biochem 2 asynchrone Flashcards
Quelles sont les bases azotés purines/pyrimidines ? Dans l’ADN et ARN
pyrimidines: C, T , U
Purines : G,A
ADN: ATGC
ARN: AUGC
Quels sont les éléments structurels essentiels mis en avant dans l’organisation des acides nucléiques ?
Les acides nucléiques sont constitués d’un squelette sucre-phosphate avec des bases azotées attachées. Ces bases interagissent par des liaisons hydrogène pour former des structures spécifiques comme la double hélice.
Quelle est l’importance des interactions entre les bases azotées pour la stabilité de l’ADN ?
Les interactions par liaisons hydrogène entre les bases complémentaires (A-T et G-C) stabilisent la structure de la double hélice et permettent une réplication précise.
Quels sont les principes fondamentaux du couplage entre les bases azotées, et comment cela garantit-il une réplication fidèle de l’ADN ?
Le couplage repose sur la complémentarité : A s’associe avec T via 2 liaisons hydrogène, et G avec C via 3 liaisons hydrogène. Cette spécificité permet une copie exacte des brins d’ADN. Même diamètre des paires de bases
Quelle est la différence entre une liaison covalente et une liaison hydrogène dans le contexte des acides nucléiques ?
Les liaisons covalentes, comme les liaisons phosphodiester, sont fortes et maintiennent le squelette sucre-phosphate. Les liaisons hydrogène sont faibles et assurent l’appariement réversible des bases.
Comment la polarité des brins d’ADN est-elle orientée, et pourquoi est-ce crucial pour leurs fonctions biologiques ?
La polarité va de 5’ à 3’ pour chaque brin. Les brins sont antiparallèles, ce qui est essentiel pour l’appariement des bases et les mécanismes de réplication et de transcription.
Pourquoi est-il important que les purines et pyrimidines aient des structures complémentaires ?
Cela permet un appariement précis entre les bases (purine-pyrimidine) pour maintenir une largeur constante de la double hélice et assurer une réplication exacte.
Comment les composants des acides nucléiques interagissent-ils pour former des structures tridimensionnelles fonctionnelles ?
Les bases azotées interagissent par liaisons hydrogène, et les groupements phosphate et sucre forment un squelette flexible mais stable, permettant la formation de structures comme la double hélice.
Pourquoi les groupements phosphate dans l’ADN sont-ils toujours orientés vers l’extérieur de la double hélice ?
les groupements phosphate, chargés négativement, sont hydrophiles et interagissent avec l’eau environnante, tandis que les bases hydrophobes sont protégées à l’intérieur.
Expliquez le rôle des liaisons phosphodiester dans la formation de la structure en chaîne des acides nucléiques.
Les liaisons phosphodiester relient le 3’ d’un sucre au 5’ du suivant via un phosphate, formant le squelette covalent stable des acides nucléiques.
Comment les variations dans la séquence des bases azotées influencent-elles l’information génétique codée par l’ADN ?
La séquence des bases détermine l’ordre des acides aminés dans les protéines, dictant ainsi les fonctions biologiques et l’information génétique transmise.
Quels sont les composants impliqués dans la formation d’une liaison osidique, et quel est le produit de cette réaction ?
Une liaison osidique se forme entre :
1. Le groupement réducteur (hydroxyle) de la fonction alcool du carbone hémiacétalique d’un ose (carbone anomère : numéro 1 chez les aldoses, numéro 2 chez les cétoses).
2. Le groupement acide (hydrogène libre) d’une autre molécule, telle qu’un alcool glucidique, une molécule carboxylique ou aminée.
Cette réaction chimique covalente produit une molécule d’eau par condensation
Quelles sont les principales différences entre un nucléotide et un nucléoside ?
Un nucléotide est composé de trois éléments : une base azotée, un sucre (pentose), et un ou plusieurs groupements phosphate. Un nucléoside, en revanche, ne contient que deux éléments : une base azotée et un sucre, sans groupement phosphate.
Qu’est-ce que l’ADN et l’ARN, et comment sont-ils structurés ?
L’ADN et l’ARN sont des polymères linéaires formés de nucléotides reliés par des liaisons phosphodiesters entre les carbones 3’ et 5’ des sucres. On les note toujours de l’extrémité 5’ vers l’extrémité 3’.
Quels sont les niveaux successifs de condensation de l’ADN, depuis le “collier de perles” jusqu’au chromosome ?
Collier de perles : ADN enroulé autour des nucléosomes.
Chromatine : Fibres formées par l’organisation des nucléosomes en solénoïde, stabilisées par l’histone H1.
Boucles : ADN formant des structures ancrées à une charpente protéique.
Mini-bandes : Enroulement des boucles en unités compactes.
Chromosome : Structure finale où les mini-bandes forment une organisation ultra-condensée.
Quelle est la différence entre l’ADN-B, l’ADN-A et l’ADN-Z ?
ADN-B est la conformation la plus courante, une hélice droite.
ADN-A est une forme déshydratée de l’ADN, aussi une hélice droite.
ADN-Z est une hélice gauche, et elle est particulièrement riche en séquences GC.
Qu’est-ce qui différencie les sillons majeur et mineur dans la double hélice de l’ADN ?
Le sillon majeur est plus large et accessible aux protéines, facilitant les interactions spécifiques.
Combien de paires de bases sont enroulées autour d’un nucléosome, et quelles protéines composent ce dernier ?
Plusieurs paires de bases sont enroulées autour d’un octamère d’histones, constitué de H2A, H2B, H3 et H4. L’histone H1 stabilise les nucléosomes adjacents.
À quoi correspond la température de fusion (Tm) dans un contexte expérimental, et comment varie-t-elle ?
La Tm est la température où 50 % des brins sont séparés. Elle est plus élevée pour les séquences riches en GC.
Comment la chromatine est-elle affectée par une faible force ionique ?
Elle se décondense pour former une structure appelée “collier de perles”, où les nucléosomes sont visibles.
Quel rôle l’histone H1 joue-t-elle dans la structure de la chromatine ?
Elle stabilise le solénoïde en liant les nucléosomes adjacents.
Comment la taille d’un chromosome humain est-elle réduite malgré la longueur totale de l’ADN ?
Par la supercompaction en plusieurs niveaux : nucléosomes, fibres de chromatine, boucles et mini-bandes.
