ADN Flashcards

Question

Processus de réplication

Answer 1

1) L'origine est reconnue par des protéines d'initiation qui ouvrent l'hélice séparant les brins 2) Liaison de l'hélicase (fonction d'ouvrir l'ADN double-brin, dézipe l'ADN) 3) Liaison de la primase (fait des petites amorces en ARN) 4) Formation du complexe primase-hélicase

Answer 2

Au niveau de chaque fourche de réplication, la synthèse d'ADN se fait sur les deux brins Les deux brins d'ADN nouvellement synthétisés ont une polarité inverse

Answer 3

Brin conducteur: synthèse d'ADN continue à partir d'une seule amorce Brin retardé (tardif): doit être synthétisé de façon discontinue, sous forme de courts fragments (fragments d'Okasaki) qui seront ensuite réunis bout à bout

Answer 4

Brèche ou coupure simple brin Rupture (manque) d'un lien phosphodiester Entre deux fragments d'Okazaki donnés

Answer 5

Enzyme ADN ligase va seller cette brèche entre deux fragments d'Okazaki en créant un lien phosphodiester créant une continuité dans le brin d'ADN

Answer 6

Eucaryotes: primase ajoute une amorce d'ARN de 10 nucléotides à tous les 200-300 nucléotides E. coli: amorce est de 5 nucléotides et fragments d'Okazaki de 1000 nucléotides

Answer 7

- L’ADN polymérase avance jusqu’à l’amorce suivante - Une activité ribonucléase élimine l‘amorce en ARN - Une ADN polymérase de réparation complète l’ADN entre les fragments d‘Okazaki - Une ligase selle le « nick »

Answer 8

Primase, ADN polymérase III, ADN polymérase I, ADN ligase, sliding clamp, SSB protéine, hélicase

Answer 9

ARN polymérase qui ne requiert pas d'amorce pour polymériser des ribonucléotides Synthétise des amorces d'ARN à partir d'une matrice d'ADN

Answer 10

Utilise les amorces d'ARN sur le brin retardé pour synthétiser les fragments d'Okazaki du brin tardif Une seule amorce d'ARN est requise pour synthétiser le brin conducteur

Answer 11

Enzyme avec deux activités requises: 1) Activité de nucléase (enlève l'amorce d'ARN) 2) Activité d'ADN polymérase dite de réparation

Answer 12

Enzyme qui lie deux bouts d'ADN en créant un lien phosphodiester et en utilisant de l'ATP

Answer 13

Clamp coulissant protéine circulaire maintient l'ADN polymérase et l'ADN pendant la synthèse d'ADN

Answer 14

Protéine fixant l'ADN simple brin, dont sont rôle est d'empêcher ce brin de s'apparier avec son brin complémentaire

Answer 15

Sépare les brins Protéines de liaison à l'ADN simple brin maintiennent brins séparés

Answer 16

- Avec l'avancement de la fourche de réplication, à mesure que l'hélicase ouvre l'hélice double brin, il en résulte un super-enroulement en aval de la fourche - La topoisomérase relâche ce stress en faisant une coupure simple-brin dans l'ADN, en aval de la fourche de réplication, et en religant le brin d'ADN coupé

Answer 17

Problème de la synthèse discontinue: Après dégradation de l'amorce en ARN il reste un bout de matrice non répliqué des brins tardifs aux extrémités du chromosome (les télomères) Car l'ADN polymérase ne peut pas démarrer la synthèse d'ADN dans le vide, elle a besoin d'un bout 3'-OH de l'amorce La primase a besoin d'une matrice pour synthétiser l'amorce À chaque réplication on perdrait un bout d'ADN

Answer 18

L'enzyme télomérase ajoute une séquence répétée 1500 fois (TGGGGTTG - environ 10 000 nucléotides répétés) d'ADN à l'extrémité 3'-OH du brin matrice du brin tardif Sa composante ARN complémentaire (3' - ACCCCAAC - 5') sert comme matrice pour sa composante protéique qui fait la synthèse des segments répétés et de l'élongation du brin dans le sens 5'-3' Cela permet d'allonger l'extrémité des chromosomes et d'assurer leur intégrité lors de la réplication

Answer 19

1) Partie protéique: activité d'ADN polymérase capable d'utiliser de l'ARN comme matrice (= activité de 'reverse transcriptase') 2) Partie ARN = matrice d'ARN faisant partie intégrante de la télomérase (3' - ACCCCAAC - 5')

Answer 20

Extension du brin complémentaire au brin retardé: la télomérase agit comme une polymérase utilisant son ARN comme matrice La télomérase se re-apparie avec l'extrémité de la séquence ajoutée plusieurs fois ici: plusieurs séquences répétées peuvent ainsi être ajoutées en tandem Le brin tardif est complété par l'ADN polymérase alpha qui porte une activité primase

Answer 21

La télomérase est uniquement active dans les gamètes et les cellules souches (cellules non différenciées et cellules embryonnaires) Le vieillissement est en partie dû à la perte de l'activité télomérase dans les cellules somatiques ce qui raccourcit progressivement les télomères

Answer 22

En moyenne, il y a environ 10 000 nucléotides répétés dans le télomère et une perte de 200 à 300 nucléotides à chaque réplication Il y a une réactivation de la télomérase dans certains types de cancer

Answer 23

- Des erreurs d’incorporation de nucléotides peuvent survenir pendant la réplication de l’ADN - L’ADN des cellules subit constamment des lésions provoquées par le métabolisme (pH, reactive oxygen species), les radiations (UV, rayon X, etc.), des composés chimiques dans l’environnement

Answer 24

Une mutation peut survenir durant la réplication due aux rares erreurs faites par l'ADN polymérase (erreur de la machinerie réplicative) Si pas de réparation: au cycle de réplication suivant, une des molécules d'ADN sera mutée de façon permanente et la mutation sera transmise et perpétuée

Answer 25

- Une erreur dans la séquence d’ADN si n’est pas corrigée est transmise, elle devient une mutation - Si les mutations surviennent dans l’ADN de cellules germinales (gamètes: ovules et spermatozoïdes), elles seront héritées par la descendance - Ces changements dans la séquence de l’ADN peuvent causer des maladies héréditaires (Drépanocytose, Fibrose kystique, cancer, etc., etc.) - Des mutations dans l’ADN de cellules somatiques peuvent être à la base du cancer (accumulation de 4-5 mutations dans une cellule)

Answer 26

Mutation dans des cellules germinales (hérédité) Maladie autosomale récessive Mutation la plus fréquente (80%) ∆F508, délétion de 3 nucléotides qui codent pour la phénylalanine 508 du canal chlore CFTR

Answer 27

1) Réparation durant la synthèse de l'ADN: proofreading Vérification et autocorrection par l'ADN polymérase 2) Correction post-réplicationelle des mésappariements: DNA mismatch repair system Reconnaissance du nucléotide mal incorporé, excision et réparation 3) Réparation des lésions par excision: excision repair Les bases mutés par déamination, dépurination, radiation (UV dimères de thymine) sont reconnues par de nucléases et excisées Ensuite, repolymérisation par l'ADN polymérase de réparation et ligation

Answer 28

La réparation est possible grâce à la nature de la double hélice d'ADN Comme l'ADN est double brin, la réparation du brin muté est faite en utilisant le brin indemne comme matrice En général, les nucléotides erronés et ou endommagés sont reconnus comme mésappariements causant une torsion, une déformation de la double hélice

Answer 29

Au cours de la synthèse de l’ADN, l’ADN polymérase vérifie son propre travail et le corrige au besoin - Vérification par la polymérase lors de l’appariement des bases - Reconnaissance des mauvais appariements par déformation de l’hélice (les ponts H sont différents) - Activité exonucléase de la polymérase : elle détache le mauvais nucléotide par hydrolyse du lien phosphodiester en reculant et agit ainsi en exonucléase - L’action régulière de polymérisation de la polymérase est reprise Grâce à ce processus, il ne survient qu’environ 1 erreur résiduelle/10 000 000 nucléotides

Answer 30

- Lors de la réplication, l’ADN polymérase vérifie si un nucléotide ajouté dans un brin d’ADN en croissance est incorrect - L’ADN polymérase détache le nucléotides incorrects et le remplace par le nucléotide correct avant de continuer. - L’ADN polymérase a un site catalytique de polymérisation (P) et un site d’édition (E) pour l’excision et la correction - Si un nucléotide ajouté dans un brin d’ADN en croissance (en rouge) est incorrect, ce brin se déplace temporairement vers le site E pour correction

Answer 31

- Les mésappariement causent une distorsion de la double hélice, qui est détectée par des protéines spécifiques - Le protéines de reconnaissance forment un complexe qui recrute une exonucléase (Exo1) * - Une portion du nouveau brin incluant le nucléotide erroné est dégradée par l’exonucléase - Réparation de cette lacune par l’ADN polymérase et ligation

Answer 32

- Ce mécanisme est spécifique au nouveau brin, donc celui-ci doit être identifié en tant que tel - Chez les bactéries comme E. coli, cette reconnaissance est faite grâce à que le nouveau brin n’est pas immédiatement méthylé - Chez d’autres organismes, on suppose que le brin néosynthétisé contient des « nicks » qui aident à l’identifier (par méthylation aussi possible, car l’ADN est méthylé après synthèse)

Answer 33

Endonucléases: clivent à l'intérieur de la molécule d'ADN produisant un nick si elles agissent sur seule brin ou une coupure si elles agissent sur les deux brins Exonucléases: digèrent un brin d'ADN dans la direction 5' à 3', soit de 3' à 5', selon le type d'exonucléase Pour qu'une exonucléase puisse agir il lui faut un bout 5' ou 3' libre, elle ne peut pas agir à l'intérieur de la molécule d'ADN Un nick fournit à la fois un bout 5' et un bout 3'

Answer 34

- Des collisions thermiques entre molécules causent la perte de purines (G, A) de certains nucléotides - Ceci ne casse pas le squelette phosphodiester de l’ADN, mais génère des lésions que l’on peut comparer à des dents manquantes

Answer 35

Le métabolisme peut causer la perte groupement amino de cytosines causant la transformation en base uracile (qui est non-complémentaire à la base située sur l’autre brin d’ADN) * Pas de perte de base dans ce cas-ci

Answer 36

Les rayons UV du soleil peuvent endommager l’ADN en provoquant la formation de liens covalents entre deux thymines adjacentes Dimère de thymine: bris du double lien C-C à l'intérieur du cycle de la base et formation d'un lien covalent avec la base inférieure ou supérieure sur le brin