Algemeen en Sars-Cov-2 Flashcards
Welke techniek gebruik je om een soort te achterhalen?
Sequentie met 16s RNA techniek
Welke techniek gebruik je om een stam te achterhalen?
VNTR
Welke techniek gebruik je om een kloon te achterhalen?
Hele genoom sequencen met NGS
Wat is 16SRNA?
Een gen dat alle organismen hebben
Wat is een fylogenetische boom?
Stamboom die laat zien hoe verwant bijv. bacterïen zijn.
Wat is de bootstrap value?
Kans dat de vertakking betrouwbaar is, uitgedrukt in een getal.
Waaruit bestaat een virus? van binnen naar buiten (3)
- eiwitmantel met genetisch materiaal
- membraan
- eiwitten aan membraan
Waar bindt het covid virus aan om een cel binnen te komen?
ACE2 receptor
Wat is de sars-cov2 cyclus? ( 6)
- cel binnen met S-eiwit aan ACE-2 receptor
- niet-structurele eiwitten worden gemaakt door host-ribosome
- genoom kopiëren
- structurele eiwitten maken: M,S,E en N
- membraan stelen en mantel+genoom
- genoom kopieën omsluiten en naar buiten.
Waarom komen virussen vaak van vleermuizen?
Vleermuizen kunnen goed virussen lang bij zich houden en verspreiden.
Waarom is het huidige coronavirus besmettelijker?
Doordat de S eiwit beter aan de ACE2 receptor bindt.
Waarom denkt met dat het virus niet uit een lab komt? (3)
- Uit de modellen blijkt dat de bindingsplaatsen SARS-CoV-2 niet optimaal zouden moeten zijn voor binding aan ACE2. Toch bindt SARS-CoV-2 heel goed aan ACE2.
- De sequentie van S-eiwit heeft dezelfde mutaties als het virus aangetroffen in schubdier.
- Er is geen spoor van molecular engineering in het genoom.