9 mars

Question 1

Qu’est ce qu’une polonie?

Answer 1

Regroupement ponctuel d’ADN (contraction de polymérase et colonie) elle est le résultat de l’amplification d’une seule molécule d’ADN par une enzyme polymérase. Ainsi chaque polonie comporte des miliers de molécules identiques d’ADN.

Question 2

quelles ont les deux approches du séquencage de l’ADN génomique?

Answer 2

Par clonage aléatoire et par approche contig de clones

Question 3

qu’est ce que la méthode par clonage aléatoire ainsi que son avantage? (séquencage d’ADN)

Answer 3

1-Fragmentation aléatoire
2-séquencage et agencement des fragments
travail bien avec les petits ADN qui ne sont pas trop répétitifs

Question 4

qu’est ce que la méthode contig de clones ainsi que son avantage? (séquencage d’ADN)

Answer 4

1-obtention d’un ensemble de fragments clonés chevauchants (division en partie de l’adn et obtention de la séquence de la sous partie par clonage aléatoire)
2- séquencage et agencement des fragments
Travail bien pour des gros ADN qui peuvent avoir plusieurs fragments répétitifs d’ADN

Question 5

Quels sont les deux vecteur de clonage de séquence génomiques utilisés de nos jours?

Answer 5

BAC (bacterial artificial chromosomes) et YAC (yeast artificial chromosomes)

Question 6

Qu’est ce que les cosmides?

Answer 6

Ce sont des vecteurs plasmiques qui comportent des extrémités cohésives (cos) du phage lambda

Question 7

ou sont le plus utiles les EST EST (Expressed Sequence Tags)?

Answer 7

Pour les espèces ou il y a beaucoup d’EST (humain et souris surtout)

Question 8

qu’est ce qu’un EST (expressed sequenc tags)?

Answer 8

ce sont des fragments d’ADNcisolés et séquencés au hasard

Question 9

Qu’est ce que la banque d’ADNc et dans quoi est elle conservé?

Answer 9

c’est l’ensembles des clones microbiologiques qui sont conservés dans des éprouvettes

Question 10

Qu’est ce que la banque de données (dbEST)?

Answer 10

ensemble de séquences d’ADNc entreposées dans des ordinateurs

Question 11

Comment se servir des EST(expressed sequenc tags)?

Answer 11

On prend la séquence peptidique d’intérêt, on interroge dbEST pour trouver un EST correspondant, on fait venir le clone d’ADNc correspondant et on peut ainsi cribler une banque d’ADNc ou on peut utiliser l’ADNc pour créer des amorces pour amplifier l’ADNc

Question 12

qu’est ce que la méthode de southern?

Answer 12

c’est une méthode par laquelle on digère de l’ADN ensuite on sépare les fragment grace a une électrophorèse sur gel. L’ADNdb est transféré par empreinte sur un papier filtre sur lequel il est ensuite fixé et dénaturé (séparation en simple brin). hydratation avec de l’ADNc marqué aisi lesfragments marqué qui sont double brins restent et le reste est éliminer par lavage. Les bandes sont rendu visibles par autoradiographie.

Question 13

qu’est ce que chambon a réussi a prouver grace à la méthode de southern sur lastructure du gène de l’ovalbumine?

Answer 13

l’existence des introns

Question 14

À quoi sert l’analyse de type Northern?

Answer 14

Elle permet de déterminer dans quel tissu un gène particulier est exprimé et a quel niveau. Il permet aussi de déterminer la longueur de l’ARN correspondant au gène.

Question 15

Comment fonctionne l’analyse de type Northern?

Answer 15

1. Extraction de l’ARN du tissu
2. Migration de l’ARN par électrophorèse pour séparer les ARNm selon leur tailles.
3. transfert sur un filtre de nylon
4. hybridation avec une sonde marquée au 32P et spécifique au gène d’intérêt + lavage
5. autoradiographie

Question 16

À quoi sert la méthode Southern?

Answer 16

elle sert à savoir si la séquence d’ADN d’intérêt est présente dans un génome quelconque et si oui dans quel état.

Question 17

quelle est la différence entre un intron et une région flanquante?

Answer 17

intron : entouré de part et d’autre d’exons
Région flanquante : en amont du premier exon et en aval du dernier exon sont les régions flanquantes 5’- et 3’- respectivement(pas des intron)

Question 18

qu’ont apportés Brown et Goldstein?

Answer 18

la correspondance entre la structure modulaire d’une protéine et les exons de son gène

Question 19

qu’est ce que le brassage d’exon?

Answer 19

c’est l’échange d’exons entre gènes qui peut avoir lieu lors de l’évolution par suite de rupture dans les introns