Biochimie 1: Les enzymes (chapitre 1) Flashcards
Qu’est-ce qu’une protéine?
Polymère formé d’acides aminés liées entre eux par des liaisons peptidiques et qui possède une structure primaire, secondaire, tertiaire et quelques fois quaternaire
Quel est le niveau de structure de protéines dans lequel les acides aminés sont liés entre eux ?
Structure primaire
L’organisation dans l’______ des acides aminés qui sont près les uns des autres dans la structure primaire est appelée structure secondaire.
espace
Dans la structure secondaire d’une protéine, il est possible de retrouver des arrangements réguliers et répétitifs comme les _______ ou les _______ ou encore des arrangements pour lesquels on ne trouve pas de régularité.
- hélices alpha
- feuillets bêta
Qu’est-ce qui constitue la structure tertiaire de la protéine ?
Son repliement complet dans l’espace.
Qu’est-ce qui constitue la structure quaternaire de la protéine?
Association de plusieurs chaines polypeptidiques
V/F: Les quatre niveaux de structure d’une protéine lui permettent d’être fonctionnelle.
Faux
Seulement les protéines de structure tertiaire et quaternaire peuvent être fonctionnelles.
Qu’est-ce qui permet à la protéine d’être fonctionnelle et comment est-il possible de rendre la non fonctionnelle?
Une protéine n’est fonctionnelle que si son arrangement dans l’espace est adéquat. Cette arrangement dépend à la fois de la séquence des acides aminés et du milieu dans lequel baigne la protéine. Un changement d’acide aminé ou une modification du pH peut changer la conformation tridimensionnelle d’un protéine et la rendre non-fonctionnelle.
Qu’est-ce qu’une enzyme ?
Protéine doué d’un pouvoir catalytique fabriquée par les organismes vivants
V/F: Les enzymes sont spécifiques et peuvent catalyser plusieurs types de réactions.
Faux
1 type réaction uniquement
Quel est le mécanisme d’action d’un biocatalyseur?
- Liaison spécifique du/des subtrat(s) (liaison enzyme-substrat)
- Abaissement de l’énergie d’activation
- Accélération de la vitesse de réaction
Qu’est-ce qui distingue un enzyme simple, un holoenzyme et un apoenzyme ?
Enzyme simple: uniquement des acides aminés
Holoenzyme: apoenzyme + cofacteur
Apoenzyme: partie protéique de l’holoenzyme, inactive sans cofacteur
Qu’est-ce qui compose un cofacteur?
ion métallique ou coenzyme
V/F La vitesse de réaction initiale des enzymes correspond à la vitesse maximale de réaction.
Faux
S’il n’y a pas assez de substrat, seulement une fraction des molécules d’enzymes ont accès aux molécules de substrat
Quels sont les effet d’une variation de la concentration du substrat sur la vitesse de réaction dans des conditions où la concentration en enzyme est constante?
Faible concentration : Vitesse initiale est presque directement proportionnelle à la concentration de substrat et non à celle de l’enzyme
Forte concentration: vitesse est maximale. Toutes les molécules d’enzymes sont saturées de substrat.
Que signifie la vitesse maximale de la réaction impliquant un enzyme?
C’est lorsque les molécules d’enzymes sont saturées de substrat.
Quels sont les effets d’une variation de la concentration de l’enzyme sur la vitesse de réaction dans des conditions où la concentration en substrat est très élevée?
La vitesse initiale/maximale sera encore plus grande jusqu’à saturation des enzymes.
Comment évaluons-nous la quantité d’enzyme en circulation chez les patients ?
Par la mesure de l’activité enzymatique plutôt que par la mesure de la concentration
Quel sont les effets d’une variation de pH et de la température du milieu dans lequel agit une enzyme?
Chaque enzyme a une température et un pH optimaux où son activité est maximale. En dehors de ces valeurs, l’activité enzymatique diminue de plus en plus.
Les cellules et l’organisme lui-même contrôle certaines réactions enzymatiques afin d’adapter leurs besoins métaboliques à leur environnement. Ces contrôles sont réalisés ou bien en affectant la _____ d’enzymes et/ou en modifiant ______ de certaines enzymes.
- quantité
- activité
Comment nomme-t-on le mécanisme qui augmente la synthèse de molécules d’une enzyme donnée et celui qui la diminue?
Induction: plus d’enzymes
Répression : moins d’enzymes
La synthèse de tous les types d’enzymes est-elle sujette à la répression/induction ?
Non. Il y a des enzymes dont la synthèse est constante. Ce sont les enzymes constitutives.
Quels sont les deux mécanismes qui contrôlent l’efficacité catalytique des enzymes?
L’allostérie et la modification covalente
Qu’est-ce qui contrôle l’activité des enzymes allostériques?
Molécules modulatrices effectrices qui interragissent avec l’enzyme
V/F: Les enzymes allostériques ont des sites catalytiques, des sites allostériques positifs et/ou des sites allostériques négatifs.
Vrai
Quel est l’effet de l’effecteur/modulateur allostérique négatif?
Il entraîne une modification du site catalytique rendant l’enzyme moins réceptive au substrat. Il y a alors une diminution de la catalyse.