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Microbiologie générale > Caractérisation et classification des microorganismes > Flashcards

Caractérisation et classification des microorganismes Flashcards

1
Q

Comment nomme-t-on les différents groupes taxonomiques?

A

Ils sont définis comme étant des taxons ou taxa (terminologie latine)

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Q

Du plus général au plus spécifique, nomme la hiérarchie des taxons d’un procaryote

A

Domaine
Phylum (embranchement)
Classe
Ordre
Famille
Genre
Espèce

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Q

Quels sont les éléments de la hiérarchie des taxons qui différencient entre les procaryotes et les eucaryotes?

A

L’embranchement et le sous-embranchement sont absents chez la taxonomie des procaryotes

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4
Q

De façon générale, quelle est la terminaison de l’ordre pour les bactéries?

A

“ales”

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5
Q

De façon générale, quelle est la terminaison de la famille des bactéries?

A

“aceae”

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6
Q

Quels sont les trois volets constituants la taxonomie?

A

-Identification
-Nomenclature
-Classification (ou systématique)

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7
Q

Que sont les souches? Donne-moi un synonyme de souche

A

Ce sont tous les descendants isolés d’une culture pure. Synonyme: isolat

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8
Q

Qu’est-ce qu’une souche type?

A

Il s’agit d’une souche possédant toutes caractéristiques représentatives de l’espèce. Habituellement, il s’agit de la première isolée

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9
Q

Quel est le taxon de base?

A

L’espèce est le taxon de base

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10
Q

Quel est le préalable permettant d’identifier un organisme?

A

Faire une culture pure de celui-ci

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11
Q

Nomme des exemples de différents caractères morphologiques.

A

-Taille des cellules
-Forme des cellules
-Associations cellulaires
-Structures cellulaires typiques
-Réaction aux colorants (comme la coloration de Gram)

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12
Q

Nomme différentes compositions biochimiques de parois cellulaires permettant de différencier certains individus

A

-Peptidoglycane: bactéries
-Pseudomuréine: archées
-Cellulose: mycètes et algues

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13
Q

Nomme des exemples de différentes physiologies permettant de différencier des individus

A

-Exigences nutritionnelles : source de carbone, facteurs de croissance à utiliser
-Conditions d’incubation : température, oxygène, lumière et autres facteurs environnementaux

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14
Q

Nomme des exemples de différents produits métaboliques permettant de différencier des individus

A

-Certains produits finaux de fermentation
-Enzymes extracellulaires présentes : protéases (dégradent protéines qui passent à travers la membrane), exotoxines, hémolysines et autres…

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15
Q

Nomme des exemples de différences génétiques permettant de différencier des individus

A

-G-C%
-Nombre de chromosomes (chez eucaryotes)
-Plasmides (chez eucaryotes et procaryotes)

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16
Q

Qu’est-ce que le pourcentage G-C? Comment fonctionne cette méthode de différenciation génétique?

A

-Utilisation du spectrophotomètre UV (260 nm) chauffant l’ADN, brisant les ponts H la dénaturant
-Méthode permettant de calculer la vitesse de séparation des ponts H en fonction de la chaleur de l’ADN exposé

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17
Q

Qu’est-ce que la température de fusion?

A

La Tm est la température à laquelle 50% de l’ADN est présent sous forme d’un simple brin

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18
Q

Quel est le pourcentage G-C typique des plantes et des animaux?

A

30-50%

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19
Q

Quel est le pourcentage G-C typique des microorganismes?

A

25-80%

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20
Q

Est-ce que le pourcentage G-C est une valeur exclusive d’une espèce?

A

Non, elle n’est pas exclusive, bien qu’elle soit une valeur typique de l’espèce

21
Q

Nomme des exemples d’intéractions avec un hôte permettant de différencier des individus

A

-Pathogénicité : spécifité de l’infection sur un hôte
-Symbiose

22
Q

Nomme des exemples écologiques permettant de différencier des individus

A

-Différents habitats
-Niche écologique, soit le rôle de l’organisme dans les cycles de la matière

23
Q

Nomme des exemples moléculaires permettant de différencier des individus

A

-Comparaison de séquences précises
-Hybridation ADN-ADN

24
Q

Décrit la méthode d’hybridation ADN-ADN

A

-Isole les molécules d’ADN
-Marque les gènes et chauffe les brins d’ADN, puis on laisse refroidir
-Présence de signaux de marquage en fonction de la complémentarité des deux brins d’ADN

25
Q

Qu’est-ce qui pourrait être une limite de l’hybridation ADN-ADN?

A

Efficace pour les organismes d’une même espèce (généralement de plus de 80% de similarité)

26
Q

Vrai ou faux. L’attribution des noms de microorganismes est décidé simplement par le chercheur l’ayant découverte.

A

Faux. Le nom doit être en fonction des règles du Comité international de systématique des procaryotes/microorganismes eucaryotes

27
Q

Qui est le père de la nomenclature?

A

Carl Von Linné

28
Q

Quels sont les caractéristiques de la nomenclature linnéenne? (2)

A

-Elle est binomale
-Doit être écrit en italique (ordi) ou souligné (à la main)

29
Q

Quels sont les caractéristiques du premier terme pour la nomenclature linnéenne?

A

-Doit être le genre
-Première lettre en majuscule
-Utilisation d’un terme latin ou grec
-Habituellement informations descriptives de ce genre
-Peut aussi être en lien avec son découvreur

30
Q

Quels sont les caractéristiques du second terme pour la nomenclature linnéenne?

A

-Doit être l’espèce
-Utilisation d’un terme latin ou grec
-Doit être descriptif

31
Q

La classification de l’arrangement en groupes et relations intergroupes est en fonction de deux paramètres. Lesquels?

A

-Les caractères communs
-Les liens évolutifs

32
Q

Qu’est-ce que la classification naturelle?

A

C’est basé sur les caractères anatomiques

33
Q

Qu’est-ce que la classification phénétique?

A

Basé sur les caractères phénotypiques: morphologie, métabolisme génétique etc…

34
Q

Qu’est-ce que la classification numérique?

A

Classification d’organisme deux par deux, en utilisant un certain nombre de caractères (minimum de 50), permettant de calculer le % de similarité (%S), puis représentation avec des dendogrammes de cette comparaison

35
Q

Quelle est la limite de la classification numérique?

A

La pondération des caractères est uniforme (caractère présent ou absent), les caractéristiques ont tous le même poids. Cette méthode ne prend pas en considération de la pertinence biologique d’un caractère

36
Q

Qu’est-ce que la classification phylogénétique?

A

-Regard sur les relations évolutives probables
-Comparaison de séquences de gènes et de protéines conservées

37
Q

Quel gène est le plus utilisé pour la classification phylogénétique?

A

Le gène codant pour la sous-unité ribosomique 16S

38
Q

Quel est le lien entre l’évolution de deux espèces et le gène pour la sous-unité ribosomique?

A

Le nombre de différences entre les deux gènes codant pour les ARN ribosomaux chez deux organismes vont être proportionnel au temps depuis la divergence de l’ancêtre commun

39
Q

Qu’est-ce que la classification polyphasique?

A

On utilise les informations phénétiques et phylogénétiques, ce qui rend cette approche plus complète

40
Q

Nomme dans l’ordre croissant les scientifiques importants pour la classification des microorganismes

A
  1. Linnaeus
  2. Haeckel
  3. Whittaker
  4. Woese
41
Q

Quel était l’approche de Linnaeus pour classer les microorganismes?

A

-Basé sur l’anatomie
-Deux règnes : animaux et plantes

42
Q

Quel était l’approche de Haeckel pour classer les microorganismes?

A

-3 règnes : animaux, plantes et protistes! Ces derniers englobaient les bactéries, levures, protozoaires et algues microscopiques

43
Q

Quel était l’approche de Whittaker pour classer les microorganismes? Quel était le problème de son approche?

A

-Tient compte de la nutrition et des organisations cellulaires
-5 règnes
-Problème: l’évolution est unidirectionnelle

44
Q

Quel était l’approche de Woese pour classer les microorganismes?

A

-Approche phylogénétique de l’ARNr
-3 domaies: Eucarya, Bacteria, Archeaa
-Première divergence tôt dans l’évolution, ayant un ancêtre commun : LUCA
-Seconde divergence dans l’évolution: archaea et eucarya

45
Q

Vrai ou faux. Les mitochondries et chloroplastes sont présents chez les procaryotes.

A

Faux. Ces organites sont seulement présents chez les eucaryotes.

46
Q

Qu’est-ce que la théorie de l’endosymbiose?

A

Théorie où les mitochondries et les chloroplastes proviennent de bactéries

47
Q

Qui pourrait être l’organisme originel ayant mener à la formation de mitochondries?

A

Un ancêtre de Rickettsia, un parasite intracellulaire

48
Q

Qui pourrait être l’organisme originel ayant mener à la formation de chloroplastes?

A

Des cyanobactéries photosynthétiques, le Prochloron

Microbiologie générale (7 decks)

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