Asselin 2 Flashcards

Question

médicament agissant sur noyau chemin droit dans noyau

Answer 1

* Leptomycin B – Alkyle et inhibe l’exportine 1 (CRM1) – Inhibe l’exportation nucléaire de plusieurs protéines * Selinexor – Médicament anticancéreux – Inhibe l’exportine 1 (CRM1) – Inhibe l’exportation nucléaire de plusieurs protéines

Answer 2

* Le noyau est composé 3): – d’un réseau insoluble de fibres * Matrice nucléaire – Maintient la forme du noyau – Organise les fibres de chromatine et les activités nucléaires (réplication et transcription) * Lamina nucléaire – Supporte l’enveloppe nucléaire

Answer 3

* Le noyau est composé 4): – De fibres de chromatine dispersées de façon ordonnée, de la matrice nucléaire, la lamina nucléaire et l’enveloppe nucléaire – Les fibres de chromatine sont organisées en territoires chromosomiques variant d’un type cellulaire à l’autre et changeant durant le cycle cellulaire. – Deux types de condensation de la chromatine: * Hétérochromatine constitutive condensée en tout temps, quelque soit le type cellulaire (télomère, centromère, etc.) * Hétérochromatine facultative qui varie selon le type cellulaire et les activités de la cellule

Answer 4

Le noyau est composé 5): – D’un nucléole, responsable de la formation des ribosomes * 1 à 2 nucléoles/cellule * Pas de membrane * Structure circulaire * Contient des fibrilles (gènes ribosomaux transcrits en ARNs) * Contient des granules (ARNr et protéines ribosomales) * Le nucléole est un exemple d’organisation de la chromatine.

Answer 5

* Flux directionnel de l’information génétique – Réplication de l’ADN – Transcription de l’information contenue dans l’ADN en ARN: transfert de l’information d’un acide nucléique à l’autre – Traduction de cette information en protéines: transfert de l’information d’une séquence d’ARN à une séquence d’acides aminés (changement de langage)

Answer 6

* Trois types d’ARN sont impliqués dans la synthèse des protéines. – ARN messager (ARNm): copie d’un gène de l’ADN, transporté au ribosome pour être traduit – ARN ribosomal (ARNr non- codant): composants des ribosomes – ARN de transfert (ARNt non- codant): intermédiaires permettant la traduction de la séquence de l’ARNm et apportant l’acide aminé approprié au ribosome

Answer 7

* Procaryote – Traduction de l’ARNm en même temps que la transcription * Eucaryote – Séparation de la transcription (noyau) et de la traduction (cytoplasme)

Answer 8

* Rétrovirus (virus à ARN): – Copie de l’ARN viral en un brin d’ADN complémentaire par une réverse transcriptase – Formation du deuxième brin, et production d’une copie ADN du génome viral – Intégration de l’ADN viral dans le génome cellulaire (provirus) – Transcription de l’ADN viral en ARNm (production de protéines virales de capside, enveloppe et réverse transcriptase) et en copie ARN du génome intégré, copie qui sera encapsidée et qui formera de nouvelles particules virales

Answer 9

* Unités fonctionnelles de l’ADN qui encodent la séquence en acides aminés d’un ou plusieurs polypeptides, ou la séquence d’un ou plusieurs types d’ARN avec des fonctions autres que spécifier la séquence en acides aminés d’un polypeptide

Answer 10

* Chaque acide aminé est spécifié par trois nucléotides (triplet=codon). * Il y a 64 codons: – 61 spécifient un acide aminé donné. – L’un d’entre eux, le codon AUG (Met), sert de codon d’initiation. – Les 3 autres codons sont des codons d’arrêt de la traduction (codons STOP) qui indiquent la terminaison de la chaîne polypeptidique (UAA, UAG, UGA).

Answer 11

* Propriétés du code génétique: – Dégénéré: puisqu’il y a 20 acides aminés, un acide aminé peut être spécifié par plus d’un triplet. – Non chevauchant: chaque nucléotide d’un triplet ne fait partie que d’un seul triplet. – Non ambigu: un codon n’encode qu’un seul acide aminé.

Answer 12

* Transcription: synthèse d’une molécule d’ARN dont la séquence est complémentaire à la séquence de nucléotides du brin d’ADN matrice * L’ARN polymérase transcrit de 5’ en 3’ sur un brin matrice inverse complémentaire (3’-5’). * L’ARN polymérase de Escherichia coli: – Formée de 5 sous-unités – Les sous-unités α2ββ’ω forment le cœur de l’enzyme – Les sous-unités α2ββ’ω avec la sous-unité σ forment l’holoenzyme (α2ββ’ωσ)

Answer 13

* Propriétés du cœur de l’enzyme: – Lie l’ADN de façon non-spécifique – Ouvre les deux brins de l’ADN – Synthétise l’ARN un nucléotide à la fois * Propriétés de l’holoenzyme: – Lie des séquences d’ADN spécifiques au début des gènes grâce au facteur σ – Ouvre les 2 brins de l’ADN – Synthétise l’ARN un nucléotide à la fois

Answer 14

* Promoteur: séquence spécifique d’une douzaine de paires de bases qui détermine où la synthèse d’ARN commence et quel brin d’ADN sert de matrice, donc la direction de la transcription * Promoteur localisé au début des gènes à être transcrits * Promoteur composé de deux séquences en amont du site d’initiation de transcription +1 (souvent un A): – Boite de Pribnow ou séquence -10 (TATAAT) – Séquence -35 (TTGACA) – Séquence conservée mais pas identique entre les promoteurs * L’holoenzyme, par l’intermédiaire de σ, reconnaît les séquences -10 et -35 dans les promoteurs. * Quelques promoteurs ont une séquence en amont UP qui renforce

Answer 15

* 1) Liaison de l’ARN polymérase au promoteur: – σ de l’holoenzyme lie les séquences -10 et -35 – L’holoenzyme déroule la double hélice d’ADN, ouvre les deux brins (activité hélicase) (15-18 pb autour du site d’initiation de transcription). * 2) Initiation de la transcription: – Catalyse du lien 3’OH-5’phosphate entre les nt – Appariement des nt avec le brin d’ADN matrice – Traction de l’ADN et transcription par l’ARN polymérase en ajoutant un nt à la fois sur une longueur de 9 nt – Synthèse abortive (scrunching) jusqu’à ARN de plus de 10 nt – Détachement du facteur σ de l’ARN polymérase qui est libérée * 3) Élongation: – Élongation un nt à la fois de 5’ en 3’ sur une matrice de 3’ en 5’ – L’ARN polymérase lie environ 30 pb d’ADN, avec un hybride ARN- ADN de 8-9 paires de bases. – Surenroulement créé enlevé par des topoisomérases * 4) Terminaison par des signaux de terminaison: – Rho-indépendants: région GC riche suivie de Us – Rho-dépendants (pas de région GC-riche) – Rho-indépendants: région GC riche suivie de Us (Figure): * Formation de boucle à cheveux dans les régions GC riches complémentaires qui tire l’ARN de l’ADN * Brisure des liens plus faibles U- A, et relâchement de l’ARN – Rho-dépendants (pas de région GC- riche): * Une protéine Rho, avec activité hélicase et en présence d’ATP, se déplace le long de la chaîne d’ARN et déroule l’ARN de l’ADN à une séquence de terminaison spécifique de 50-90 nt, menant au relâchement de l’ARN polymérase et de l’ARN.

Answer 16

– ARN polymérase I: nucléole; précurseurs des ARNs ribosomaux 28S, 18S et 5.8S (pré-ARNr) – ARN polymérase II: nucléoplasme; pré-ARNm, snARN et microARN – ARN polymérase III: nucléoplasme; pré-ARNt, ARNr 5S et autres petits ARNs

Answer 17

– Promoteur de base de -45 à +20: suffisant pour l’initiation exacte de la transcription – Élément de contrôle en amont (UCE) de -180 à -107: augmente l’efficacité de la transcription – Des facteurs de transcription généraux liant les deux parties du promoteur facilitent le recrutement de l’ARN polymérase I au promoteur, et l’initiation exacte.

Answer 18

– Séquence Initiateur (Inr) autour du site d’initiation de transcription à +1 – Boite TATA (TATAAAA) vers -25 – Élément de reconnaissance TFIIB (BRE) en amont de la boite TATA – Élément promoteur en aval (DPE) vers +30 * Deux types généraux de promoteurs: – Promoteurs dépendant de la boite TATA (Inr et TATA avec ou sans BRE) – Promoteurs dépendant de DPE (DPE et Inr) * Les promoteurs de base assurent des niveaux de transcription de base. Ils ont besoin d’autres éléments dans l’ADN dont les séquences proximales en amont (100 à 200 pb du site d’initiation de transcription) et les amplificateurs (éloignés), pour améliorer leur efficacité.

Answer 19

– La plupart sont en aval du site d’initiation de transcription. * Promoteur des gènes encodant les ARNt avec deux blocs de 10 pb (boite A et boite B) * Promoteur du gène encodant l’ARNr 5S avec deux blocs de 10 pb (boite A et boite C)