ARNt non chargés à GCN2 qui l’active

34
Q

Décrire le mécanisme PEK

A

Il y a une diminution de la vitesse de traduction losrqu’un stress quelquonce, comme une haute concentration en sucre mène à un excès de protéines non repliées.

35
Q

Comment est-il possible d’inhiber la forme active de la kinase HRI?

A

En présence d’hème, l’enzyme est inactive, ce qui empêche la phosphorylation de la Ser-51 d’eIF2, qui va inhiber la traduction.

36
Q

Le permier mécanisme qui inhibe la traduction des ARNm est la phosphorylation de la SER-51 sur eIF2 à l’aide d’une kinase. Quel est la cible des kinases qui ciblent un différent facteur de traduction. Quel est son nom?

A

Les autres kinases vont phosphoryler la coiffe 5’ du facteur eIF4E.

37
Q

Deux protéines sont en compétition pour se lier à eIF4E. Quelles sont leur nom et leur forme si applicable

A

4R-BP non-phosphorylé compétitionne avec eIF4G pour se lier à eIF4E

38
Q

Qelle protéine est responasable de l’inhibition de la traduction grâce à sa fixation à la coiffe 5’

A

C,est 4E-BP sous sa forme non-phosphorylée. Lorsque la protéine est phosphorylée, elle ne peut plus se lier à eIF4E et n’inhibe donc pas avec la traduction

39
Q

Quelle est le nom de la kinase responsable de la phosphorylation au niveau de la coiffe 5’?

A

mTor

40
Q

Quels sont les facteurs physiologiques qui vont activer l’activité phosphorylase de mTor?

A
  • Facteurs de croissance
  • HOrmones
  • Facteurs stimulant la division cellulaire
41
Q

Vrai ou faux?

La régulationde la traduction d’ARNm spécifiqu chez les eucaryotes utilise la liaison à eIF2

A

Faux, c’est la liaison à eIF4E

42
Q

Ou la protéine Bruno se lie-t-elle?

A

dans la région 3’ non traduite de l’ARNm Oskar (BRE)

43
Q

Ou ls protéine Cup se lie-t-elle? De quel genre de protéine s’agit-il

A

Cup se lie à Bruno sur l’ARNm.

C’est une 4E-BP

44
Q

À quoi la protéine MAskin se lie-t-elle? Et quel en est l’Effet de la liaison? Comment la liason est-elle possible?

A

Maskin se lie à eIF4E grâce àa son domaine 4e-BP et inhibe la traduction de plusieurs ARNm chez les VERTÉBRÉS

45
Q

Quel est le rôle de Maskin?

A

C’est d’empêcher les ARNm maternel de former le complexe d’initiation. Cela garde les ARNm sous forme dormante prêt à être traduit lors de la fertilisation. C’est impossible d’obtenir le complexe d’initiation puisque Maskin se lie aux courtes queues de poly-A

46
Q

Que signifie PAP

A

Poly-A Polymerase

47
Q

Pourquoi l’équilibre du fer est-il si important?

A

En trop grande concentration, il est toxique

48
Q

Quel est le nom de la protéine qui est principal régulateur des niveaux de fer chez l’Homme?

A

La ferritine

49
Q

Par quoi la synthèse de la ferritine est-elle régulée

A

Par IRP (iron regulated protein)

50
Q

Comment se nomme la structure en tige-boucle qu’IRP peut reconnaître

A

IRE (iron response element

51
Q

Est ce que la ferrintine est toxique

A

Non

52
Q

Quel est l’atome que lie la ferritine

A

Le fer

53
Q

Nommer la chaîne d’événement lorsque la concentration de fer est très élevée?

A

Il y a traduction de l’ARNm de la ferrintine. La ferritine est donc produite. La ferritine lie le fer, ce qui diminnue sa concentration

54
Q

Nommer la chaîne d’événement lorsque la concentration de fer est très faible?

A

Il n’y a pas traduction de l’ARnm de la ferritine. DOnc, le peu de fer présent demeure sous forme libre

55
Q

GCN4 agit lorsqu’il y a une carence en aa. Que fait-il?

A

il active tous les sentiers métaboliques qui produisent des aa

56
Q

Vrai ou faux?

L’ARNm de GCN4 est polycitronique

A

Vrai

57
Q

Quele st le rôle de GCN2

A

de détecter la concentration en aa

58
Q

En conditions normales, y a-t-il activation de GCN4?

A

Non, car il n’y a pas de carence en aa

59
Q

Vrai ou faux?

La traduction est un moyen d’éliminer les ARNm défectueux

A

Vrai

60
Q

Quel est le cas qui ne permet pas à la traduction d’éliminer un ARNm défectueux

A

C’est dans le cas d’une mutation ponctuelle qui ne modifie qu’un seul aa

61
Q

Lequel est le plus gros; l’ARNt ou l’ARNtm

A

C’est l’ARNtm

62
Q

Quel est le rôle des ARNtm

A

C’est de secourir les ribosomes qui ont parcouru l’ARNm entier jusqu’à son extrêmité 3’ et est maintenant bloqué

63
Q

Comment s’effectue l’initiation d’un ARNm qui est dépourvu d’un codon stop?

A

De la même manière

64
Q

Nommez un exemple d’ARNtm

A

SsrA

65
Q

Pourquoi l’ARN SsrA ne peut se lier qu’à un ribosome bloqué à l’extrêmité 3’ de l’ARNm?

A

Parce que le site A du ribosome doit être libre

66
Q

Vrai ou faux?

Les cellules eucaryotes vérifient l’intégrté de leurs ARnm en cours de traduction grâce à 3 mécanismes?

A

Faux, il y a 2 mécanismes

67
Q

Quels sont les mécanismes qui vérifient l’intégrité de leurs ARNm au cours de la traduction?

A
  1. Présence d’un codon non-sens prématuré

2. Absence de codon stop

68
Q

Quel est l’orientation de l’exonucléase et quel est son rôle?

A

Elle dégrade l’ARNm défectueux dans le sens 5’ à 3’

69
Q

Quelle est la différence entre une endonucléase et une exonucléase?

A

L’exonucléase clive de manière succèssive une des extrêmités de l’ARNm alors qu’une endonucléase clive des parties centrales

70
Q

Quel est le rôle de exosome? À quoi se lie-t-il?

A

C’est de dégrader l’ARNm. Il se lie à l’ectrêmité 3’ de TOUS les ribosomes bloqués à l’extrêmité 3’ de la queue de Poly-A

71
Q

Combien de Su compose l’exosome?

A

2 Su

72
Q

Nommez les Su de l’Exosome

A
  1. l’exonucléase (dégrade de 3’ vers 5’)

2. Ski7, aka le facteur de terminaison (facteur de libération de classe II, càd libère le ribosome)

73
Q

Qu’arrive-t-il à la queue de Ploy-A en absence de codon stop?

A

La queue est traduite, ce qui entraîne l’Addition d’une suite de Lys à la chaîne polypeptidique (AAA)

74
Q

Qu’arrive-t-il à la protéine contenant la suite de Lys?

A

Elle est dégradée

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