cell cycle Flashcards

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1
Q

Chromosome

Chromotid

Chromotin

A

chorosome: 染色體 condensed form ready for mitosis

chormotid 染色分體:2 chormotid –> chromosome

chromotin: 染色質 loosely spread in the nucleus in arrested state,在G0G1 phase的genome遺傳物質

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Q

Mitosis

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A
  1. Prophase: 紡錘體(mitotic spindle)的出現,核膜(nuclear membrane)消失。
  2. Metaphase:染色分體(chromatids)排列於細胞中央。
  3. Anaphase:排好的染色分體均分至兩端。
  4. Telophase / cytokinesis:中間出現隔板,細胞一分為二,daughter cell (子細胞)形成,各自chromosomes (染色體)到daughter cell後核膜重生成,cytokinesis是細胞質的分裂。
    (註:在G0G1 phase的genome遺傳物質稱為chromatin染色質,是比較疏鬆的狀態,散播在細胞核,此時細胞仍需被調控,要控制基因開啟或關閉,因此要有足夠空間讓protein bind在promotor上面。進到M phase時染色質會開始濃縮,這時候才會看到chromosome,稱為染色體。)
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Q

Sic1

A

綁架S phase CDKs,抑制其活性

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Q

Securin

A
  • Securin能在DNA複製後將染色分體扣在一起。故當要分裂時這些扣環要被分解,染色體才可以分開
  • undergo ubiquitination
  • regulatory factor: APC/C+Cdc20
  • timing: from metaphase to anaphase
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Q

E2F

A

E2F transcription factor complex regulate轉錄轉譯出很多G1/S phase cyclins

(cyclin E和cyclin A)

binds CDK2

G1/S CDK complex

讓細胞進入S phase

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6
Q

the 3 ubiquitin pathways

A

*

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Perfectly
7
Q

SCF

A

Transcription factor

Sic 1是S phase CDK的inhibitor,將Sic 1分解掉,促使順利進入S phase

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8
Q

what are the cyclin and CDK for start point

A

cyclin A: S phase CDK (during the whole Sphse tll the end of mitosis)

cyclin E: G1/S phase CDK(just the start of S phase only)

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9
Q

Rb

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A
  • transcription suppressor in the start point

In unphosphorylated state: 綁架 E2F, transcription factor of cycline E & A gene

To activate the start point

  1. G1 CDK phosphorylates Rb
  2. Rb 離開E2F transcription factor
  3. Production of cyclin E & A
  4. Activation of S phase CDK (=CDK2)

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10
Q

Cohesin (DNA replication)

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A
  1. G1 phase:cohesin就已經出現在chromosome的strain上面。
  2. S phase:DNA聚合酶開始複製,cohesin會把新複製的strain(sister chromatids)拉住避免跑掉。
  3. PP2A(Protein phosphatase 2 A)是固守在centromere附近的cohesin。
  4. 要進入分裂時將複製好的sister chromatids拉在一起,才可以有效率地做有絲分裂
  5. M phase(Prophase):透過Polo kinase和Aurora B kinase移除大部分cohesin,除了在centromere附近被PP2A覆蓋住的cohesin要到最後染色體分離的時候才會解開

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11
Q

wee1 kinase

Cdc25 phosphatase

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A

wee1 kinase: Inactivator of mitotic CDK by phosphorylation of it

  • 在mitotic CDK上的(amino acid sequence) Threonine(T14)和Tyrosine(Y15)上加上磷酸根,抑制CDK的活性。
  • Cdc25 phosphatase: Activator of mitotic CDK by dephosphorylation

進到M phase,S phase DNA複製完成並確認無錯後,cdc25 phosphatase水解磷酸根,使mitotic CDK活化,進入mitosis

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Breakdown of nuclear envelop : mechanism

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A
  1. 核膜的組成基本單位:lamin tetramer。
  2. Tetramer de-polymerization:要進到mitosis時mitosis promoting factor(MPF)會出現(一種kinase),在lamin的N端和C端加上磷酸根,拆掉聚合體,核膜消失。

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Aurora B

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A

a kinase, promoted by mitotic CDK

  1. 拿掉cohesin之後也會均勻磷酸化紡錘絲的兩端,讓紡錘絲均勻將姊妹染色分體(sister chromatids)拉到細胞兩端。
  2. 如果紡錘絲分布不均勻, Aurora B就不會磷酸根錯誤的紡錘絲,停在M phase。

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Q

condesin protein complex

A

during mitosis, it is activated by mitotic CDKs

  • link sister chromatids together after DNA replication and promote condensation

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checkpoint 2: Metaphase進入Anaphase

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A

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Q

Cdc14

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A
  • phosphatase

After anaphase, Cdc14 is being promoted by mitotic exit network

two functions

  1. causing dephosphorylation of Cdh1 –> activating APC/C + Cdh1 –> inhibiting mitotic CDK by degradation of mitotic cyclin
  2. Increase [Sic1】 綁架S phase cyclin and CDK, turning off start point
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17
Q

List an example of plasma membrane attached proteins signaling

A
  1. 例如:Fas-fas ligand,當T cell需要的活性需要被關掉時,其中一個T cell膜上會表現fas ligand,另一個T cell會表現fas receptor,兩者結合後會引發T cell自身的apoptosis。
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18
Q

JAK-STAT pathway

A
  1. 當ligand與receptor binding後,使得receptor dimerized,然後活化細胞膜內端的kinase(構型改變),吸引下游的target protein並把phosphate group接在它上,此時target protein會dimerized,接著進入細胞核後,bind在DNA上進而調控transcription & translation,調控完後,phosphatase會把磷酸根拔掉,因此target protein不能再dimerized。
  2. JAK: kinase, STAT: targeted protein (or transcription factor)

G

M

T

Y

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19
Q

GDPR signal transduction mechanism

A

當ligand與receptor結合時,造成receptor造型的改變,從而與 G protein結合,G protein構型也發生改變把GDP吐掉,把GTP吃進來進而活化,此時,Gα與Gβ,γ分離,帶著GTP與effector protein結合,活化effector protein從而可以往下傳遞訊息。接著GTP會被水解成GDP,回到resting的狀態。

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20
Q

Gα有很多種類,活化下游不同的effector, give some example

A
  1. Gas: activate adenylyl cyclase –> [CAMP] rises (stimulatory); receptor: b-adrenergic / glucagon /serotonin/ vassopressin
  2. Gai: activate adenylyl cyclase –> [CAMP] falls inhibitory); receptor: a2 adrenergic / acetycholine
  3. Gaq: effector protein (Phospholipase C); stimulatory; 2nd messanger: IP3/DAG; receptor: a1 adrenergic

G

M

T

Y

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21
Q

GRK

A

GPCR kinase for desentinization of GPCR

ligand與GPCR結合後,GRK(GPCR kinase)會過來加phosphate group在receptor上,令receptor與Gβ,γ分離,使得receptor與β-arrestin結合,被帶進細胞endosome,receptor可以暫時在endosome裡,令膜上receptor量下降。Endosome會做2件事,Recycling 或Degradation

G

M

T

Y

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22
Q

b-arrestin

A

Large molecular size

  1. endocytosis: for Homologous Densitinization of GPCR

ligand與GPCR結合後,GRK(GPCR kinase)會過來加phosphate group在receptor上,令receptor與Gβ,γ分離,使得receptor與β-arrestin結合,被帶進細胞endosome,receptor可以暫時在endosome裡,令膜上receptor量下降。Endosome會做2件事,Recycling 或Degradation

  1. big molecule –> 作為Docking protein,有多面向(interaction with different protein) 可以與多個蛋白質結合。
  2. 活化c-Jun kinase cascade (pathway of signal transduction)。c-Jun kinase cascade與細胞增殖有關。
  3. 活化MAP kinase cascade訊息傳遞路徑,與細胞增殖、細胞運動有關。

G

M

T

Y

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23
Q

homologous desensitization / heterogenous desensitization

A

homologous desensitization: 只針對特定ligand所連結的receptor

heterogenous desensitization: 無差別地拆開所有當時在膜上的GPCR

G

M

T

Y

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24
Q

GAPs

A

GTPase activating protein

  • accelerate hydrolysis of GTP into GDP on the G-protein
  • desentinization of GPCR by regulation of G-protein
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25
Q

臨床上如果GPCRs沒有被適當地關掉所產生的問題

A
  1. Vibrio chorela(霍亂弧菌) or some strains of E. coli有特殊的toxin,當toxin進入腸道上皮細胞後,活化Gαs,產生很多的cAMP。當cAMP濃度太高,造成細胞中的電解質及水分大量跑到腸道中,造成嚴重的下痢(Watery diarrhea)。
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26
Q

rhodopsin

A
  • protein found on the 視板 of rod cell; for light sensation
  • function like a GPCR: instead of binding a ligand to stimulate G-protein, 當被接收光後會被活化,產生構型上的改變, which then activate G-protein
  • _Second message_r: GMP! activated PDE reduces cGMP (converting it into GMP), causing ion channels to be closed
  • Regulation: Rhodopsin活化後被 arrestin結合,rhodopsin會被拉進endosome中,減少rhodopsin在細胞膜上的數量

G

M

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27
Q

Ca2+-sensing proteins

A
  1. 可以activate guanylate cyclase,產生cGMP,提高cGMP的濃度,打開離子通道
  2. 負向調控方式Negative Feedback
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28
Q

cGMP phosphodiesterase (PDE)

A

PDE可以把cGMP變為GMP (vs Protein kinase A/C)

  1. 黑暗時:胞內有較高濃度的cGMP,cGMP會接在ion channel上使之打開,Na+ & Ca2+進入細胞。
  2. 明亮時:rhodopsin被活化產生conformational change可以recruit Gαt protein,並使Gαt protein活化(接上GTP),進而活化下游的effector protein—— PDE(cGMP phosphodiesterase),而活化的PDE可以把cGMP變為GMP,導致胞內的cGMP濃度下降,因此無法與ion channel做binding,結果是ion channel關閉,neurotransmitters比較少,整個反應過程在50ms內,但也會有負調控。

The above is an example of GDPR-mediated ion chennel

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29
Q

transducin and arrestin distribution in light and dark situation

A

Transducin: G protein a subunit of rod cells

In dark: transducin on disk membrane largely while arrestin on cytosol mostly –> coz need to catch lgiht!!

Vice versa

30
Q

同樣的ligand做不同的信息傳遞路徑,對同樣的target會產生不同的作用

Give an example

A
31
Q

Phospholipase C

A
  • phospholipid hydrolase; mainly act on cell membrane
  • increase [Ca2+]
32
Q

EGF

A

EGF(EGF是Epidermal Growth Factror):負責控制上皮細胞生長,若分泌太多、或是受器分泌太多、或受器有突變,會跟癌症形成相關

33
Q

Characteristic of HER family

A

belongs to receptor tyrosine kinases; membrane itself is a monomer, during signal transduction, it will be dimerised with itself or other members.

HER1: 可以跟自己/HER2形成dimer

HER2:

a. HER2本身不跟ligand結合,然而可以和其他三種HER都形成dimer,原因: HER2的結構上有一個hook,使他永遠處在preactivated的狀態,專門負責傳遞訊息。
b. 屬於一種生長受器,媒介很多跟生長有關的反應,加速細胞生長。因此在很多癌症細胞上都有HER2過度表現(over expression)的情況,尤其在乳癌身上有25%的病人身上有這個情形。癌症細胞上的HER2甚至可以不用ligand的結合

HER3:

本身親和性、作用性比較不強的受器,因此NRG1、2也可以選擇跟作用較強的HER4結合。

另外,HER3不能被phosphorylated!

當HER3與HER2結合時主要是HER2在作用。

G

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34
Q

PTB

A

After ligand binding, Domain that facilitate signal transduction:

Both RTK/Cytokine kinase: proteins possessing PTB / SH2 domain bind to phosphorylated receptor

  • Docking protein (eg IRS-1):很大,可以把這條pathway上需要的蛋白質,一次叫來完成訊息傳遞。這個大分子的上面就有PTB domain,所以可以跟activated RTK做結合。

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35
Q

SH2

A

After ligand binding, Domain that facilitate signal transduction:

Both RTK/Cytokine kinase: proteins possessing PTB / SH2 domain bind to phosphorylated receptor

  • Docking protein (eg IRS-1):很大,可以把這條pathway上需要的蛋白質,一次叫來完成訊息傳遞。這個大分子的上面就有PTB domain,所以可以跟activated RTK做結合。

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36
Q

SHP1

A
  1. involve in down regulating signal transduction
  2. short-term

phosphate group的phosphatase domain平常是不活化的,因為結合位被兩個SH2 domain塞住。而當SH2 domain接到一個磷酸根上面的時候,phosphatase domain的結合位露出,就可以結合在要作用的磷酸根上把他拔掉,進而不活化受器。

SHP1就可以來作用停止訊息傳遞。

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37
Q

Structure and mechanism of STAT protein

A

Structure:

  1. N-terminal DNA binding domain
  2. SH2 domain: JAK結合
  3. C-terminal DNA binding domain with tyrosine kinase:Contains tyrosine to be phosphorylated by JAK

Mechanism:

  1. SH2 domain接上JAK
  2. DNA binding domain being phosphorylated
  3. Dimerization takes place
  4. dimer跑到nucleus內結合到DNA上面

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38
Q

SOCS

A

​a long-term practice used to down-regulating signal transduction of RTK/cytokine tyrosine

SOCS box上接有一個SH2 domain,當SH2 domain接到磷酸根上時,SOCS box會召喚E3 ubiquitin ligase,之後再去recruit更多物質把sigal protein包圍把他帶到proteosome,把負責傳訊息的蛋白質降解掉、切掉。

最後再把胺基酸碎片拿去回收、再利用。

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39
Q
A
40
Q

GRB2

A

adaptor protein involved in Ras pathway

connecting Ras and RTK

In the pathway, ligand結合RTK後, 召喚帶有SH2 domain GRB2,以及Sos,接著GRB2、Sos、Ras組裝起來。

G

M

T

Y

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41
Q

c-fos gene

A
  1. c-fos gene是一個典型的例子。c-fos gene和c-Jun gene會幫助細胞進入cell cycle,促使細胞分裂,是一種early response genes。
42
Q

Sos

A

Involved in Ras pathway

After ligand結合RTK

召喚帶有SH2 domain GRB2,以及Sos,接著GRB2、Sos、Ras組裝起來。

Sos促使Ras中的GDP degradation,並接上一個GTP。

G

M

T

Y

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43
Q

Raf

A

kinase involved in Ras pathway

When Ras (G-protein) is activated, it dissoicates form its complex and bind to Raf

  • Raf的構造比較複雜,包含N-terminal regulatory domain和C-terminal kinase domain,本身也是一個kinase。不活化時14-3-3把Raf N-terminal和C-terminal的磷酸根bind住,而當與活化的Ras結合後14-3-3會被拿掉,Raf被活化。
  • 被活化的Raf是一個kinase,活化後往下找到MEK(Raf的target),MEK也是一個kinase,再去活化MAPK,MAPK仍然是kinase,進到細胞核內去啟動transcription factor。

G

M

T

Y

检测语言世界语中文简体中文繁体丹麦语乌克兰语乌兹别克语乌尔都语亚美尼亚语伊博语俄语保加利亚语信德语修纳语僧伽罗语克罗地亚语冰岛语加利西亚语加泰罗尼亚语匈牙利语南非祖鲁语卡纳达语卢森堡语印地语印尼巽他语印尼爪哇语印尼语古吉拉特语吉尔吉斯语哈萨克语土耳其语塔吉克语塞尔维亚语塞索托语夏威夷语威尔士语孟加拉语宿务语尼泊尔语巴斯克语布尔语(南非荷兰语)希伯来语希腊语库尔德语弗里西语德语意大利语意第绪语拉丁语拉脱维亚语挪威语捷克语斯洛伐克语斯洛文尼亚语斯瓦希里语旁遮普语日语普什图语格鲁吉亚语毛利语法语波兰语波斯尼亚语波斯语泰卢固语泰米尔语泰语海地克里奥尔语爱尔兰语爱沙尼亚语瑞典语白俄罗斯语科萨科西嘉语立陶宛语索马里语约鲁巴语缅甸语罗马尼亚语老挝语芬兰语苏格兰盖尔语苗语英语荷兰语菲律宾语萨摩亚语葡萄牙语蒙古语西班牙语豪萨语越南语阿塞拜疆语阿姆哈拉语阿尔巴尼亚语阿拉伯语韩语马其顿语马尔加什语马拉地语马拉雅拉姆语马来语马耳他语高棉语齐切瓦语

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44
Q

MEK

A

kinase involved in Ras pathway

Before:Raf

After:MAPK

Activated Raf是一個kinase,活化後往下找到MEK(Raf的target),MEK也是一個kinase,再去活化MAPK,MAPK仍然是kinase,進到細胞核內去啟動transcription factor。

G

M

T

Y

检测语言世界语中文简体中文繁体丹麦语乌克兰语乌兹别克语乌尔都语亚美尼亚语伊博语俄语保加利亚语信德语修纳语僧伽罗语克罗地亚语冰岛语加利西亚语加泰罗尼亚语匈牙利语南非祖鲁语卡纳达语卢森堡语印地语印尼巽他语印尼爪哇语印尼语古吉拉特语吉尔吉斯语哈萨克语土耳其语塔吉克语塞尔维亚语塞索托语夏威夷语威尔士语孟加拉语宿务语尼泊尔语巴斯克语布尔语(南非荷兰语)希伯来语希腊语库尔德语弗里西语德语意大利语意第绪语拉丁语拉脱维亚语挪威语捷克语斯洛伐克语斯洛文尼亚语斯瓦希里语旁遮普语日语普什图语格鲁吉亚语毛利语法语波兰语波斯尼亚语波斯语泰卢固语泰米尔语泰语海地克里奥尔语爱尔兰语爱沙尼亚语瑞典语白俄罗斯语科萨科西嘉语立陶宛语索马里语约鲁巴语缅甸语罗马尼亚语老挝语芬兰语苏格兰盖尔语苗语英语荷兰语菲律宾语萨摩亚语葡萄牙语蒙古语西班牙语豪萨语越南语阿塞拜疆语阿姆哈拉语阿尔巴尼亚语阿拉伯语韩语马其顿语马尔加什语马拉地语马拉雅拉姆语马来语马耳他语高棉语齐切瓦语

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45
Q

MAPK

A

kinase involved in Ras pathway

Activated Raf是一個kinase,活化後往下找到MEK(Raf的target),MEK也是一個kinase,再去活化MAPK,MAPK仍然是kinase,進到細胞核內去啟動transcription factor。

46
Q

目的of Ras pathway

A

gene activation!

  1. c-fos gene是一個典型的例子。c-fos gene和c-Jun gene會幫助細胞進入cell cycle,促使細胞分裂,是一種early response genes。
47
Q

P90

A

MAPK會dimerize,可以磷酸化p90,p90跑到細胞核內磷酸化活化SRF,SRF及TCF會接到c-fos gene上面,啟動c-fos gene的promoter。

48
Q

Phospholipase Cγ作用機制

A

vs GPCR中的Phospholipase Cβ

作用對象都在細胞膜附近,活化一連串的下游產物,最終目的是要讓:

  1. 內質網內的Ca2+跑出來,活化下游訊息傳遞路徑
  2. 內質網內的Ca2+不夠時,促使內質網靠近細胞膜,開啟細胞膜上的鈣離子通道,讓胞外的鈣離子進來
49
Q

PI-3 kinase

A
  • may be activated by JAK STAT
    1. Role of PI-3 kinase:phosphorylating PIP 或 PIP2

–> Final product(終產物) PI 3,4-bisphosphate 或 PI 3,4,5-triphosphate

–> All happens on the cell membrane

  1. 在細胞膜上的PI 3,4-bisphosphate會召喚PKB(protein kinase B),PKB上面的PH domain連接一端在PI 3,4-bisphosphate的一個磷酸根上,此時partially-active)、。
  2. PKB的結構此時比較開放,而PDK1 kinase、PDK2兩個酵素前來在PKB上各加上一個phosphate group,完整的活化PKB。
50
Q

PI 3,4-bisphosphate 或 PI 3,4,5-triphosphate

A

Final product of PI-3 kinase pathway

membrane-bound

Role: recruit inactive PKB, then phosphorylating it and turn it into partially activate state

then, PDK1 Kinase and PDK2 also come! phosphorylating partially active PKB, which becomes fully active!

–> Promote cell survival

51
Q

PKB

A

Protein kinase B

  • Inactive state: recruited by PI-3 pathway
  • partially acitve: phosphorylated by PI 3-4-biphosphate
  • fully active: 再加上 phosphorylated by PDK1 and PDK

PKB的功能:

  1. 主要目的是promote cell survival。不活化促進細胞凋亡的蛋白質。有兩種方式,第一種是直接inactivate pro-apoptotic protein,第二種是inactivate FOXO3a,FOXO3a是負責活化pro-apoptotic protein的transcription factor。
  2. 同樣是癌細胞常用的手段,抑制已經癌化的細胞走向細胞凋亡。
  3. PTEN phosphatase (tumor suppressor gene)會de-phosphorylating PI-3,進而抑制掉下游的整個路徑,細胞就會走向細胞凋亡。所以在腫瘤細胞上缺少PTEN phosphatase也是常見的特徵。
52
Q

FOXO3a

A
  • pro-apoptotic protein的transcription factor。
  • inactivated by PKB(which therefore promote cell survival)
53
Q

PTEN phosphatase

A
  1. tumor suppressor gene: 會de-phosphorylating PI-3,進而抑制掉下游的整個路徑,細胞就會走向細胞凋亡。所以在腫瘤細胞上缺少PTEN phosphatase也是常見的特徵。
54
Q

TGF-β

A
  1. TGF-β平常在extra-cellular就以monomer存在,要作用時會先用S-S bond結合形成dimer
  2. 共有三種receptor, 三種receptor各司其職:
  3. RI: signaling transduction,
  4. RII負責連接ligand,
  5. RIII則是負責濃縮ligand(TGF-β) 的濃度,加速蒐集ligand。因為他不是一個receptor serine kinase,所以他是不負責傳遞訊息的。
  6. 連接上ligand後,胞內的serine residue會被磷酸化,接著促使smad2、3、4組合在一起,forming smad complex。
  7. smad complex進到細胞核內接到PAI-1這段基因,調控基因表現。
55
Q

Receptor serinekinase

A

TGF-β (in dimer form) as the only ligand

共有三種receptor, 三種receptor各司其職:

RI: signaling transduction,

RII負責連接ligand,

RIII則是負責濃縮ligand(TGF-β) 的濃度,加速蒐集ligand。因為他不是一個receptor serine kinase,所以他是不負責傳遞訊息的。

連接上ligand後,胞內的serine residue會被磷酸化,接著促使smad2、3、4組合在一起,forming smad complex。

smad complex進到細胞核內接到PAI-1這段基因,調控基因表現。

Function: 抑制上皮細胞增生,很特別,跟前面看到的機制剛好相反

56
Q

smad complex

A
  1. Receptor serine kinase 連接上ligand(TGF-β)後,胞內的serine residue會被磷酸化,接著促使smad2、3、4組合在一起,forming smad complex。
  2. smad complex進到細胞核內接到PAI-1這段基因,調控基因表現。
57
Q

smag 7

A

Down regulating the receptor serine receptor pathway!

  1. 正常調控smad7從細胞核進到細胞質內,把smad2、3、4分開,訊號關閉。Since TGF-b is responsible for inhibiting epithelium cell proliferation, so cell smad7 is actually promoting cell proliferation
  2. 癌症細胞:ski會模仿smad7作用,一樣把smad2、3、4分開,使細胞繼續無限增生。同時還可以召喚histone deacetylation,直接停止PAI-1的基因表現。
58
Q

ski

A

The helper of cancer cells, promote its cell proliferating by

  1. dessociating samd2, 3, 4, so inhibiting the downstream interaction (preventing the inhibition on epithelium cell proliferation). Similar to the role of smag7
  2. directly recruiting other enzyme to stop the gene expression of PAI-1 (histone deacetylation)
59
Q

PAI-1

A

Gene that is responsible for the inhibition of epithelium proliferation

expression of the gene is promoted by smad complex (activated upon TGF-b binding to receptor serine kinase

can be regulated by smag 7, which dissociated the smad complex into smad2,3,4 or directly stop the gene from expressing

60
Q

Give examples of ligands that activate NF-κB signaling pathway

A

a. 細菌、黴菌:跟Toll-like receptor結合。
b. cytokine:IL-1(eg) 跟IL-1 receptor結合。
c. 病毒、外界刺激(如紫外線):

直接刺激I-κB kinase。

61
Q

NF-κB signaling pathway and its function

A
  1. Ligand binding to receptor

2. Activation of NF-κB

(inactivate state: 包含p65、p50兩個部分,平常被I-κB綁架不活化)

當ligand接上receptor時,就會去活化I-κB kinase –> 磷酸化I-κB –> 召喚E3 ligase來,接到I-κB上並degrade他。

  1. NF-κB被釋放進到細胞核內,
  • 活化下游的inflammatory cytokine、 chemokine、enzyme的製造,
  • 這些物質都是用來防禦入侵的感染因子。
  • 另外也會活化白血球的adhesion protein,促使白血球出血管道感染部位作用。
62
Q

I-κB

A

Binding to subuntis of NF-kB normally

When being phosphorylated by its kinase, it recruits E3 ligase to degrade itself, so as to free NF-kB for the subsequent signalling transduction

63
Q

E3 ligase

A

being recruited by I-kB when I-kB is being phosphorylated by its kinase in the NF-kB signaling pathway.

It then degrades I-kB so as to free NF-kb for the subsequent signal transduction

64
Q

Poly-K63-linked ubiquitin chains

A
  1. 專論IL-1 receptor的活化路徑:IL-1 receptor的下面有一個Poly-K63-linked ubiquitin chains的結構蛋白質,是一個docking protein,會召喚I-κB kinase,及其他相關蛋白質前來一次傳遞訊息。
65
Q

Insulin release mechanism

A

Glucose enters cell by glocose channes, and turns into pyruvate that cause the ATP-sensitive K+ channel to open.

Action potential –> opeing of voltage-sensitive Ca2+ channel –> release of insulin

66
Q

Give an example of receptor kinase

A

JAK-STAT pathway

  1. JAK & STAT是兩個不同的family,每個family有1-7個protein,不同的cytokine recruit不同的JAK(kinase),活化不同的STAT(signal protein),使之dimerized,再進入細胞核中做基因調控。
67
Q

Types of receptors

  1. Nicotinic receptor
  2. Muscarinic Receptor
A
  1. Nicotinic receptor: somatic system, acting on muscle fibers, Ach as neurotransmitters, ligand gated channel
  2. Muscarinic receptor (GPCR)
    a. Sympathatic/parasympathatic, Ach as neurotransmitters
  3. Adrenergic receptor:belongs to GPCR
    a. sympathatic: NE/E as neurotransmitters released by brain
    b. released by adrenal medulla (NE/E)
68
Q

Activator protein and inhibitor protein for GDP binding protein (GTPase) and gives an example

A
  1. Activator protein: GEP (guanine neucleotide exchange factor)

會把GDP拿掉,把GTP塞進去,活化GTPase

  1. inhibitor protein: GAP (GDPase accelerating protein)

hydrolysis of GTPase

  1. Example of GTPase: a subunit of G protein
69
Q

homologous desensitization and gives an example

A

只針對特定ligand所連結的receptor

  1. GPCR kinase (GRK)
    1. Adding phosphate group onto GPCR à bind to GPCR
    2. GRK1-GRK7與β-arrestin結合,bringing GPCR into endosome,從而減少膜上receptor的量,抑制 G protein interaction,此過程稱為homologous desensitization。
70
Q

Give an example of GPCR ion channel

A

ion channel:K+ channel

goal:  減緩心肌的收縮
ligand: Ach

acetylcholine與receptor binding後,活化Gαi protein(接上GTP),與一般的GPCR不同 ,此時是Gβ, γ subunit與effector protein結合,這裡的effector protein是K+ channel,活化K+ channel,K+流到細胞膜外,產生細胞depolarization (去極化)。結果是減緩心肌的收縮。

Another example: light (receptor is rhodopsin)