Biochimie Clinique Partie 1 Flashcards
Pourquoi demande-t-on une analyses dans le contexte médical?
-Diagnostique (confirmation ou exclusion)
-Pathologie (évaluer le degré)
-Thérapie (monitoring)
-Médecine préventive (dépistage)
Pourquoi demande-t-on des analyses dans le contexte d’une étude clinique?
- Criblage des sujets recrutés
- Protection des sujets inclus
- Médicaments (efficacité, toxicité, innocuité, posologie et observance)
Pour quelles phases y-a-t-il une source de variabilité qui vient influencer le résultat final de l’analyse et/ou l’interprétation que l’on fait du résultat final?
Toutes : aspects pré-analytique, aspect analytique et aspect post-analytique
Qu’est-ce que l’aspect pré-analytique?
Classification des causes de la variabilité pré-analytique des résultats d’analyses de laboratoire (avant/pendant/après le prélèvement)
Quelles sont les ordres de variations avant le prélèvement?
-Les variations prévisibles (cycliques : ultradienne, circadienne, infradienne et circanuelle)
-Les variations imprévisibles (biologique : intra-individuelle et interindividuelles)
-Les variables reliées au patient (exercice, diète, stress, posture)
Quelles sont les variabilités pré-analytique pendant le prélèvement?
- Type d’échantillons
- Contenants et additifs
- Technique de prélèvement
Quelles sont les types d’échantillons qu’on peut obtenir à partir du sang?
-Sang total : en présence d’un anticoagulant
-Plasma : Sang total en présence d’un anticoagulant qui est centrifuger afin de récolter la fraction liquide
-Sérum : Sang total qu’on fait coaguler et centrifuger pour obtenir la fraction liquide ne contenant pas les protéines de la coagulation
Quels sont les types d’échantillons liquides ou autres?
-Urine
-Salive
-Autres liquide : LCR, pleural, synoviale, péricardique, ascite, etc
-Autre matrices: selles, expectorations, etc
Quels sont les contenants et additifs possible?
- Anticoagulants : EDTA di ou tri potassique, Héparine de lithium, Citrate de sodium, etc
- Préservatifs : Fluorure de sodium (inhibiteur de la glycolyse), HCl 6 N (préservatifs pour analyse urinaire), etc
- Additifs : gel séparateur, séparateur mécanique, activateur de coagulation, etc
Quelles sont les étapes d’un prélèvement sanguin?
- Mettre des gants
- Choisir une veine de gros calibre
- Appliquer le garrot pour faire gonfler la
veine en le serrant modérément (pour
éviter les risques d’hémolyse) - Désinfecter l’endroit de la ponction
veineuse - Tenir l’aiguille avec un angle de 30° et
piquer à 1 cm au dessous de la saillie
veineuse - Desserrer le garrot (< 1 minute car
risque d’hémolyse) - Remplir les tubes adéquatement
- Assurer une bonne identification des
tubes immédiatement
Quelles sont les étapes critiques lors d’un prélèvement sanguin?
- Désinfecter l’endroit de la ponction veineuse
- Desserrer le garrot
- Remplir les tubes adéquatement
- Assurer une bonne identification des tubes immédiatement
Quelles sont les conséquences de l’hémolyse?
- Augmentation causée par la relâche du contenu
intracellulaire des globules rouges - Augmentation causée par une interférence
analytique in vitro - Diminution causée par une interférence
analytique in vitro
Quelles sont les variabilité pré-analytique après le prélèvement ?
- Transport
- Prétraitement
- Entreposage
Qu’est ce qui fait en sorte que le transport peut apporter une certaine variabilité ?
Délais et température
Quels sont les effets d’un délai ou d’une mauvais conservation des échantillons pendant le transport?
- pO2 : diminue, car l’oxygène est consommée par les cellules sanguines
- pCO2 : augmente, car les cellules sanguines produisent du dioxyde de carbone
- pH : diminue, du fait du changement du pCO2 et de la glycolyse
- cCa2+ : augmente, car le changement du pH influence les liaisons entre ions Ca2+ et les protéines
- cGlucose : diminuer, car le glucose est métabolisé
- cLactate : augmente, à cause de la glycolyse
Quels sont les différents prétraitements qui peuvent être utilisés?
Centrifugation, séparation, aliquote, extraction et précipitation
Comment entrepose-t-on les prélèvements ?
- Court terme = température ambiante
- Moyen terme = réfrigération
- Long terme = congélation
Qu’est-ce qu’une erreur analytique?
Lorsque personne ne peut toujours exactement mesurer la valeur vraie d’une quantité
Quelle sont les deux choses qui dictent l’importance d’une erreur analytique?
La précision de l’appareil de mesure et le calibrage approprié du dispositif ou de l’appareil
Qu’est-ce qu’une faute brute ?
Non-respect des étapes d’une procédure
Qu’est-ce que l’inexactitude?
Différence entre la valeur obtenue expérimentalement et la valeur vraie pour un échantillon à concentration connue (+ ou -)
Qu’est-ce que l’imprécision?
Écart-type ou coefficient de variation calculé à partir des
résultats obtenus
Qu’est-ce que l’erreur analytique totale?
Inexactitude + imprécision
Qu’est-ce que l’interférence analytiques In Vivo ?
Interférence par une substance ou un facteur pré-analytique qui modifie la concentration in vivo de l’analyte
Qu’est-ce que l’interférence analytique In Vitro?
Interférence par une substance qui perturbe la méthode analytique et qui donne un faux résultat
Quels sont des exemple d’interférence In Vivo?
– Tabagisme : le tabagisme augmente le taux de la carboxyhémoglobine (HbCO)
– Médicaments : la prise d’acétaminophène augmente les niveaux de l’enzyme aspartate aminotransférase (AST)
– Drogues : l’alcoolisme augmente les niveaux de l’alanine aminotransférase (ALT) et de l’AST
– Diète : repas entraîne l’augmentation du glucose et des triglycérides et les aliments riches en sérotonine (banane, avocat, chocolat, etc.) entraînent une augmentation du 5-HIAA urinaire
– Menstruations : diminution de l’hémoglobine et du fer sérique
– Hémolyse : hémolyse intravasculaire cause l’augmentation du potassium
Quelles sont les exemples d’interférences In Vitro?
• Spectrophotométriques (aspects) : hémolyse, ictère, lipémie
• Chimiques
• Immunologiques : interférences des immunoessais
• Chromatographique : co-migration
Qu’est-ce qu’une valeur de référence ?
Les valeurs de référence visent à décrire les différentes valeurs que peuvent prendre les résultats des tests de biologie médicale chez les sujets en bonne santé (normaux) d’un groupe d’individus définis (par exemple, classes d’âge, sexe, etc.). Elles sont présentés sous forme d’un intervalle de référence avec une limite inférieur et supérieur
Quelles sont les différentes méthode pour établir des valeurs de références?
• « Hard way » : sélection a priori d’individus sains selon des critères d’inclusion et d’exclusion. On détermine la concentration de l’analyte chez les individus sélectionnés (population normale). Valeurs de référence = Moyenne ± 2 écart-types (si la distribution est normale)
• « Soft way » : utiliser les résultats des patients déjà emmagasinés dans les bases de données du laboratoire (LIS) pour établir les valeurs de référence. Supposition 1 : Très peu de résultats sont anormaux même chez les malades. Supposition 2 : le nombre de malades est faible en comparaison du nombre de sujets sains (poids relatif des résultats anormaux est très faible)
• « No way » : Seuil consensus établis par des groupes d’experts. Pas de valeurs de référence = absence = 0
Quelles sont les deux ordres de caractéristiques d’une analyse?
-Caractéristiques relevant exclusivement du test lui-même (caractéristiques intrinsèques): La Sensibilité (Se) et la Spécificité (Sp) sont des exemples d’indices statistiques qui dépendent des caractéristiques intrinsèques
- Caractéristiques relevant du test lui-même et de la population à qui il est appliqué (prévalence de la maladie dans la population considérée) : la Valeur prédictive positive (VPP) et la Valeur prédictive négative (VPN) sont des exemples d’indices statistiquent qui dépendent aussi de la population étudiée
Qu’est-ce que la sensibilité du test ?
Proportions de vrai + chez les malades
Qu’est-ce que la spécificité ?
La proportion de vrais - chez les non-malades
Qu’est-ce que la valeur prédictive + (VPP)?
La probabilité que le sujet soit réellement malade sachant que son test est +
Qu’est-ce que la valeur prédictive négative (VPN)?
- La probabilité que le sujet soit réellement indemne si son test est -
Qu’est-ce que le rapport de vraisemblance?
Le rapport de la probabilité d’être malade sur la probabilité de ne pas l’être une fois que je connais le résultat du test
Quelle est la formule du rapport de vraisemblance + (L+)?
L+ = Se/(1-SP)
Comment le rapport de vraisemblance positif nous permet-il de confirmer la maladie?
Plus le rapport de vraisemblance d’un test positif est élevé, plus il nous permet de confirmer la maladie
Quelle est la formule du rapport de vraisemblance - (L-)?
L-= (1-Se)/Sp
Comment le rapport de vraisemblance négatif nous permet d’exclure la maladie?
Plus le rapport de vraisemblance d’un test négatif est petit, plus il nous permet d’exclure la maladie
Qu’est-ce que OR nous donne?
Permet de déterminer si la maladie est plus fréquente dans le groupe A ou dans le groupe B
Comment peut-on interpréter OR?
• proche ou égal à 1 : la maladie est indépendante du groupe
• supérieur à 1 : la maladie est plus fréquente dans le groupe A que dans le groupe B
• bien supérieur à 1 : la maladie est beaucoup plus fréquente dans le groupe A que dans le groupe B
• inférieur à 1 : la maladie est moins fréquente dans le groupe A que dans le groupe B
• proche de zéro : la maladie est beaucoup moins fréquente dans le groupe A que dans le groupe B
Quelle analyse diagnostique doit-on choisir pour le dépistage?
Analyse ayant une haute sensibilité (Se)
Quelle analyse diagnostique doit-on choisir pour confirmer un diagnostique ?
Analyse avec une grande spécificité (Sp)
Quelle courbe met en relation la spécificité et la sensibilité ?
La courbe ROC
Quelles sont les étapes pour construire une courbe ROC?
- On fixe une valeur seuil
- On calcule la Se et Sp
- On place le point sur la courbe ROC
- On répète à partir d’une autre valeur seuil
Comment trouver une valeur seuil optimale sur une courbe ROC?
Il s’agit du point de la courbe le plus éloigné de la diagonale représentant le test d’apport nul
Que permet l’aire sous la courbe ROC?
-Permet dévaluer l’intérêt diagnostique d’un test
-Permet de comparer les performances diagnostiques de plusieurs test biologiques
Comment déterminer si une différence significative existe entre deux résultats consécutifs?
1- jugement et expérience professionnels
2- RCV
3- SCL
De quoi dépend le RDV?
Du coefficient de variation analytique et du coefficient de variation biologique intra individuelle
De quoi dépend SCL?
Écart-type analytique usuel des 3-6 derniers mois
