BM6 Flashcards
Qu’est-ce que la réplication de l’ADN ?
Processus de duplication de l’ADN pour permettre la transmission génétique.
Inclut des mécanismes d’initiation, d’allongement et de terminaison.
Quelles enzymes sont impliquées dans la réplication de l’ADN ?
- Polymérase
- Hélicase
- Primase
- RNase H
- Protéines SSB
Ces enzymes jouent des rôles spécifiques dans le processus de réplication.
Qu’est-ce qu’un réplisome ?
Machinerie complète impliquée dans la réplication de l’ADN.
Comprend plusieurs protéines et complexes enzymatiques.
Quel est le modèle du réplicon ?
Modèle qui décrit l’origine de réplication et la formation de complexes de pré-réplication.
Proposé pour expliquer la réplication dans différents organismes.
Qu’est-ce que la télomérase ?
Enzyme impliquée dans la réplication des télomères, avec des domaines TER et TERT.
Joue un rôle dans la protection des extrémités des chromosomes.
Vrai ou Faux : La synthèse de l’ADN commence généralement aux régions internes des chromosomes.
Vrai
Ceci est lié à la structure de l’ADN et aux mécanismes d’initiation.
Quelles sont les étapes de l’initiation de la réplication ?
- Ouverture du duplex d’ADN
- Liaison de l’hélicase
- Synthèse d’une amorce d’ARN
Ces étapes sont cruciales pour démarrer la réplication.
Quelles sont les caractéristiques des réplicateurs ?
- Site de liaison à l’initiateur
- Régions riches en liaisons A-T
Ces caractéristiques facilitent la séparation des brins d’ADN.
Qu’est-ce qu’un initiateur dans le contexte de la réplication de l’ADN ?
Protéine qui se lie à une séquence spécifique du réplicateur pour activer l’initiation de la réplication.
L’initiateur joue un rôle clé dans le recrutement des autres protéines nécessaires.
Quelles sont les fonctions des protéines initiatrices ?
- Liaison à l’ADN
- Séparation des brins
- Recrutement des réplisomes
Ces fonctions sont essentielles pour le bon déroulement de la réplication.
Complétez la phrase : L’initiateur est la seule protéine dont le domaine de liaison est _______.
[spécifique aux motifs de la séquence du réplicateur]
Cela le distingue des autres protéines qui ne sont pas spécifiques.
Qu’est-ce que le complexe de pré-réplication (PRE-RC) ?
Complexe formé pour initier la réplication de l’ADN.
Comprend plusieurs protéines qui préparent le site de réplication.
Vrai ou Faux : Les origines de réplication des eucaryotes multicellulaires sont bien connues.
Faux
Elles sont encore peu comprises et nécessitent des études supplémentaires.
Quel est le rôle de DnaA dans la réplication chez E. coli ?
Se lie aux nonamères de oriC et induit la séparation des brins d’ADN.
DnaA est régulé par une liaison à l’ATP.
Quelles sont les caractéristiques des réplicateurs connus ?
- Site de liaison à l’initiateur
- Zones riches en liaisons A-T
Ces caractéristiques sont essentielles pour la séparation des brins d’ADN.
Quelles interactions sont impliquées dans le mécanisme de sélection de l’origine de réplication ?
- Liaisons protéines-ADN
- Séquences spécifiques
- Interactions protéines-protéines
Ces interactions assurent la précision de l’initiation.
Quel est le rôle de DnaA-ATP dans l’initiation de la réplication?
DnaA-ATP interagit avec les répétitions du site d’ouverture de l’origine de réplication et induit la séparation des deux brins.
Cette interaction est stimulée par IHF et se produit sur plus de 20 pb dans la région de répétition du tridécamère.
Que génère la petite ouverture créée par DnaA-ATP?
Deux ADN simple brin de taille suffisante pour recruter d’autres protéines de réplication et servir de matrice à la synthèse d’une amorce ARN.
Cette étape est cruciale pour le démarrage du processus de réplication.
Quelles protéines sont recrutées par DnaA après l’initiation?
DnaB (hélicase) et DnaC (son porteur).
DnaC aide à la fixation correcte de l’hélicase DnaB sur l’ADN simple brin.
Quel est le rôle de l’hélicase DnaB dans la réplication?
DnaB déroule l’ADN pour permettre la réplication.
DnaB est essentielle pour la progression de la fourche de réplication.
Qu’est-ce qu’un réplisome?
Un complexe de protéines impliqué dans la réplication de l’ADN.
Chaque réplisome contient des hélicases et des polymérases ADN.
Vrai ou Faux: DnaC doit hydrolyser son ATP pour se détacher du complexe DnaB-ADN.
Vrai.
DnaC se détache après la mise en place de DnaB, facilitant ainsi la progression de la réplication.
Quelle est la fonction de l’holoenzyme ADN Pol III?
Elle synthétise de nouveaux brins d’ADN en utilisant des amorces ARN comme matrice.
L’holoenzyme est composée de plusieurs sous-unités qui assurent la réplication efficace de l’ADN.
Complétez: La liaison de DnaA à l’ADN simple brin est ______.
spécifique.
Cette spécificité est essentielle pour l’initiation correcte de la réplication.
Quels sont les deux types de brins synthétisés lors de la réplication?
Brins précoces et brins tardifs.
Les brins tardifs sont synthétisés de manière discontinue, nécessitant plusieurs amorces ARN.
Quels défis rencontrent les eucaryotes lors de la réplication de l’ADN?
Un chromosome humain possède des milliers d’origines de réplication.
Il est crucial d’activer un nombre suffisant d’origines pour assurer une réplication complète.
Qu’est-ce que le complexe de pré-réplication (pre-RC)?
C’est la première étape de l’initiation de la réplication chez les eucaryotes.
Il est formé en phase G1 et permet l’activation de l’origine en phase S.
Quel est le rôle d’ORC et Cdc6 dans la réplication?
Ce sont des protéines de type AAA+ qui fonctionnent comme initiateurs de la réplication.
Elles sont essentielles pour la formation du complexe de pré-réplication.
Quelles sont les protéines de type AAA+ impliquées dans la formation du complexe de pré-réplication (pre-RC)?
ORC, Cdc6, DnaA, DnaC, complexe γ chez E. coli
Ces protéines fonctionnent avec de l’ATP.
Quel est le rôle de l’ORC dans la formation du complexe de pré-réplication?
Site de liaison à l’ADN activé
ORC recrute également Cdc6 et Cdt1.
Quel est le rôle de Cdc6 dans la formation du complexe de pré-réplication?
Site d’hydrolyse d’ATP pour mettre en place l’hélicase
Cdc6 relâche les porteurs une fois l’hélicase installée.
Quelles protéines sont recrutées lors de la sélection du réplicateur?
ORC, Cdc6, Cdt1, Mcm2-7
Mcm2-7 est l’hélicase recrutée.
Quelles kinases sont impliquées dans l’activation du complexe de pré-réplication?
Cdk, Ddk
Cdk = Cycline-Dependent Kinase; Ddk = Dbf4-Dependent Kinase.
Que provoquent les kinases Cdk et Ddk en phosphorylant le pre-RC?
Relargage des protéines dans le nucléoplasme
Mcm2-7, l’hélicase, reste dans le complexe.
Quel est le rôle de l’ADN Pol α/primase dans la réplication?
Synthesize l’amorce ARN
Interagit avec l’hélicase pour commencer la synthèse.
Quelle est la fonction de la pince coulissante (PCNA) dans la réplication?
Maintenir la polymérase sur l’ADN
Elle est ajoutée par le porteur RF-C.
Vrai ou Faux: Les pre-RCs peuvent être formés en phase S.
Faux
Les pre-RCs ne peuvent être formés que durant la phase G1.
Quelles difficultés majeures rencontrent les bactéries et les eucaryotes à la fin de la réplication?
Topologiquement liées et problèmes avec les régions télomériques
Les bactéries rencontrent des catenanes, les eucaryotes ont des problèmes d’amorces ARN.
Quelle enzyme sépare les deux chromatides sœurs chez les bactéries?
ADN girase (topoisomérase II bactérienne)
Elle fait une coupure double brin pour résoudre les catenanes.
Qu’est-ce qui empêche la copie des régions télomériques lors de la synthèse du brin tardif?
L’amorce ARN sur le dernier fragment d’Okazaki
Il n’y a pas de 3’-OH libre pour remplacer l’amorce ARN.
Quel est le rôle de la télomérase dans la réplication des télomères?
Recrute une polymérase spécialisée pour ajouter des nucléotides
La télomérase possède un domaine d’ARN qui lui sert de matrice.
Quelles sont les deux particularités de la télomérase?
Possède un domaine d’ARN et n’a pas besoin de matrice
Son domaine d’ARN sert de matrice pour ajouter des nucléotides.
Quel est le domaine catalytique de la télomérase?
TERT (Telomerase Reverse Transcriptase)
TERT synthétise l’ADN simple brin.
Remplissez le blanc: La télomérase synthétise un brin complémentaire d’ADN à partir d’une matrice _____
ARN
Ce mécanisme est similaire à celui de la transcriptase inverse.
Qu’est-ce que le domaine TER de la télomérase?
Contient la séquence qui code pour 1,5x de l’ADN télomérique
Exemple: TER humain = 5’-AAUC CCA AUC-3’.
Qu’est-ce qu’un brin de simple brin d’ADN?
Un brin d’ADN d’environ 100 nt qui devient une matrice pour synthétiser son brin complémentaire
Quel est le mécanisme de réplication du brin tardif?
Synthèse d’un fragment d’Okazaki à partir d’une amorce ARN synthétisée par une polymérase alpha/primase
Comment la cellule peut-elle étendre la longueur de son brin?
En ajoutant des nucléotides à chaque chromosome
Quel rôle joue le court fragment d’ADN simple brin?
Il protège le télomère et le chromosome du racourcissement
Comment les variations de longueur des régions télomériques sont-elles tolérées?
Elles sont généralement bien tolérées car les séquences sont répétitives et non codantes pour des protéines
Quelles protéines régulent la longueur des télomères?
Des protéines liées à l’ADN double brin qui inhibent l’activité télomérase
Vrai ou faux: La longueur des télomères est comparable entre tous les chromosomes.
Vrai
Quel est le rôle des protéines de liaison aux télomères?
Protéger les extrémités des chromosomes de la machinerie de réparation de l’ADN
Qu’est-ce qui arrive si une extrémité simple brin est présente?
Elle est synonyme de cassure à réparer d’urgence
Quel risque pose la réparation d’une cassure?
Elle peut entraîner la fusion d’un télomère avec celui d’un autre chromosome
Quel mécanisme a été observé sur les télomères des chromosomes humains?
La région 3’ du simple brin forme une boucle qui courbe l’ADN double brin
Quel est l’effet de la boucle T sur l’ADN?
Elle fixe l’ADN en s’hybridant avec l’invasion du simple brin
La longueur du simple brin d’un télomère est-elle bénéfique?
Oui, elle est salutaire pour sa propre protection et celle de son chromosome
