Chap 1 Les Proteines Flashcards
Caractéristique du vivant
- capable de de développer et de se reproduire en conservant la complexité de l’originale
- former d’une ou plusieurs cellules + 4 grandes classes de bio molécules : lipides, protéine, glucides, acide nucléique
- tres divers
- chaque composant à une fonction spécifique et interagit de façon dynamique
- les être vivant échange avec leur environnement de l’énergie des matériaux et de l’information
Holoproteine
Compose exclusivement d’une ou plusieurs chaîne polypeptidique
Hétéroprotéine
Compose d’une partie protéique et un groupement prosthétique
Protéine : toutes les structures 1, 2,3,4 ère
1- séquence en aa liée par des liaisons covalent ( petitdique )cette séquence est codée par l’ADN
2-Arrangement local d’une chaîne polypeptidique avec des motifs hélice alpha feuillet bêta
3-repliement d’une chaîne polypeptidique dans l’espace ( monomère )
4- arrangement spécial d’une protéine multimerique : association de sous unités d’une protéine complexe
Liaison de forte énergie
->liaison covalence
C’est la mise en commun d’au moins un doublet électronique
- liaison petitidique
- pont disulfure
Liaison de faible énergie
-> liaison hydrogène
Attraction électrostatique faible entre un atome électronégatif et une atome hydrogène lie par covalence à un second atome électronégatif
Rôle : appariement des bases
Structure des protéines
Liaison intermoléculaire
Liaison faible
> > Liaison ionique
Attraction électrostatique entre deux ions de charges opposés
Liaisons faible
—> Liaison hydrophobe
Unissent les molécules hydrophobes pour fuir le contact avec l’eau ou autres molécules hydrophiles
Liaison faible
—-> van de walls
Force d’attraction et de répulsion entre les électrons - et les noyaux + de 2 atomes proche l’un de l’autre dans l’espace
Caractéristique de la liaison petidique
Et parler de la caractéristique des angles phi et psy
- Rigide
- Plane
- Polaire
Ils sont soit à 0 degrés et 180 degrés et inversement : la nature des atomes et groupe R limite l’angle de torsion
Caractéristique de l’hélice alpha
-structure secondaire la plus commune
-la liaison hydrogène s’effectuer entre le CO de l’aa n et le NH de l’aa n+4
1 tour = 3’6 residues
-chainé latérale à l’extérieur : hélice amphiphile
Caractéristiques du feuillet bêta
on a des feuillet bêta :
- antiparallèle il est exposé l’eau sur l’une des surface
-parallèle : souvent enfoui
> on peut avoir la formation de feuillet amphiphiles
Tous les groupement amides polaires sont impliqués dans les liaisons hydrogène sauf ceux situé aux extrémité : pour ceux la liaison avec l’eau, traitée chaîne polaire de feuillet bêta, tonneau bêta
Caractéristique du coude bêta
-structure la plus simple
-impie 4 résidus
-glycine et proline souvent présente
-à la surface des protéines : interaction avec l’eau
» permet un changement de direction de la chaîne polypeptidique, limite la taille de la protéine de maniere compacte
Caracteristique de la structure tridimensionnelle
- > par quoi est elle détermine ?
- > experience ou elle adopte cette structure spontanément
- > qu’est qui permet de les replier en général
- Elle est déterminé par sa sequence
- la plupart des protéines sont capable de se replié spontanément en solution diluée
- le repliement est souvent assuré par des chaperones
Quelle est la structure tridimensionnelle dans les membranes lipdiqus
- les aa apolaire interagissent avec la bicouche lipidique
- les aa polaire sont soit à la surface soit au centre de la protéine replié : on peut avoir la formation d’une surfa e polaire : sert de pore ou de canal ionique
