Chap 1.4 Flashcards
Quels sont les deux moyens de régulation de la traduction
Majoritairement au niveau de la transcription et parfois au niveau de la synthèse protéique
Quel est l’avantage de réguler la traduction plutôt que la transcription?
Le contrôle de la traduction se fait au niveau de l’initiation
Combien de mécanismes y a-t-il pour la régulation de la traduction chez les bactéries?
2
Nommez les mécanismes de la régulation chez les bactéries
- Fixation de protéines près du site de fixation du ribosome
- Formation d’appariement au sein de l’ARNm
Quelle est la conséquence commune aux deux mécanismes de la régulation de la traduction chez les bactéries
Il est impossible pour le ribosome de se lier à son site de liaison puisqu’il est soit :
a) occupé par une/des protéines
b) masqué par les appariment ARNm-ARNm
Avec quoi la synthèse des protéines r est-elle coordonnée?
Avec la quantité ARNr libre
Vrai ou Faux?
Les protéines r agissent comme répresseurs de leur propre synthèse?
Vrai
Comment les protéines r font pour réprimer leur propre synthèse ?
Il y a liaison d’une protéine r sur le site de l’ARNm où la traduction débute sur chaque opéron
Qu’est ce qui permet aux protéines r d’agir comme composante du ribosome et comme régulateur de leur propre traduction?
C’est par les structures primaires et secondaires similaires du site de liaison de S8 sur l’ARN 16S et de l’ARNm.
Existe-t-il d’autre(s) molécules qui peuvent réguler leur propre traduction?
Oui, il y en a 2:
Les aaRS (aminoacyl-ARNt-synthéthase) se fixent sur leurs propres ARNm
Dans certains cas, l’ARNm lui même va changer sa structure pour favoriser ou inhiber la traduction
Qu’est ce qu’un ribocommutateur?
C’est une molécule qui régule l’initiation de la traduction.
Quelles sont les deux positions du ribocommutateur et quels sont les effets de chacune d’elles?
Position ouverte (ON): le site de fixation du ribosome est accessible. La traduction peut donc avoir lieu. Position fermée (OFF): le site de fixation du ribosome n'est pas accessible. La traduction ne peut donc pas avoir lieu
Quels sont les paramètres qui explique la position d’un ribocommutateur?
La concentration de ……..?
Est-ce que tous les ARNm bactériens sont traduits à la même vitesse?
non
Qu’Est ce qui fait varier la vitesse de l’initiation de la traduction, et par quel facteur?
La vitesse d’initiation varie en fonction de la séquence Shine-Dalgarno et la vitesse peut être augmentée jusqu,à un facteur X100
Qu’Est ce qui fait varier la vitesse de l’élongation de la chaîne lors de la traduction?
C’est la fréquence des codons préférés et de leur ARNt correspondants
Comment le ribosome reconnaît-il le codon start et se lie à l’ARNt?
Il y a appariemnts entre le séquence Shine-Dalgarno (de l’ARNm) et l’extrêmité 3’ de l’ARN 16S
Que veut-on dire par un régulation globale?
C’est la régulation simultanée de toute la population des ARNm
Chez quelle classe du vivant y a-t-il une régulation globale au niveau de la traduction?
C’est chez les eucaryotes
Vrai ou faux?
En plus de la régulation globale au niveau de la traduction chez les eucaryotes, il y a aussi de la régulation spécifique?
Vrai
Quels sont les facteurs physiologiques qui mènent à l’inhibition de la traduction d’ARNm?
- Carence en aa
- Infection virale
- Haute température
Quel niveau de la traduction est régulé par la régulation globale?
C’est au niveau de l’initiation, lors de:
- la reconnaissance de l’ARNm
- la liaison de l’ARNt initiateur (ARNti) à la SU 40S
Comment se nomme le mécanisme de régulation de la traduction qui inhibe la traduction d’ARNm?
C’est la phosphorylation de protéines
Quelle est la sous-unité de quel facteur de traduction qui est phosphorylée afin d’inhiber la traduction des ARNm?
C’est la sous-unité alpha d’eIF2
Comment la phospholyration d’eIF2 permet l’inhibation de la traduction des ARNm?
L’activité d’un facteur d’échange du GTP qui agit sur eIF2 est inhibée. Cela diminue le ratio d’eIF2 liée au GTP par rapport à la quantité d’eIF2 qui est liée à un GDP.
Puisqu’il faut absolument eIF2 lié à du GTP pour lier l’ARNt initiateur à la SU40S, la faible quantité d’eIF2 lié à du GTP explique la faible initiation de la traduction
Quel est le rôle d’eIF2
Acheminer l’ARNt initiateur vers la SU 40S
Quel est la classe d’enzyme qui phosphoryle la SU alpha d’eIF2?
Ce sont des kinases
Combien de kinases différentes l’humain possède-t-il pour phosphoryler eIF2. Sont-elles tous régulées de la même manière?
Il y a 4 kinases et elles ne sont pas régulées de la même manière, mais par des stress cellulaires distincts.
Quel est le résidu précis qui est phosphorylé sur eIF2
C’est la Ser-51
Nommer les 4 kinases qui phosphoryle eIF2
- HRI
- PKR
- GCN2
- PEK
Décrire le mécanisme d’HRI
Il y a une diminution de la vitesse de traduction :
- Dans les réticulocytes: lorsqu’il y a une quantité insuffisante d’hème
- Dans les autres celluless: Suite à un stress oxydatif ou de hautes températures
Décrire le mécanisme de PKR
Il y a une diminution de la vitesse de traduction lors d’une infection virale (puisque cela produit souvent des ARN doubles-brin de longueur supérieure à 30pb)
Décrire le mécanisme de GCN2
Il y a une diminution de la vitesse de traduction lors d’une carence en aa. Cest la liaison d’ARNt non chargés à GCN2 qui l’active
Décrire le mécanisme PEK
Il y a une diminution de la vitesse de traduction losrqu’un stress quelquonce, comme une haute concentration en sucre mène à un excès de protéines non repliées.
Comment est-il possible d’inhiber la forme active de la kinase HRI?
En présence d’hème, l’enzyme est inactive, ce qui empêche la phosphorylation de la Ser-51 d’eIF2, qui va inhiber la traduction.
Le permier mécanisme qui inhibe la traduction des ARNm est la phosphorylation de la SER-51 sur eIF2 à l’aide d’une kinase. Quel est la cible des kinases qui ciblent un différent facteur de traduction. Quel est son nom?
Les autres kinases vont phosphoryler la coiffe 5’ du facteur eIF4E.
Deux protéines sont en compétition pour se lier à eIF4E. Quelles sont leur nom et leur forme si applicable
4R-BP non-phosphorylé compétitionne avec eIF4G pour se lier à eIF4E
Qelle protéine est responasable de l’inhibition de la traduction grâce à sa fixation à la coiffe 5’
C,est 4E-BP sous sa forme non-phosphorylée. Lorsque la protéine est phosphorylée, elle ne peut plus se lier à eIF4E et n’inhibe donc pas avec la traduction
Quelle est le nom de la kinase responsable de la phosphorylation au niveau de la coiffe 5’?
mTor
Quels sont les facteurs physiologiques qui vont activer l’activité phosphorylase de mTor?
- Facteurs de croissance
- HOrmones
- Facteurs stimulant la division cellulaire
Vrai ou faux?
La régulationde la traduction d’ARNm spécifiqu chez les eucaryotes utilise la liaison à eIF2
Faux, c’est la liaison à eIF4E
Ou la protéine Bruno se lie-t-elle?
dans la région 3’ non traduite de l’ARNm Oskar (BRE)
Ou ls protéine Cup se lie-t-elle? De quel genre de protéine s’agit-il
Cup se lie à Bruno sur l’ARNm.
C’est une 4E-BP
À quoi la protéine MAskin se lie-t-elle? Et quel en est l’Effet de la liaison? Comment la liason est-elle possible?
Maskin se lie à eIF4E grâce àa son domaine 4e-BP et inhibe la traduction de plusieurs ARNm chez les VERTÉBRÉS
Quel est le rôle de Maskin?
C’est d’empêcher les ARNm maternel de former le complexe d’initiation. Cela garde les ARNm sous forme dormante prêt à être traduit lors de la fertilisation. C’est impossible d’obtenir le complexe d’initiation puisque Maskin se lie aux courtes queues de poly-A
Que signifie PAP
Poly-A Polymerase
Pourquoi l’équilibre du fer est-il si important?
En trop grande concentration, il est toxique
Quel est le nom de la protéine qui est principal régulateur des niveaux de fer chez l’Homme?
La ferritine
Par quoi la synthèse de la ferritine est-elle régulée
Par IRP (iron regulated protein)
Comment se nomme la structure en tige-boucle qu’IRP peut reconnaître
IRE (iron response element
Est ce que la ferrintine est toxique
Non
Quel est l’atome que lie la ferritine
Le fer
Nommer la chaîne d’événement lorsque la concentration de fer est très élevée?
Il y a traduction de l’ARNm de la ferrintine. La ferritine est donc produite. La ferritine lie le fer, ce qui diminnue sa concentration
Nommer la chaîne d’événement lorsque la concentration de fer est très faible?
Il n’y a pas traduction de l’ARnm de la ferritine. DOnc, le peu de fer présent demeure sous forme libre
GCN4 agit lorsqu’il y a une carence en aa. Que fait-il?
il active tous les sentiers métaboliques qui produisent des aa
Vrai ou faux?
L’ARNm de GCN4 est polycitronique
Vrai
Quele st le rôle de GCN2
de détecter la concentration en aa
En conditions normales, y a-t-il activation de GCN4?
Non, car il n’y a pas de carence en aa
Vrai ou faux?
La traduction est un moyen d’éliminer les ARNm défectueux
Vrai
Quel est le cas qui ne permet pas à la traduction d’éliminer un ARNm défectueux
C’est dans le cas d’une mutation ponctuelle qui ne modifie qu’un seul aa
Lequel est le plus gros; l’ARNt ou l’ARNtm
C’est l’ARNtm
Quel est le rôle des ARNtm
C’est de secourir les ribosomes qui ont parcouru l’ARNm entier jusqu’à son extrêmité 3’ et est maintenant bloqué
Comment s’effectue l’initiation d’un ARNm qui est dépourvu d’un codon stop?
De la même manière
Nommez un exemple d’ARNtm
SsrA
Pourquoi l’ARN SsrA ne peut se lier qu’à un ribosome bloqué à l’extrêmité 3’ de l’ARNm?
Parce que le site A du ribosome doit être libre
Vrai ou faux?
Les cellules eucaryotes vérifient l’intégrté de leurs ARnm en cours de traduction grâce à 3 mécanismes?
Faux, il y a 2 mécanismes
Quels sont les mécanismes qui vérifient l’intégrité de leurs ARNm au cours de la traduction?
- Présence d’un codon non-sens prématuré
2. Absence de codon stop
Quel est l’orientation de l’exonucléase et quel est son rôle?
Elle dégrade l’ARNm défectueux dans le sens 5’ à 3’
Quelle est la différence entre une endonucléase et une exonucléase?
L’exonucléase clive de manière succèssive une des extrêmités de l’ARNm alors qu’une endonucléase clive des parties centrales
Quel est le rôle de exosome? À quoi se lie-t-il?
C’est de dégrader l’ARNm. Il se lie à l’ectrêmité 3’ de TOUS les ribosomes bloqués à l’extrêmité 3’ de la queue de Poly-A
Combien de Su compose l’exosome?
2 Su
Nommez les Su de l’Exosome
- l’exonucléase (dégrade de 3’ vers 5’)
2. Ski7, aka le facteur de terminaison (facteur de libération de classe II, càd libère le ribosome)
Qu’arrive-t-il à la queue de Ploy-A en absence de codon stop?
La queue est traduite, ce qui entraîne l’Addition d’une suite de Lys à la chaîne polypeptidique (AAA)
Qu’arrive-t-il à la protéine contenant la suite de Lys?
Elle est dégradée
