biocell Flashcards
1
Q
Comment le transport de molécules hydrophobes (O2, CO2, N2, hormones stéroïdes) se fait-il à travers la membrane?
A
Diffusion à travers la membrane
2
Q
Que contiennent les parties hydrophile/hydrophobe des lipides?
A
Partie hydrophile: AA
Partie hydrophobe: AG
3
Q
Quelle est la fonction du cholestérol dans la bicouche lipidique?
A
Augmente les propriétés imperméables
- permet d’avoir des chaînes qui s’imbriquent les unes les autres
- essentiel à l’intégrité de la membrane
4
Q
Quelle est la fonction de l’asymétrie de la bicouche?
A
Permet aux protéines synthétisées d’être à l’extérieur de la membrane du RE (permet aux protéines membranaires d’être du bon côté de la membrane)
Permet une bonne transmission des signaux (différence entre partie exposée à intra et extracellulaire)
5
Q
De quels facteur la vitesse de diffusion à travers la membrane dépend-elle?
A
Taille des molécules
Solubilité relative dans l’huile
6
Q
Qu’est-ce qui confère la spécificité au site de liaison d’une protéine de transport membranaire?
A
Hydrophilie (suffisamment pour que la molécule se lie; si elle était hydrophobe elle pourrait diffuser à travers la membrane)
7
Q
Nommez les 3 types de transport actif chez les mammifères
A
Transporteurs couplés (associent le transport de soluté dans les 2 sens; symport ou antiport)
Pompes couplées à l’ATP (associent le transport contre le gradient à l’hydrolyse de l’ATP)
Pompes couplées à la lumière (associent le transport contre le gradient à l’énergie lumineuse)
8
Q
Nommez les 3 types de transport
A
Uniport: protéine porteuse qui transporte un seul soluté d’un côté de la membrane à l’autre
Symport: protéine porteuse qui transporte 2 types de solutés à travers la membrane dans la même direction
Antiport: protéine de transport qui transporte 2 ions ou 2 petites molécules différentes à travers la membrane dans des directions opposées, soit simultanément, soit successivement
9
Q
Nommez les 3 types de pompes à ATP
A
Type P: pompes qui se phosphorylent en cours du cycle de passage (transportent ions)
Type F: pompes qui utilisent le gradient H+ pour phosphoryler ATP
Transporteur ABC: pompent essentiellement des petites molécules à travers les membranes
10
Q
Qu’est ce qu’une protéine de résistance aux drogues?
A
Protéine de type transporteur ABC qui peut pomper les médicaments hydrophobes (comme certains anticancéreux) pour les faire sortir du cytoplasme des cellules eucaryotes
11
Q
Quels sont les 3 types de canaux ioniques?
A
a) canaux à vanne contrôlée par le voltage
b) canaux à vanne mécaniques
c) canaux à vanne contrôlée par un ligand (neurotransmetteur, ion, nucléotide)
12
Q
Définissez gradient électrochimique?
A
Influence combinée de la concentration d’un ion de part et d’autre de la membrane et de la différence de la charge électrique des deux côtés de la membrane (potentiel membranaire)
13
Q
Quels sont les sens du transport des canaux à K+ et à Na+?
A
K+: sortie d’ions
Na+: entrée d’ions
14
Q
Quelle est la fonction des ions potassium dans le potentiel membranaire?
A
Équilibre les chares portées par les anions cellulaires fixés à l’intérieur de la cellule
15
Q
Décrivez, étape par étape, la dépolarisation d’une membrane
A
- Différence de potentiel au repos
- Stimulus qui excite légèrement le potentiel
- Petit changement provoque ouverture de canal Na+
- Transport des ions Na+ intervient dans potentiel de membrane
- Stimule la polarisation jusqu’à atteinte d’un max
- Inactivation du canal Na+ (permet aux ions K+ de repolariser la membrane)
- Atteinte de valeur potentiel seuil -> changement de conformation (fermeture de canal Na+)
16
Q
Quelles sont les fonctions des nœuds de Ranvier?
A
Accélération du signal
Conservation de la même amplitude du signal
17
Q
Décrivez, étape par étape, la conversion du signal chimique (neurotransmetteur) en signal électrique.
A
- Stimuli -> liaison de vésicules avec membranes
- Libération de neurotransmetteurs
- Liaison de neurotransmetteurs sur transporteurs sur cellule postsynaptique
- Ouverture de canaux
- Dépolarisation de cellules postsynaptiques
18
Q
Décrivez, étape par étape, le processus de transmission neuromusculaire.
A
- Influx nerveux -> terminaison nerveuse -> dépolarisation de la membrane plasmique
- ouverture transitoire des canaux Ca2+ à vannes contrôlées par le voltage de cette membrane
- Ca2+ s’écoule dans la terminaison nerveuse lorsque la concentration extracellulaire est 1000x+ élevée qu’intra
- exocytose d’acétylcholine dans la fente synaptique - Fixation d’acétylcholine libérée sur les récepteurs à l’acétylcholine de la membrane plasmique neuromusculaire
- ouverture transitoire des canaux à Na+ à vannes contrôlées par le voltage
- entrée de Na+ dans la cellule musculaire
- dépolarisation de la membrane - Ouverture des canaux Na+ contrôlés par le voltage
- création d’une encore + grande dépolarisation
- ouverture des canaux Na+ contrôlés par le voltage voisins à cette dépolarisation locale
- autopropagation de la dépolarisation - Activation des canaux Ca2+ contrôlés par le voltage
- Ouverture transitoire des canaux Ca2+ (stress méc)
- Contraction des myofibrilles de la cellule musculaire (car augmentation de [Ca2+])
19
Q
Décrivez, étape par étape, le mécanisme de mouvement unidirectionnel pour la myosine
A
- Attachée: début de cycle: conformation rigidité
- Libérée: fixation d’une molécule d’ATP sur la grande fente de la tête
- Armée: fermeture de la fente autour de la molécule d’ATP (hydrolyse de l’ATP)
- Génération de force: fixation de la tête de myosine sur un nouveau site du filament d’actine (libération de Pi et ADP)
- Attachée: fin de cycle (conformation rigidité, myosine a reculé par rapport à actine)
20
Q
Quel est le rôle de la tropomyosine?
A
Stabilisation de la jonction actine-myosine avant la contraction
Relarguage de Ca2+ par RS -> retrait du complexe à la troponine (permet à l’actine et à la myosine de se contracter)
21
Q
Décrivez, étape par étape, la transmission de l’influx nerveux en contraction musculaire
A
- Fixation de Ca2+ à la troponine -> changement de confo
- Libération de la tropomyosine sur le site de liaison sur l’actine
- Fixation des têtes de myosine activées sur des sites de liaison
a) Pi quitte la tête
b) La tête change de forme
c) Les disques Z se rapprochent
d) ATP se fixe sur les têtes de myosine (détachement des têtes, activation de la myosine) - Reste de Ca2+ dans le cytoplasme -> étape 3 continue
- S’il n’y a plus d’influx:
a) les pompes à Ca2+ quittent la troponine
b) la tropomyosine retourne sr le site de liaison
c) relâchement musculaire
22
Q
Nommez les purines et les pyrimidines
A
Purines (2 cycles): adénine et guanine
Pyrimidine (1 cycle): thymine et cytosine
23
Q
Combien de chromosomes le génome humain contient-il?
A
22 autosomes (paires) + 1 paire de chromosomes sexuels = 24 chromosomes différents
24
Q
Exon vs intron?
A
exon: partie codante du gène, séquence qui se retrouvera dans l’ARNm
intron: région non-codante du gène (excisée par épissage)
25
Qu'est ce que le chromosome fait pendant l'interphase?
Expression active des gènes
Réplication de l'ADN
Duplication des chromosomes pour dormer 2 chromosomes fils différents
26
Qu'est ce que le chromosome fait pendant la phase M?
Condensation du chromosome
Rupture de l'enveloppe nucléaire
Formation du fuseau mitotique à partir des microtubules et d'autres protéines
Capture des chromosomes mitotiques condensés par le fuseau mitotique
Chaque chromosome fils est repoussé à une extrémité de la cellule
Reformation de l'enveloppe nucléaire autour de chaque jeu de chromosome
27
Décrivez le rôle des histones
Enrouler l'ADN (ADN super enroulé ne peut pas être répliqué)
28
Définissez gène
région de l'ADN, transcrite en une seule unité. qui porte l'information d'un caractère héréditaire particulier, correspondant habituellement à
a) une protéine unique
b) un unique ARN
29
Définissez centromère
région resserrée d'un chromosome mitotique, maintenant ensemble les chromatides soeurs
30
Définissez origine de réplication
endroit dans un chromosome où débute la réplication d'une molécule d'ADN
31
Définissez télomère
extrémité d'un chromosome associée à une séquence d'ADN caractéristique et qui est répliquée de façon particulière. s'oppose à la tendance qu'auraient autrement les chromosomes à se raccourcir à chaque cycle de réplication
32
Nommez l'enzyme qui relie ensemble les fragments d'Okazaki
ADN ligase
33
Quel est le rôle de l'ADN polymérase?
Synthèse de l'ADN; réunit les nucléotides en utilisant une matrice d'ADN comme guide
34
Dans quel sens la réplication de l'ADN se fait-elle?
5' -> 3'
35
Nommez l'enzyme qui corrige les brins amorce mal appariés et son fonctionnement
Exonucléase correctrice
Détache tous les résidus non-appariés de l'extrémité du brin amorce, continuant jusqu'à ce qu'elle ait enlevé assez de nucléotides pour retrouver une base appariée à l'extrémité 3'
36
Quel est le rôle d'ADN primase?
Synthèse d'une amorce d'ARN sur la matrice d'ADN
37
Définissez amorce
oligonucléotide qui s'apparie avec un brin matrice d'ADN ou d'ARN et amorce la synthèse par une polymérase d'un brin complémentaire
Primase retire cette section d'ARN et la remplace par ADN
38
Décrivez, étape par étape, la synthèse des fragments d'Okazaki
1. Synthèse d'une nouvelle amorce d'ARN par ADN primase
2. ADN polymérase s'ajoute à la nouvelle amorce d'ARN pour commencer le nouveau fragment d'Okazaki
3. ADN polymérase termine le fragment d'ADN
4. Ancienne amorce d'ARN éliminée + remplacée par de l'ADN
5. ADN ligase scelle la coupure (unit le nouveau fragment d'Okazaki à la chaîne en croissance
39
Quel est le rôle d'ADN hélicase
Catalyse l'ouverture d'acides nucléiques appariés sous forme de double brins
Avec l'énergie de l'hydrolyse d'ATP ou GTP
40
Quel est le rôle d'ADN topoisomérase?
Dérouler/ stabiliser la double hélice
| Casse une liaison phosphodiester sur un brin d'ADN
41
ADN topoisomérase I vs ADN topoisomérase II?
I: produit un point de cassure transitoire (brèche) sur un seul brin (permet rotation libre aux 2 segments d'ADN)
II: liaison covalente avec les 2 brins de l'hélice d'ADN; formation d'une cassure transitoire du double brin de l'hélice
42
Décrivez, étape par étape, le fonctionnement de ADN topoisomérase II
a) fixation sur le site de croisement
b) utilisation de l'ATP
1. Coupure de l'une des doubles hélices d'ADN irréversiblement pour former une "vanne" entre ces ADN
2. Passage de la 2e double hélice voisine d'ADN à travers cette cassure
3. Recollage de la cassure
4. Dissociation de l'ADN
43
Décrivez une cellule souche
cellule non-différenciée (capacité de différenciation)
capacité de réplication (selon quel gène est activé)
présente dans tous les tissus
compense les pertes de cellules
44
Dans quel sens la transcription se fait-elle?
5' -> 3'
| à partir d'un brin d'ADN 3'-> 5'
45
Décrivez un ARNm
Molécule d'ARN qui spécifie la séquence en acides aminés d'une protéine
Produite par maturation d'ARN produite par ARN polymérase
Code les protéines
Traduite en protéine selon processus catalysé par ribosomes
46
Décrivez un ARNr
molécule d'ARN spécifique qui forme une partie de la structure du ribosome et participe à la synthèse de protéines
47
Décrivez un ARNt
ensemble de petites molécules d'ARN utilisés dans la synthèse protéique comme une interface (adapteur) entre ARNm et AA
Liés de façon covalente à un AA particulier
48
Quel est le rôle d'ARN polymérase II?
mène à la formation d'ARNm
49
Définissez promoteur
séquence nucléotidique de l'ADN sur laquelle se fixe l'ARN polymérase pour commencer la transcription
50
Décrivez une boîte TATA
Séquence d'initiation à la transcription
À ne pas confondre avec site de départ de la transcription
Permet que le facteur de transcription se fixe au point de départ
51
Définissez protéine activatrice de la transcription
Protéine activatrice qui, quand elle se lie à une séquence régulatrice de l'ADN, en active la transcription (cibles pharmacologiques importantes)
52
Qu'est ce qu'un médiateur?
complexe protéique qui permet aux protéines activatrices de communiquer correctement avec les facteurs généraux de transcription
53
Qu'est ce que l'épissage de l'ARN?
élimination des introns d'un pré-ARNm en reliant les exons situés de chaque côté de chaque intron
54
Décrivez, étape par étape, la série de réactions nécessaires à la production d'ARNm
1. Transcription
2. Modification covalente des 2 extrémités de LA'RN
3. Épissage
4. Ajout de la coiffe 5'
5. Ajout de la queue poly-A à l'extrémité 3' (poly-adénylation)
55
Quel est le rôle de la coiffe de l'ARNm?
Empêcher la dégradation de l'ARNm
Exportation du noyau par pores nucléaires
Maturation de l'ARN
56
Quels sont les rôles de la queue poly-A de l'ARNm?
Là où se fixent les protéines
Rythme l'accès des enzymes à l'ARNm
Détermine la durée de vie d'une molécule d'ARNm
Contribue à maintenir intact son message tant et aussi longtemps que la cellule en a besoin
57
Nommez les 3 structures de l'ARNm qui aident à traverser les pores nucléaires
Complexes de liaison à la coiffe : marque la fin de la coiffe
Complexe de jonction des exons: marque la fin de l'épissage
Protéines de liaison aux poly-A: marque la fin de l'addition des poly-A 3' terminaux
58
Décrivez le rôle de la protéine CBC
Complexe de liaison de la coiffe
| Vérifier si la molécule est adéquate/ complète (CBC ne peut pas se délier de l'ADN inadéquat -> destruction d'ARNm)
59
Décrivez le rôle de l'exosome
large complexe protéique dont l'intérieur est tapissé d'exonucléases d'ARN 3' -> 5'
Dégradation des ARN improprement produtits
60
Décrivez un facteur d'initiation
protéine qui favorise l'association correcte entre un ribosome et un ARNm
- nécessaire à l'initiation de la synthèse protéique
- facilite le chargement sur le ribosome de l'ARNt, initiant ainsi la traduction
61
Décrivez, étape par étape, le mécanisme de transfert de l'ARNm, depuis sa transcription dans le noyau jusqu'au début de la traduction
1. Transcription dans le noyau
2. Sortie de l'ARN du noyau (par pores nucléaires)
3. Liaison avec les facteurs d'initiation à la synthèse protéique (prend la place de la protéine CBC qui se lie à la coiffe)
4. Début de la traduction
62
Dans quel sens l'ARNm est il traduit?
5' -> 3'
63
Quelle extrémité de la molécule protéique est synthétisée en premier?
N-terminale
64
Décrivez, étape par étape, le mécanisme de traduction des ARNm
1. Liaison d'un nouvel aminoacyl-ARNt lié sur le site à libre du ribosome / éjection d'un ARNt du site E
2. Formation d'une nouvelle liaison peptidique (peptide sur le site P -> peptide sur le site A)
3. Déplacement de la grande sous-unité d'un triplet vers l'extrémité 3'
4. Déplacement de la petite sous-unité d'un triplet vers l'extrémité 3'
- réinitialisation du ribosome
- hydrolyse du lien entre l'ARNt et l'AA
- site A libre
65
Décrivez anticodon
Séquence de 3 nucléotides dans une molécule d'ARNt, complémentaire au codon de 3 nucléotides d'une molécule d'ARNm
66
Définissez répresseur (protéine répresseur de gènes, répresseur transcriptionnel)
Protéine qui se fixe sur une région spécifique de l'ADN pour bloquer la transcription du gène adjacent
67
Définissez mémoire cellulaire
Mécanismes qui permette à une cellule et à ses descendants de maintenir un schéma d'expression génétique modifié de façon persistante, sans altération de la séquence d'ADN
68
Énumérez les 4 mécanismes de recontrôle de l'expression des gènes
Boucle de recontrôle positif
Boucle de recontrôle négatif
Dispositif oscillant
Boucle de recontrôle par amorçage vers l'avant
69
Expliquez le mécanisme de recontrôle "dispositif oscillant"
Circuit à 2 gènes qui peut osciller entre l'expression d'un gène ou d'un autre
70
Expliquez le mécanisme de recontrôle "boucle de recontrôle par amorçage vers l'avant"
sert de filtre, répondant à des signaux entrants prolongés, mais ne prenant pas en compte des signaux brefs
71
Décrivez fuseau mitotique
Disposition des microtubules et de leurs protéines associées qui se forme entre les pôles opposés d'une cellule eucaryote pendant la mitose
- organisation bipolaire des microtubules
- tirent et séparent les chromatides sœur au cours de l'anaphase
72
Quel est le mécanisme d'action de la vinblastine (cancérothérapie)?
Endommage le fuseau mitotique
Cellules pas capables de se diviser
Processus de mort cellulaire (des cellules tumorales)
73
Décrivez un anneau contractile
Anneau riche en actine et en myosine qui se forme sous la surface des cellules animales en cours de division cellulaire.
Se contracte et sépare les cellules filles par pincement
74
Nommez les 3 phases de l'interphase
Phase G1
Phase S
Phase G2
75
Décrivez les points de contrôle du cycle cellulaire
1. Point de contrôle du départ
2. Point de contrôle G2/M
3. Transition de la métaphase à l'anaphase
76
Quel est l'effet d'une augmentation de l'activité Cdk au point de contrôle G2/M ?
Augmentation de la phosphorylation des protéines qui contrôle:
- condensation des chromosomes
- rupture de l'enveloppe nucléaire
- assemblage du fuseau
- autres évènements ayant lieu au début de la mitose
77
Énumérez les rôles des cyclines G1/S
Activent les Cdk dans la phase G1 tardive
Contribuent à déclencher la progession à partir du point de départ
Engagent la cellule dans le cycle cellulaire
Taux baisse pendant la phase S
78
Énumérez les rôles des cyclines S
Se lient aux Cdk tout de suite après le point de départ
Stimulent al duplication des chromosomes et la synthèse de l'ADN
Taux reste élevé jusqu'à la mitose
Contribuent aussi au contrôle de certains évènements au début de la mitose
79
Énumérez les rôles des cyclines M
Activent les Cdk qui stimulent l'entrée en mitose au point de contrôle G2/M
Promouvoit les évènements de la mitose
80
Énumérez les rôles des cyclines G
Aident à gouverner els activités des cyclines G1/S (contrôlent le passage au point de départ en phase G1 tardive)
81
Définissez gène de cycle de division cellulaire (cdc)
Gène dont le produit (une protéine cdc) contrôle une étape particulière, ou un ensemble d'étape du cycle cellulaire eucaryote
82
Mitose vs cytocinèse?
Mitose: division du noyau d'une cellule eucaryote, qui implique la condensation de l'ADN en chromosomes visibles et la séparation des chromosomes dupliqués pour former 2 jeux identiques
Cytocinèse: division en deux d'une cellule animale et végétale, distincte de la division associée de son noyau. Faut partie de la phase M
83
Nommez les 6 étapes de la mitose
1. Prophase
2. Prométaphase
3. Métaphase
4. Anaphase
5. Télophase
6. Cytocinèse
84
Décrivez les processus cellulaires ayant lieu durant la prophase
Position des chromosomes:
Position des centrosomes:
Position des microtubules:
Condensation des chromosomes (pas encore attachés au fuseau mitotique)
Position des chromosomes: dans le noyau
Position des centrosomes: aléatoire (se dirigent vers les pôles)
Position des microtubules: en cours d'assemblage du fuseau
85
Décrivez les processus cellulaires ayant lieu durant la prométaphase
Position des chromosomes:
Position des centrosomes:
Position des microtubules:
Rupture de l'enveloppe nucléaire
Attachement des chromosomes au fuseau
Position des chromosomes: déplacement actif vers les microtubules
Position des centrosomes: aux pôles du fuseau
Position des microtubules: relient les centrosomes
86
Décrivez les processus cellulaires ayant lieu durant la métaphase
Position des chromosomes:
Position des centrosomes:
Position des microtubules:
Chromosomes solidement attachés à l'équateur du fuseau mitotique, mais n'ont pas encore migré vers des pôles opposés
Position des chromosomes: alignés à l'équateur du fuseau (mi-chemin entre les pôles)
Position des centrosomes: aux pôles du fuseau
Position des microtubules: relient les centrosomes; deviennent de plus en plus courts
87
Décrivez les processus cellulaires ayant lieu durant l'anaphase
Position des chromosomes:
Position des centrosomes:
Position des microtubules:
Stade de la mitose au cours duquel les chromatides sœurs se séparent et s'éloignent l'une de l'autre
Ségrégation des chromosomes
Position des chromosomes: se séparent et se déplacent vers les centromères
Position des centrosomes: déplacement vers l'extérieur
Position des microtubules: relient les centrosomes; deviennent de plus en plus courts
88
Décrivez les processus cellulaires ayant lieu durant la télophase
Position des chromosomes:
Position des centrosomes:
Position des microtubules:
Décondensation des chromosomes
Formation d'enveloppes nucléaires distinctes
Début de la contraction de l'anneau constricteur
Position des chromosomes: aux pôles du fuseau, se décondensent
Position des centrosomes: pôles
Position des microtubules: se chevauchent, se séparent
89
Décrivez les processus cellulaires ayant lieu durant la cytocinèse
Position des chromosomes:
Position des centrosomes:
Position des microtubules:
Division en 2 de la cellule
Position des chromosomes: dans l'enveloppe nucléaire, se décondensent
Position des centrosomes: 1 dans chaque cellule fille
Position des microtubules: reformation de rangées de microtubules interphasiques centralisées par le cœur du chromosome
90
Énumérez les rôles de M-Cdk
Phosphorylation de plusieurs protéines par M-Cdk
Induction de l'assemblage du fuseau mitotique
S'assure que chaque chromatide sœur est bien attachée aux pôles du fuseau mitotique
Déclenche la condensation des chromosomes
Favorise la rupture de l'enveloppe nucléaire
Favorise les réarrangements du cytosquelette et de l'appareil de Golgi
91
Décrivez les condensines et leur rôle
Complexe de protéines impliquées dans la condensation des chromosomes avant la mitose; cible de M-Cdk
Rôle: formation d'une structure en forme d'anneau qui utilise l'énergie apportée par l'hydrolyse de l'ATP pour initier la compaction et la séparation des chromatides soeurs
92
Mitose vs méiose?
Mitose:
- formation de cellules diploïdes
- 1 réplication d'ADN/ cytocinèse
- alignement individuel des chromosomes sur le fuseau
- ce sont les chromatides sœurs qui se séparent
Méiose:
- formation de gamètes (cellules haploïdes)
- 1 réplication de l'ADN/ 2 cytocinèses
- alignement des chromosomes par paires sur le fuseau
- ce sont les chromosomes dupliqués qui se séparent (méiose 1) ; séparation des chromosomes puis séparation des PAIRES de chromosomes
93
Définissez appariement
au cours de la méiose (début de la prophase méiotique), alignement des chromosomes homologues sur toute leur longueur
94
Définissez recombinaison génétique (crossing-over)
processus au cours duquel les molécules d'ADN sont cassées et les fragments réunis en une nouvelle combinaison (permet le brassage génétique et l'expression différentielle)
95
Énumérez les 3 types de recombinaison génétique
recombinaison homologue (générale)
recombinaison conservatrice spécifique au site
recombinaison avec transposition
96
Quels sont les rôles des centromères dans le processus d'appariement (méiose)
Attachement des microtubules
| Séparent les chromosomes durant l'anaphase
