Biologie cellulaire Flashcards
1ère théorie cellulaire
1)Tout les organismes vivants sont composés d’une ou plusieurs cellules
2)Une cellule provient tjrs de la division d’une cellule préexistante
Quelle est l’utilité de cette technique?
Microscopie électronique
(MET)
Permet de visualiser les petites structures
On peut voir les organites
Mieux que le microscope photonique (électrons + petits)
Qui a trouvé le modèle de la structure d’ADN?
Watson et Crick, grâce aux travaux de Rosalind Franklin
Quelles étaient les conditions de l’atmosphère primitive?
De nombreuses molécules gazeuses ayant la possibilité de produire des molécules organiques, des nucléotides et des acides aminés
Quelles sont les nucléotides de l’ADN?
Adénine
Thymine
Guanine
Cytosine
Quelles sont les nucléotides de l’ARN?
Adénine
Uracile
Guanine
Cytosine
Qu’est-ce qui rend l’ADN très stable?
Liaisons d’hydrogène entre les deux brins de l’ADN
Pourquoi la stabilité de l’ADN est intéressante?
Lui permet de se conserver sur plusieurs années sans être trop modifiée
Pourquoi l’ARN est considéré instable?
Molécule simple brin
Demi-vie très courte
Formation de structure secondaire
Elle se dégrade facilement et rapidement
Pourquoi l’ARN peut prendre différentes formes?
Un seul brin, les nucléotides veulent quand même se lier avec leurs copains complémentaires. Alors l’ARN va se torsionner et se plier pour créer ces liens
L’ARN peut-elle avoir une activité catalytique?
Pourquoi?
Oui, grâce à son instabilité. Elle peut réagir plus facilement que l’ADN qui est stable
De quoi est principalement formé un acide aminé?
D’un groupement amine, un groupement carboxyle et d’un carbone alpha avec chaine latérale variable
De quoi sont formés les protéines?
D’acides aminés
Quels types de liaisons relient les acides aminés qui forment les protéines?
Liaisons peptidiques (liaisons covalentes)
Vrai ou faux?
Les acides aminés sont plus diversifiés que les nucléotides
Vrai!
20 acides aminés vs 5 nucléotides
Quelle molécule a le plus grand pouvoir de catalyse?
(ADN, ARN, protéines)
1)Protéine
2)ARN
3)ADN
Quelles sont les structures des lipides dans un environnement aqueux?
Micelle ou Bicouche
Comment sont les triglycérides?
Entièrement hydrophobes
Comment sont les phosphoglycérolipides?
Tête hydrophile (Groupe Phosphate)
Queue hydrophobe (Longue chaine carbonée)
À quoi pouvait ressembler l’ancêtre de LUCA?
1-Bicouche lipidique
2-ARN (car c’est une forme plus simple que l’ADN)
3-Protéines
Quel était le matériel génétique de base des premières cellules?
L’ARN, à cause de sa simplicité
Vrai ou faux?
Les virus sont vivants
Faux! Les virus doivent se lier à un vivant pour “vivre”
Pourquoi la majorité des cellules sont à ADN aujourd’hui?
Car l’ADN est plus stable et au cours de l’évolution de la cellule, elle se complexifie et nécessite alors plus de stabilité
Si l’ADN emmagasine l’information génétique, à quoi sert l’ARN?
Fonction de messager
Quel est le trajet de l’ADN à la protéine?
1- ADN se fait transcire pour devenir ARN messager
2- ARN messager se fait traduire pour devenir la protéine
OU
2-ADN se fait transcrire pour devenir ARN fonctionnel
Différence entre Procaryotes et Eucaryotes
Procaryotes: Arrivés en premier et pas de noyau
Eucaryotes: Possèdent un noyau
Quelles sont les cellules les plus anciennes existantes?
Les bactéries
Comment est fait l’échange d’ADN chez les bactéries?
Par échange de plasmides
(Plasmide est plus petit que le chromosome bactérien)
À quoi sert le glycocalyx des bactéries?
Sert de colle et permet à la bactérie de s’accrocher
Que possèdent toutes les bactéries?
1- Paroi gram + ou gram -
2- ADN sous forme circulaire libre dans le cytoplasme
3- Ribosomes
4- Membrane plasmique
Pourquoi on classifie les Archaea chez les Procaryotes?
Car elles ne possèdent pas de noyau
Qu’est-ce que les Bactéries et les Archaea ont en différence?
1-Paroi différente
2-Éléments génétiques et certaines protéines
3-Ribosomes sont très différents
Comment certains procaryotes anaérobiques sont-ils devenus aérobiques?
En “inventant” la phosphorylation oxydative
Qu’est-ce qui distingue les Eucaryotes des Bactéries?
Présence d’un noyau et une multitude d’organites
Vrai ou faux?
Le volume d’une cellule augmente plus vite que sa superficie
Vrai!
Quel est le rôle de l’invagination de la membrane plasmique?
1-Sert à augmenter la surface de contact avec l’extérieur
2-Sert à protéger le génome (ADN)
L’invagination de la membrane plasmique crée…?
Le réticulum endoplasmique
(systèmes membranaires et noyau)
Création de la mitochondrie
Cellule eucaryote anaérobique phagocyte une bactérie aérobique.
Ne la dégrade pas et en fait une alliée
Création du chloroplaste
Cellule eucaryote aérobique phagocyte une cellule procaryote photosynthétique
Ne la dégrade pas et en fait une alliée
Pouquoi création mitochondrie puis création chloroplaste?
1-Tous les Eucaryotes ont des mitochondries, mais juste les végétaux possèdent des chloroplastes
2-Théorie la plus simple pour expliquer l’apparition des eucaryotes
Vrai ou faux?
La cellule végétale ne possède que des chloroplastes
Faux! La plante fait de la photosynthèse masi elle respire aussi. Elle possède donc des chloroplastes ET des mitochondries
Qu’est-ce qui apporte la théorie de l’endosymbiose?
ADN: Indépendant du génome, circulaire (comme dans une bactérie!)
Membranes: Mitochondries possèdent 2 membranes, ce qui laisse croire qu’il y a eu phagocytose d’une bactérie
Par quels moyen/techniques l’endosymbiose a été prouvée?
1-Électrophorèse
2-Microscopie
Quelles sont les deux lois de la thermodynamique?
1-L’énergie est tjrs conservée: dans chq transformation, l’énergie est conservée
2-L’entropie d’un système isolé augment ou reste constante: elle ne peut que croître durant une transformation
Vrai ou faux?
De l’énergie est nécéssaire pour combattre l’entropie
Vrai!
Créer le désordre est une réaction spontanée, alors que remettre à l’ordre nécessite de l’énergie
Comment les cellules maintiennent l’ordre malgré l’entropie?
Flux constant de réactions chimiques, donc métabolisme
Vrai ou faux?
L’énergie dégagée par le catabolisme n’est pas conservée
Faux!
L’énergie est conservée, soit dans les nouvelles cellules ou dans la chaleur créée par la cellule
Vrai ou faux?
L’énergie dissipée par la cellule sous forme de chaleur augmente l’entropie totale
Vrai!
Où se trouve l’énergie?
A + B = AB
Produits
Où se trouve l’énergie?
AB = A + B
Réactifs
Qu’est-ce que l’état d’équilibre?
Lorsque G réactifs = G produits
Une réaction spontanée possède un deltaG…
Négatif
(Réaction exergonique, catabolisme, libération de chaleur)
Une réaction non spontanée possède un deltaG…
Positif
(réaction endergonique, anabolisme)
Où se trouve généralement l’énergie dans les molécules?
Entre les liaisons
(Molécule + grosse =
+énergie emmagasinée = molécule moins stable!)
Comment une enzyme accélère une réaction chimique?
En diminuant l’énergie d’activation de la réaction
(Le niveau d’énergie à atteindre pour que la réaction se produise est plus bas, donc plus accessible plus rapidement)
De quoi dépend le deltaG de la réaction?
1-Énergie intrinsèque (deltaG 0)
2-La concentration des produits et des réactifs
Équation de du deltaG de la réaction
deltaG(rxt) = deltaG 0 + 1,4log(concentration produits/concentration réactifs)
Vrai ou faux?
Plus le deltaG0 d’une réaction est négatif, plus il faut de produits pour atteindre l’équilibre
Vrai!
Vrai ou faux?
Plus le deltaG0 d’une réaction est positif, plus il faut de réactifs pour atteindre l’équilibre de la réaction
Vrai!
Vrai ou faux?
Liaisons d’hydrogène est une interaction forte entre deux molécules polaires
Faux! C’est une liaison faible
Que se passe-t-il avec les interactions hydrophobes dans un milieu aqueux?
Les groupements hydrophobes sont responsables du repliement des protéines vers l’intérieur
Comment sont les chaînes carbonées?
1-Longues et rectilignes (parfois ramifiées)
2-Ce sont les squelettes des macromolécules biologiques
Quel est le rôle de l’histone chez l’ADN?
Elle compacte l’ADN pour former le nucléosome
Quelle est l’utilité de cette technique?
Cristallographie aux rayons X
On retire toute l’eau pour que les atomes ne bougent pas
On mesure les angles et les intensités des rayons diffractés
On peut déterminer la position moyenne des atomes, leur nature et leurs liaisons chimiques
Monomère des Protéines
A. Aminés
Polymère des Nucléotides
A. nucléiques
Quelle liaison relie les nucléotides qui forment le brin d’ADN?
Liaisons covalentes (Phosphodiesters)
Quelle est l’utilité de cette technique?
Purification des acides nucéiques
On purifie l’ADN puis on peut:
1-Amplification par PCR
2-Séquençage
3-Transferts Southern
Quelle est l’utilité de cette technique?
Électrophorèse sur gel d’agarose
Permet de séparer les fragments d’ADN en fonction de leur taille
Qu’est-ce qui permet la migration des a.nucléiques pour l’électrophorèse sur gel?
A. nucléiques sont des molécules polaires chargées négativement
On utilise cette charge pour les faire migrer
Quelle liaison unit la structure primaire des protéines?
Liaison peptidique
Une protéine commence tjrs par … et termine par …?
Commence par groupement amine et se termine par un groupement carboxyle
Vrai ou faux?
La structure primaire d’une protéine est fonctionnelle
Faux!
Comment se plie les structures secondaire des protéines?
1-Hélice alpha
2-Feuillet bêta
3-Reverse turn
Quelles structures des protéines sont fonctionnelles?
Tertiaires et Quaternaire
Qu’est-ce que la structure tertiaire d’une protéine?
Agencement d’hélices alpha et de feuillets bêta
Vrai ou faux?
Un domaine donné se replie tjrs de la même façon
Vrai!
Quelle est l’utilité de cette technique?
Purification d’une protéine
On purifie par chromatographie sur colonne, se sépare selon leur polarité
Vrai ou faux?r
Il y a seulement la chromatographie d’affinité qui permet de purifier suffisament une protéine
Vrai!
Sinon, il faut combiner deux ou plusieurs types de chromatographies
À quoi sert de “His-tagger” une protéine?
On clone le gène qui clone pour protéine X dans un plasmide bactérien avec un His-tag
Ensuite, on extrait les protéines de la bactérie et on purifie par chromatographie d’affinité
Quelle est l’utilité de cette technique?
Électrophorèse sur gel de polyacrylamide
Sépare les protéines selon leur taille
Utilité du SDS
Détergent puissant chargé négativement
(Rend les protéines négatives pour rendre la migration possible)
Utilité beta-mercaptoéthanol
Agent réducteur
(défait les ponts S-S, donc dénature)
Séquençage d’une protéine
1-Protéines coupées = digérées en peptides
2-Séparation des peptides
3-Analyse de la masse de chq résidu de chq peptide
4-Comparaison des masses théoriques des a.aminés et des massex expérimentales trouvées
On détermine la séquence la plus probable
Microscopie photonique
Limites de résolution à cause de la longueur d’onde de la lumière.
On peut observer le vivant
Microscopie électronique
Permet une plus grande résolution car les électrons sont bcp plus petits que les photons
On observe ce qui est mort
À quoi sert la MEC?
Fournit un apport structurel et biochimique pour les cellules environnantes
De quoi est composé la MEC des bactéries
Paroi: peptidoglycane
Comment est la paroi des bactéries
Solide, ferme, flexible et poreuse
Ne limite pas le trafic des molécules
De quoi est formé la grile de la paroi des bactéries
Longues chaînes de disaccharides aminés (NAM et NAG)
Tétrapeptides
Pourquoi les a.aminés Glu et Lys sont utile dans la grille de la paroi bactérienne?
Elles sont petites et font des liens avec les molécules d’eau
Quels sont les types de parois bactériennes
Gram + et Gram -
Quelle est la coloration des gram +
Mauve
Quelle est la coloration des gram -
Rose
Pourquoi les gram + et les gram - sont de différentes couleurs
1ere membrane: Peptidoglycane conserve le mauve chez les Gram +
2e membrane (juste chez les Gram -): Le mauve peut sortir plus facilement de la couche de peptidoglycane car elle est plus mince et plus faible à cause de la présence de la 2e couche, lipopolysaccharide
De quoi est composé la paroi des cellules végétales
Cellulose, pectine et lignine
Comment est la paroi des cellules végétales
Solide et peu élastique
Quels sont les types de parois chez les cellules végétales
Primaire et secondaire
De quoi est composé la paroi primaire
Fibres de cellulose liées de manière covalente avec la pectine
De quoi est composé la paroi secondaire
Comme la primaire avec la lignine en plus, ce qui renforce la paroi
À quoi sert la paroi secondaire
Cellules qui font le transport de l’eau, comme des tuyaux qui laissent passer l’eau
Vrai ou faux?
La cellulose forme de longues chaînes qui se regroupent pour former des microfibrilles puis des fibres
Vrai
Comment sont positionnées ces fibres de cellulose
Perpendiculairement les unes par rapport aux autres
De quoi est composée la matrice des cellules végétales
Pectine, hémicellulose, glycoprotéines et de composés phénoliques
Quel est l’avantage de la plante de posséder une MEC avec des molécules très hydrophobes
Lui permet de garder son eau
Turgescence
Beaucoup d’eau
Paroi empêche la cellule d’exploser
Plasmolyse
Pas assez d’eau
La paroi empêche la cellule de s’écraser
Lignine
Polymère d’unités de phénylpropanol
Que colore la safranine?
(végétaux)
Se lie à l’ADN et à la lignine
Se colore en rouge
Que colore le “fast-green”?
Le cytoplasme
Colore en vert
De quoi est composée la MEC des cellules animales?
Liquide, d’un gel et de fibres
Est-ce que la MEC des cellules animales est composée d’une paroi?
Non
De quoi est formé le gel dans la MEC des cellules animales
GAG
(hydrophile, ce qui lui donne sa forme de jello)
Où est situé le gel dans la MEC
Il remplit l’espace
À quoi sert la charge négative du gel
À attirer les ions Na+ et l’eau
Permet la turgescence
Qu’est-ce que protéoglycane?
GAG qui s’est lié de manière covalente avec des protéines
Qu’est-ce que l’arthrose
Maladie où le cartilage articulaire s’effrite avec le temps
Sa MEC est composée de GAG (acide hyaluronique) et de fibres
Dans l’arthrose, l’acide hyaluronique devient moins abondant
Des injections d’a. hyaluronique soulage la douleur car on “remplace” l’éponge
Comment est la structure du collagène
Longue, rigide et hélicoidale à 3 brins
De quoi est formé la triple hélice de collagène
De 3 polypeptides
Vrai ou faux
Chque hélice de collagène fait un tour par 3 a. aminés
Vrai
Pourquoi y a-t-il bcp de Pro et de Gly dans les hélices de collagène
Ils sont tous les deux très petits
Pro permet la rotation
Gly peut se placer entre les a. aminés et donner la forme hélicoidale
Qu’est ce que le syndrome d’Ehlers-Danlos
Syndrome causé par des mutations dans les gènes codant pour les collagènes ou pour les GAG
Qu’est-ce que l’élastine?
Protéine hydrophobe, riche en proline en en glycine
Permet l’élasticité du tissu
Pourquoi retrouve-t-on bcp d’élastine das la MEC des artères, du coeur et de la vessie?
Ces organes doivent varier leur taille, donc ont besoin d’une structure élastique
Vrai ou faux
La fibronectine est une protéine intracellulaire
Faux, elle est extracellulaire
À quoi sert la fibronectine
Agit comme une colle qui lie le collagène et les GAG avec les cellules
La fibronectine est-elle un polymère?
C’est un dimère
La séquence RGD est nécessaire pour quoi
Nécessaire et suffisante pour lier les cellules avec la fibronectine
Vrai ou faux
Les intégrines sont des protéines transmembranaires
Vrai
À quoi servent les intégrines
Lient de manière réversible la séquence RGD de la fibronectine
Les intégrines ont une fonction de … et de …
Adhérence et récepteurs
Vrai ou faux
Les deux côtés de la membrane plasmique sont interchangeables
Faux, chq couche a sa propre composition lipidique et protéique
Que veut dire “saturés”
Qu’il n’y a pas de liens doubles, juste des liens simples
Qu’est-ce que glycolipides
On remplace le groupement phosphate par des surcres
Les glycolipides participent à la formation du glycocalyx
Comment sont les phospholipides qui forment les micelles
Forme conique
Possède une queue hydrophobe
Comment sont les phospholipides qui forment des bicouches
Forme cylindrique
Deux queues hydrophobes
Pourquoi la bicouche se referme spontanément pour former une boule
Position la plus énergétiquement favorable
Comment as-t-on prouvé la bicouche
Bain de Langmuir: un bras compresse des globules rouges déposées sur l’eau et on détermine leur superficie avant et après les avoir éclatées
Résultat: Superficie double = deux fois plus de membrane = double couche
Comment bouge les lipides dans la bicouche?
Latéralement: se fait facilement et peuvent tourner sur elles-mêmes
Flip-Flop: Plus rare, nécessite de l’énergie et une enzyme (flippase)
Vrai ou Faux
La membrane plasmique des Archaea possède une plus grand stabilité à température élevée
Vrai
Qu’est-ce qui diffère de la membrane plasmique chez les Archaea
Bicouche formée par diéthers et tétraéthers de glycérol au lieu d’un simple éther
Comment sont les chaînes de carbones liées au glyrécol
Ramifiées
Qu’est-ce qui permet de diminuer la fluidité membranaire des Archaea
La présence de tétraéthrs de diglycérol, il y a plus d’interactions donc plus dure à défaire et nécessite des températures très très très élevées
Vrai ou faux
Le cholestérol est présent seulement chez les cellules animales
Vrai
À quoi sert le cholestérol dans la membrane
Régule la fluidité
Empêche la cristallisation des a.gras
Rigidifie les membranes
Diminue la perméabilité
Permet la formation des radeaux lipidiques
Qu’est-ce qui remplace le cholestérol chez les cellules non-animale
D’autres stérols
Rôle du glycocalyx
Reconnaissance cellulaire
Immunité
Vrai ou faux
Une glycoprotéine est une protéoglycane
Faux!
Quels sont les types de protéines membranaires
Transmembranaires
Ancrées
Périphériques
La cryofracture
On observe ce qui est mou
On congèle l’échantillon puis on coupe à froid
Cryodécapage (sublimation de la glace)
Production d’une réplique métallique à froid
Vrai ou faux
La perméabilité sélective de la membrane a tjrs lieu
Faux, seulement si la fluidité de la membrane est bien balancée
De quoi dépend la fluidité de la membrane
Composition de la membrane
Température de l’envrionnement
Solution lorsque la membrane cesse d’être fluide à cause du froid
Cholestérol fait des trous pour augmenter la fluiditié
On utilise un a.gras cis (donc “croche”) ce qui crée de l’espace et rends les interactions moins possibles et liquifie la membrane
Solution lorsque la membrane est trop fluide à cause du chaud
Cholestérol bouche des trous, ce qui diminue la fluidité
On ajoute des a.gras trans ou insaturés, ce qui augmente les interactions entres les a.gras et solidifie la membrane
Microscopie à fluorescence
Émission d’une lumière d’une certaine couleur suite à l’excitation d’une molécule fluo.
On excite la molécule pour qu’elle exprime couelur X, mais elle démontre couleur Y
À quelle protéine fluorescente fusionne-t-on la protéine d’intérêt pour suivre son parcours
GFP
Quelle expérience a été effectuée pour démontrer la mosaique fluide de la membrane
Deux cellules marquées par deux couleurs fluo. différentes ont été fusionnées.
Au début, on voit un coté vert et un coté rouge
Plus tard, on voit que les deux couleurs sont mélangées partout
Comment peut-on quantifier la fluidité
Technique du FRAP
(récupération de la fluorescence après photodécoloration)
Lorsqu’il fait froid, le T 1/2 est…
Plus long!
Lorsqu’il fait chaud le T 1/2 est…
Plus court!
Qu’est-ce qui permet une plus grande fluidité à des températures basses?
A.gras cis
Qu’est-ce qui permet une fluidité moins grande à des températures élevées
A.gras trans
Agrégats protéiques
Les protéines membranaires finctionnent sous forme de gros complexes protéiques
Pour que le complexe soit fonctionnel, chacune de ses protéines doivent être présentent au bon endroit
Vrai ou faux
Le complexe protéique peut bouger dans son ensemble tout comme ses protéines à l’état individuel
Faux! Le complexe peut bouger mais pas ses protéines à l’état individuel
Microscopie à force atomique
(MFA)
Permet de visualiser la topographie de la surface d’un échantillon
Pointe montée balaie la surface d’un échantillon et rayon laser permet de détecter les changement dans la hauteur de la pointe
Radeaux lipidiques
Longues chaînes d’a.gras saturés associées ensemble, bouge ensemble et permet l’ancrage de protéines membranaires
Comment peut-on observer les radeaux lipidiques
Par MFA, ils augmentent l’épaisseur de la membrane
Pourquoi une Archée possède-t-elle des taches de couleur sur sa membrane plasmique
Un pigment, rétinal, est attaché à la bactériorhodopsine (protéine membranaire)
Bactério. se regroupe sur les radeaux lipidiques, ce qui cause la formation de taches
Jonctions cellulaires étanches
Formées de protéines membranaires
Se lient fortement aux domaines extracellulaires voisins
Pas ou très peu de mouvement possible
Association avec le cytosquelette
Filaments de spectrine s’assemblent en réseau sous la membrane plasmique
Donnent la forme caractéristique des globules rouges
Vrai ou faux
Ce qui est lié aux filaments de spectrine ne peut pas bouger
Vrai! Seulement ce qui n’est pas lié au réseau peut bouger
Que doivent posséder les protéines transmembranaires?
Courtes régions non-polaires pour traverser la membrane hydrophobe
Hélice alpha peut-elle traverser la membraen
Oui, si elle possède plusieurs a.aminés non polaires consécutifs pour garder le domaine membranaire dans la membrane
Les feuillets beta amphiphiles peuvent-ils traverser la membrane
Les tonnaux beta peuvent, car les chaines latérales non-polaires sont orientées vers l’extérieur
Diffusion
Mouvement des molécules d’une région plus concentrée vers une région moins concentrée
Osmose
Solution hypotonique vers une solution hypertonique pour atteindre isotonie
Pourquoi les transporteurs membranaires sont utile
1-Facilient la diffusion
2-Transportent des molécules dans le sens contraire de la diffusion
Deux types de transports membranaires
Transport passif (pas ATP requis)
Transport actif (ATP requis)
Vrai ou faux
Les canaux (pores) peuvent être saturés
Non
Comment agit une protéine porteuse
Comme une enzyme
Se lie à un substrat spécifique, change de conformation et le laisse passer vers le cytoplasme
Vrai ou faux
Les protéines porteuses peuvent être saturées
Vrai
Aquaporine
Canaux spécifiques à l’eau
Ne laissent passer que l’eau car…
1-taille du trou est ajustée à celle de l’eau
2-mini section hydrophobe à l’intérieur du pore qui empêche le passage d’ions
Qu’est-ce qui permet aux molécules d’eau d’entrer dans aquaporine
avancent une par une grâce à la cohésion de l’eau
A.aminés spécifiques à l’int. du canal forment des liaisons H
Transporteurs d’ions
1-Canaux ioniques (passif)
OU
2-Pompes ATP-dépendantes (actif)
Que fait le filtre de sélection étroit composé de carbonyles
Distingue les K+ des Na+
Les C=O lient les K+ alors qu’ils ne lient que partiellement les Na+
Vrai ou faux
Il n’y a que ATP qui est une source d’énergie
Faux, il y a des photons et une gradient de concentration d’un autre ion
Transport symport
Transport dans la même direction que le gradient de concentration
Libère de l’énergie
Transport antiport
Transport contre le gradient de concentration
Nécessite de l’énergie
Utilité des pompes ATP-dépendantes de type P
Besoin d’un cycle phosphorylation-Déphosphorylation
Maintenir le gradient des principaux ions cellulaires
Quel bord sont pompés les Na+ et les K+
Na+ vers l’extérieur
K+ vers l’intérieur
Utilité pompes ATP-dépendantes de type ABC
(ATP-Binding Cassette)
Utile pour transporter de manière unidirectionnelle
Hydrolyse d’ATP mais pas de phosphorylation
Que permet la lisaison du ligand au transporteur
(pompes ABC)
Permet sa dimérisation
Fibrose kystique
Maladie où il y a mutation du gène codant pour la protéine CFTR
CFTF = transporteur de type ABC pour Cl-
La sortie du Cl- permet le mouvement de l’eau vers l’ext. et hydrate le mucus
Avec la mutation, le transporteur est non fonctionnel et le Cl- reste dans les cellules et le mucus n’est plus hydraté
Type V
Membrane des vacuoles et lysosomes
Utilise l’ATP
Type F
Membrane interne des mitochondries, thylakoides et celle des bactéries
Fabrique ATP
À quel processsus biologique le type F sert-il
Respiration cellulaire
À quel processus biologique le type V sert-il
Acidifier le milieu (Lysosome)
Pour rétablir l’équilibre, les H+ cherchent à revenir vers la matrice. Ils doivent passer par quoi
Sous-unité F0 de ATP synthase
Rotation de la F0
1-H+ entre dans C-ring
2-À chq nouveau H+ qui entre, il y en a un qui sort
3-Le mouvement des H+ permet la rotation de la F0
4-Quand H+ arrive à sous-unité a, ils sont propuls vers la matrice
Vrai ou faux
Lorsque F0 troune, la sous-unités y tourne aussi
Vrai
Que modifie la rotation de la sous-unité y
Les trois sites catalytiques situés sur la F1
Que possède chq site catalytique de ATP synthase
Formé sous-unité alpha et beta
Lient ADP et Pi
Quelles sont les conformations des sites catalytiques
Ouverte: ADP et Pi entrent
Lousse: ADP et Pi se rapprochent
Tight: Formation ATP
Vrai ou faux
Ce sont les sous-unités alpha et beta qui tournent, les sites catalytiques ne bougent pas
Faux! c’est l’inverse
Potentiel membranaire
Différence de charge électrique de part et d’autre de la membrane plasmique
mesurée en volts
Vrai ou faux
Le potentiel membranaire prend généralement une valeur positive
Faux, elle est négative
De quoi dépend le potentiel membranaire au repos
Pompe Na+/K+ et canaux passifs à K+
Rôle pompe Na+/K+ potentiel au repos
Maintient les concentrations de Na+ très bas
Fait entrer le K+ pour équilibrer
Rôle canaux de fuite K+ au potentiel de repos
K+ quitte la cellule selon son gradient de concentration
Entre dans la cellule selon son gradient électrique
Pourquoi dit-on que les K+ sont indécis
Rester à l’intérieur pour équilibrer charge électrique
OU
Quitter pour équilibrer sa concentration
Comment bougent les K+
Selon leur équilibre électrochimique
Les K+ laissent une charge négative en sortant de la cellule
Le gradient de K+ donne…
Potentiel membranaire de repos
Le gradient de Na+ est utilisé pour…
1-le mouvement des solutés
2-Maintien de l’isotonie (garder la forme)
3-Transmission des signaux électriques
Comment fonctionne la transmission de signaux
1-Stimulus induit ouverture d’un canal ionique Na+
2-Membrane se dépolarise à cet endroit spécifique
3-Ouverture des canaux voltage-dépendants adjacents
Propagation de la vague de dépolarisation
Les canaux Na+ s’ouvrent et se ferment en fonction de quoi
Voltage
Qu’est-ce qui permet au canal Na+ v-d de s’inactiver
Son domaine cytoplasmique
Pourquoi le PA se propage le long de l’Axone
Dépolarisation locale permet d’activer les canaux voltage-dép. voisins
Que cause l’arrivée du PA dans les branches terminales du neurone
Sécrétion des signaux chimiques neurotrasmetteurs
Chez les bactéries, le gradient de H+ est utilisé pour…
1-Génération ATP
2-Rotation du flagelle (tourne en spirale)
3-Symport des petites molécules
Monomère de actine-F
actine-G
Utilité générale de l’actine
Support de la membrane
Donner la forme à la cellule
Comment est actine-Gq
globulaire et un monomère
Comment est actine-F
filamenteuse et polymère
Vrai ou faux
Les filaments d’actine sont dynamiques
Vrai, ils peuvent se former et se déformer
change de forme entre actine-G et actine-F
Vrai ou faux
La longueur des filaments est stable
Faux, elle varie et est modulaire
Pourquoi actine-G s’assemble spontanément en filament
plus stable
concentration de monomères élevée
Vrai ou faux
Les côtés + et - de l’actine G est lié à ses charges
Faux!
Quel côté de actine-G possède une fente pour loger la molécule d’ATP
Coté (-)
Pourquoi on dit que le filament est “polaire”
Chq extrémité est différente
De quel côté le filament s’allonge généralement
Coté (+)
Vrai ou faux
L’hydrolyse d’ATP ne sert pas à la polymérisation
Vrai!
Courbe poly. = agumente vite
Courbe hydrolyse = augmente graduellement
De quel côté la dépolymérisation s’effectue plus facilement
Coté (-)
Pourquoi polymérisation coté +
Plus énergie de libérée
Coté - libère moins énergie car il a absorbé l’énergie de l’hydrolyse
Polymérisation dépend des concentrations
Bcp actine-G = sur les deux cotés
Peu actine-G = sur le coté +
Pourquoi dépolymérisation coté -
Car coûte moins cher en énergie à produire
Dépolymérisation dépend des concentration
Bcp actine-F = dépoly. sur 2 cotés
Peu actine-F = dépoly. sur coté -
Étapes pour former filament actine in vitro
Nucléation: lent, produit noyau actine-G stable
Élongation nette
État stable: assemblage et désassemblage des monomères
Complexe ARP est composé de…
7 protéines
Que permet ARP
Formation de nouvelles branches sur le réseau existant
Façons de dépolymériser son réseau d’actine
1-Diminuer la concentration intracellulaire actine-G
2-Utiliser protéines qui empêchent la poly. ou promouvoir la dépoly. ou déstabiliser la structure d’actine-F
Vrai ou faux
Il est facile de modifier rapidement la concentration de l’actine-G intracellulaire
Faux, il est plus facile de contrôler l’expression des protéines qui aident à la polymérisation ou à la dépolymérisation
Protéine qui aide la polymérisation
Profiline
Protéine qui aide à la déplymérisation
Thymosine
Que favorise la cytB chez les champignons
La dépolymérisation du réseau d’actine
Où se trouve les filaments d’actine
Cortex cellulaire, regroupés en filet
Que font les faisceaux d’actine-F
Participent à la formation des jonctions intercellulaire des épithéliums et dans l’ancrage à la MEC
Dans les jonctions adhérentes, les … sont liés à … qui se lient à …
Filaments d’Actine
Protéines adaptatrice
Protéine transmembranaires (cadhérines)
Les fibroblastes sont ancrés à la MEC par…
Intégrines
Actine des bactéries
MreB
Pourquoi les filaments intermédiaires sont “non polaires”
Extrémités identiques
Les FI sont plus stables que le réseau d’actine
Oui, grâce aux nombreuses liaisons entre les tétramères
Types de FI
lamines nucléaires
vimentines
neurofilament
kératine
Comment les FI lient les cellules ensemble
Desmosomes
Comment les FI lient le tissu conjonctif
Hémisdesmosome
Protéine transmembranaire impliquée pour les desmososmes
cadhérines
Protéine transmembranaire impliquée pour les hémidesmosomes
Intégrines
Utilité des lamines nucléaires
Forme réseau dense dans le noyau,
Régule réplication de ADN, cycle cellulaire et organisation de chromatine
FI des bactéries
Crescentin
Les microtubules sont formés de …
13 protofilaments “polaires”
Les tubulines alpha et beta sont liés à..
molécule GTP
La sous-unité beta hydrolyse … en protofilaments
Son GTP en GDP après l’assemblage
Vrai ou faux
In vitro, la formation de microtubules est comme celle de actine-F
Vrai
Comment se passe la formation microtubules in vivo
Tous les cotés - sont liés au MTOC
Que contient MTOC
y-tubuline (lie alpha-tubuline au coté -)
La dépolymérisation des microtubules in vivo se fait de quel coté
Coté +
