BLAST

Question 1

Qué hace BLAST

Answer 1

Encuentra una región de similitud local (secuencia conservada) entre una secuencia de “consulta” de aminoácidos que conforman una proteína o la secuencia de nucleótidos del ADN frente a una base de datos de referencia .

Question 1

Qués es BLAST

Answer 1

herramienta de búsqueda de alineación local básica (BLAST) es la herramienta más utilizada para búsqueda de secuencias en bases de datos.

Question 2

Objetivo final de BLAST

Answer 2

inferir las relaciones evolutivas y funcionales entre 2 secuencias de ADN o proteínas.

Question 3

BLASTN

Answer 3

secuencia de nucleótidos es contrastada contra otra secuencia de nucleótidos de referencia.

Question 4

BLASTP

Answer 4

secuencia proteínica es contrastada contra otra secuencia proteínica de referencia.

Question 5

BLASTX

Answer 5

Todos los marcos de lectura de una secuencia de nucleótidos se contrastan contra una secuencia de proteínas de referencia.

Question 6

TBLASTN

Answer 6

secuencia proteínica es contrastada contra todos los marcos de lectura de secuencias de nucleótidos de referencia.

Question 7

TBLASTX

Answer 7

traducciones de 6 marcos de la secuencia de nucleótidos se buscan contra 6 marcos traducciones de una base de datos de secuencias de nucleótidos

Question 8

MEGABLAST

Answer 8

Adecuado para encontrar alineación entre secuencias estrechamente relacionadas

Question 9

PSI-BLAST

Answer 9

Adecuado para buscar homólogos remotos o miembros de una familia de proteínas

Question 10

PHI-BLAST

Answer 10

Adecuado para encontrar secuencias de proteínas con un patrón específico en la base de datos