BM4 Flashcards
Qu’est-ce que la réplication de l’ADN?
Processus par lequel l’ADN se dédouble pour former deux molécules identiques
La réplication de l’ADN est essentielle pour la division cellulaire.
Quels sont les principales phases de la division cellulaire?
- Prophase
- Métaphase
- Anaphase
- Télophase
- Cytodiérèse
- Interphase
Comment l’ADN doit-il se préparer pour la réplication?
L’ADN doit se décompacter
Quelles sont les enzymes clés impliquées dans la réplication de l’ADN?
- ADN polymérase
- Hélicase
- Protéines SSB
- Primase
- RNase H
Qu’est-ce qu’un réplisome?
Machinerie impliquée dans la réplication de l’ADN
Quels sont les types d’origines de réplication?
- Origines de réplication bactériennes
- Origines de réplication eucaryotes
Qu’est-ce que l’hypothèse de la matrice protéique?
Hypothèse abandonnée selon laquelle une protéine pourrait agir comme matrice pour la réplication de l’ADN
Quel est le résultat de l’expérience de Meselson et Stahl?
Démonstration que la réplication de l’ADN est semi-conservative
Dans quel milieu l’expérience de Meselson et Stahl a-t-elle été réalisée?
Milieu de culture contenant du 15N et du 14N
Quelles sont les caractéristiques des origines de réplication chez les eucaryotes?
- Nombreuses origines de réplication
- Situées tous les 30-50 kilobases le long des chromosomes
- Variabilité de taille des origines
Vrai ou Faux: L’ADN de Drosophile en réplication montre des bulles de réplication.
Vrai
Quelles sont les spécificités de l’ADN polymérase?
- Liaisons Watson-Krick
- Liaisons phosphodiester
- Processivité
Remplissez le blanc: Les nucléotides sont reliés par des liaisons _______.
[phosphodiester]
Quel type de molécule est l’ARN?
Biopolymère autoréplicatif, mais très instable
Quel est le rôle des prions dans la réplication?
Ils peuvent se répliquer sans ADN, en perturbant les protéines normales
Quelles sont les deux hypothèses sur la réplication de l’ADN testées par Meselson et Stahl?
- Hypothèse conservative
- Hypothèse semi-conservative
- Hypothèse dispersive
Comment se déroule la réplication chez les bactéries?
Une seule origine de réplication, réplication bi-directionnelle
Qu’est-ce que la régulation épigénétique des origines de réplication?
Contrôle de l’activité des origines de réplication selon l’état de la chromatine et le développement
Quelles sont les bases des désoxyribonucléotides?
- dGTP
- dATP
- dCTP
- dTTP
Qu’est-ce que la complémentarité de l’ADN?
Les bases azotées se pairent spécifiquement: A avec T, C avec G
Qu’est-ce qu’une chaîne nucléotidique ?
Une structure composée de nucléotides reliés par des liaisons phosphodiester.
Comment les nucléotides sont-ils reliés entre eux ?
Par une liaison phosphodiester (covalente) entre le groupement hydroxyle libre en C3 et le phosphate alpha du nucléotide triphosphate.
Quel est le sens de la synthèse du brin complémentaire de l’ADN ?
De 5’ vers 3’.
Quel est le rôle du pyrophosphate dans la synthèse de l’ADN ?
Il fournit de l’énergie lors de sa libération et clivage.
Quelles sont les deux réactions impliquées dans l’ajout d’un nucléotide à la chaîne d’ADN ?
- Rupture de la liaison pyrophosphate
- Formation d’une liaison phosphodiester.
Quelle enzyme est responsable de l’hydrolyse du pyrophosphate ?
La pyrophosphatase.
Quel est le bilan global de la réaction de synthèse de l’ADN ?
(dNMP)n + 1 + 2 Pi.
Quelle est la constante d’équilibre (Keq) de la réaction de synthèse de l’ADN ?
10^5.
Vrai ou Faux : L’ADN polymérase peut ajouter des nucléotides sans amorce.
Faux.
Comment l’ADN polymérase choisit-elle le bon nucléotide à ajouter ?
Elle se base sur la complémentarité de la liaison Watson-Crick.
Quel est l’impact de l’incorporation d’un mauvais nucléotide par l’ADN polymérase ?
Celle-ci est 10 000 fois plus lente.
Quels types de nucléotides l’ADN polymérase peut-elle catalyser ?
- Adénine
- Thymine
- Cytosine
- Guanine.
Qu’est-ce qui empêche l’ADN polymérase de distinguer les rNTPs des dNTPs ?
Un mécanisme d’exclusion stérique à son site actif.
Quels sont les deux acides aminés impliqués dans la reconnaissance des nucléotides par l’ADN polymérase ?
Glutamates.
Quel type de liaison est responsable de la spécificité de l’ADN polymérase ?
Liaison Watson-Crick.
Quel est l’effet des contacts électrostatiques van der Waals avec l’anneau de sucre sur la spécificité de l’ADN polymérase ?
Ils permettent la distinction entre les rNTPs et les dNTPs.
Quelle est la force d’une liaison van der Waals comparée à une liaison hydrogène ?
1 kcal/mole < 3,7 kcal/mole.
Quelles fonctions possède l’ADN polymérase ?
- Polymérase
- Exonucléase.
Quelle est l’énergie de liaison pour l’hydrogène?
3,7 kcal/mole
Quelles sont les deux fonctions principales de l’ADN polymérase?
- Polymérase
- Exonucléase
Quels sont les trois domaines principaux de l’ADN polymérase?
- La paume
- Les doigts
- Le pouce
Quel type de liaison est formé par l’ADN polymérase?
Liaison phosphodiester
Qu’est-ce qui réduit l’affinité de l’hydrogène pour son oxygène du 3’-OH?
L’action d’une base (-)
Quels ions métalliques aident à incorporer le nucléotide triphosphate entrant?
- Mg2+
- Zn2+
Que se passe-t-il en cas de mésappariement lors de la catalyse par l’ADN polymérase?
Interférence avec les contacts du sillon mineur
Comment la base matrice interagit avec les doigts de l’ADN polymérase?
Les doigts participent à la catalyse
Quel est le rôle du pouce dans l’ADN polymérase?
Maintient l’amorce pour garantir une position vacante
Quelle est la vitesse d’action de l’ADN polymérase processive?
1000 à 10 000 nucléotides à la seconde
La polymérase est-elle spécifique à la nature de la séquence?
Non, l’affinité de la polymérase pour son substrat n’est pas spécifique à la nature de la séquence
Complétez la phrase: L’ADN polymérase glisse sur l’ADN grâce à des interactions _______.
[électrostatiques]
Quel mécanisme permet à la polymérase de rester attachée à l’ADN après chaque ajout de base?
Liaison non spécifique à la séquence
Quel est l’effet de la protéine PCNA sur la processivité de l’ADN polymérase?
Elle augmente la processivité
À quel moment la polymérase est-elle prête à ajouter le nucléotide suivant?
Après la réouverture des doigts
Quel type de mécanisme est impliqué dans la réparation de l’ADN par l’exonucléase?
Le mécanisme se lie au brin mésapparié
Comment les ions Mg2+ contribuent-ils à la catalyse?
Ils coordonnent les charges négatives des autres phosphates
Quel est le produit de l’attaque du 3’-OH du dernier nucléotide incorporé?
3’-O-l’hydroxyle déprotoné
Quel est le rôle des doigts lors de l’ajout d’un nucléotide?
Ils emprisonnent l’appariement
