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Metabolism - Final > 8 - Microbiome > Flashcards

8 - Microbiome Flashcards

1
Q

Qu’est-ce que le microbiome?

A

La totalité des microorganismes associés à un hôte.

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2
Q

Quels sont les types de microbiomes?

A

Symbiotique, commensal, ou pathogénique.

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3
Q

Quels types de microorganismes composent le microbiome?

A

Principalement des bactéries, mais aussi des champignons et des virus (phages).

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4
Q

Quelle est la masse approximative du microbiome humain et combien d’espèces sont présentes?

A
  • La masse du microbiome humain est d’environ 200g.
  • 10000 espèces
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5
Q

Qu’est-ce que la plasticité du microbiome?

A

Le microbiome est plastique, mais retourne à un ‘état de base’ qui peut varier entre individus et espèces.

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6
Q

Quelles sont les activités exécutées par le microbiome?

A

Le microbiome exécute des activités métaboliques essentielles, mais les mêmes fonctions ne sont pas forcément exécutées par les mêmes espèces dans différents contextes.

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7
Q

Vrai ou Faux.
Dans le microbiome gastro-intestinal, le nombre de microorganismes augmente plus on avance dans le track (estomac, petit intestin, grand intestion)

A

Vrai

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8
Q

Comment classifie-t-on le microbiome?

A

On classifie le microbiome plutôt en phylae qu’en espèces.

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9
Q

Quels sont les principaux phylae de bactéries dans le microbiome?

A
  • Firmicutes
  • Bacteroidetes.
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10
Q

Quels sont les caractéristiques des 2 phylaes importants ?

A
  • Firmicutes (Clostridia, Bacilli) : gram + et anaerobes
  • Bacteroidetes : gram -, ne fait pas de spore, peut être aerobes ou anaerobes, très présent dans l’environnement.
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11
Q

E.coli appartient-elle à un des phylaes principaux? Si non, dites lequel.

A

NON,
Pseudomonadota / Proteobacteria.

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12
Q

Quelles sont les caractéristiques des souches d’Escherichia coli?

A
  • composant mineure du microbiome humain
  • 10% des humains l’ont pas.
  • La plupart des souches d’Escherichia coli ne sont pas pathogènes, mais la souche O157:H7 produit des toxines.
  • chouchou pour les scientists
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13
Q

Vrai ou Faux.
Le microbiome est set depuis notre naissance.

A

Faux,
Il s’acquiert tout au long de l’enfance, où il n’est pas encore stable.

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14
Q

Qu’est-ce qui peut influencer la composition du microbiome depuis la naissance jusqu’à la stabilisation? (5)

A
  • mode d’accouchement
  • traitement à l’antibiotique pendant la grossesse
  • allaitement
  • eating dirt (pathogènes and food) quand tu es bébé
  • diete au long terme.
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15
Q

Qu’est-ce qui peut provoquer des modifications temporaires du microbiome adulte (habituellement relativement stable) ?

A

Des changements de conditions, comme un régime alimentaire, peuvent provoquer des modifications temporaires.

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16
Q

Vrai ou Faux (freebie)
Les microbiomes de différents adultes est le même pour tout le monde.

A

Faux

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17
Q

Quel est le rôle potentiel du cæcum et de l’appendice dans la stabilité du microbiome en cas de diarrhée?

A

L’appendice contiendrait un ‘inoculum’ pour la reconstitution d’un microbiome sain.

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18
Q

Quels sont les bénéfices des métabolites produits par le microbiome gastro-intestinal? (5)

A
  • colonisation,
  • métabolisme,
  • éducation immune,
  • pré-digestion (comme la cellulose)
  • production de vitamines.
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19
Q

Quels sont les effets nuisibles associés aux métabolites du microbiome gastro-intestinal? (3)

A
  • absence de colonisation,
  • présence de microbes pathogéniques
  • modulation immune (IBD).
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20
Q

Comment peut-on définir le microbiome et comment les espèces interagissent-elles entre elles?

A
  • le microbiome est un écosystème où les espèces peuvent être bénéfiques ou compétitrices.
  • certaines se nourrissant des déchets d’autres et produisant des métabolites essentiels comme des vitamines.
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21
Q

Quels sont les principaux aspects métaboliques du microbiome? (4)

A

1) Production de vitamines
2) Modulation du métabolisme des acides biliaires
3) Digestion de carbohydrates non-digestibles
4) Productions de SCFA

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22
Q

Qu’est-ce qu’une vitamine et pourquoi est-elle essentielle pour l’organisme?

A

Une vitamine est un métabolite essentiel qui ne peut pas être synthétisé par l’organisme et doit être pris avec la nourriture.

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23
Q

Quelles vitamines sont principalement produites par le microbiome?

A

presque toutes les vitamines hydrosolubles, notamment les vitamines B, surtout la cobalamine (vitamine B12), ainsi que la vitamine K.

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24
Q

Où sont absorbées les vitamines de la nourriture et où sont produites celles par le microbiome?

A

Les vitamines de la nourriture sont absorbées dans l’ileum, tandis que les vitamines produites par le microbiome se trouvent dans le colon, sauf chez les ruminants.

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25
Q

Quelle est la pertinence de la production de vitamines par le microbiome pour la santé humaine?

A

La biodisponibilité et la pertinence de la production de vitamines par le microbiome pour la santé humaine restent peu claires, mais cela présente un intérêt biotechnologique.

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26
Q

DIAPO 18

A
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27
Q

Quels sont les acides biliaires primaires produits par le foie? (2)

A
  • l’acide cholique (CA)
  • CDCA
28
Q

C’est quoi la différence entre le CA et le CDCA ?

A

des groupements hydroxyles ajoutés par la p450 par rxn d’oxydation

29
Q

Quels sont les acides biliaires secondaires transformés par le microbiome dans le côlon? (3) D’où proviennent-ils?

A
  • DCA
  • LCA
  • UDCA
  • transformation effectuée par le microbiome dans le colon.
30
Q

Quels récepteurs de signalisation sont influencés par les acides biliaires?

A

Les acides biliaires influencent les récepteurs TGR5 (transmembranaire) et FXR (nucléaire).

31
Q

Quelle est une propriété des acides biliaires secondaires?

A

Les acides biliaires secondaires peuvent entrer dans la recirculation entérohépatique.

32
Q

Comment le microbiome intestinal module-t-il le métabolisme?

A

Le microbiome intestinal module le métabolisme par la modification d’acides biliaires dans le colon, qui agissent comme ligands de récepteurs clés dans la régulation métabolique.

33
Q

Les FXR et les TGR5 sont lié à quelles régulations du métabolisme?

A
  • gluconéogénèsee
  • secretion de GLP-1
  • secretion d’insuline
  • augmente la sensibilité à l’insuline.
34
Q

Comment est lié le système nerveux central au lumen de l’intestin ?

A

Avec les récepteurs FXR et TGR5 qui sont exprimé au cerveau (les sels biliaires sont les ligands de ces récepteurs)

35
Q

Vrai ou Faux.
Des bactéries du microbiome intestinal ne digèrent pas des carbohydrates non-digestible.

A

Faux,
C’est les bactéries qui les digérent.

(NDC exemple: cellulose, β-glucane, pectine, chitine, gommes naturelles)

36
Q

Quel est le rôle du microbiome dans l’estomac des ruminants, en particulier dans le rumen?

A

Le microbiome dans le rumen des ruminants est capable de digérer la cellulose, agissant comme un bioréacteur, et produit des SCFA qui sont absorbés par l’animal.

37
Q

Pourquoi les ruminants ne se nourrissent-ils pas directement des sucres dérivés de la cellulose?

A

Parce qu’il n’est PAS capables de digérer la cellulose.

38
Q

Quel est l’effet des fibres sur le microbiome chez les humains?

A

Le contenu en fibres a un effet sur la composition du microbiome.

39
Q

Quel est un des aspects bénéfiques du microbiome nourri par les fibres du phylum Bacteroidetes?

A

La protection contre des bactéries pathogéniques par la formation d’un mucus par le microbiome lorsqu’il est nourri par les fibres.

40
Q

Quels sont les principaux produits du métabolisme microbien intestinal issus de la fermentation?

A

SCFA : acétate, propionate et butyrate.

41
Q

Quelle est la différence entre les ruminants et les humains lorsqu’on parle de la digestion des NDC ?

A
  • 75-80% des besoins énergétiques des ruminant vient des SCFA.
  • 10% pour l’humain
42
Q

Quel est le rôle des SCFA dans le métabolisme?

A

Les SCFA sont utilisées pour alimenter la gluconéogenèse, la synthèse de lipides, et le cycle de l’acide citrique (TCA).

43
Q

Où sont utilisés les SCFA dans la gluconéogenèse et le TCA?

A
  • Acetate (2C) est transformé en Acetyl-CoA pour le TCA ou en oxaloacetate pour servir à la glyconéogenèse.
  • Butarate (4C) subit un cycle de β-oxydation pour faire 2 Acetyl-CoA
  • Propionate → Propionyl-CoA → Succinyl-CoA (dans TCA)
44
Q

Quel est le principal carburant des colonocytes humains?

A

Le principal carburant des colonocytes humains est constitué des SCFA.

45
Q

Que se passe-t-il aux SCFA absorbés par les colonocytes?

A

95% des SCFA absorbées par les colonocytes trouvent leur chemin vers le foie.

46
Q

Comment les SCFA sont-ils utilisés dans le foie?

A

Dans le foie, les SCFA sont utilisés pour la synthèse du cholestérol et des acides gras, ainsi que pour alimenter la gluconéogenèse.

47
Q

Quelle est la concentration de SCFA dans le lumen du colon humain?

A

La concentration de SCFA dans le lumen du colon humain est de 20 à 140 mM.

48
Q

Quels sont les principaux produits gazeux formés lors de la fermentation anaérobie?

A

Les principaux produits gazeux formés sont H2S, H2, NH4 et CH4 (méthane).

49
Q

Quel est l’effet des SCFA sur l’axe intestin - cerveau?

A

Les SCFA influencent l’axe intestin - cerveau.

50
Q

Quels types de récepteurs ont été identifiés pour les SCFA?

A

Ils appartiennent à la famille des RCPG.

51
Q

Où peut-on trouver des SCFA dans le corps?

A

Les SCFA se trouvent dans le liquide cérébrospinal.

52
Q

Quels systèmes peuvent être impliqués dans les effets indirects des récepteurs des SCFA?

A

Le système nerveux autonome, le système immunitaire, ou le foie.

53
Q

Vrai ou Faux (freebie)
Il a n’y a pas de corrélation entre le microbiome et la santé mentale.

A

Faux
Il y a des corrélations.

54
Q

Quelles sont les manifestations de santé mentale associées au microbiome au niveau clinique?

A

Dépression, trouble de l’humeur, trouble du spectre de l’autisme, Alzheimer, Parkinson, sclérose en plaques.

55
Q

Quels éléments sont impliqués dans l’interaction entre le microbiome et le système nerveux?

A

Les acides biliaires et les SCFA.

56
Q

Quel type de lien existe entre le microbiome et les manifestations de santé mentale?

A

Il n’infère pas un lien simple de cause à effet, mais une interaction bi-directionnelle vers le système nerveux autonome.

57
Q

Vrai ou Faux.
On peut améliorer les manifestations de santé mentale en faisant une intervention au niveau du microbiome.

A

Vrai
Par transfert fécal, soit chez la souris, soit chez l’humain.

58
Q

Comment l’obésité peut-elle être transférée chez les souris?

A

L’obésité peut être transférée via le microbiome intestinal.

59
Q

Quelle procédure médicale est maintenant acceptée pour traiter l’infection à C. difficile?

A

La transplantation fécale.

60
Q

Quels sont les types de bactéries souvent présents dans les préparations probiotiques? (not important)

A

Les préparations probiotiques contiennent souvent des bifidobactéries ou des lactobacilles.

61
Q

Quel est le principal bienfait des probiotiques selon les études? (not important)

A

Les études suggèrent un bienfait plutôt non spécifique des probiotiques.

62
Q

Les produits probiotiques induisent-ils une colonisation durable de l’hôte? (not important)

A

Non, la prise de produits probiotiques n’induit pas une colonisation durable de l’hôte.

63
Q

Pourquoi l’effet des probiotiques sur le microbiome intestinal n’est-il pas bien caractérisé? (not important)

A

L’effet des probiotiques sur le microbiome intestinal n’est pas bien caractérisé en raison de l’importance spécifique des espèces et souches utilisées, ainsi que du mode d’action.

64
Q

Quels sont les effets des probiotiques sur le microbiome intestinal? (not important)

A

Les probiotiques ont un effet global sur le microbiome intestinal, mais cet effet est plutôt transitoire.

65
Q

Comment les probiotiques agissent-ils dans l’intestin? (not important)

A

Les probiotiques peuvent rebalancer le microbiome, avoir un effet direct grâce aux vitamines bactériennes, influencer leurs métabolites, et permettre un transfert génique latéral.

Metabolism - Final (6 decks)

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