Agrobacterium - Plants Interaction : Basics in Plant Genetic Engineering

Question 1

Agrobacterium tumefaciens merupakan bakteri … dan menyebabkan …

Answer 1

Gram negatif
Tumor Crown gall (kanker/tumor)

Question 2

Corwn gall terjadi ketika … melalui …

Answer 2

Ada luka pada batang yang membuat A. tumefaciens bisa menyerang tanaman melalui kemotaksis sebagai respons terhadap bahan kimia yang dihasilkan oleh tanaman yang terluka

Question 3

Bahan kimia yang dilepaskan oleh tanaman ketika ada sel tanaman yang rusak

Answer 3

Gula dan molekul fenolik: Acetosyringon

Question 4

Bagaimana tumor pada tanaman akibat A. tumefaciens tersebut terbentuk?

Answer 4

Hasil dari transfer, integrasi, dan eksperimen gen pada segmen spesifik DNA plasmid A. tumefaciens yang disebut T-DNA

Question 5

Di mana letak T-DNA pada A. tumefaciens?
T-DNA bisa digunakan untuk apa?

Answer 5

Plasmid Ti (Tumor inducing) yang merupakan plasmid besar
T-DNA bisa digunakan sebagai sarana untuk mentransfer gen pada tanaman

Question 6

Pada Ti-plasmid yang termasuk pada T-DNA region adalah

Answer 6

Left border-auksin-sitokinin-opine-right border

Question 7

Urutan vir ragion pada Ti Plasmid

Answer 7

ABGCDFH

Question 8

Urutan letak elemen pada Ti plasmid

Answer 8

T-DNA region - tra - occ - moc - ori - vir region

Question 9

Sebutkan dua langkah penempelan A. tumefaciens ke sel tanaman

Answer 9

1. Polisakarida
2. Jalinan serat selulosa -> diproduksi oleh Agro. chv gen (terlibat dalam penempelan bakteri)

Question 10

Bagaimana induksi gen virulensi (gen vir) bekerja?

Answer 10

VirA merasakan fenolik -> VirA memfosforilasi dan mengaktifkan VirG -> VirG menginduksi ekspresi semua gen vir

Question 11

Bagaimana proses pembentukan T-DNA

Answer 11

VirD1/VirD2 mengenali LB dan RB -> VirD2 menghasilklan nick untai tunggal dalam DNA

Question 12

Mengapa Transfer T-DNA bisa keluar dari sel bakteri

Answer 12

T-DNA/VirD2 diekspor dari sel bakteri oleh T-pilus

Question 13

Apa yang dimaksud dengan T-pilus

Answer 13

Protein yang diproduksi oleh operon virB dan virD2

Question 14

Bagaimana integritas T-DNA ke dalam DNA kromosom tenaman bisa terjadi

Answer 14

Kompleks T-DNA/VirD2 dan protein Vir melintasi membran plasma melalui saluran yang dibentuk oleh VirE2

Question 15

Fungsi dari VirE2

Answer 15

Melindungi T-DNA dari nuklease dan memfasilitasi lokalisasi nuklear/ penempelan pada inti sel

Question 16

Apa saja penginduksi vir region yang terdapat pada jaringan tanaman yang terluka

Answer 16

Asetosyringon, coniferyl alcohol, coniferin, ethyl ferulate, bromoacetosyringone (inhibitor)

Question 17

T-DNA bekerja di makhluk hidup apa?

Answer 17

Eukariot terutama tanaman

Question 18

Mekanisme transfer pada T-DNA (mirip dengan konjugasi)

Answer 18

-transfer ssDNA, nick spesifik lokasi di right border
-transfer left border sering kasar

Question 19

Apa saja gen gormon pada T-DNA

Answer 19

1. iaaM, iaaH: enzim untuk sintesis IAA
2. ipt (tmr):enzim untuk sintesis sitokinin

Question 20

DNA penginduksi tumor

Answer 20

Plasmid Ti
-ori, T-DNA, vir, dan opine katabolisme