Bioquímica Flashcards
¿Cuál es el colesterol bueno?
HDL
¿Cuál es el colesterol malo?
LDL
¿Qué son lipoproteinas y para que sirven?
Macromoléculas de lípidos y proteínas que transportan grasa por todo el organismo.
¿Cuales son las condiciones estándar?
25 grados centígrados y 1 atmósfera de presión
¿Qué es mejor mantequilla o margarita?
Diferecias
La mantequilla es mejor para cocinar alimentos rápido por su cadena corta de ácidos grasos.
La margarina es mejor para alimentos de cocción largos por que tiene grasas insaturadas. En teoría es mejor la margarina.
¿Qué es glucolisis?
Ruta degradativa de la glucosa
¿Qué es catabolismo?
Reacciones degradativas que queman las moléculas que se ingieren como nutrientes para producir energía
¿Qué son las propiedades variables de estado?
Composición, volumen, temperatura y presión
Definición de energía
Capacidad de un cuerpo para realizar un trabajo
La entalpía estandar de una reacción se calcula a partir de..
La entalpia estandar de formación de los reactivos y productos
¿Qué es la termodinámica?
Ciencia que describe y relaciona las propiedades físicas de la materia y sus intercambios de energía
¿Qué es energía potencial?
Cantidad de trabajo que se puede realizar al liberar energía
¿Qué es energía de combustión?
Energía contenida en los enlaces de carbono de los combustibles producida por una oxidación.
¿Qué es energía química?
Energía liberada de las moléculas para un trabajo celular
1 principio de la termodinámica o principio de conservación
Energía no se crea ni se destruye, solo se transforma
¿De dónde proviene la energía que utiliza un organismo heterótrofo?
De nutrientes y de energía almacenada en dicho organismo
Según su relación con el entorno los sistemas pueden ser de tipo:
Aislados: no intercambian materia ni energía con el entorno
Cerrados: solo intercambian energía con el entorno
Abiertos: intercambian energía y materia con el entorno
¿Qué es un sistema?
El estudio de las propiedades de una porción de materia
Diferencia entre calor y energía térmica
Calor es el resultado del aumento de la temperatura
Energía térmica es energía cinética que ya tiene el sistema
¿Qué es la energía libre de Gibbs?
Energía liberada por un sistema para realizar un trabajo a presión constante.
La estructura cuaternaria de una proteína es?
La interacción entre varias cadenas de proteinas
Se pueden considerar agentes desnaturalizantes
Temperatura, pH y sales o disolvente apolares
La estructura terciaria de una proteína es
Plegamiento en una disposición tridimensional
La estructura primaria de una proteína es
El orden concreto en que sus aminoácidos se disponen en la cadena
Considerando los niveles de organización de las proteínas, estas se pueden clasificar en
Globulares y fibrosas
La estructura secundaria de una proteína es
Su disposición espacial concreta
Ejemplo de estructura secundaria
alfa hélice o lamina beta
Ejemplo de proteína globular en la que se observan diferentes estructuras secundarias en la misma molécula (a y b hélice)
Enzima lisozima
Hélice que gira a la derecha
dextrógira
Hélice que gira a la izquierda
Levógira
Cuando las proteínas se encuentran en una conformación limitada, la cual es la más estable desde el punto de vista energético se denomina…
Conformación nativa
Qué es desnaturalización
Pérdida de la estructura tridimensional de la proteína que conlleva a la pérdida de la función
Que determina la estructura tridimensional de las proteínas?
La identidad de los aminoácidos que la componen y por el orden concreto en que estos aminoácidos se disponen en la cadena
Las interacciónes secundarias y terciarias son covalentes
V o F
Falso son no covalentes (puentes de hidrógeno, electrostáticas e hidrofóbicas)
La unidad de repetición estructural en proteínas multiméricas (compuesta por una cadena o varias) se denomina
Protromero
Protromero
Unidad de repetición estructural en proteínas multiméricas
Una proteína formada por 2 subunidades se llama
Dímero
Proteína formada por 3 subunidades
Trímero
Considerando los niveles de organización las proteínas se pueden clasificar en
Globulares y fibrosas
La secuencia concreta de aminoácidos de una protína aporta información sobre..
Su estructura molecular, su función y su evolución
Como se llama el estudio que permite conocer el papel de aminoácidos concretos en la estructura y función de la proteína?
Mutagénesis
Qué tipo de interacción tiene un papel muy importante en la estabilización de la estructura tridimensional de las proteínas?
Interacciónes hidrofóbicas
La alfa hélice es una estructura secundaria helicoidal levógira.
V o F
Falso, es dextrógira
La alfa hélice es estabilizada por…
Puente de hidrógeno intracatenarios
Porqué se produce la anemia falciforme?
Por una variación en un único aminoácido de la cadena Beta de la hemoglobina (Glu 6 es sustituido por Val)
La anemia falciforme hace a quien la padece, resistente a que enfermedad?
Malaria
El núcleo de las proteínas globulares es hidrofílico.
V o F
Falso. Es hidrofóbico
Quien propuso la estructura secundaria?
Linus Pauling y Robert Corey
La Alfa hélice incluye cuantos residuos por vuelta?
3,6
Cuales son los aminoacidos que se encuentran con más frecuencia en la alfa hélice?
Ala, Glu, Leu y Met
Quien descubrió las láminas B?
Linus Pauling y Robert Corey
Cuántos tipos de lámina B existen?
2 láminas B paralelas y láminas B antiparalelas
Porqué se denominan láminas B paralelas?
Porque todas las hebras se disponen con la misma orientación de sus grupos amino y carboxilo terminales
Porqué se denominan láminas B antiparalelas?
Porque la orientación de sus grupos amino y carboxilo terminales se disponen de forma alternada
Cuál de las láminas B es más resistente?
Las láminas B antiparalelas porque sus puentes de hidrógeno no son en ángulos, son rectos
Qué son motivos o estructuras superseundarias?
Son combinaciones de varios elementos con estructura secundaria definida
Cuál es el motivo más sencillo en el que se relacionan hebras B?
Horquilla B
Qué es un dominio?
Combinación de varios motivos formando una unidad funcional
Qué dominios se presentan en una proteína transmembrana?
Dominio extracelular, dominio transmembrana (estructura alfa hélice) y dominio citosólico
Dónde son sintetizadas las proteínas?
En el ribosoma
Cuál es la función de las chaperonas?
Interactuar con cadenas parcialmente plegadas o plegadas de forma defectuosa y corregirlas.
Definición de desnaturalización?
Modificación estructural que conduce a la pérdida de función
Que factor altera principalmente a los enlaces de puente de hidrógeno y produce una desnaturalización de proteínas?
Calor
Asociación de varias cadenas proteicas de forma no covalente?
Proteína multimerica
Ejemplo de proteína estructural?
Colageno
Ejemplo de proteína de transporte y almacenamiento?
Hemoglobina
Ejemplo de proteína con función de defensa?
Anti cuerpo
Ejemplo de proteína con función catalítica?
Enzimas
De que depende la función de las proteínas en la mayoría de los casos?
Ligandos que pueden ser moléculas pequeñas u otras proteínas
Como se llama al lugar específico en donde interactua el ligando con la proteína?
Sitio de fijación o de unión
Proteína más abundante en los vertebrados?
Colageno
Donde esta presente el colágeno?
Hueso, dientes, cartílagos, tendones, córnea del ojo y tejidos epiteliales.
Tipo de colágeno más abundante?
Tipo 1
Cual es la estructura del colágeno?
Tiene una estructura de triple hélice dextrógira formada por tres cadenas alfa levógiras
Qué son priones?
Proteínas capaces de actuar como agentes infecciosos
Cuál vitamina es necesaria para la formación adecuada de colágeno?
Vitamina C
Enfermedad producida por la falta de vitamina c?
Escorbuto
Cuál es la clasificación de enzimas según el tipo de reacciones que catalicen? OTHILIL
Oxidorreductasas Transferasas Hidrolasas Liasas Isomerasas Ligasas
Cuál es la función de las enzimas?
Acelerar las reacciones celulares actuando sobre SUSTRATOS específicos que se van a transformar en productor.
Como funciona una enzima?
Formando un complejo enzima-sustrato que estabiliza el estado de transición
El interior de las proteínas es hidrofílico
V o F
Falso es hidrofóbico
La unión entre enzima-sustrato se realiza en una zona denominada
Centro activo
Como funciona la enzima desde un punto de vista de energía?
Rebajan la energía de activación
Se pueden producir enlaces covalentes transitorios entre la enzima y el sustrato?
V o F
Verdadero
Qué estudia la cinética química?
Las velocidades de la reacción
Qué establece la ecuación de Michaelis-Menten?
Explica el comportamiento de las reacciones en las que la concentración de complejo enzima-sustrato permanece constante y la concentración de sustrato es muy superior a la de la enzima.
Qué es K-cat?
Representa el número de moléculas de sustrato que resulta transformado en producto en unidad de tiempo con una sola molécula de enzima cuando la concentración de sustrato es elevada.
Qué es K-m?
Es la constante de Michaelis-Menten.
Qué es V-max?
Velocidad máxima obtenida con concentraciones de sustrato elevadas
Las enzimas se pueden inhibir unicamente de forma irreversible?
V o F
Falso también de forma reversible
Qué tipo de inhibidores reversibles hay?
Competitivos, no competitivos y acompetitivos
Qué factores externos pueden alterar la actividad enzimática?
Temperatura y pH
Qué es un cofactor?
Cationes metálicos que es necesario para el correcto funcionamiento de una enzima
Qué es una coenzima?
Molécula orgánica necesarioa para el correcto funcionamiento de una enzima?
La porción proteica que requiere un componente adicional se llama?
Apoenzima
La apoenzima+cofactor o coenzima se llama?
Holoenzima
Dentro del centro activo hay ciertos aminoácidos que intervienen en la unión del sustrato a la enzima y se denomina…
Residuos de unión
Una reacción química espontánea es endergónica o exergónica?
Exergónica
En una reacción exergónica la energía basal del sutrato es _____ que la del producto
Mayor
Qué se tiene que superar para que una reacción ocurra
Una barrera energética llamada energía de activación
Qué es el estado de transición?
Es una estructura que está sufriendo una transformación y que no tiene las propiedades ni del sustrato ni del producto.
Las enzimas aceleran la reacción a través de 2 mecanismos:
La formación de enlaces covalentes
La creación de interacciones no covalentes que van acompañadas de una liberación de energía llamada energía de unión o de fijación
La velocidad de cualquier reacción está determinada por…
La concentración de sustrato y la constante de velocidad
Quien y cuando se postulo el modelo “llave cerradura”
Emil Fischer en 1894
Las interacciones entre enzima y sustrato son de naturaleza
No covalente
Que propone el modelo de encaje inducido
La interacción entre ambas moléculas hace que la proteína sufra un cambio de conformación que permite la interacción entre enzima y estado de transición
Qué es K-s
Constante de disociación del complejo E-S
¿Qué es calor?
Energia que se manifiesta por un aumento de T°
Diferencia entre calor y energía térmica
Energía térmica es energía cinética que posee un sistema
Calor es el resultado de un aumento de T°
¿Qué es un sistema?
Toda parte del universo que se delimita mentalmente, es decir, la porción de materia cuyas propiedades se estudian (Célula, reacción química, etc)
¿Qué es un sistema abierto?
Un sistema que intercambia energía y materia
¿Qué es un sistema cerrado?
Un sistema que intercambia energía pero no materia
Qué funciones desempeñan loas hidratos de carbono?
Almacenamiento y obtención de energía
Formación de estructuras
Comunicación celular
Los monosacaridos se clasifican en…
En función de su grupo funcional en aldosas y cetosas
La presencia de carbonos asimétricos determina que los monosacáridos presentan…
Esteroisomería
Qué son los enantiómeros?
Moléculas cuya imagen especula no es superponible
En la naturaleza sólo un enantiómero es biológicamente activo, cuál es la forma presente en los hidratos de carbono naturales?
La forma D
Como se diferencian los epímeros?
En la disposición de los sustituyentes de un solo centro quiral
¿Qué es un sistema aislado?
Un sistema que no intercambia ni materia ni energía
¿Qué es la termodinámica?
Ciencia que describe & relaciona las propiedades físicas de la materia y sis intercambios de energía
Existen muchas formas de energía & se pueden ___ entre sí
interconvertir
Ley de la conservación de la energía
La energía no se crea ni se destruye, solo se transforma
Proceso que libera calor
Exotérmico
Proceso que absorbe calor
Endotérmico
¿Qué es la entropía?
Medida del grado de desorden o de libertad de un sistema
La ____ de una reacción química se calcula a partir de las entropías estándar de los reactivos y productos
Entropía estándar
¿Qué es un indicador de pH?
Sustancia que permite medir el pH de un medio
¿Qué es un ácido según Arrhenius?
Electrolitros que contienen H &que, disueltos en H2O, producen una concentración de iones Hidrógeno o protones H+
¿Qué es una base según Arrhenius?
Sustancia que, disuelta en H2O, produce un exceso de iones Hidróxido OH-
¿Qué es un ácido según Bronsted-Lowry?
Cualquier sustancia que tenga la capacidad de perder o donar un protón o hidrogenión H+
¿Qué es una base según Bronsted-Lowry?
Sustancia capaz de ganar o aceptar un protón o hidrogenión H+
¿Qué es un ácido conjugado?
Sustancia que resulta al añadir un protón H3O+ a una base
¿Qué es una base conjugada?
Molécula que procede de un ácido por captación de un protón H+, y que, en cuanto más fuerte el ácido, más débil la base conjugada, y viceversa
¿Qué es una sustancia anfotérica?
Compuesto que puede reaccionar tanto como un ácido como una base
¿Qué es disociación?
Separación de un compuesto en dos o más especies, generalmente iónicas
¿Qué es ionización?
Procedimiento por el cual se generan iones, un átomo o molécula que dispone de carga eléctrica a partir de ganar o perder electrones
¿Qué es titulación?
Procedimiento para determinar la molaridad de un ácido o base
¿Qué es el pH?
Coeficiente que indica el grado de acidez o basicidad de una solución acuosa.
Escala básica del pH
1-6= ácido 7 = neutro 8-14 = base
¿Qué es el pOH?
Es análoga a la expresión de pH
¿Cómo se calcula el pOH?
pOH = pH -14
¿Qué es un electrolito?
Sustancia que, disuelta, conduce corriente eléctrica gracias a que estan formados, total o parcialmente, por iones
82.5g de alcohol etílico (C2H6O) en 450 mL de solución
Calcule la molaridad
3.98M
Los monosacáridos en solución acuosa adoptan una configuración ___ que presenta un nuevo carbono asimétrico, denominado ___
Ciclada
Anomérico
¿Cuál de las siguientes interacciones no se considera una interacción no covalente?
Interacciones iónicas
Enlaces carbono-carbono
Enlaces carbono-carbono
La lactosa es un disacarido formado por glucosa y frucosa.
V
F
Verdadero
Un ribosoma es un organelo.
V
F
Falso
EL hnRNA sufre modificaciones a través del
Espliceosoma
El DNA es una doble hélice…
Antiparalela, dextrógira
El estado de un sistema se define por algunas propiedades, como su composición, volumen, temperatura y presión. Estas propiedades son llamadas:
Funciones de estado
El tRNA es una molécula de RNA que se encarga de
Transferir aminoácidos
Una muestra de DNA contiene una concentración del nucleótido adenina de 0.3mM ¿Cuál es la concentración del nucleótido timina?
0.3mM
Las liasas..
Catalizan la escisión reversible de enlaces carbono-carbono
Las oxidorreductasas…
Catalizan reacciones de oxidación y reducción
La Ks indica
La constante de disociación del complejo ES
Un inhibidor reversible es
Una molécula que se une a la enzima mediante interacciones NO covalentes y las inhibe
Un cofactor es
Un CATIÓN metálico en cuya presencia la enzima puede hacer su función catalizadora
Clasificación de las proteínas según sus niveles de organzación
globulares y fibrosas
Las hidrolasas…
Transfieren un grupo -OH desde el agua a otro sustrato
Las isomerasas…
Catalizan reacciones que suponen un movimiento de un grupo o doble enlace dentro de la molécula
Las transferasas…
Transfieren un grupo química de una molécula a otra
Un reactivo electrófilo es
Un reactivo que tiene gran avidez por centros de elevada densidad electrónica
Un reactivo nucleófilo es
Un reactivo que tiene gran afinidad por zonas con una baja densidad electrónica
Las enzimas son…
Proteínas que combinan diferentes mecanismos químicos para disminuir la energía de activación y aumentar la velocidad de la reacción
El estado de transición es
Un estado transitorio inestable que resulta estabilizado por los residuos del centro activo
Las ligasas
Catalizan la formación de enlaces carbono-carbono y requieren energía a través de hidrolizar ATP
Una coenzima es
Una molécula orgánica que transporta de manera transitoria grupos funcionales durante la reacción catalizada por la enzima
Un dominio puede definirse como
La combinación de varios motivos, con una estructura terciaria y una función específica
Una curva típica de cinética enzimática muestra
Una primera etapa lineal, una segunda etapa curvilínea y una última etapa de meseta
La Vmax indica
La velocidad máxima teórica que se obtiene en una reacción catalizada en condiciones determinadas
La Kcat indica
La constante de velocidad de la limitante de transformación del complejo ES en E & P