Caractérisation et classification des microorganismes Flashcards
Comment nomme-t-on les différents groupes taxonomiques?
Ils sont définis comme étant des taxons ou taxa (terminologie latine)
Du plus général au plus spécifique, nomme la hiérarchie des taxons d’un procaryote
Domaine
Phylum (embranchement)
Classe
Ordre
Famille
Genre
Espèce
Quels sont les éléments de la hiérarchie des taxons qui différencient entre les procaryotes et les eucaryotes?
L’embranchement et le sous-embranchement sont absents chez la taxonomie des procaryotes
De façon générale, quelle est la terminaison de l’ordre pour les bactéries?
“ales”
De façon générale, quelle est la terminaison de la famille des bactéries?
“aceae”
Quels sont les trois volets constituants la taxonomie?
-Identification
-Nomenclature
-Classification (ou systématique)
Que sont les souches? Donne-moi un synonyme de souche
Ce sont tous les descendants isolés d’une culture pure. Synonyme: isolat
Qu’est-ce qu’une souche type?
Il s’agit d’une souche possédant toutes caractéristiques représentatives de l’espèce. Habituellement, il s’agit de la première isolée
Quel est le taxon de base?
L’espèce est le taxon de base
Quel est le préalable permettant d’identifier un organisme?
Faire une culture pure de celui-ci
Nomme des exemples de différents caractères morphologiques.
-Taille des cellules
-Forme des cellules
-Associations cellulaires
-Structures cellulaires typiques
-Réaction aux colorants (comme la coloration de Gram)
Nomme différentes compositions biochimiques de parois cellulaires permettant de différencier certains individus
-Peptidoglycane: bactéries
-Pseudomuréine: archées
-Cellulose: mycètes et algues
Nomme des exemples de différentes physiologies permettant de différencier des individus
-Exigences nutritionnelles : source de carbone, facteurs de croissance à utiliser
-Conditions d’incubation : température, oxygène, lumière et autres facteurs environnementaux
Nomme des exemples de différents produits métaboliques permettant de différencier des individus
-Certains produits finaux de fermentation
-Enzymes extracellulaires présentes : protéases (dégradent protéines qui passent à travers la membrane), exotoxines, hémolysines et autres…
Nomme des exemples de différences génétiques permettant de différencier des individus
-G-C%
-Nombre de chromosomes (chez eucaryotes)
-Plasmides (chez eucaryotes et procaryotes)
Qu’est-ce que le pourcentage G-C? Comment fonctionne cette méthode de différenciation génétique?
-Utilisation du spectrophotomètre UV (260 nm) chauffant l’ADN, brisant les ponts H la dénaturant
-Méthode permettant de calculer la vitesse de séparation des ponts H en fonction de la chaleur de l’ADN exposé
Qu’est-ce que la température de fusion?
La Tm est la température à laquelle 50% de l’ADN est présent sous forme d’un simple brin
Quel est le pourcentage G-C typique des plantes et des animaux?
30-50%
Quel est le pourcentage G-C typique des microorganismes?
25-80%
Est-ce que le pourcentage G-C est une valeur exclusive d’une espèce?
Non, elle n’est pas exclusive, bien qu’elle soit une valeur typique de l’espèce
Nomme des exemples d’intéractions avec un hôte permettant de différencier des individus
-Pathogénicité : spécifité de l’infection sur un hôte
-Symbiose
Nomme des exemples écologiques permettant de différencier des individus
-Différents habitats
-Niche écologique, soit le rôle de l’organisme dans les cycles de la matière
Nomme des exemples moléculaires permettant de différencier des individus
-Comparaison de séquences précises
-Hybridation ADN-ADN
Décrit la méthode d’hybridation ADN-ADN
-Isole les molécules d’ADN
-Marque les gènes et chauffe les brins d’ADN, puis on laisse refroidir
-Présence de signaux de marquage en fonction de la complémentarité des deux brins d’ADN
