Bioénergétique Flashcards

1
Q

qu’est-ce que le catabolisme?

A

dégradation

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q

qu’est-ce que l’anabolisme?

A

synthèse

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q

comment on passe d’une macromolécule à des éléments de bases (bloques)

A

catabolisme

libère de l’énergie

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

comment on passe des élements de bases (bloques) à une macromolécule

A

anabolisme

besoin d’énergie

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q

qu’est-ce que l’énergie potentielle chimique?

A

énergie stockée dans les liaisons assemblant les atomes en molécules

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q

en quoi peut être convertie l’énergie potentielle

A

énergie potentielle (hauteur) en

énergi cinétique (mouvement)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
7
Q

vrai ou faux l’énergie cinétique + l’énergie potentielle peut varier

A

faux, reste constant

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
8
Q

vrai ou faux un enzyme peut abaisser l’énergie d’activation

A

vraib

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
9
Q

vrai ou faux un enzyme peut changer la thermodynamique d’une réaction

A

faux

l’énergie des produits et des réactif ne change pas

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
10
Q

qu’est-ce qu’une réaction endergonique

A

delta G (énergie libre) est positif

Ep>Er

non-spontannée

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
11
Q

qu’est-ce que la réaction exergonic

A

delta G (énergie libre) négatif

spontannée Ep < Er

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
12
Q

qu’est-ce que l’énergie d’activation vs delta G

A

Ea: Er jusqu’à énergie max (état de transition)

donc: Emax - Er

delta g = énergie entre les produits et les réactifs

donc: Ep -Er

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q

vrai au faux lors d’une réaction exergonic on peut aussi avoir besoins d’enzyme

A

vrai

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
14
Q

comment une réaction endergonic peut-elle avoir lieu?

A

par couplage avec une réaction exergonic

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q

vrai ou faux toutes les réaction in vivo s’effectuent avec une diminution nette d’énergie libre

A

vrai

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
16
Q

vrai ou faux il peut y avoir transfert d’énergie

A

vrai l’énergie libre est une propriété d’un système

donc possibilité de couplage

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
17
Q

quel est la monnaie d’échange constante utilisé par les système ?

A

ATP

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
18
Q

vrai ou faux les réactions défavorables sont couplé avec des défavorables

A

vrai

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
19
Q

vrai ou faux on veut faire fluctuer la valeur de l’ATP

A

faux la maintenir constante

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
20
Q

nommer une liaison très riche en E

A

les liaisons phosphoanhydride (entre des P de l’ATP)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
21
Q

ATP = ? mM

ADP = ? mM

ADP = ? mM

A

ATP = 10 mM

ADP = 1 mM

ADP = 1 mM

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
22
Q

Que permet l’hydrolyse de l’ATP (équation)

A

libère de l’énergie

ATP + H20 -> ADP + Pi

delta G0= -30kJ/mol

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
23
Q

Qu’est-ce que la charge énergétique de l’ATP (avec formule)

A

[ATP) + 0,5 [ADP) = > 0,8

[ATP) + [ADP) + [AMP)

(ce qu’on vx maintenir constant = valeur ATP)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
24
Q

Quand est-ce que la plupart des enzymes seront saturés

A

109 molécules/cellule

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
25
Q

de quoi dépend la variation d’énergie libre d’une réaction?

A

de la concentration de chaque réactant

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
26
Q

vrai ou faux desfois la valeur de l’ATP change

A

vrai selon la concentration de réactant

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
27
Q

Écrire l’équation de Gibbs, signifie quoi

A

delta G = delta G0 + RT ln ([C)c [D)d/[A)a [B)b)

signifie que la valeur réelle de delta G peut changer

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
28
Q

si la concentration de P et égale à celle de réactif comment sa l’influence le delta G réelle

A

delta G réelle = delta G intrinséque

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
29
Q

dire les effets de la concentration sur delta G

A

plus tu augmente ta concentration de produit plus tu diminue le delta g réelle

plus tu augmente ta concentration de réactif plus tu augmente le delta g réelle

vis vera

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
30
Q

Definir delta g

A

variation d’énergie libre

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
31
Q

définir delta G zéro

A

variation d’énergie libre standard (25 degres celsius, 1 atm, 1M chaque réactif et produit et pH 7)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
32
Q

Qu’est-ce que R

A

R= 8,3145 J/K x mol

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
33
Q

qu’est-ce que T

A

la température en kelvin

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
34
Q

qu’est-ce que a,b,c,d

A

coefficient stoechiométrique

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
35
Q

de quoi dépend la spontanéité d’une réaction?

A

des concentrations réelles des réactifs

(une concentration avec un delta g 0 positive peut se produire in vitro en fonction de la concentration des réactifs)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
36
Q

qu’est-ce qu’on regarde pour savoir si spontané ou non

A

delta G 0 !!!!

par contre in vivo une non spontané peut se faire si la concentration des réactifs le permet

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
37
Q

vrai ou faux la spontanéité thermodynamique signifie que la réaction est rapide

A

faux

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
38
Q

vrai ou faux la véritable variation d’énergie libre d’une réaction dépend de la concentration initiale des réactants et des produits

A

vrai

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
39
Q

vrai ou faux l’énergie libre pour qu’une réaction avec delta G positif arrive doit venir d’un enzyme qui catalyse la réaction

A

faux, d’une autre réaction avec une variation de delta G négative

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
40
Q

vrai ou faux en général les réaction anabolique ont un delta G positif

A

vrai

nécessite de l’énergie

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
41
Q

Nommer des combustibles métaboliques

A

glucose, a.g, a.a

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
42
Q

Que produit l’oxydation de combustibles métaboliques (glucose, a.a, a.g)?

A

des cofacteurs réduits:

NADH, FADH2

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
43
Q

Quel type de réaction est le transfert d’électrons du NADH/FADH2 sur l’oxygène

A

réaction exergonique

où l’énergie libre est récolté pour synthétiser de l’ATP

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
44
Q

Comment l’énergie libre provenant du transfert d’électrons du NADH /FADH2 est convertie afin d’ensuite promouvoir la synthèse d’ATP

A

Convertie sous forme de gradient transmembranaire de protons

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
45
Q

Comment est le potentiel membranaire de la membrane

A

négatif (négatif vers l’intérieur et positif vers l’extérieur)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
46
Q

vrai ou faux il y a des protons qui entrent et qui sortent de la matrice

A

vrai

(va et viens entre l’espace intermembranaire et la matrice)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
47
Q

qu’est-ce qui fait sortir les protons dans l’espace intermembranaire afin de créer un gradient de protons? comment?

A

l’ensemble respiratoire

en mettant l’oxygène en eau et en accumulant les électrons (chaines d’électrons)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
48
Q

qu’est-ce qui fait entrer les protons dans la matrice selon leur gradient, comment?

A

la pompe atpase

elle utilise le fait que les protons vont selon leur gradient (car ils ont été accumulés par l’ensembles respiratoire dans l’espace intermembranaire)

(H+ vont entrer dans la matrice) pour prendre l’ADP y ajouter un phosphate et synthétiser de l’ATP

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
49
Q

pour faire quoi est utilisé l’énergie du transport d’électrons?

A

l’énergie du transport d’électrons dans l’ensemble respiratoire est utilisé pour

pour le pompage des protons hors de la mitochondrie (créer un gradient)

(dans l’espace intermembranaire)

(pour ensuite etre utilisé par la pompe ATPase pour tansporter les protons selon leur gradient dans la matrice de la mitochondrie pour synthétiser de l’ATP)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
50
Q

Dans la thermodynamique des réactions d’oxydoréduction quel est le truc mémo technique

A

LEO the lion says GER

loss of electron is oxydation

gain of electron is reduction

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
51
Q

qu’est-ce qu’une oxydation

A

perte d’électron

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
52
Q

qu’est-ce qu’une réduction

A

gain d’électron

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
53
Q

qu’est-ce qu’un agent oxydant

A

reçoit un électronn

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
54
Q

qu’est-ce qu’un agent réducteur

A

donnant un électron

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
55
Q

équation oxydation

A

réducteur -> oxydant + é

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
56
Q

équation réduction

A

oxydant + é -> réducteur

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
57
Q

vrai ou faux les électrons sont transférés individuellement en tant qu’atomes H

A

faux, les électrons sont tranférés par paires en tant qu’atomes H

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
58
Q

qu’est-ce que NAD fait?

A

NAD accepte un ion H- (hybride, un proton avec 2 é)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
59
Q

qu’est-ce que FAD fait?

A

accepte 2H (2 protons et 2 é)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
60
Q

qu’est-ce que le potentiel redox?

A

indique la tendance qu’a une substance à être réduite (donc accepter des électrons)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
61
Q

décrire les impacts des variations de E0

A

plus la valeur de E0 (potentiel redox) est grande et plus il y a de chance pour que la forme oxydée du substrat accepte des é pour être réduite

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
62
Q

vrai ou faux E0 indique une valeur dans des conditions standard

A

vrai

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
63
Q

qu’elles sont les conditions standards de E0?

A

1 atm

25 degres celsius

pH 7,0

concentration de 1M (toutes les espèces)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
64
Q

Comment sont écrites par convention les 1/2 réaction biologique importantes

A

comme une réaction de réduction

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
65
Q

écrire la 1/2 équation de réduction de l’oxygène avec son potentiel redox

A

1/2 O2 + 2H+ + 2é -> H2O

E0 = 0,816 V

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
66
Q

écrire la 1/2 équation de réduction de l’ubiquinone avec son potentiel redox

A

ubiquinone + 2H+ + 2é -> ubiquinol + H2

E0 = 0,045 V

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
67
Q

écrire la 1/2 équation de réduction du pyruvate avec son potentiel redox

A

pyruvate- + 2H+ + 2É -> lactate-

E0 = -0,185 V

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
68
Q

écrire la 1/2 équation de réduction du NAD+ avec son potentiel redox

A

NAD+ + H+ + 2é -> NADH

E0 = -0,320 V

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
69
Q

classer en ordre selon le potentiel redox du plus positif au plus négatif les 1/2 réaction de réduction du: NAD+, oxygène, ubiquinone et pyruvate

A

oxygène

ubiquinone

pyruvate

NAD+

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
70
Q

Qu’est-ce que la combustion?

A

une réaction d’oxydation

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
71
Q

comment on se protège de la combustion dans la cell et le sang?

A

en maintenant les concentrations d’oxygène faible dans le sang (5%) et dans la cellule (1%)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
72
Q

quelle équation permet de calculer le potentiel rédox réelle (l’écrire)

A

Équation de Nerst:

E = E0 + (RT/nF) ln ([ox)a/[Red)b)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
73
Q

Décrire E

A

potentiel rédox réelle

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
74
Q

décrire E0

A

potentiel rédox standart

(1 atm, 1M chaque réactif et produit, ph 7)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
75
Q

vrai ou faux le E et E0 sont souvent identique

A

Vrai

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
76
Q

définir R

A

constante des gaz parfaits

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
77
Q

définir T

A

température en kelvin

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
78
Q

définir n

A

nombre d’é transférés

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
79
Q

définir F

A

constante de Faraday

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
80
Q

Comment bouge les é

A

les é vont de manière spontanné de la substance au potentiel redox le plus faible à celui le plus fort

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
81
Q

pourquoi en biologie E est souvent très proche de E0

A

car les concentrations des espèces oxydées et réduites sont similaires, de sorte que le terme logarithmique est petit donc E est souvent très proche de E0

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
82
Q

À partir de quoi est-ce possible de calculer la variation d’énergie libre

A

de la variation du potentiel rédox

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
83
Q

Calculer la variayion d’énergie libre à partir des potentiels rédox:

pyruvate- + 2H+ + 2É -> lactate- E0 = -0,19 V

NAD+ + H+ + 2é -> NADH E0 = -0,32 V

A

les é vont spontannément de la substance avec le E0 plus faible vers celui avec le plus élevé

delta E = E élevé - Efaible

delta E = c’est aussi la variation d’énergie libre

= -0,19 - (-0,32)

= + 0,13V

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
84
Q

équation de la variation d’énergie livre à partir de la variation du potentiel rédox

A

delta G0 = - n F deltaE0

n = nbr d’é transféré

F = équivalent calorique du faraday

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
85
Q

quel est l’unité de delta G0

A

kcal/mole

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
86
Q

quel est la relation entre delta E0 et delta G0

A

ils sont inverse (du à l’équation vu avant)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
87
Q

si le delta E0 est positif est-ce une réaction exergonique ou endergonic?

A

exergonic

car cela veut dire que le delta G0 est négatif

(puisqu’ils sont inverses)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
88
Q

vrai ou faux plus delta E0 est grand plus les é ont tendance à passer d’une substance à l’autre

A

vrai

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
89
Q

vrai ou faux plus delta E0 est grand plus la variation d’énergie libre est petite

A

faux!!

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
90
Q

Est-ce que l’oxydation du NADH est exergonic ou endergonic (calcul) et est-ce que ça se fait en une ou plusieurs étapes, pourquoi?

A

exergonic et plusieurs étapes!!

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
91
Q

comment on sait si une réaction prend plusieurs étapes

A

on compare son delta G0 a celui de l’ATP et combien de fois sa entre dedans

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
92
Q

vrai ou faux les é cont spontannément de la substance au potentiel rédox le plus faible vers la substance au potentiel rédox le plus fort

A

vrai

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
93
Q

vrai ou faux les complexes respiratoire se font directement

A

faux transfert en étapes

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
94
Q

qu’est-ce qui se passe avec l’énergie libre lors du transfert des é du NADH vers l’oxygène

A

permet de mettre l’énergie libre ne réserve!!

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
95
Q

où se produit le transfert des é du NADH vers l’oxygène chez les eucaryotes vs les procaryotes

A

eucaryotes: mitochondries
procaryotes: membrane plasmique

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
96
Q

vrai ou faux si une molécule ou un atome est oxydé l’autre doit être réduit

A

vrai

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
97
Q

vrai ou faux une variation du potentiel rédox négatif indique une réaction spontannée

A

faux, une variation de potentiel redox positif indique une réaction spontannée

98
Q

vrai ou faux le NAD+ est un agent réducteur qui donne des électrons et des protons aux molécules organiques

A

faux, le NAD+ est un agent oxydant qui accepte des électrons de molécules organique pour être réduit en NADH

99
Q

combien de membranes a la mitochondrie?

A

2

membrane externe et membrane interne

100
Q

décrire la membrane externe de la mitochondrie

A

membrane externe:

perméable aux petites molécules et aux ions grâce à des porines (type de protéines) permettant la diffusion de substances allant jusqu’à 10kD

101
Q

Décire la membrane intern de la mitochondrie et son rôle

A

imperméable aux ions et molécules non chargés

transporteur d’ADP, d’a.g à longue chaines

permet la phosphorylation oxydative

102
Q

vrai ou faux il est essentielle que la membrane externe de la mitchondrie soit imperméable

A

faux la membrane interne

103
Q

qu’est-ce qui se produit dans la matrice de la mitochondrie

A

krebs

oxydation des a.g

104
Q

à quoi ressemble la composition de l’espace inter-membranaire et pourquoi?

A

à la composition du cytosol à cause des porines

105
Q

qu’est-ce que l’on retrouve dans la matrice mitochondriale?

A

NADH et FADH2

106
Q

comment la plupart du NADH et FADH2 dans la matrice mitochondriale est généré?

A

TCA (cycle de krebs)

B-oxydation

107
Q

vrai ou faux il y a du NADH dans le cytosol

A

vrai

108
Q

à quoi va servir le NADH et FADH2 dans la matrice de la mitochondrie

A

à la phosphorylation oxydative par le transport d’électron afin de faire de l’ATP

109
Q

vrai ou faux la glycolyse se fait dans le cytoplasme et change le glucose en pyruvate et libère de l’énergie

A

vrai

110
Q

vrai ou faux on peut transporter le NADH du cytosol à la mitochondrie

A

faux car pas de transporteurs de NADH

111
Q

Quels sont les deux navettes présentes sur la membrane interne de la mitochondrie? (CAR TOUT PASSE AU NIVEAU DE LA MEMBRANE EXTERNE GRÂCE AU PORINES)

A

navette glycérol phosphate

navette malate aspartate

112
Q

que permet la navette glycérol phosphate

A

utilisation du NADH au début mais plus FADH2 afin d’amener des électrons à la chaine respiratoire et produire 1,5 ATP

113
Q

Décrire le fonctionnement de la navette glycérol phosphate et équation

A

À la base, le L-Glycérol P entre vers l’espace intermembranaire de manière spontannée par la membrane externe puisqu’il est liposoluble.

(celui-ci provient du NADH + H+ oxydé par le

Glycérol-P DHc en NAD+ )

Une fois dans l’espace intermembranaire le L-Glycérol-P avec le co-enzyme mitochondrial FAD grâce à la Glycérol-P DHm libère du FADH2

Le FADH2 combiné à l’ubiquinone (Q) au niveau de la membrane interne de la mitochondrie vi la chaine respiratoire (QH2) et grâce à l’oxygène libère 1,5 ATP dans la matrice mitochondriale.

NADH+ H+ + E-FAD -> NAD+ + E-FADH2

(cytoplasmique (mito) (cytopla) (mito)

114
Q

Combien de transporteurs impliqués dans la navette glycérol phosphate

A

1 seul (transporteur FAD en FADH2)

115
Q

que permet la navette malate/ aspartate

A

utiliser le NADH afin d’amener des électrons à la chaine respiratoire et produire 2,5 ATP

116
Q

Décrire le fonctionnement de la navette malate/aspartate

A

Ici on est directement au niveau de l’espace intermembranaire.

Le NADH est oxydé et cède ses éléctrons à l’oxaloacétate menant au malate par la malate déhydrogénase

Le malate entre dans la matrice par un transporteur (antiport malate-alphacétoglutarate)

Le malate dans la matrice est oxydé en oxaloacétate (en ajoutant NAD+) par la malate déhydrogénase libérant du NADH et de l’oxaloacétate

Le NADH + H+ avec de l’oxygène donnes ses électrons à la chaine respiratoire qui produit 2,5 ATP

Alors que l’oxaloacétate formé dans la matrice réagit avec du glutamate par l’aspartate aminotransferase et forme de l’alpha cétoglutarate (est utilisé pour le transporteur (antiport malate-alphacétoglutarate permettant l’entrer de malate) et de l’aspartate

L’apartate sort de la matrice mitochondriale par le transporteur (antiport glutamate-aspartate) (cool car nécessitait glutamate à l’étape d’avant ! on veut qu’il entre)

L’aspartate dans l’espace intermembranaire combiner à l’alpha cétoglutarate (provenant de l’antiport malate alpha cétoglutarate) par l’aspartate aminotransferase permet la formation de glutamate (utiliser dans l’antiport glutamate-aspartate) et d’oxaloacétate permettant de recommencer le cycle.

117
Q

Comment les electrons passent des coenzymes (FADH2 et NADH) à l’oxygène moléculaire

A

via la chaine respiratoire

(ce qui libère beaucoup d’énergie)

118
Q

Écrire l’équation de la chaine respiratoire et en parler

A

NADH+ H+ + 1/2 O2 -> NAD+ + H2O

possible de défaire en 2 demi réactions soit celle de l’O2 et du NADH ce qui donne un potentiel redox positif et donc une différence d’énergie libre négative donc réaction spontannée et exergonique

119
Q

Combien d’électrons sont transféré à l’oxygène à la fin

A

2!!

120
Q

vrai ou faux tous les transporteurs de la chaine respiratoire se trouve dans la membrane externe de la mitochondrie

A

faux membrane interne

121
Q

les transporteurs de la chaine respiratoire sont majoritairement des?

A

protéines

122
Q

Le complexe de la chaine respiratoire a combien de complexe et de groupes indépendants mobiles?

A

5 complexes: 1, 2, 3, 4 et 5

2 groupes indépendants: Q (ubiquinone/coenzyme Q) et CytC

123
Q

que possèdent les coplexes de la chaine respiratoire afin de faciliter les transferts d’électrons

A

depend du complexe mais:

hèmes, Fe-s, flavine (FMN, FAD), ubiquinone, cytochromes

124
Q

vrai ou faux tous les complexes de la chaine respiratoire ont des propriétés de transporteur de proton

A

faux, seulement certains

125
Q

Décrire brievement dans l’ordre la chaine respiratoire

A

complexe 1 : site de liaison de NADH + H+ qui devient NAD+ (du côté de la matrice) prend en charge 2é qui permet de libèrer 4H+ dans intermembranaire (exergonic)

complexe 2: à de la succinate qui devient fumarate par succinate déshydrogénase puis grâce FAD ->FADH2, 2 é se rende à l’ubiquinone (Q)

Q: coenzyme Q: ubiquinone: recoit des é par complexe 1 et 2, donc par les 4é elle est réduite

complexe 3: accepte ubiquinol (former au Q, donc 4é) et transfère les 4é au cytochrome c réductase, libère 4H+ dans intermembranaire

complexe 4: le cytochrome c vient se lier à complexe 4 et cela libère 2H+ dans intermembranaire, cytochrome c oxydase permet de prendre 1/2O2 + 2H+ -> eau

complexe 5: ATPase/ ATP synthase qui fait entrer un H+ à la fois dans la matrice

126
Q

vrai ou faux la chaine respiratoire est très exergoniqe

A

TRÈS VRAI c’est ce qui permet d’accumuler les protons dans l’espace intermembranaire

(met de l’énergie libre de côté (en réserve) par un gradient de proton)

127
Q

apprécier la chaine respiraroire

A
128
Q

Décrire le complexe 1

nom

protomère

composantes

A

NADH-ubiquinone-réductase

25

FMN, Fe-S

129
Q

Décrire le complexe 2

nom

protomère

composantes

A

succinate-ubiquinone réductase

4

FAD, Fe-S et cytochrome

130
Q

Décrire le complexe 3

nom

protomère

composantes

A

ubiquinol- cytochrome c réductase

8

Fe-S, cytochrome

131
Q

Décrire le complexe 4

nom

protomère

composantes

A

cytochrome c oxydase

12

cytochrome et ions cuivre

132
Q

Mettre en ordre du plus lourd au moins lourd les 4 complexes de la chaine respiratoire

A

complexe 1, complexe 3, complexe 4, complexe 2

133
Q

Décrire ce qui se produit dans le complexe 1 au niveau de ses complexes protéiques

A

Le complexe 1 : FMN et Fes

NADH (c’est un donneur de 2 é)

Le site de liaison au NADH est lié au complexe 1 vers la matrice, celui-ci prend en charge 2é

NADH -> NAD+ + H+

ceci donne 2é qui entre dans le complexe 1 au niveau du bras de la matrice pour aller sur le cofacteur FMN puis vers Fe-S (1 é à la fois) puis N-2 puis quand les 2é se joignent à Q avec 2H+(provenant de la matrice) cela donne QH2 et permet l’éjection dans l’espace intermembranaire de 4H+

134
Q

que se passe-t-il si ajoute H+,H- à FMN

A

FMNH2 (passe de oxydé à totalement réduit)

135
Q

Que devient FMNH2 si enleve H+ et é

A

devient FMNH* (passe de totalement réduit à réduit)

136
Q

que se passe-t-il si enlève à FMNH* H+ et é

A

FMN (passe de réduit à oxydé)

137
Q

qu’est-ce que devient l’ubiquinone (Q) (acétone) si ajoute un é

A

Q*- semiquinone

138
Q

que devient semiquinone Q*- si ajoute é et 2H+

A

QH2 ubiquinol (alcool)

139
Q

vrai ou faux dans le complexe 1 on va du bras de la matrice vers le côté de la matrice N ou côté P de l’intermembrane

A

vrai

140
Q

vrai ou faux dans le complexe 1 c’est 4H+ pour chaque 2é

A

vrai

141
Q

Décrire l’ordre de centres REDOX du complexe 1 avec la distance requis pour transmettre des é

A

1- FMN: 2é

2- centre Fer-soufre: 1é

3- le coenzyme Q: 2é

la distance requis pour transmettre des é est d’environ 14A

142
Q

Comparer FMN, semiquinone intermédiaire et FMNH

A

FMN: forme oxydé (les 2 N sont célibataires) = peut capter des électrons

semiquinone intermédiaire: slm 1N est célibataire

FMNH: forme réduite (les 2N sont en couple avec un H) = peut donner des électrons

143
Q

qu’est-ce qui se passe entre FMN et semiquinone intermediaire

A

gain de H+ et é

144
Q

qu’est-ce qui se passe entre semiquinone intermediaire et FMNH

A

gain de é et H+

145
Q

qu’est-ce qui se passe entre FMN et FMNH

A

gain de 2é et 2H+

146
Q

d’où proviennent les deux électrons capturer par FMN

A

De NADH

147
Q

Qu’est que la flavine (FMN) fait avec les 2é qu’elle a capturer de NADH

A

les transfert 1é à la fois à un grouper Fe-S

148
Q

Qu’est-ce que le centre Fer-Soufre

A

micro-chemin pour les é

149
Q

Quels sont les composantes des centres fer souffres

A
  • fer
  • souffre
  • cystein
  • une protéine en u
150
Q

vrai ou faux les groupes Fer-S sont des transporteurs de 2é

A

faux, d’un seul é à la fois car les atomes de fer cyclent entre Fe2+(réduit) et Fe3+(oxydé)

PAS FE !!!!

151
Q

Où est le coenzyme Q?

A

ancrée dans la membrane

152
Q

vrai ou faux l’ubiquinone est un transporteur d’un é

A

faux 2é

153
Q

comparer l’ubiquinone, l’intermédiaire semiquinone et l’ubiquinol

A

ubiquinone (Q) = la forme oxydée = 2 cétones 0 alcool

intermédiaire semiquinone (*QH) = 1 alcool 1 cétone

ubiquinol (QH2) = 2 alcool 0 cétone

154
Q

entre l’ubiquinone, l’intermédiaire semiquinone et l’ubiquinol lequel a une chaine isoprénique

A

ubiquinone

155
Q

que permet la une chaine isoprénique de l’ubiquinone

A

puisqu’elle a une taille variable et qu’elle est hydrophobe, elle permet de rester coller a la membrane

156
Q

entre l’ubiquinone, l’intermédiaire semiquinone et l’ubiquinol lequel est un transporteur soluble

A

ubiquinol (2 alcool)

157
Q

entre l’ubiquinone et l’intermédiaire semiquinone que se passe-t-il?

A

Ajout de H+ et é

158
Q

entre l’intermédiaire semiquinone et l’ubiquinol que se passe-t-il

A

ajout de H+ et é

159
Q

entre l’ubiquinone et l’ubiquinol que se passe-t-il

A

ajout de 2H+ et 2é

160
Q

vrai ou faux les quinones sont des composés aromatiques comportant un noyau de benzène sur lequel deux atomes d’H sont sont remplacé par deux atomes d’oxygène formant deux liaison carbonyles

A

faux, plutôt une série de diène

161
Q

vrai ou faux le complexe 1 transporte 2H+

A

faux 4H+

162
Q

vrai ou faux les é du NADH rentre toujours par le complexe 1

A

vrai

163
Q

vrai ou faux les centre Fe-S transporte 2é

A

faux, 1é

164
Q

vrai ou faux le complexe 1 oxyde la NADH

A

vrai

165
Q

vrai ou faux le potentiel redox du NADH est plus petit que pour le FMN

A

vrai car va du NADH au FMN et toujours du plus petit redox au plus grand

166
Q

Nommer les réactions qui contribue au stock d’ubiquinol

A
  • complexe 1 (décrit avant)
  • complexe 2( succinate dehydrogenase) :

par succinate -> fumarate 2é vont à Q et devient QH2

  • acyl-coa dehydrogenase

SCoA -> SCoA 2é vont à Q et devient QH2

  • mitochondrial dehydrogénase

glycerol 3-P -> dihydroxyacetone phosphate 2é vont à Q et fait QH2

dihydroxyacetone phosphate -> glycerol 3-P par la cytosolique dehydrogenase (ce qui est en même temps et fait NADH + H+ -> NAD+)

167
Q

Combien de réactions contribue au stock d’ubiquinol

A

4 réactions

168
Q

vrai ou faux l’ubiquinone est un transporteur de 2é

A

vrai

169
Q

Que contient le complexe 3?

A

deux cytochromes (b et c1)

une protéine Fer-S (connue comme protéine de Rieske (ISP))

170
Q

Synonyme de complexe 3

A

ubiquinol cytochrome c oxydoréductase

171
Q

Combien de round nécessite le complexe 3, pourquoi?

A

2 round car c’est 1é à la foie et donc au total 2é sont transmis au cyto c (2é sur 4é) dans l’espace intermembranaire et 4 H+ au total (2H+ a chaque round)

172
Q

Décrire round 1 et round 2 du complexe 3

A

Round 1

1- QH2 donne 1é à ISP qui elle donne à cyto c1 qui donen à cyto c qui passe de cyto c Fe3+ à cytoc Fe2+

2- QH2 donne aussi 1é à cyto b

3- il reste plus que QH2 cède alors ces 2 protons à l’espace intermembranaire, alors le Q se retouve seule c’est alors que le cytob reonne 1é à Q ce qui donne *Q-

(bilan: donne 2H+ à espace intermembranaire, *Q- et cyto c avec 1 é de plus donc cyto Fe2+)

Round 2:

4- Un autre QH2 donne ces 2é au complexe 3 comme en haut et ses 2 H+ à l’espace intermembranaire

5- Le cyto b donne son é au *Q- de plus haut pour faire QH2 (en utilisant 2H+ de la matrice)

BILAN TOTAL: regénérer QH2, cyto Fe2+, donc 2é sont sorties vers cyto c et 4H+ dans l’espace intermembranaire

4-

173
Q

quel parties des cyto subissent une réduction réversible et met combien d’é en jeu

A

hème et 1 é

174
Q

le potentiel redox des cyto va de quoi a quoi

A

-0,08V à +0,385V

175
Q

décrire les hèmes des cytochromes (3)

A
  • 4 groupement pyrrols: liés avec alternance -/=
  • coordination d’un atome de Fer au centre
  • différence entre les hèmes: les chaines latérales
176
Q

qu’elle est la particularité de l’heme A

A

longue chane carbonée (isoprénique)

hydrophobe donc ancrage dans la membrane

177
Q

quelle est la particularité de l’hème b (des cyt b)

A
  • petite chaine latérale
  • hème tient dans une protéine
178
Q

quelle est la particularité de l’hème c

A
  • liaisons covalentes avec sa protéine
  • a des cystéines lié a des soufres
179
Q

où se localise le cytochrome c

A

dans l’espace intermembranaire a une concentration de 0,7mM

180
Q

synonyme de complexe 4

A

cytochrome c oxydase

181
Q

quel rôle joue le cytochrome c

A

il transporte les é entre le complexe 3 et 4

4é apporté par 4 cyto c (qui sont consommés pour la réduction de l’oxygène)

182
Q

écrire la réaction du complexe 4, bilan?

A

O2 + 4é + 4H+ -> H2O

donc 2 protons pour 2 é !!!!

183
Q

vrai ou faux 4H+ sont libérés du complexe 4

A

faux 2H+ (pour 2é)

184
Q

qu’est-ce que le centre rédox du complexe 4 comporte?

A

des groupements hème

des ions de cuivre

185
Q

Où est-ce qu’il y a des protons de libéré et combien?

A

complexe 1 4H+

complexe 3 4H+

complexe 4 2H+

186
Q

apprécier où va l’Énergie du transport des é

A
187
Q

Quelle est la théorie de peter mitchell

A

théorie chimiosmotique (1961)

grâce à lui les barrages hydroéléctriques

il explique qu’il y a un couplage oxydation/phosphorylation

soit que au fond la réduction-oxydation des complexes 1,3,4 de la chaine d’électron sert a faire un gradient de proton donc un débalancement de concentration de proton donc une charge électrique entre l’espace intermembranaire et la matrice

188
Q

Qu’est-ce que le couplage oxydation/phosphorylation

A

que l’oxydation du NADH, transport d’é, pompage des protons, formation du gradient éléctrochimique, consommation d’oxygène sert à la synthèse d’ATP

c’est couplé!!!

189
Q

Faire un texte suivi et bref des rôles des complexes 1,3,4 et 5

A

Le complexe 1 reçoit 2é venant de NADH et les passe à CoQ via FMN ce qui libère 4H+ de la matrice à l’espace intermembranaire.

Le complexe 3 passe les é de CoQH2 à cyto c par cyto b et cyto c1 et une protéine Fe-S. CoQH2 amène 2H+ à travers la membrane et puis 2 autres H+ sont pompé hors de la matrice.

Le complexe 4 reçoit les é du cyto c et part cyto a et a3 les passe à l’oxygène moléculaire qui est réduit en eau quand 2 protons sont sortie de la matrice dans l’espace intermembranaire.

Le complexe 5 (ATP synthase) utilise l’énergie du gradient de p+ fait par le transport des é pour synthétiser de l’ATP à partir d’ADP et PI

190
Q

Dans quel complexe il y n’y a pas de transfert de proton dans l’espace intermembranaire

A

complexe 2

191
Q

vrai ou faux le coenzyme q transfère ses é entre le complexe 1 et 3

A

vrai

192
Q

vrai ou faux le coenzyme q transfère ses é entre le complexe 2 et 3

A

vrai

193
Q

vrai ou faux le coenzyme q transfère ses é entre le complexe 3 et 4

A

faux

194
Q

vrai ou faux le gradient de proton est un gradient électrochimique qui represente une variation de potentiel

A

vrai

195
Q

comment représenter le gradient de proton

A

delta G

196
Q

delta G est la variation d’énergie pour générer les gradients de protons, comment elle peut être influencé?

A

1) RTlnHo/Hi : gradient de concentration chimique
2) ZFdeltaposéidon: effet électrique

Z= charge des ions

delta poséidon = potentiel de membrane du au déséquilibre des charges positives

donc gradient éléctrochimiue

delta poséidon = 150-200mv

197
Q

Quel est le delta G pour un proton? represente quoi?

A

20 kj/mol environ 5,2kcal/mol

donc champ électrique vrm puissant car très petite distance comme la foudre

198
Q

De quoi est composé l’ATP synthase

A

F0 = ancrée dans la membrane (enchassé)

F1 = vers la matrice activité catalytique)

F0 et F1 relié par gamma

F1 a des sous-unités B et alpha (avec des résidus His)

F0 a c-ring qui tourne et s-u a fixe

199
Q

vrai ou faux l’ATP est synthétiser dans F1

A

vrai

200
Q

vrai ou faux dans la pompe ATP synthase le gamma et f1 tourne

A

faux gamma et c ring

201
Q

dans la pompe atp synthase qu’est-ce qui est attaché au c-ring

A

avidine qui lie actine (permet de tourner)

202
Q

nommer des synonyme de ATP synthase

A

F0F1ATP synthétase

complexe 5

203
Q

que permet l’ATP synthase

A

synthétise de l’ATP à partir du gradient éléctrochimique

204
Q

vrai ou faux les protons sont éjécté vers la matrice par la ATP synthase (selon leur gradient)

A

vrai permet la synthèse de l’ATP

205
Q

Sur quoi repose la synthèse de l’ATP de l’ATP synthase

A

sur une conversion énergétique via des changements de conformations des s-u

206
Q

vrai ou faux dans l’ATP synthase on commence avec de l’énergie chimique pour finir avec de l’énergie électrique

A

faux, l’énergie chimique de réactions redox est transformé en force protomotrice, puis en mouvement mécanique d’un moteur rotatif pour finir à nouveau en énergie chimique sous la forme d’ATP

207
Q

Décrire l’énergétique du couplage

A

delta G de l’oxydation d’1 mole de NADH = 220kj

NADH = une paire d’é = 10 p+ (4 complexe 1, 4 complexe 3 et 2 complexe 4)

le delta G pour un p+ est 20,4 kj/mol x10= 204 kj/mol

rendement couplage = 204/220 = 90%!!

208
Q

que veut dire rendemenent du couplage? et quel est-il?

A

90% de l’énergie dans le NADH est récupéré!

209
Q

qu’est-ce que le rapport p/o?

A

nombre de phosphorylation d’ADP/atomes d’oxygènes réduits

ce n’est pas un numero entier!

une rotation complète de l’ATPsynthase produit 3ATP (1 par chaque s-u F1B)

chaque s-u c lie un H+

(une rotation de 360 degres a bsoins d’un numero de proton égal un numero de s-u c donc si c=12 = 12p+ et génère 3 ATP donc p/o = 2,5)

210
Q

quel relation démontre le rapport P/o?

A

la relation entre la respiration et la synthèse d’ATP

211
Q

quel est le P/O du NADH?

A

2,5

car 10 p+/4 é nécessaire (????)

212
Q

quel est le p/o du FADH2?

A

1,5

( 6p+/ 4 é nécessaire ????)

213
Q

La F1ATPase a besoin de combien de H+ pour synthétiser 1atp

A

4 H+

(tourne 400 fois/s)

214
Q

combien d’énergie nécessaite la synthèse d’ATP

A

81,6 kJ/mol

car le retour des H+ selon leur gradient dans l’ATP synthase a un delta G = -20,4 kJ/mol x4 H+ pour 1 ATP = -81,6 kJ/mol

215
Q

Combien de mécanismes pour produire de l’ATP?

A

2 mécanismes

216
Q

Nommer les 2 mécanismes pour produire de l’ATP

A
  • phosphorylation au niveau du substrat
  • gradient ionique (chemiosmosis)
217
Q

vrai ou faux si on utilise la navatte malate aspartate on fait plus d’ATP

A

vrai

218
Q

Quel est le bilan total de la glycolyse + cycle de krebs?

A

chaque NADH = 2,5 ATP

chaque FADH2 = 1,5 ATP

1 glucose

= 10 x2,5 = 25 ATP (NADH)

= 2 X 1,5 = 3 ATP (FADH2)

= …………..= 2 ATP (PS)

= …………..= 2 GTP (PS)

total = 32 ATP

mais pourait être 30 ATP si utilise navette glycerol phosphate pour entrer au lieu de malate aspartate

delta G0 du glucose = -688 kcal/mol

synthèse ATP = 32 x 7,3 = 233,6 kcal/mol

rendement = 233,3/688 x 100%= 33,9%

219
Q

qu’est-ce qui se passe avec le 66% qui n’est pas pour la synthèse de l’ATP

A

se retrouve sous forme de chaleur

220
Q

Nommer/décrire les 3 façons comment se fait le contôle de la respiration

A

1- par la disponibilité d’ADP et Pi et la vitesse de retour des H+

la vitesse de retour des H+ à l’intérieur de la matrice dissipe le gradient des protons. ça stimule donc le transport des é par la chaine de transport de ceux-xi. le retour se fait à travers l’ATP synthase mais celle-ci fonctionne slm s’il y a assez d’ADP ! Logique? oui! quand on consomme l’ATP il est convertie en ADP donc stimule plus ATP vis verca

2- disponibilité de cofacteurs réduits (NADH et QH2)

3- par la vitesse de consommation d’O2 (effet du NO)

221
Q

Observer le controle respiratoire (argument 1)

A
222
Q

qu’est-ce que le découplage?

A

les H+ reviennent dans la matrice sans passer par l’ATP synthase

donc pas de synthèse d’ATP = FORTE production de chaleur

223
Q

vrai ou faux les groupes hèmes des cytochromes subissent une réduction irréversible mettant en jeu un seul é

A

faux réversible

224
Q

est-ce qu’on travail fort lors de découplage?

A

oui autant que lors de symthèse d’ATP saud que la c’est forte production de chaleur

225
Q

nommer des agents découplants naturels

A

(UPC)!!

  • nouveaux-nés
  • mammifères adaptés au froid (hibernation)
  • tissu adipeux brun (thermogénèse)
  • plantes: aposère fétide, chauffage des pointes florales, attraction des insectes
226
Q

nommer des agents découplants artificiels

A

dinitrophénol, FCCP

227
Q

Nommer des inhibiteurs de la phosphorylation oxydative avec leurs cibles

A

rotenone : complexe 1

malonate : complexe 2

antimycin-a : complexe 3

cyanide: complexe 4
olygomycin: complexe 5

228
Q

nommer les inhibiteurs de la phosphorylation oxydative qui agissent plus près de la matrice

A

malonate (complexe 2), antimycin-a (complexe 3) et cyanide (complexe 4)

229
Q

nommer les inhibiteurs de la phosphorylation oxydative qui agissent plus près de l’espace intermembranaire

A

rotenone (complexe 1) et oligomycin (complexe 5)

230
Q

normalement on respire 100 pMol/min (respiration basale), qu’est-ce qui arrive si on ajoute oligomycin?

A

puisque c’est un inhibiteur de l’ATP synthase

on n’a plus de respiration lié à l’ATP mais bien seulement celle lié au proton ce qui donne moins de 50 pMol/min…

231
Q

normalement on respire et 100 pMol/min, puis on ajoute oligomycin ce qui inhibe l’ATP synthase donc slm respiration basé sur les protons: 50 pMol/min, que ce passe-t-il si ajoute FCCP?

A

FCCP = agent découplant

donc on ne dépend plus (pas) de l’ATP afin de respirer donc respiration indépendante des mitochondries :

175 pMol/min

232
Q

qu’est-ce que la capacité de respiration maximal?

A

respiration après l’addition de FCCP! car capacité maximale de respiration car nécessite pas le couplage

233
Q

normalement on respire et 100 pMol/min, puis on ajoute oligomycin ce qui inhibe l’ATP synthase donc slm respiration basé sur les protons: 50 pMol/min, puis ajoute FCCP donc on est dans la capacité de réserve des mitochondrie (capacité maximale de respiration), puis on ajoute du Rotenone et antimycin A, que se passe-t-il?

A

certain délai avant de baisser car on a une capacité de réserve où nous pouvons survivre dans la réserve des mitochondrie mais rapidement arrive à une respiration indépendante des mitochondrie… 25pMol/min..

234
Q

vrai ou faux toute l’énergie potentielle du glucose est transformée en ATP

A

faux (chaleur aussi)

235
Q

vrai ou faux l’ATP produit par la glycolyse dans le cytosol se fait par phosphorylation oxydative

A

faux

236
Q

vrai ou faux l’ATP produit par la glycolyse dans le cytosol se fait par phosphorylation au niveau du substrat

A

vrai

237
Q

vrai ou faux l’ATP produit par la glycolyse dans le cytosol se fait par B-oxydation

A

faux

238
Q

combien d’ATP produisent les é du FADH2

A

1,5 ATP

239
Q

la séquence des événements du transport des é a été élucidée grâce à l’utilisation des inhibiteurs comme la roténone, l’antimycine A et le cyanure, qu’advient-il de la consommation d’oxygène lors de l’addition de ces inhibiteurs?

a- augmente

b- diminue

c- reste pareil

A

b- diminue

240
Q

RÉPONDRE AU QUESTIONNAIRE !!!!!

A

oui il l’a mis en ligne pour se pratiquer!

u can do it !!!