Azoté Flashcards
vrai ou faux l’azote dans l’air est chimiquement inerte
vrai
vrai ou faux l’azote n’est pas un atome très stable
faux, car peut faire des triples liaisons
vrai ou faux l’azote est très abondant
vrai
que signifie le fait que l’azote a un energie d’activation élevé
qu’il a besoin d’un catalyseur
en quoi il faut convertir l’azote
en ammoniac
la réduction de l’azote en ammonic est elle énergétiquement favorable? (formule)
oui
N2 + 3H2 = 2NH3
deltaG = -33 kj/mole
vrai ou faux la fixation de l’azote ce fait de manière aérobique ou anaérobique
faux, slm anaérobique
quelle enzyme permet la fixation de l’azote (azote en ammoniac)
nitrogénase
vrai ou faux la nitrogénase est présente dans toutes les espèces
faux, uniquement chex qq bactéries et algues
décrire la nitrogénase
c’est une métalloprotéine contenant des centres Fe-S et un cofacteur avec du Fer et du molybdène
combien de % de l’azote est fixé par la nitrogénase
90%
combien de s-u à la nitrogénase nommer
2 s-u
Fe (dinitrogénase réductase) et MoFe (dinitrogénase)
vrai ou faux la nitrogénase nécessite de l’ATP (énergivore)
vrai, très énergivore mais slm pour le transport des électrons (plus de 16 ATP)
vrai ou faux la fixation de l’azote nécessite un agent réducteur faible au minimum
faux, un agent réducteur fort : ferredoxine ou flavodoxine
que requiert comme condition la fixation d’azote
des conditions d’anaérobie stricts
Combien de types de bactéries qui fixent l’azote
2 types
vrai ou faux bcp d’azotes est fixés par les bactéries
vrai
ont sont situé la majorité des bactéries fixant l’azote
dans les nodules de racines de petits poids
les bactéries fixant l’azote situé dans les nodules des plantes utilise-t-il de l’atp
oui, utilise près de 20% de l’ATP produit par la plante
bactérie grâce à l’ATP transforme ______ en ______
azote en ammoniac
nommer les 2 types de bactéries fixant l’azote
1- bactérie anaérobique du sol (Klebsiella, Azobacter)
2- bactérie aérobiques (Rhizobium) en symbiose avec des racines de légumineuses (leghémoglobine (protége les nodules) pour conditions anaérobiques)
vrai ou faux les bactéries des nodules produisent la quantité d’azote dont les plantes ont besoin
faux, plus d’azote que ce qu’elles ont besoin (enrichie le sol)
vrai ou faux haber est un processus naturelle de fixation d’azote
faux, la nitrogénase est naturelle alors que Haber est chimique
nommer des techniques aidant la nitrogénase
guano (déchet des oiseaux)
fumier
engrais organique
Décrire ce que permet Haber
processus chimique pour fixer l’azote en ammoniac (nitrogen fertilizer)
2% de l’énergie!
utilise des catalyseurs métallique, des hautes températures et des hautes pressions pour casser la tripe liaison de l’azote (100 million de tonnes par annéesO
À quoi peut mener une sur-utilisation de Haber
defait le cycle de l’azote
pollution des eau, ecosysteme
eutrophication
prolifération d’algues (pousse grâce à l’azote et prennent tout l’oxygène)
diminue la quantité d’oxygène dispo pour les organismes aquatiques
créer des dead zones
vrai ou faux l’azote est maintenu +/- stable grâce à haber
faux, grâce au cycle de l’azote
Décrire le cycle de l’azote
1- Fixation de l’azote
ammoniac formé à partir de l’azote atmosphérique (N2) ou des nitrates présent dans le sol (NH3) par les bactéries fixant l’azote dans les nodules des plantes légumineuses
2-Nitrification
oxydation de l’ammoniac par les bactérie en nitrite (NO2) et nitrate (NO3) (nitrosomonas eet nitrosoccocus pour les nitrites et nitrosobacter pour les nitrates)
3- Assimilation ou Dénitrification
assimilation: la plupart des plantes et autres microorganismes vont réduire les nitrates du sol en nitrite (nitrate réductase) puis les nitrite en ammoniac (nitrite réductase)
dénitrification: processus bactérien de respiration alternatif en milieu axonique ou les nitrates et les nitrites sont convertis en NH3 puis en gaz diazoté (usines de dépollution des eaux usées: dégradé les formes d’azote ammoniacale provoque la dénitrification)
4- suite à assimilation décomposition puis ammonification
plante meurt puis décomposer donc ammonification: c’est la production d’ammonium a partir soit de la matière organique en décomposition soit par la réduction en nitrate. Réalisé par des bactéries et des champignons
synonyme d’assimilation
organification (conjugué à des molécules carbonées)
qu’est-ce que l’assimilation en une phrase
réduction des nitrates et des nitrites
quel est la source la plus importe d’azote pour les plantes
nitrate
décrire nitrate a ammoniac
nitrate
grâce à nitrate réductase ( + nadph, nadh)
nitrite
grâce à nitrite réductase (+ nadph, nadh)
ammoniac + eau
que catalyse l’enzyme nitrate réductase
le transfert des électrons entre le NA(D)PH et le nitrate
idem pour l’enzyme nitrite réductase mais avec le nitrite
vrai ou faux les nitrates sont présente que chez les bactéries
faux, bactéries et les plantes
nommer le cofacteur essentiel à l’assimilation (réduction des nitrates et des nitrites)
le molybdenum (Mo)
expliquer les engrais
produits fertilisants. Les engrais organiques sont généralement d’origine animale ou végétale. Ils peuvent aussi être synthétisées, comme l’urée. Le nitrate est la source la plus importante d’azote pour les plantes
Trouver le bon ordre pour les processus suivant :
a) dénitrification
b) fixation
c) nitrification
1) abc 2) bca 3) bac
2) bca
vrai ou faux la fixation de l’azote par la nitrogénase implique la production d’énergie
faux, besoin d’E
vrai ou faux la fixation de l’azote par la nitrogénase implique des conditions anaérobique
vrai
vrai ou faux la fixation de l’azote par la nitrogénase implique la production d’ammoniac
vrai
vrai ou faux la fixation de l’azote par la nitrogénase implique la molybdène
vrai
vrai ou faux l’ammoniac du sol est convertie d’abord en nitrate
faux
vrai ou faux l’ammoniac du sol est convertie d’abord en nitrite
vrai
vrai ou faux l’ammoniac du sol est convertie d’abord en urée
faux
Écrire l’équation de la nitrogénase
N2 + 8H+ + 8é + 16ATP -> 2 NH3 + H2 + 16adp + 16 pi
note : je pense que c pas la nitrogénase en tant que tel qui a besoin d’ATP mais plus le transport des é
fuck
Nommer 5 réactions permettant d’organifier l’ammoniac
1- glutamine synthétase (tous les organisme)
2- glutamine synthase (chez les procaryote et les plantes) = assiste la réaction 1
3- glutamate déshydrogénase (tous les organismes)
4- aparagine synthétase (voie secondaire)
5- carbamoyl-phosphate synthétase (tous les organismes)
Décrire la réaction par la glutamine synthétase (aussi chez qui)
tous les organismes
glutamate + NH3 + ATP -> glutamine
grâce à la glutamine synthétase
vrai ou faux la réaction par glutamine synthétase nécessite de l’ATP
vrai
décrire le glutamine, sa fonction sur sa structure chimique?
fonction amide ou réservoir d’azote amide
nommer un inhibiteur de la glutamine synthétase
glufosinate
par quoi et produit la glufosinate et utiliser pour?
produit par des bactérie du sol pour la deforestation
que permet la glutamine synthétase chez les mammifaire (2)
la neutralisation des ions NH3 (ammoniac) toxique (astrocytes)
transport de l’ammoniac vers le foie et les reins
abréviation et synonyme de glutamate synthase
glutamine oxoglutarate aminotransférase
GOGAT
chez qui est présent le glutamate synthase
procaryote et plantes
écrire réaction de la glutamate synthase
glutamine + alpha cétoglutarate + NAD(P)H + -> 2 glutamate
si je veux mettre du glutamate en alpha-cétoglutarate
NH3-R
que se passe-t-il avec les 2 glutamate venant de la glutamate synthase
1 est fait juste pour etre réutiliser et recommencer et faire de la glutamine
nommer les 3 mécanisme de controle de l’activité de la glutamine synthétase chez E coli
1- par inhibition feedback des produits de fin de réaction (9 différents)
2- par modification covalente par adénylation (addition d’AMP)
3- par contrôle de l’expression de l’enzyme (génétique)
à quoi ressemble la glutamine synthetase de E coli
anneaux hexamérique
car 12 s-u avec chacune son site catalytique (mais comme deux anneaux un par dessu l’autres de 6)
vrai ou faux la gluthamine syntétase est un dodécamer
vrai 12 s-u
décrire le site actif de la glutamine synthétase
site actif avec 2 ions magnésium et un site d’adenylations en jaune (Tyr)
combien de site de liaison à l’ATP , pourquoi?
3 s-u ont un site de liaison à l’ATP, soit
3 s-u avec ADP
pourquoi la glutamine synthétase est aussi grosse?
stabilité
réduction de la superficie exposé
contrôle
à quoi peut être comparé la glutamine synthétase
ordinateur moléculaire
Nommer les inhibiteur de l’inhibition feedback et la glutamine synthétase (directe et indirect)
direct (agit sur glutamine);
tryptophan
histidine
glucosamine 6-P
carbamoyl phosphate
CTP
AMP
indirect (agit sur glutamate):
alanine
glycine
sérine
vrai ou faux un inhibiteur a lui seul peut inhiber la glutamine synthétase
faux, l’inhibition est cumulative slon le nbr d’inhibiteur qui competitionne pour le site actif
combien d’inhibiteur de la glutamine synthétase, combien sont requis pour une inhibition complete?
9
et les 9 sont requis
vrai ou faux l’inhibition feedback est un phénomene très rapide
vrai
décrire la modification covalente de la glutamine synthétase
glutamine synthétase + ATP -> glutamine synthétase-AMP
glutamine synthétase-AMP = inactive
lorsqu’il y a une grande concentration de glutamine
l’adénylation est sensible aux niveau de glutamine (adenylyl transferase catalyse les réactions d’adénylation et déadynylation)
qu’est-ce qui est nécessaire lors d’un deadénylation
adenylyl transferase et Pi
écrire l’équation de la glutamate déshydrogénase
alpha cétoglutarate + NH3 + NAD(P)H -> glutamate
vrai ou faux la glutamate déshydrogénase est présente slm chez les plantes
faux tous les organismes
décrire la distinction entre les animaux et plantes/bactéries pour la glutamate déshydrogénase
plantes/bactéries:
voie de synthèse de glutamate
animaux:
vers la gauche (vers alpha-cétoglutarate)
formation d’ammoniac pour l’élimination et la récupération de l’énergie contenue dans la chaine carbonée (cycle de krebs)
vrai ou faux slm NADP est nécessaire dans la réaction de la glutamate déshydrogénase
faux, NAD ou NADP ou les deux
selon l’organisme et les tissus
vrai ou faux il eciste 2 forme de la glutamate déshydrogénase
vrai chez certains organismes 2 enzymes distincts (GLUD1 et GLUD2)
Comment on ctrl l’activité de la glutamate déshydrogénase
surtout par la concentration des réactants
qu’est-ce qui est respondable de hyperinsulinism/hyperammonemia
mutation d’augmentation dans le niveau mitochondirale de glutamate déshydrogénase
quel est la voie préféré entre glutamate synthétase-glutamine synthase ou glutamate deshydrogénase, alors quand est utilisé l’autre?
glutamate synthétase-glutamine synthase (plus petit km)
glutamate deshydrogénase alors utilisé quand il y a trop d’azote
La source d’azote pour la synthèse des purines est?
glutamine
vrai ou faux la glutamate déshydrogénase synthétise le glutamate à partir de l’apha cétoglutarate et NH3
vrai
vrai ou faux la glutamate déshydrogénase covertit le glutamate en apha cétoglutarate et NH3
vrai
vrai ou faux la glutamate déshydrogénase synthétise la glutamine à partir de l’apha cétoglutarate et NH3
faux
vrai ou faux la glutamine synthétase est contrôlé par tous ces métabolites
glycine
CTP
tryptophane
glucosamine 6-P
glutamate
alanine
faux, pas glutamate
vrai ou faux il est possible de transférer des groupements aminés d’un produit à l’autre
vrai
quels réactions permet de redistribuer les groupements NH2
les réactions de transamination
(surtout glutamate et alanine)
pourquoi on voudrait redistribuer les groupements amines
pour synthétiser les différents a.a à partir des acides alpha-cétoniques correspondants
pour quoi sont utilisés les réactions de transamination apart redistribuer les groupements NH2
utilisé en catabolisme poir récupérer ces acides alpha-cétoniques et obtenir de l’énergie
toutes les transaminases utilisent un co-enzyme lequel?
pyridoxal-phosphate
(dérivé de la vitamine B6)
écrire une réaction de transaminase
glutamate + pyruvate -> alpha cétoglutarate + alanine
grâce à: GTP (glutamate pyruvate transaminase) et coenzyme pyridoxal-pyruvate (B6)
combien d’a.a sont métabolisés par transamination
17 a.a
nommer 3 des 17 a.a métabolisé par transamination
alanine
aspartate
glutamate
à partir de quoi est métabolisé l’alanine
pyruvate
à partir de quoi est métabolisé l’aspartate
oxalacetate
à partir de quoi est métabolisé le glutamate
alpha céto glutarate
dans quoi serait possible la transamination
navette malate aspartate
Nommer 3 a.a métabolisé par déshydrogénase
proline
lysine
threonine
à partir de quoi sont synthétiser les a.a
des intermédiaires de la glycolyse
des intermédiaires du cycle de krebs
la voie des pentoses (NADP)
D’où provient le groupement amino des a.a
du glutamate et de la glutamine
vrai ou faux les etres humains peuvent synthétiser les 20 a.a
faux, ils ne peuvent pas slm 10 sont non essentiels
vrai ou faux l’arginine est un a.a essentielle
vrai, même si elle est synhtétiser par les cellules des mammifère
mais a un taux insuffisant pour rencontrer les besoins de l’organisme
pour quoi est requis la méthionine
pour la synhtèse de cystéine