BM9 Partie 2 - Transposition d'ADN Flashcards
Quelle est la définition générale de la transposition?
C’est un cas particulier de recombinaison ou un segment d’ADN est déplacé (ou copié et déplacé) à un autre endroit du génome. Ce type de séquence d’ADN est appelé élément transposable ou transposon.
Qu’est-ce qui est nécessaire au déplacement des transposons?
Une recombinaison des séquences des extrémités du transposon avec celles de son site d’accueil. Dans certains cas, un intermédiare ARN est nécessaire à la transposition.
Vrai ou Faux: Les transposons n’ont pas de sites d’accueil spécifiques.
Vrai. Ils peuvent même s’insérer au milieu de la séquence codante d’un gène et l’inactiver, ou bien dans la séquence régulatrice et modifier ainsi l’expression du gène associée.
Que sont les caractéristiques des transponsons?
- Présents dans le génome de tous les organismes vivant
- Une source majeure de mutation
- Responsables de certaines maladies génétiques et de cancers
- Utilisés comme vecteurs de transformation génétique
Qu’est-ce qu’une syncytines?
Protéines d’origine rétrovirale qui ont été recrutés pour assurer la synthèse d’une membrane du placenta d’origine embryonnaire (le syncytiotrophoblaste). Sans syncytines, pas de placenta.
Que sont les 3 classes de transposons? Décrivez-les brièvement.
- Transposons à ADN
- 1 transposase +2 sites de recombinaison
- Sites de recombinaison: 25pb-plusieurs centaines de pb, séquences +/- répétées/inversées
- Comportent d’autres gènes codants qui régulent leur propre processus de transposition, mais également des gènes qui peuvent être utiles au génome hôte. - Transposons à ARN/viral (rétrotransposons, rétrovirus, éléments Long Terminal Repeat ou LTR)
- Sites de recombinaison IDEM transposons à ADN
- Rétrotransposons: encode 2 protéines indispensables à leur mobilité, une intégrase (transposase) et une transcriptase inverse (ADN polymérase) - Rétrotransposons non viraux (Poly-A)
- Encode 2 protéines: ORF-1 (protéine de liaison à l’ARN) et ORF-2 (transcriptase inverse et endonucléase)
Décrivez le mécanisme de déplacement d’un transposon à ADN.
- Excision du transposon de son site et intégration à un nouveau site (couper-coller), initiant la recombinaison.
- La transposase se lie aux séquences terminales répétées et inversées pour former un complexe ADN-protéine stable (le transposome)
- Attaque d’un pont phosphodiester du site d’insersion de l’ADN cible par l’une des 2 extrémités 3’-OH libre du transposon.
- Chacune des 2 réactions de trans-estérification provoque 1 incision dans l’ADN cible.
- Les sous-unités de la transposase clivent 1 brin d’ADN à chaque extrémité du transposon à la jonction avec l’ADN hôte flanquant, en générant 2 extrémités 3’-OH.
- Les 2 extrémités 3’-OH sont libérées en premier par la transposase.
Décrivez le clivage de brins non-transférés
-Leurs extrémités 5’-P ne se lient pas directement à l’ADN cible lors de la réaction de transfert. (That’s literally it le reste n’est pas à l’exam send help)
Décrivez le mécanisme de réplication d’un transposon à ADN
- Le transposon est dupliqué à chaque cycle de transposition
- Mécanisme semblable au “couper-coller” pour l’étape d’assemblage du transposome mais il n’y a pas de clivage des brins non transférés, donc le transposon reste à son site d’origine
- Seules les extrémités 3’-OH se lient aux sites de l’ADN cible par réaction de transfert de brin. Les extrémités 5’-P restent liées au sites de l’ADN d’origine.
Que sont les fonctions du transposome?
- Maitient les sites de recombinaison ensemble
- Protège l’ADN des enzymes de dégradation
Sur quoi dépend la taille des portions d’ADN simple brin créées par les 2 incisions produites lors du transfert de brin?
Elle est dépendantes du nombre de bases qui séparent les deux sites d’insersion du transposon, AKA les séquences flaquantes.
Vrai ou Faux: 2 strucutres de fourche de réplication sont utilisées pour l’assemblage de la machineri de réplication.
Faux: 2 sont créées, mais seulement une est utilisée pour l’assemblage de la machinerie de réplication.
Décrivez le mécanisme de réplication par intermédiare à ARN chez les rétrotransposons et les rétrovirus.
- Il y a transcription de leur séquence d’ADN par une ARN polymérase de la cellule hôte. (comprend le promoteur, les gènes de la région centrale et la séquence LTR en 3’.)
- Le transcrit est ensuite rétro-transcrit en ADN complémentaire double brin par la transcriptase inverse. L’ADNc est alors reconnu par l’intégrase qui, en se liant aux 2 extrémités de l’ADNc, va cliver quelques nucléotides terminaux aux extrémités 3’. Ces extrémités vont attaquer directement l’ADN cible (pas de 2ième brin à exciser).
Vrai ou Faux: Contrairement aux autres types de transposon, il y a spécificité de site d’intégration pour les rétrotransposons et les rétrovirus.
Faux: Tout les transposons n’ont pas de spécificité de site d’intégration.
Que sont les trois types de séquences compris par les LTRs?
Unique U3’/U5’ et répétée R.
