Cellule, macromolécule, histoire Flashcards

1
Q

C’est quoi la biologie cellulaire?

A

Spécialité de la biologie qui porte son attention sur les cellules; autant du point de vue structural que fonctionnel.

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Q

C’est quoi la cytologie?

A

Branche de la biologie qui étudie la cellule sous tous ses aspects: forme, aspects, fonction et métabolisme (cyto: cellule, logie=étude)
Unité: micromètre, um
La cellule est le plus petit dénominateur commun fonctionnel du vivant

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3
Q

C’est quoi les 4 étapes de la théorie cellulaire?

A
  1. La cellule est l’unité structurale et fonctionnelle des organismes vivants
  2. Toute cellule provient d’une cellule antérieure à elle-même et transmet de l’information héréditaire (ADN).
  3. Les processus de l’organisme dépendent de l’activité biochimique totale des cellules le composant
  4. Toutes les cellules sont composées des mêmes bases chimiques.
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4
Q

Quelles sont les caractéristiques universelles des cellules?

A
  • Toutes les cellules stockent leur information héréditaire grâce au même code chimique linéaire: l’ADN
  • Toutes les cellules répliquent cette information héréditaire par polymérisation à l’aide d’une matrice
  • Toutes les cellules utilisent une forme intermédiaire de cette information: ARN
  • Toutes les cellules utilisent les protéines comme catalyseurs des réaction chimiques
  • Toutes les cellules sont entourées d’une membrane plasmique qui est semi-perméable.
  • Toute vie nécessite l’énergie libre.
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5
Q

Quelles sont les deux sortes de cellules possibles?

A

eucaryote et procaryote

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6
Q

Quels sont les trois domaines du vivant selon les caractéristiques cellulaires?

A
  • La présence ou l’absence de certains organites
  • L’information génétique
  • La machinerie de traitement de cette information (réplication, transcription, traduction)
  • Le métabolisme et la conversion de l’énergie.
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7
Q

Décrit un peu le règne des procaryotes?

A

Les procaryotes appartiennent à l’ancien <> des Monères (le mot dérive du grec signifie simple ou seul). Maintenant diviser en deux domaines: procaryote et archée. Tous les autres organismes sur Terre sont du domaine des eucaryotes et ils sont divisés en 4 autres règnes.

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8
Q

Quelles sont les fonctions communes de toutes les cellules?

A
  • Maintenir son intégrité et sa forme: Dépend de la membrane plasmique qui délimite la cellule, ainsi que du contenu intracellulaire (le cytosquelette notamment)
  • Obtenir les nutriments nécessaires pour réaliser ses processus métaboliques. La cellule a besoin de certaines substances du milieu extracellulaire pour former de nouvelles structures chimiques. Elle amasse l’énergie nécessaire à sa survie par l’intermédiaire des processus métaboliques.
  • Éliminer ses déchets: La cellules doit pouvoir se débarrasser des déchets qu’elle accumule pour éviter qu’ils perturbent ses activités normales.
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9
Q

Quelles sont les fonctions spécialisées des cellules et donne deux exemples?

A
  • La composition en organites et la forme de la cellule dépendent en partie du type cellulaire et de la fonction de celle-ci
  • Ex: cellule de sécrétion au niveau de l’estomac sont vraiment différentes.
  • Cellules centroacineuses: elles font partie des canaux du pancréas. Pauvre en organites
  • Cellules acinaires:assurant la sécrétion des protéases dans le conduit du pancréas. Riches en organites reliés à la voie de sécrétion.
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10
Q

Quelles sont les deux types d’organites?

A

membraneux et non membraneux

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11
Q

Décrit les organites membraneux?

A

Sont formés d’un compartiment délimité par au moins une membrane de mosaîque fluide similaire à la membrane plasmique. Les échanges sont assurés par le transport des molécules ou des protéines entre la lumière d’un organite et le cytoplasme environnant.

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12
Q

Décrit un peu les avancées dans l’invention du microscope?

A

Les frère Janssen: Ils inventent le microscope composé 1580
Van Leeuwenhoek: développe des microscopes simples permettant un grossissement de 266x
Hooker: Publie une collection de dessins d’objets microscopiques et popularise la microscopie. On lui doit l’invention des coupes fines et du termes cellules

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13
Q

Décrit la théorie cellulaire de 1837? bien qu’elle ne soit pas toute vraie.

A
  • La cellule est une unité structurale, physiologique et organisationnelle des êtres vivants.
  • La cellule a une existence double: en tant qu’entité distincte et en tant que bloc de construction d’un organisme
  • Les cellules se forment via la génération spontanée, le processus est similaire à la formation des cristaux.
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14
Q

C’est au 19ième siècle que l’organisation de la cellule est réellement observée. Décrit la

A
  • Capacité des microscopes composés d’atteindre la résolution du microscope simple
  • Description de la continuité cellulaire: des différents organites à la division et à la fécondation.
  • Le développement des colorants synthétiques à la fin du 19e siècle perme d’augmenter le contraste des observations microscopique et assure la description de la majorité des organites.
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15
Q

Qu’est ce que Avery a fait?

A

Continue les recherches de griffith sur la transformation bactérienne en déterminant la source de la substance transformante: l’ADN

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16
Q

Qu’est-ce que Franklin, Gosling et Wilkins ont fait?

A

Ils produiront des profils de diffractions (rayons x) de qualité suffisante pour déduire la structure chimique de l’ADN

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17
Q

Qu’est ce que Watson et Crick ont fait?

A

en 1953, tentant de battre de vitesse les autres chercheurs dans la description de l’ADN. Font le lien entre les photographies au rayons X de Franklin et la double hélice alpha décrite chez les protéines.

18
Q

C’est quoi les macromolécules??

A

Composées d’association d’éléments, liés ensemble par des liaisons chimiques plus ou moins fortes.

19
Q

LA formation spontanées d’une liaison, entre deux atomes implique toujours quoi?

A

La libération D’une partie de l’énergie interne des atomes libres.

20
Q

Décrit les lois de la thermodynamique?

A

1.L’énergie est conservée lors que chaque transformation
2.Le désordre (l’entropie) ne peut que croître au cours d’une transformation.
Donc l’énergie libre baisse dans les réactions spontanées (delta g négatif)
L’ÉNERGIE EST UTILISÉE POUR COMBATTRE L’ENTROPIE.

21
Q

L’état d’équilibre pour un groupes d’atomes est quoi?

A

l’état dans lequel l’énergie libre est minimale

22
Q

LEs réactions spontanées vont vers quoi?

A

une énergie libre moindre, delta g négatif (libère de l’énergie)

23
Q

Les réactions non-sponanées vont vers quoi?

A

delta g positif (nécessitent de l’énergie)

24
Q

Les enzymes font quoi dans une réactions?

A

ont la capacité à modifier le delta g d’une réaction en diminuant l’énergie d’activation. accélèrent une réaction

25
Q

L’énergie de réaction dans la cellule dépend de:

A

1) propriétés intrinsèques des molécules (leur énergie moyenne)
2) Concentration réelles des produits et réactifs.

26
Q

Le delta G totale est égale a quoi?

A

La somme des delta g des liaisons individuelles.

27
Q

Quelles sont les liaisons chimiques?

A
covalentes
non polaires
ioniques
hydrogène
interactions hydrophobe: van der Waals.
28
Q

Décrit les liaisons hydrophobes dans l’eau ?

A

Formées par les molécules non polaires sont des liaisons van der waals avec une composante d’exclusion de l’eau.

29
Q

Quels liaisons sont responsables du repliement des protéines?

A

Les groupements hydrophobes séquestrés à l’intérieure d’une macromolécule par le delta g négative due à l’exclusion d’eau, sont responsables du repliement des protéines.

30
Q

Décrit la formation de chaînes carbonées: Liens covalents non-polaires

A

Les atomes de carbone peuvent s’associer entre eux
par des liaisons simples, doubles ou triples jusqu’à former d’immenses chaînes rectilignes, ramifiées ou cycliques.
Il s’agit des véritables squelettes des macromolécules biologiques.

31
Q

Décrit les groupements fonctionnels?

A

Les groupements fonctionnels sont des groupements d’atomes qui participent le plus aux réactions chimique des molécules organiques (ils ont des liens polaires et parfois ils sont ionisés)
Ils sont des ajouts sur les squelettes de carbone parce qu’ils ont chacun leur particularité. Il y en a qui ont des charges d’autre non donc ça amène une fonction. Les liens covalents sont forts donc ça prends beaucoup d’énergie pour les défaire.

32
Q

La polarité fait quoi sur les groupement fonctionnels?

A

impact sur les interactions car vont pouvoir faire des pont-h et des interactions hydrophobes.

33
Q

Décrit les interactions spécifique protéines-ADN

A

Dans l’ADN c’est vraiment important les liaisons covalentes pour pas perdre la molécule pour pas la briser.
Il y a une complémentarité entre la surface des protéines de liaison d’ADN et la surface du sillon majeur dans l’ARN.
Sillon majeur: forme une courbure donc on va avoir un côté plus larges que l’autre. *feuille de papier.
Les acides aminés sont capables de reconnaître l’ADN. On doit lire l’ADN pour produire l’ARN et des protéines. Besoin d’un complexe stable mais nécessite aussi d’être capable de se défaire facilement pour pouvoir réutiliser.

34
Q

Décrit en gros les protéines?

A

Les acides aminés sont des modules de construction pour des protéines.

Assemblage des éléments en acides aminés → Formation d’un lien peptidique entre 2 acides aminés → Une liaison covalente entre les acides aminés d’une protéine. Elle survient entre le groupe carboxyle d’un acide aminé et le groupe amine du suivant → Repliement de la protéine en structure secondaire tertiaire et quaternaire. Formation de domaines fonctionnels.

35
Q

Décrit un acide aminés?

A

Le coeur est un carbone asymétrique (carbone-alpha) qui se lie à un groupement amine (Nh2), un groupement carboxyle (COOH), un atome d’hydrogène (H) et une chaîne latérale (R) qui varie selon le type d’acide aminé (spécifique). Tableau présent en annexe à l’exam.

36
Q

décrit la structure secondaire d’une protéines?

A

Repliement de base selon 2 types de structures communes à toute les protéines
Hélice alpha: est un cylindre stabilisé par des liaisons hydrogènes. Possèdent des chaînes latérales à l’extérieur.
Feuillets Béta: Le feuillets B est une surface plane stabilisée par des liaisons hydrogènes. Le feuillet B a des chaînes latérales au-dessus et au-dessous de la feuille.

37
Q

Décrit la structure tertiaire?

A

Une protéine fonctionnelle est formée d’un agencement d’hélices alpha, feuillets B ou une combinaison des deux.
Elle possède les domaines fonctionnels (régions ayant des activités enzymatiques et/ou des sites de liaisons à d’autres molécules)

38
Q

Décrit la structure quaternaire d’une prot?

A

Association de 2 ou plusieurs chaînes polypeptidiques, avec des liaisons faibles.
Obligation d’interagir avec une autre protéine parce que fonction vraiment spécifique.
Par des liaisons covalentes.

La structure secondaire se forment spontanément dans l’eau grâce au lien H facile au niveau des coeurs des acides aminés»
On parle d’une structure quaternaire lorsqu’on a plus qu’une chaîne peptidique.

39
Q

Décrit les domaines de protéines?

A

Un domaine donné se replie toujours de la même façon (même forme 3D) indépendamment du contexte dans lequel il se trouve.
Sa forme détermine sa fonction
Un domaine peut faire partie de plusieurs protéines et ls fonction d’une protéine peut être interprétée par les domaines qui s’y trouvent.

40
Q

Décrit l’exemple des domaines des lysosome?

A

Type de macromolécule: protéine (enzyme)
Structure: Lie les glucides dans un conformation particulière (<> la molécule)
Fonction: Accélère la réaction dans laquelle de l’eau est ajoutée à la liaison entre deux sucres (l’hydrolyse). Permet la dégradation de la molécule. Lysosome diminue l’énergie d’activation, et les 2 acides aminés (Glu35 et Asp 52) stratégiquement placés catalysent la réaction d’hydrolyse. Que ont de spécial le Glu et le Asp? Interaction sont basées sur le fait qu’elles sont chargées négativement.

41
Q

Décrit l’exemple des domaines de l’ADN

A

Type de macromolécule:Acides nucléiques
Structure: deux brins complémentaires
Fonction: Permet la réplication du matériel génétique lors de la division
Séparer les brins sans briser les liaisons covalentes pour dénaturer l’ADN. Réplication: donne deux molécules d’ADN identiques. Mitose.