Biochimie clinique I Flashcards

1
Q

Pourquoi on demande des analyses?

A
  • Contexte médical (Diagnostic, Pathologie, Thérapie, Médecine préventive)
  • Contexte d’une étude clinique (criblage des sujets recrutés, protection des sujets inclus, médicaments)
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q

Que sont les exécutions d’analyses?

A

Aspect pré-analytique
Aspect analytique
Aspect post-analytique
Pour chaque phase, il y a une source de variabilité qui vient influencer le résultat final de l’analyse et/ou l’interprétation que l’on faut du résultat final.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q

Qu’est-ce que l’aspect préanalytique?

A

Classification des causes de la variabilité pré-analytique des résultats d’analyses de laboratoire (avant, pendant et après le prélèvement)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

Que sont les variabilités pré-analytique avant le prélèvement?

A

Variations prévisibles:
- Cycliques, tout ce qui est régulatoire (ultradienne, circadienne, infradienne, circanuelle)
Variations imprévisibles (aléatoires):
- Biologique (intra-individuelle, interindividuelles)
Variables reliées au patient (comment le patient traite son corps et les hormones qui sont sécrétés):
- Exercice
- Diète
- Stress
- Posture

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q

Que sont les variabilités pré-analytiques pendant le prélèvement?

A
  • Types d’échantillon
  • Contenants et additifs
  • Technique de prélèvement
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q

Que sont les types d’échantillon de sang?

A

Sang total:
- Présence d’un anticoagulant
Plasma:
- Sang total en présence d’un anticoagulant
- Centrifugation: fraction liquide (plasma), fraction solide (cellules)
Sérum:
- Sang total que l’on fait coaguler
- Centrifugation, fraction liquide (sérum sans les protéines), fraction solide (cellules et caillot)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
7
Q

Que sont d’autres types d’échantillon?

A
  • Urine
  • Autres liquides: céphalorachidien, pleural, synovial, péricardique
  • Autres matrices: selles, expectorations.
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
8
Q

Que sont des contenants et additifs pendant le prélèvement?

A

Anticoagulants:
- EDTA
- Héparine de lithium
- Citrate de sodium
Préservatifs:
- Fluorure de sodium
HCl 6 N
Additifs:
- Gel sépérateur
- Activateur de la coagulation

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
9
Q

Quel est la technique de prélèvement?

A
  1. Mettre des gants
  2. Choisir une veine de gros calibre
  3. Appliquer le garot pour faire gonfler la veine en le serrant modérément
  4. Désinfecter l’endroit de la ponction veineuse
  5. Tenir l’aiguille avec un angle de 30 degrées et piquer à 1 cm au dessous à la saillie veineuse
  6. Desserrer le garrot
  7. Remplir les tubes adéquatement
  8. Assurer une bonne identification des tubes immédiatement
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
10
Q

Que se passe-t-il si il n’y a aucun respect de l’ordre de prélèvement des tubes?

A
  • Contamination par K2-EDTA ou K3-EDTA
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
11
Q

Quest-ce que l’hémolyse et qu’est-ce que ça cause?

A
  • Destruction des globules rouge (relâche du contenu intracellulaire)
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
12
Q

Qu’est-ce que la variabilité pré-analytique après le prélèvement?

A
  • Transport
  • Prétraitement
  • Entreposage
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q

Comment le transport peut-il affecté le prélèvement?

A
  • Délais (commissionnaire, service de courrier, système de capsules envoyées par pneumatique)
  • Température (glacière)
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
14
Q

Que sont les effets d’un délai ou d’une mauvaise conservation des échantillons pendant le transport?

A
  • Diminution de glucose
  • Diminution de gaz sanguin (pH, pO2, pCO2)
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q

Qu’est-ce que le prétraitement?

A
  • Centrifugation (vitesse et température)
  • Prétraitement: Séparation, Aliquote, Extraction, Précipitation)
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
16
Q

Comment fonctionne l’entreposage?

A

Court terme: Température ambiante (20 à 24 dégrées Celsius)
Moyen terme: Réfrigération (2-8 dégrées Celsius)
Long terme: Congélation (-20, -30, -80)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
17
Q

Qu’est-ce que l’aspect analytique d’un prélévement?

A

Définition de l’erreur analytique:
- Exactitude
- Précision
Interférenes analytiques

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
18
Q

Qu’est-ce que l’erreur analytique?

A

Pour chaque mesure, même si elle est soigneusement faite, il ya une erreur associée inhérente avec la mesure. Personne ne peut toujours exactement mesurer la valeur vraie d’une quantité.
L’importance de l’erreur est due:
- À la précision de l’appareil de mesure (précision)
- Au calibrage approprié du dispositif (exactitude)
C’est différent d’une erreur ou d’une faute “brute” = non-respect des étapes d’une procédure
- Une faute brute est due à une application inexacte de l’appareil de mesure, telle que mal interpréter la mesure
- Les pratiques soigneuses exercées au laboratoire devraient éliminer la plupart des fautes

19
Q

Qu’est-ce que l’exactitude?

A

L’exactitude d’une expérience est une mesure de la façon dont étroitement les résultats expérimentaux sont conformes à une valeur vraie ou admise
Inexactitude (biais): différence entre la valeur moyenne obtenue et la valeur vraie

20
Q

Qu’est-ce que la précision?

A

La précision d’une expérience est une mesure de la fiabilité de l’expérience, ou comment l’expérience est reproductible
Imprécision: écart-type ou coefficient de variation calculé à partir des résultats obtenus

21
Q

Que sont les interférences analytiques?

A

In vivo - Interférence par une substance ou un facteur pré-analytique qui modifie la concentration in vivo de l’analyte
In vitro - Interférence par une substance qui perturbe la méthode analytique et qui donne un faux résultat

22
Q

Que sont des exemples d’interférences in vivo?

A
  • Tabagisme
  • Médicaments
  • Drogues
  • Diète
  • Menstruations
  • Hémolyse
23
Q

Que sont des interférences in vitro?

A
  • Spectrophotométriques
  • Chimiques
  • Immunologiques
  • Chromatographiques
24
Q

Que sont des valeurs de références?

A
  • Les valeurs de référence visent à décrire les différentes valeurs que peuvent prendre les résultats des tests de biologie médicale chez les sujets en bonne santé d’un groupe d’invidus définis
  • Elles sont présentées sous forme d’un intervalle de référence avec une limite inférieure et supérieure
25
Q

Comment établir des valeurs de référence?

A

“Hard way”
- Sélection a priori d’invités sains selon des critères d’inclusion et d’exclusion
- Détermine la concentration de l’analyte
- Valeurs de référence = Moyenne +/- 2 écart-types (si la distribution est normale)
“Soft way”
- Utiliser les résultats des patients déjà emmagasinés dans les bases de données du laboratoire (LIS) pour établir les valeurs de référence
“No way”
- Seuil consesus établis par des groupes d’experts

26
Q

Comment déterminer qu’une analyse est utile pour le diagnostic?

A

En étudiant ses caractéristiques, elles sont de deux ordres.
1. Caractéristiques relevant exclusivement du test lui-même (caractéristiques intrinsèques): la Sensibilité et la Spécificité
2. Caractéristiques relevant du test lui-même ET de la population à qui il est appliqué (prévalence de la maladie dans la population considérée): La Valeur prédictive positive et la Valeur prédictive négative

27
Q

Connaissant le diagnostic, combien de personnes vraiment atteintes de la maladie le test identifie-t-il?

A

La sensibilité: la proportion de vrais positifs chez les malades
Se= VP/VP+FN

28
Q

Connaissant le diagnostic, quelle est la probabilité que le test identifiera correctement une personne n’étant pas atteinte de la maladie?

A

La spécificité: La proportion de vrais négatifs chez les non malades
Sp = VN/VN+FP

29
Q

Ne connaissant pas le diagnostic, mais sachant que le résultat du test positif, quelle est la probabilité que le patient soit atteint de la maladie?

A

La valeur prédictive positive (VPP): La probabilité que le sujet soit réellement malade sachant que son test est positif.
VPP= VP/VP+FP

30
Q

Ne connaissant pas le diagnostic, mais sachant que le résultat du test négatif, quelle est la probabilité que le patient ne soit pas atteint de la maladie?

A

La valeur prédictive négative (VPN): la probabilité que le sujet soit réellement indemne si son test est négatif
VPN= VN/VN+FN

31
Q

Qu’est-ce que le rapport de vraisemblance?

A

Différents indices associant Se et Sp ont été proposés pour faciliter le calcul de la probabilité post test de la maladie
- Le rapport de la probabilité d’être malade sur la probabilité de ne pas l’être une fois que je connais le résultat du test

32
Q

Que représente le rapport de vraisemblance positif (L+)?

A

L’accroissement de la probabilité qu’une personne soit atteinte d’une maladie à la suite d’un test positif
L+ = Se/ (1-Sp)
Idéalement L+ = infini
Plus le rapport de vraisemblance d’un test positif est élevé, plus il nous permet de confirmer la maladie.

33
Q

Que représente le rapport de vraisemblance négatif?

A

L’accroissement de la probabilité qu’une personne ne soit pas atteinte d’une maladie à la suite d’un test négatif
L- = (1-Se)/Sp
Idéalement L- = 0
Plus le rapport de vraisemblance d’un test négatif est petit, plus il nous permet d’exclure la maladie.

34
Q

Est-ce que la maladie est plus fréquente dans le groupe A ou dans le groupe B?

A
  • Odds ratio (OR)
  • Si la probabilité qu’un évènement arrive dans le groupe A est p, et q dans le groupe B, le rapport des cotes est OR = p(1-p)/q(1-q)
35
Q

Comment interpréter l’OR?

A
  • OR est toujours plus grand ou égal à zéro
    Proche ou égal à 1 = maladie est indépendante du groupe
    Supérieur à 1 = plus fréquente dans le groupe A
    Inférieur = moins fréquente dans le groupe A
36
Q

Quelle analyse diagnostique choisir?

A

Pour le dépistage, on recherche une analyse avec une haute sensibilité (Se)
Pour confirmer un diagnostic, on recherche une analyse avec une grande spécificité (Sp).

37
Q

Qu’est-ce qu’une courbe ROC?

A

ROC: “Receiver Operating Characteristic”
Pour illustrer la relation existante entre la sensibilité et la spécificité d’un test pour toutes les valeurs seuils possibles.

38
Q

Comment construire une courbe ROC?

A
  1. On fixe une valeur seuil
  2. On calcule la Se et Sp
  3. On place le point sur la courbe ROC
  4. On répète à partir d’une autre valeur seuil
    Si la valeur seuil est très élevée = tous les individus sont sain, Sp = 100%
    Si la valeur seuil est très basse, tous les individus sont malades, Se = 100%
39
Q

Quel est la valeur seuil optimale?

A

Le point de la courbe le plus éloigné de la diagonale représentant le test d’apport nul.
Selon l’exemple, c’est le seuil avec une Se = 79% et une Sp = 71%

40
Q

Qu’est ce que l’aire sous la courbe ROC?

A
  • Permet d’évaluer l’intérêt diagnostique d’un test, test est informatif ou non
  • Permet de comparer les performances diagnostiques de plusieurs tests biologiques
41
Q

Comment déterminer si une différence significative (cliniquement) existe entre 2 résultats consécutifs?

A
  1. Jugement et expérience des professionnels
  2. RCV = “Reference Change Value”
  3. SCL = “Significant Change Limit”
42
Q

Qu’est-ce que le RCV?

A

RCV (%) = 2,77 (CVa2+CVb2)
CVa = Coefficient de Variation analytique
Cab = Coefficient de Variation biologique intra individuelle

43
Q

Qu’est-ce que le SCL?

A

SCL = 3 x ETu
ETu = ET analytique usuel des 3-6 derniers mois